Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3836505	3837385	881	106 [0]	[0] 17	[rfaB]–[rfaI]	[rfaB],[rfaI]

GAGTTTCTTAATTCAGTTATTGATTATGATCATAAAGTAGAAACAGAAAATCTTTGTCTGGA  >  W3110S.gb/3837386‑3837447 |                                                              gAGTTTGTTAATTCAGTTATTGATTATGATGATAAAGTAGAAACAGAAAATCTTTGTCTGGa  <  1:151801/62‑1 (MQ=255) gAGTTTCTTAATTCAGTTATTGATTATGATCATAAAGTAGAAACAGAAAATCTTTGTCTGGa  <  1:1375173/62‑1 (MQ=255) gAGTTTCTTAATTCAGTTATTGATTATGATCATAAAGTAGAAACAGAAAATCTTTGTCTGGa  <  1:90465/62‑1 (MQ=255) gAGTTTCTTAATTCAGTTATTGATTATGATCATAAAGTAGAAACAGAAAATCTTTGTCTGGa  <  1:904487/62‑1 (MQ=255) gAGTTTCTTAATTCAGTTATTGATTATGATCATAAAGTAGAAACAGAAAATCTTTGTCTGGa  <  1:884883/62‑1 (MQ=255) gAGTTTCTTAATTCAGTTATTGATTATGATCATAAAGTAGAAACAGAAAATCTTTGTCTGGa  <  1:348004/62‑1 (MQ=255) gAGTTTCTTAATTCAGTTATTGATTATGATCATAAAGTAGAAACAGAAAATCTTTGTCTGGa  <  1:335120/62‑1 (MQ=255) gAGTTTCTTAATTCAGTTATTGATTATGATCATAAAGTAGAAACAGAAAATCTTTGTCTGGa  <  1:1561648/62‑1 (MQ=255) gAGTTTCTTAATTCAGTTATTGATTATGATCATAAAGTAGAAACAGAAAATCTTTGTCTGGa  <  1:1552193/62‑1 (MQ=255) gAGTTTCTTAATTCAGTTATTGATTATGATCATAAAGTAGAAACAGAAAATCTTTGTCTGGa  <  1:1028640/62‑1 (MQ=255) gAGTTTCTTAATTCAGTTATTGATTATGATCATAAAGTAGAAACAGAAAATCTTTGTCTGGa  <  1:1371357/62‑1 (MQ=255) gAGTTTCTTAATTCAGTTATTGATTATGATCATAAAGTAGAAACAGAAAATCTTTGTCTGGa  <  1:1369441/62‑1 (MQ=255) gAGTTTCTTAATTCAGTTATTGATTATGATCATAAAGTAGAAACAGAAAATCTTTGTCTGGa  <  1:1360484/62‑1 (MQ=255) gAGTTTCTTAATTCAGTTATTGATTATGATCATAAAGTAGAAACAGAAAATCTTTGTCTGGa  <  1:1346398/62‑1 (MQ=255) gAGTTTCTTAATTCAGTTATTGATTATGATCATAAAGTAGAAACAGAAAATCTTTGTCTGGa  <  1:1343380/62‑1 (MQ=255) gAGTTTCTTAATTCAGTTATTGATTATGATCATAAAGTAGAAACAGAAAATCTTTGTCTGGa  <  1:1296122/62‑1 (MQ=255) gAGTTTCTTAATTCAGTTATTGATTATGATCATAAAGTAGAAACAGAAAATCTTTGTCTGGa  <  1:1079676/62‑1 (MQ=255) |                                                              GAGTTTCTTAATTCAGTTATTGATTATGATCATAAAGTAGAAACAGAAAATCTTTGTCTGGA  >  W3110S.gb/3837386‑3837447

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑