Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3839399	3839417	19	21 [0]	[0] 26	rfaJ	UDP‑D‑glucose:(galactosyl)lipopolysaccharide glucosyltransferase

AATATTACCGTAAATAACATTTAACTGGTTTATTATGATTCAGAAGAGCAAGATCAAAGACT  >  W3110S.gb/3839418‑3839479 |                                                              aaTATTACCGTAAATAACATTTAACTGGTTTATTATGATTCAGAAGAGCAAGATc         >  1:1385752/1‑55 (MQ=255) aaTATTACCGTAAATAACATTTAACTGGTTTATTATGATTCAGAAGAGCAAGATCAAAGCCt  >  1:1543684/1‑62 (MQ=255) aaTATTACCGTAAATAACATTTAACTGGTTTATTATGATTCAGAAGAGCAAGATCAAAGACt  >  1:270757/1‑62 (MQ=255) aaTATTACCGTAAATAACATTTAACTGGTTTATTATGATTCAGAAGAGCAAGATCAAAGACt  >  1:974325/1‑62 (MQ=255) aaTATTACCGTAAATAACATTTAACTGGTTTATTATGATTCAGAAGAGCAAGATCAAAGACt  >  1:959192/1‑62 (MQ=255) aaTATTACCGTAAATAACATTTAACTGGTTTATTATGATTCAGAAGAGCAAGATCAAAGACt  >  1:932347/1‑62 (MQ=255) aaTATTACCGTAAATAACATTTAACTGGTTTATTATGATTCAGAAGAGCAAGATCAAAGACt  >  1:822469/1‑62 (MQ=255) aaTATTACCGTAAATAACATTTAACTGGTTTATTATGATTCAGAAGAGCAAGATCAAAGACt  >  1:766878/1‑62 (MQ=255) aaTATTACCGTAAATAACATTTAACTGGTTTATTATGATTCAGAAGAGCAAGATCAAAGACt  >  1:751064/1‑62 (MQ=255) aaTATTACCGTAAATAACATTTAACTGGTTTATTATGATTCAGAAGAGCAAGATCAAAGACt  >  1:584165/1‑62 (MQ=255) aaTATTACCGTAAATAACATTTAACTGGTTTATTATGATTCAGAAGAGCAAGATCAAAGACt  >  1:485448/1‑62 (MQ=255) aaTATTACCGTAAATAACATTTAACTGGTTTATTATGATTCAGAAGAGCAAGATCAAAGACt  >  1:484141/1‑62 (MQ=255) aaTATTACCGTAAATAACATTTAACTGGTTTATTATGATTCAGAAGAGCAAGATCAAAGACt  >  1:402798/1‑62 (MQ=255) aaTATTACCGTAAATAACATTTAACTGGTTTATTATGATTCAGAAGAGCAAGATCAAAGACt  >  1:360452/1‑62 (MQ=255) aaTATTACCGTAAATAACATTTAACTGGTTTATTATGATTCAGAAGAGCAAGATCAAAGACt  >  1:320240/1‑62 (MQ=255) aaTATTACCGTAAATAACATTTAACTGGTTTATTATGATTCAGAAGAGCAAGATCAAAGACt  >  1:1112603/1‑62 (MQ=255) aaTATTACCGTAAATAACATTTAACTGGTTTATTATGATTCAGAAGAGCAAGATCAAAGACt  >  1:270551/1‑62 (MQ=255) aaTATTACCGTAAATAACATTTAACTGGTTTATTATGATTCAGAAGAGCAAGATCAAAGACt  >  1:267461/1‑62 (MQ=255) aaTATTACCGTAAATAACATTTAACTGGTTTATTATGATTCAGAAGAGCAAGATCAAAGACt  >  1:183686/1‑62 (MQ=255) aaTATTACCGTAAATAACATTTAACTGGTTTATTATGATTCAGAAGAGCAAGATCAAAGACt  >  1:160220/1‑62 (MQ=255) aaTATTACCGTAAATAACATTTAACTGGTTTATTATGATTCAGAAGAGCAAGATCAAAGACt  >  1:1592285/1‑62 (MQ=255) aaTATTACCGTAAATAACATTTAACTGGTTTATTATGATTCAGAAGAGCAAGATCAAAGACt  >  1:1367530/1‑62 (MQ=255) aaTATTACCGTAAATAACATTTAACTGGTTTATTATGATTCAGAAGAGCAAGATCAAAGACt  >  1:1326670/1‑62 (MQ=255) aaTATTACCGTAAATAACATTTAACTGGTTTATTATGATTCAGAAGAGCAAGATCAAAGACt  >  1:1272240/1‑62 (MQ=255) aaTATTACCGTAAATAACATTTAACTGGTTTATTATGATTCAGAAGAGCAAGATCAAAGACt  >  1:1195841/1‑62 (MQ=255) aaTATTACCGTAAATAACATTTAACTGGTTTATTATGATTCAGAAGAGCAAGATCAAAGACt  >  1:1154100/1‑62 (MQ=255) |                                                              AATATTACCGTAAATAACATTTAACTGGTTTATTATGATTCAGAAGAGCAAGATCAAAGACT  >  W3110S.gb/3839418‑3839479

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑