Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3523988	3524038	51	22 [0]	[0] 44	yiiR	conserved inner membrane protein

GAATCAACGTCGGGACAAAACGCCCCACCGCCCATTGCCAGACACCCGGTAAAATCGCCCA  >  W3110S.gb/3524039‑3524099 |                                                             gAATCAACGTCGGGCCAAAACGCCCCACCGCCCATTGCCAGACACCCGGTAAAATCGccc   >  1:1034263/1‑60 (MQ=255) gAATCAACGTCGGGACAAAACGCCCCACCGCCCATTGCCAGaca                   >  1:259290/1‑44 (MQ=255) gAATCAACGTCGGGACAAAACGCCCCACCGCCCATTGCCAGACACCCGGTAAAATCGccaa  >  1:577988/1‑59 (MQ=255) gAATCAACGTCGGGACAAAACGCCCCACCGCCCATTGCCAGACACCCGGTAAAATCGCCCa  >  1:587626/1‑61 (MQ=255) gAATCAACGTCGGGACAAAACGCCCCACCGCCCATTGCCAGACACCCGGTAAAATCGCCCa  >  1:434280/1‑61 (MQ=255) gAATCAACGTCGGGACAAAACGCCCCACCGCCCATTGCCAGACACCCGGTAAAATCGCCCa  >  1:442003/1‑61 (MQ=255) gAATCAACGTCGGGACAAAACGCCCCACCGCCCATTGCCAGACACCCGGTAAAATCGCCCa  >  1:450073/1‑61 (MQ=255) gAATCAACGTCGGGACAAAACGCCCCACCGCCCATTGCCAGACACCCGGTAAAATCGCCCa  >  1:479598/1‑61 (MQ=255) gAATCAACGTCGGGACAAAACGCCCCACCGCCCATTGCCAGACACCCGGTAAAATCGCCCa  >  1:498178/1‑61 (MQ=255) gAATCAACGTCGGGACAAAACGCCCCACCGCCCATTGCCAGACACCCGGTAAAATCGCCCa  >  1:535737/1‑61 (MQ=255) gAATCAACGTCGGGACAAAACGCCCCACCGCCCATTGCCAGACACCCGGTAAAATCGCCCa  >  1:551781/1‑61 (MQ=255) gAATCAACGTCGGGACAAAACGCCCCACCGCCCATTGCCAGACACCCGGTAAAATCGCCCa  >  1:568128/1‑61 (MQ=255) gAATCAACGTCGGGACAAAACGCCCCACCGCCCATTGCCAGACACCCGGTAAAATCGCCCa  >  1:568422/1‑61 (MQ=255) gAATCAACGTCGGGACAAAACGCCCCACCGCCCATTGCCAGACACCCGGTAAAATCGCCCa  >  1:31287/1‑61 (MQ=255) gAATCAACGTCGGGACAAAACGCCCCACCGCCCATTGCCAGACACCCGGTAAAATCGCCCa  >  1:626256/1‑61 (MQ=255) gAATCAACGTCGGGACAAAACGCCCCACCGCCCATTGCCAGACACCCGGTAAAATCGCCCa  >  1:684514/1‑61 (MQ=255) gAATCAACGTCGGGACAAAACGCCCCACCGCCCATTGCCAGACACCCGGTAAAATCGCCCa  >  1:686036/1‑61 (MQ=255) gAATCAACGTCGGGACAAAACGCCCCACCGCCCATTGCCAGACACCCGGTAAAATCGCCCa  >  1:713214/1‑61 (MQ=255) gAATCAACGTCGGGACAAAACGCCCCACCGCCCATTGCCAGACACCCGGTAAAATCGCCCa  >  1:752140/1‑61 (MQ=255) gAATCAACGTCGGGACAAAACGCCCCACCGCCCATTGCCAGACACCCGGTAAAATCGCCCa  >  1:776439/1‑61 (MQ=255) gAATCAACGTCGGGACAAAACGCCCCACCGCCCATTGCCAGACACCCGGTAAAATCGCCCa  >  1:828789/1‑61 (MQ=255) gAATCAACGTCGGGACAAAACGCCCCACCGCCCATTGCCAGACACCCGGTAAAATCGCCCa  >  1:883156/1‑61 (MQ=255) gAATCAACGTCGGGACAAAACGCCCCACCGCCCATTGCCAGACACCCGGTAAAATCGCCCa  >  1:923449/1‑61 (MQ=255) gAATCAACGTCGGGACAAAACGCCCCACCGCCCATTGCCAGACACCCGGTAAAATCGCCCa  >  1:1545695/1‑61 (MQ=255) gAATCAACGTCGGGACAAAACGCCCCACCGCCCATTGCCAGACACCCGGTAAAATCGCCCa  >  1:1183496/1‑61 (MQ=255) gAATCAACGTCGGGACAAAACGCCCCACCGCCCATTGCCAGACACCCGGTAAAATCGCCCa  >  1:1272576/1‑61 (MQ=255) gAATCAACGTCGGGACAAAACGCCCCACCGCCCATTGCCAGACACCCGGTAAAATCGCCCa  >  1:1089441/1‑61 (MQ=255) gAATCAACGTCGGGACAAAACGCCCCACCGCCCATTGCCAGACACCCGGTAAAATCGCCCa  >  1:1289079/1‑61 (MQ=255) gAATCAACGTCGGGACAAAACGCCCCACCGCCCATTGCCAGACACCCGGTAAAATCGCCCa  >  1:1289531/1‑61 (MQ=255) gAATCAACGTCGGGACAAAACGCCCCACCGCCCATTGCCAGACACCCGGTAAAATCGCCCa  >  1:1366517/1‑61 (MQ=255) gAATCAACGTCGGGACAAAACGCCCCACCGCCCATTGCCAGACACCCGGTAAAATCGCCCa  >  1:1460026/1‑61 (MQ=255) gAATCAACGTCGGGACAAAACGCCCCACCGCCCATTGCCAGACACCCGGTAAAATCGCCCa  >  1:1521380/1‑61 (MQ=255) gAATCAACGTCGGGACAAAACGCCCCACCGCCCATTGCCAGACACCCGGTAAAATCGCCCa  >  1:1621753/1‑61 (MQ=255) gAATCAACGTCGGGACAAAACGCCCCACCGCCCATTGCCAGACACCCGGTAAAATCGCCCa  >  1:1645898/1‑61 (MQ=255) gAATCAACGTCGGGACAAAACGCCCCACCGCCCATTGCCAGACACCCGGTAAAATCGCCCa  >  1:10146/1‑61 (MQ=255) gAATCAACGTCGGGACAAAACGCCCCACCGCCCATTGCCAGACACCCGGTAAAATCGCCCa  >  1:206041/1‑61 (MQ=255) gAATCAACGTCGGGACAAAACGCCCCACCGCCCATTGCCAGACACCCGGTAAAATCGCCCa  >  1:222140/1‑61 (MQ=255) gAATCAACGTCGGGACAAAACGCCCCACCGCCCATTGCCAGACACCCGGTAAAATCGCCCa  >  1:294476/1‑61 (MQ=255) gAATCAACGTCGGGACAAAACGCCCCACCGCCCATTGCCAGACACCCGGTAAAATCGCCCa  >  1:1001066/1‑61 (MQ=255) gAATCAACGTCGGGACAAAACGCCCCACCGCCCATTGCCAGACACCCGGGAAAATCGCCCa  >  1:29527/1‑61 (MQ=255) gAATCAACGTCGGGACAAAACGCCCCACCGCCAATTGCCAGACACCCGGTAAAATCGCCCa  >  1:186494/1‑61 (MQ=255) gAATCAACGTCGGGACAAAACGCCCCACCGCACATTGCCa                       >  1:914918/1‑40 (MQ=255) gAATCAACGTCGGGACAAAACGCCCAACCGCCCATTGCCAGACACCCGGt             >  1:1007469/1‑50 (MQ=255) gAATAAACGTCGGGACAAAACGCCCCACCGCCCATTGcc                        >  1:1285479/1‑39 (MQ=255) |                                                             GAATCAACGTCGGGACAAAACGCCCCACCGCCCATTGCCAGACACCCGGTAAAATCGCCCA  >  W3110S.gb/3524039‑3524099

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑