Missing coverage evidence...
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TCATCGTCTCAGCATTCGGGATCTCTTGCTGGGTGCGGT  >  W3110S.gb/3619548‑3619586 |                                       tCATCGTCTCAGCATTCGGGATCTCTTGCTGGGTGCGGt  <  1:247153/39‑1 (MQ=255) tCATCGTCTCAGCATTCGGGATCTCTTGCTGGGTGCGGt  <  1:980883/39‑1 (MQ=255) tCATCGTCTCAGCATTCGGGATCTCTTGCTGGGTGCGGt  <  1:941122/39‑1 (MQ=255) tCATCGTCTCAGCATTCGGGATCTCTTGCTGGGTGCGGt  <  1:903983/39‑1 (MQ=255) tCATCGTCTCAGCATTCGGGATCTCTTGCTGGGTGCGGt  <  1:822357/39‑1 (MQ=255) tCATCGTCTCAGCATTCGGGATCTCTTGCTGGGTGCGGt  <  1:820874/39‑1 (MQ=255) tCATCGTCTCAGCATTCGGGATCTCTTGCTGGGTGCGGt  <  1:741810/39‑1 (MQ=255) tCATCGTCTCAGCATTCGGGATCTCTTGCTGGGTGCGGt  <  1:680508/39‑1 (MQ=255) tCATCGTCTCAGCATTCGGGATCTCTTGCTGGGTGCGGt  <  1:553143/39‑1 (MQ=255) tCATCGTCTCAGCATTCGGGATCTCTTGCTGGGTGCGGt  <  1:546895/39‑1 (MQ=255) tCATCGTCTCAGCATTCGGGATCTCTTGCTGGGTGCGGt  <  1:501374/39‑1 (MQ=255) tCATCGTCTCAGCATTCGGGATCTCTTGCTGGGTGCGGt  <  1:469993/39‑1 (MQ=255) tCATCGTCTCAGCATTCGGGATCTCTTGCTGGGTGCGGt  <  1:378613/39‑1 (MQ=255) tCATCGTCTCAGCATTCGGGATCTCTTGCTGGGTGCGGt  <  1:341238/39‑1 (MQ=255) tCATCGTCTCAGCATTCGGGATCTCTTGCTGGGTGCGGt  <  1:1071964/39‑1 (MQ=255) tCATCGTCTCAGCATTCGGGATCTCTTGCTGGGTGCGGt  <  1:223297/39‑1 (MQ=255) tCATCGTCTCAGCATTCGGGATCTCTTGCTGGGTGCGGt  <  1:203685/39‑1 (MQ=255) tCATCGTCTCAGCATTCGGGATCTCTTGCTGGGTGCGGt  <  1:196738/39‑1 (MQ=255) tCATCGTCTCAGCATTCGGGATCTCTTGCTGGGTGCGGt  <  1:172442/39‑1 (MQ=255) tCATCGTCTCAGCATTCGGGATCTCTTGCTGGGTGCGGt  <  1:1632326/39‑1 (MQ=255) tCATCGTCTCAGCATTCGGGATCTCTTGCTGGGTGCGGt  <  1:1624431/39‑1 (MQ=255) tCATCGTCTCAGCATTCGGGATCTCTTGCTGGGTGCGGt  <  1:1498313/39‑1 (MQ=255) tCATCGTCTCAGCATTCGGGATCTCTTGCTGGGTGCGGt  <  1:1399802/39‑1 (MQ=255) tCATCGTCTCAGCATTCGGGATCTCTTGCTGGGTGCGGt  <  1:1364910/39‑1 (MQ=255) tCATCGTCTCAGCATTCGGGATCTCTTGCTGGGTGCGGt  <  1:1211724/39‑1 (MQ=255) tCATCGTCTCAGCATTCGGGATCTCTTGCTGGGTGCGGt  <  1:1178569/39‑1 (MQ=255) tCATCGTCTCAGCATTCGGGATCTCTTGCTGGGTGCGGt  <  1:114253/39‑1 (MQ=255) |                                       TCATCGTCTCAGCATTCGGGATCTCTTGCTGGGTGCGGT  >  W3110S.gb/3619548‑3619586

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑