Missing coverage evidence...
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*	*	÷	W3110S.gb	3716702	3717576	875	23 [0]	[0] 42	[atpH]–[atpA]	[atpH],[atpA]

ACCGCGGTGAAGATGCGCTGATCATTTACGATGACCTGTCTAAACAGGCTGTTGCTTACCGT  >  W3110S.gb/3717577‑3717638 |                                                              aCCGCGGTGAATATGCGCTGATCATTTACGATGACCTGTCTAAACAGGCTGTTGCTTACCGt  <  1:225128/62‑1 (MQ=255) aCCGCGGTGAAGATGCGCTGATCATTTTCGATGACCTGTCTAAACAGGCTGTTGCTTACCGt  <  1:916547/62‑1 (MQ=255) aCCGCGGTGAAGATGCGCTGATCATTTACGATGACCTGTCTAAACAGGCTGTTGCTTACCGt  <  1:757531/62‑1 (MQ=255) aCCGCGGTGAAGATGCGCTGATCATTTACGATGACCTGTCTAAACAGGCTGTTGCTTACCGt  <  1:377999/62‑1 (MQ=255) aCCGCGGTGAAGATGCGCTGATCATTTACGATGACCTGTCTAAACAGGCTGTTGCTTACCGt  <  1:469525/62‑1 (MQ=255) aCCGCGGTGAAGATGCGCTGATCATTTACGATGACCTGTCTAAACAGGCTGTTGCTTACCGt  <  1:476000/62‑1 (MQ=255) aCCGCGGTGAAGATGCGCTGATCATTTACGATGACCTGTCTAAACAGGCTGTTGCTTACCGt  <  1:550508/62‑1 (MQ=255) aCCGCGGTGAAGATGCGCTGATCATTTACGATGACCTGTCTAAACAGGCTGTTGCTTACCGt  <  1:582194/62‑1 (MQ=255) aCCGCGGTGAAGATGCGCTGATCATTTACGATGACCTGTCTAAACAGGCTGTTGCTTACCGt  <  1:605156/62‑1 (MQ=255) aCCGCGGTGAAGATGCGCTGATCATTTACGATGACCTGTCTAAACAGGCTGTTGCTTACCGt  <  1:621293/62‑1 (MQ=255) aCCGCGGTGAAGATGCGCTGATCATTTACGATGACCTGTCTAAACAGGCTGTTGCTTACCGt  <  1:621554/62‑1 (MQ=255) aCCGCGGTGAAGATGCGCTGATCATTTACGATGACCTGTCTAAACAGGCTGTTGCTTACCGt  <  1:71059/62‑1 (MQ=255) aCCGCGGTGAAGATGCGCTGATCATTTACGATGACCTGTCTAAACAGGCTGTTGCTTACCGt  <  1:355654/62‑1 (MQ=255) aCCGCGGTGAAGATGCGCTGATCATTTACGATGACCTGTCTAAACAGGCTGTTGCTTACCGt  <  1:786197/62‑1 (MQ=255) aCCGCGGTGAAGATGCGCTGATCATTTACGATGACCTGTCTAAACAGGCTGTTGCTTACCGt  <  1:799162/62‑1 (MQ=255) aCCGCGGTGAAGATGCGCTGATCATTTACGATGACCTGTCTAAACAGGCTGTTGCTTACCGt  <  1:822211/62‑1 (MQ=255) aCCGCGGTGAAGATGCGCTGATCATTTACGATGACCTGTCTAAACAGGCTGTTGCTTACCGt  <  1:828464/62‑1 (MQ=255) aCCGCGGTGAAGATGCGCTGATCATTTACGATGACCTGTCTAAACAGGCTGTTGCTTACCGt  <  1:837729/62‑1 (MQ=255) aCCGCGGTGAAGATGCGCTGATCATTTACGATGACCTGTCTAAACAGGCTGTTGCTTACCGt  <  1:844837/62‑1 (MQ=255) aCCGCGGTGAAGATGCGCTGATCATTTACGATGACCTGTCTAAACAGGCTGTTGCTTACCGt  <  1:892801/62‑1 (MQ=255) aCCGCGGTGAAGATGCGCTGATCATTTACGATGACCTGTCTAAACAGGCTGTTGCTTACCGt  <  1:894086/62‑1 (MQ=255) aCCGCGGTGAAGATGCGCTGATCATTTACGATGACCTGTCTAAACAGGCTGTTGCTTACCGt  <  1:918280/62‑1 (MQ=255) aCCGCGGTGAAGATGCGCTGATCATTTACGATGACCTGTCTAAACAGGCTGTTGCTTACCGt  <  1:1280893/62‑1 (MQ=255) aCCGCGGTGAAGATGCGCTGATCATTTACGATGACCTGTCTAAACAGGCTGTTGCTTACCGt  <  1:1015490/62‑1 (MQ=255) aCCGCGGTGAAGATGCGCTGATCATTTACGATGACCTGTCTAAACAGGCTGTTGCTTACCGt  <  1:101574/62‑1 (MQ=255) aCCGCGGTGAAGATGCGCTGATCATTTACGATGACCTGTCTAAACAGGCTGTTGCTTACCGt  <  1:1017070/62‑1 (MQ=255) aCCGCGGTGAAGATGCGCTGATCATTTACGATGACCTGTCTAAACAGGCTGTTGCTTACCGt  <  1:1039595/62‑1 (MQ=255) aCCGCGGTGAAGATGCGCTGATCATTTACGATGACCTGTCTAAACAGGCTGTTGCTTACCGt  <  1:1212001/62‑1 (MQ=255) aCCGCGGTGAAGATGCGCTGATCATTTACGATGACCTGTCTAAACAGGCTGTTGCTTACCGt  <  1:12334/62‑1 (MQ=255) aCCGCGGTGAAGATGCGCTGATCATTTACGATGACCTGTCTAAACAGGCTGTTGCTTACCGt  <  1:1235766/62‑1 (MQ=255) aCCGCGGTGAAGATGCGCTGATCATTTACGATGACCTGTCTAAACAGGCTGTTGCTTACCGt  <  1:1236362/62‑1 (MQ=255) aCCGCGGTGAAGATGCGCTGATCATTTACGATGACCTGTCTAAACAGGCTGTTGCTTACCGt  <  1:1247682/62‑1 (MQ=255) aCCGCGGTGAAGATGCGCTGATCATTTACGATGACCTGTCTAAACAGGCTGTTGCTTACCGt  <  1:1004700/62‑1 (MQ=255) aCCGCGGTGAAGATGCGCTGATCATTTACGATGACCTGTCTAAACAGGCTGTTGCTTACCGt  <  1:1361223/62‑1 (MQ=255) aCCGCGGTGAAGATGCGCTGATCATTTACGATGACCTGTCTAAACAGGCTGTTGCTTACCGt  <  1:1410060/62‑1 (MQ=255) aCCGCGGTGAAGATGCGCTGATCATTTACGATGACCTGTCTAAACAGGCTGTTGCTTACCGt  <  1:1431120/62‑1 (MQ=255) aCCGCGGTGAAGATGCGCTGATCATTTACGATGACCTGTCTAAACAGGCTGTTGCTTACCGt  <  1:1555897/62‑1 (MQ=255) aCCGCGGTGAAGATGCGCTGATCATTTACGATGACCTGTCTAAACAGGCTGTTGCTTACCGt  <  1:156098/62‑1 (MQ=255) aCCGCGGTGAAGATGCGCTGATCATTTACGATGACCTGTCTAAACAGGCTGTTGCTTACCGt  <  1:15818/62‑1 (MQ=255) aCCGCGGTGAAGATGCGCTGATCATTTACGATGACCTGTCTAAACAGGCTGTTGCTTACCGt  <  1:1596602/62‑1 (MQ=255) aCCGCGGTGAAGATGCGCTGATCATTTACGATGACCTGTCTAAACAGGCTGTTGCTTACCGt  <  1:1608894/62‑1 (MQ=255) aCCGCGGTGAAGATGCGCTGATCATTTACGATGACCTGTCTAAACAGGCTGTTGCTTACCGt  <  1:1617832/62‑1 (MQ=255) |                                                              ACCGCGGTGAAGATGCGCTGATCATTTACGATGACCTGTCTAAACAGGCTGTTGCTTACCGT  >  W3110S.gb/3717577‑3717638

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑