Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3863100	3863100	1	74 [0]	[0] 100	lldP/yibL	L‑lactate permease/conserved hypothetical protein

GCCAATTGTGTTGTGTAGGGATAATGACAATGAATGGTTAACTAAA  >  W3110S.gb/3863101‑3863146 |                                              gCCAATTGTGTTGTGTAGGGATAATGACTATGAATGGTTAACTaaa  <  1:719426/46‑1 (MQ=255) gCCAATTGTGTTGTGTAGGGATAATGACAATGAATGGTTAACaaaa  <  1:878162/46‑1 (MQ=255) gCCAATTGTGTTGTGTAGGGATAATGACAATGAATGGTTAACTaaa  <  1:431441/46‑1 (MQ=255) gCCAATTGTGTTGTGTAGGGATAATGACAATGAATGGTTAACTaaa  <  1:676880/46‑1 (MQ=255) gCCAATTGTGTTGTGTAGGGATAATGACAATGAATGGTTAACTaaa  <  1:620708/46‑1 (MQ=255) gCCAATTGTGTTGTGTAGGGATAATGACAATGAATGGTTAACTaaa  <  1:587132/46‑1 (MQ=255) gCCAATTGTGTTGTGTAGGGATAATGACAATGAATGGTTAACTaaa  <  1:579273/46‑1 (MQ=255) gCCAATTGTGTTGTGTAGGGATAATGACAATGAATGGTTAACTaaa  <  1:491845/46‑1 (MQ=255) gCCAATTGTGTTGTGTAGGGATAATGACAATGAATGGTTAACTaaa  <  1:491060/46‑1 (MQ=255) gCCAATTGTGTTGTGTAGGGATAATGACAATGAATGGTTAACTaaa  <  1:487674/46‑1 (MQ=255) gCCAATTGTGTTGTGTAGGGATAATGACAATGAATGGTTAACTaaa  <  1:480041/46‑1 (MQ=255) gCCAATTGTGTTGTGTAGGGATAATGACAATGAATGGTTAACTaaa  <  1:479495/46‑1 (MQ=255) gCCAATTGTGTTGTGTAGGGATAATGACAATGAATGGTTAACTaaa  <  1:465210/46‑1 (MQ=255) gCCAATTGTGTTGTGTAGGGATAATGACAATGAATGGTTAACTaaa  <  1:442655/46‑1 (MQ=255) gCCAATTGTGTTGTGTAGGGATAATGACAATGAATGGTTAACTaaa  <  1:70195/46‑1 (MQ=255) gCCAATTGTGTTGTGTAGGGATAATGACAATGAATGGTTAACTaaa  <  1:422082/46‑1 (MQ=255) gCCAATTGTGTTGTGTAGGGATAATGACAATGAATGGTTAACTaaa  <  1:421575/46‑1 (MQ=255) gCCAATTGTGTTGTGTAGGGATAATGACAATGAATGGTTAACTaaa  <  1:414763/46‑1 (MQ=255) gCCAATTGTGTTGTGTAGGGATAATGACAATGAATGGTTAACTaaa  <  1:414035/46‑1 (MQ=255) gCCAATTGTGTTGTGTAGGGATAATGACAATGAATGGTTAACTaaa  <  1:410025/46‑1 (MQ=255) gCCAATTGTGTTGTGTAGGGATAATGACAATGAATGGTTAACTaaa  <  1:398999/46‑1 (MQ=255) gCCAATTGTGTTGTGTAGGGATAATGACAATGAATGGTTAACTaaa  <  1:398497/46‑1 (MQ=255) gCCAATTGTGTTGTGTAGGGATAATGACAATGAATGGTTAACTaaa  <  1:358828/46‑1 (MQ=255) gCCAATTGTGTTGTGTAGGGATAATGACAATGAATGGTTAACTaaa  <  1:355548/46‑1 (MQ=255) gCCAATTGTGTTGTGTAGGGATAATGACAATGAATGGTTAACTaaa  <  1:349879/46‑1 (MQ=255) gCCAATTGTGTTGTGTAGGGATAATGACAATGAATGGTTAACTaaa  <  1:1008216/46‑1 (MQ=255) gCCAATTGTGTTGTGTAGGGATAATGACAATGAATGGTTAACTaaa  <  1:827111/46‑1 (MQ=255) gCCAATTGTGTTGTGTAGGGATAATGACAATGAATGGTTAACTaaa  <  1:986113/46‑1 (MQ=255) gCCAATTGTGTTGTGTAGGGATAATGACAATGAATGGTTAACTaaa  <  1:976752/46‑1 (MQ=255) gCCAATTGTGTTGTGTAGGGATAATGACAATGAATGGTTAACTaaa  <  1:967434/46‑1 (MQ=255) gCCAATTGTGTTGTGTAGGGATAATGACAATGAATGGTTAACTaaa  <  1:967059/46‑1 (MQ=255) gCCAATTGTGTTGTGTAGGGATAATGACAATGAATGGTTAACTaaa  <  1:950043/46‑1 (MQ=255) gCCAATTGTGTTGTGTAGGGATAATGACAATGAATGGTTAACTaaa  <  1:949779/46‑1 (MQ=255) gCCAATTGTGTTGTGTAGGGATAATGACAATGAATGGTTAACTaaa  <  1:912559/46‑1 (MQ=255) gCCAATTGTGTTGTGTAGGGATAATGACAATGAATGGTTAACTaaa  <  1:908754/46‑1 (MQ=255) gCCAATTGTGTTGTGTAGGGATAATGACAATGAATGGTTAACTaaa  <  1:896806/46‑1 (MQ=255) gCCAATTGTGTTGTGTAGGGATAATGACAATGAATGGTTAACTaaa  <  1:885441/46‑1 (MQ=255) gCCAATTGTGTTGTGTAGGGATAATGACAATGAATGGTTAACTaaa  <  1:869724/46‑1 (MQ=255) gCCAATTGTGTTGTGTAGGGATAATGACAATGAATGGTTAACTaaa  <  1:682361/46‑1 (MQ=255) gCCAATTGTGTTGTGTAGGGATAATGACAATGAATGGTTAACTaaa  <  1:809693/46‑1 (MQ=255) gCCAATTGTGTTGTGTAGGGATAATGACAATGAATGGTTAACTaaa  <  1:794717/46‑1 (MQ=255) gCCAATTGTGTTGTGTAGGGATAATGACAATGAATGGTTAACTaaa  <  1:791199/46‑1 (MQ=255) gCCAATTGTGTTGTGTAGGGATAATGACAATGAATGGTTAACTaaa  <  1:787105/46‑1 (MQ=255) gCCAATTGTGTTGTGTAGGGATAATGACAATGAATGGTTAACTaaa  <  1:779644/46‑1 (MQ=255) gCCAATTGTGTTGTGTAGGGATAATGACAATGAATGGTTAACTaaa  <  1:778618/46‑1 (MQ=255) gCCAATTGTGTTGTGTAGGGATAATGACAATGAATGGTTAACTaaa  <  1:774812/46‑1 (MQ=255) gCCAATTGTGTTGTGTAGGGATAATGACAATGAATGGTTAACTaaa  <  1:762474/46‑1 (MQ=255) gCCAATTGTGTTGTGTAGGGATAATGACAATGAATGGTTAACTaaa  <  1:745394/46‑1 (MQ=255) gCCAATTGTGTTGTGTAGGGATAATGACAATGAATGGTTAACTaaa  <  1:722662/46‑1 (MQ=255) gCCAATTGTGTTGTGTAGGGATAATGACAATGAATGGTTAACTaaa  <  1:316680/46‑1 (MQ=255) gCCAATTGTGTTGTGTAGGGATAATGACAATGAATGGTTAACTaaa  <  1:1217271/46‑1 (MQ=255) gCCAATTGTGTTGTGTAGGGATAATGACAATGAATGGTTAACTaaa  <  1:297217/46‑1 (MQ=255) gCCAATTGTGTTGTGTAGGGATAATGACAATGAATGGTTAACTaaa  <  1:1390073/46‑1 (MQ=255) gCCAATTGTGTTGTGTAGGGATAATGACAATGAATGGTTAACTaaa  <  1:1368045/46‑1 (MQ=255) gCCAATTGTGTTGTGTAGGGATAATGACAATGAATGGTTAACTaaa  <  1:1357513/46‑1 (MQ=255) gCCAATTGTGTTGTGTAGGGATAATGACAATGAATGGTTAACTaaa  <  1:1334361/46‑1 (MQ=255) gCCAATTGTGTTGTGTAGGGATAATGACAATGAATGGTTAACTaaa  <  1:1327509/46‑1 (MQ=255) gCCAATTGTGTTGTGTAGGGATAATGACAATGAATGGTTAACTaaa  <  1:1310363/46‑1 (MQ=255) gCCAATTGTGTTGTGTAGGGATAATGACAATGAATGGTTAACTaaa  <  1:1308655/46‑1 (MQ=255) gCCAATTGTGTTGTGTAGGGATAATGACAATGAATGGTTAACTaaa  <  1:12667/46‑1 (MQ=255) gCCAATTGTGTTGTGTAGGGATAATGACAATGAATGGTTAACTaaa  <  1:1240162/46‑1 (MQ=255) gCCAATTGTGTTGTGTAGGGATAATGACAATGAATGGTTAACTaaa  <  1:1230218/46‑1 (MQ=255) gCCAATTGTGTTGTGTAGGGATAATGACAATGAATGGTTAACTaaa  <  1:1477490/46‑1 (MQ=255) gCCAATTGTGTTGTGTAGGGATAATGACAATGAATGGTTAACTaaa  <  1:1209895/46‑1 (MQ=255) gCCAATTGTGTTGTGTAGGGATAATGACAATGAATGGTTAACTaaa  <  1:1184147/46‑1 (MQ=255) gCCAATTGTGTTGTGTAGGGATAATGACAATGAATGGTTAACTaaa  <  1:1179546/46‑1 (MQ=255) gCCAATTGTGTTGTGTAGGGATAATGACAATGAATGGTTAACTaaa  <  1:1144206/46‑1 (MQ=255) gCCAATTGTGTTGTGTAGGGATAATGACAATGAATGGTTAACTaaa  <  1:1129106/46‑1 (MQ=255) gCCAATTGTGTTGTGTAGGGATAATGACAATGAATGGTTAACTaaa  <  1:110548/46‑1 (MQ=255) gCCAATTGTGTTGTGTAGGGATAATGACAATGAATGGTTAACTaaa  <  1:1059248/46‑1 (MQ=255) gCCAATTGTGTTGTGTAGGGATAATGACAATGAATGGTTAACTaaa  <  1:1056065/46‑1 (MQ=255) gCCAATTGTGTTGTGTAGGGATAATGACAATGAATGGTTAACTaaa  <  1:105594/46‑1 (MQ=255) gCCAATTGTGTTGTGTAGGGATAATGACAATGAATGGTTAACTaaa  <  1:1026089/46‑1 (MQ=255) gCCAATTGTGTTGTGTAGGGATAATGACAATGAATGGTTAACTaaa  <  1:1611172/46‑1 (MQ=255) gCCAATTGTGTTGTGTAGGGATAATGACAATGAATGGTTAACTaaa  <  1:295268/46‑1 (MQ=255) gCCAATTGTGTTGTGTAGGGATAATGACAATGAATGGTTAACTaaa  <  1:28664/46‑1 (MQ=255) gCCAATTGTGTTGTGTAGGGATAATGACAATGAATGGTTAACTaaa  <  1:281863/46‑1 (MQ=255) gCCAATTGTGTTGTGTAGGGATAATGACAATGAATGGTTAACTaaa  <  1:278245/46‑1 (MQ=255) gCCAATTGTGTTGTGTAGGGATAATGACAATGAATGGTTAACTaaa  <  1:240690/46‑1 (MQ=255) gCCAATTGTGTTGTGTAGGGATAATGACAATGAATGGTTAACTaaa  <  1:226771/46‑1 (MQ=255) gCCAATTGTGTTGTGTAGGGATAATGACAATGAATGGTTAACTaaa  <  1:209710/46‑1 (MQ=255) gCCAATTGTGTTGTGTAGGGATAATGACAATGAATGGTTAACTaaa  <  1:206459/46‑1 (MQ=255) gCCAATTGTGTTGTGTAGGGATAATGACAATGAATGGTTAACTaaa  <  1:206214/46‑1 (MQ=255) gCCAATTGTGTTGTGTAGGGATAATGACAATGAATGGTTAACTaaa  <  1:167007/46‑1 (MQ=255) gCCAATTGTGTTGTGTAGGGATAATGACAATGAATGGTTAACTaaa  <  1:1631534/46‑1 (MQ=255) gCCAATTGTGTTGTGTAGGGATAATGACAATGAATGGTTAACTaaa  <  1:1618527/46‑1 (MQ=255) gCCAATTGTGTTGTGTAGGGATAATGACAATGAATGGTTAACTaaa  <  1:1506347/46‑1 (MQ=255) gCCAATTGTGTTGTGTAGGGATAATGACAATGAATGGTTAACTaaa  <  1:1606499/46‑1 (MQ=255) gCCAATTGTGTTGTGTAGGGATAATGACAATGAATGGTTAACTaaa  <  1:1604186/46‑1 (MQ=255) gCCAATTGTGTTGTGTAGGGATAATGACAATGAATGGTTAACTaaa  <  1:1603105/46‑1 (MQ=255) gCCAATTGTGTTGTGTAGGGATAATGACAATGAATGGTTAACTaaa  <  1:1593773/46‑1 (MQ=255) gCCAATTGTGTTGTGTAGGGATAATGACAATGAATGGTTAACTaaa  <  1:1545428/46‑1 (MQ=255) gCCAATTGTGTTGTGTAGGGATAATGACAATGAATGGTTAACTaaa  <  1:1539897/46‑1 (MQ=255) gCCAATTGTGTTGTGTAGGGATAATGACAATGAATGGTTAACTaaa  <  1:1537035/46‑1 (MQ=255) gCCAATTGTGTTGTGTAGGGATAATGACAATGAATGGTTAACTaaa  <  1:1513792/46‑1 (MQ=255) gCCAATTGTGTTGTGTAGGGATAATGACAATGAATGGTTAACTaaa  <  1:1508912/46‑1 (MQ=255) gCCAATTGTGTTGTGTAGGGATAATGACAATGAATGGGTAACTaaa  <  1:1249835/46‑1 (MQ=255) gCCAATTGTGTTCTGTAGGGATAATGACAATGAATGGTTAACTaaa  <  1:1496585/46‑1 (MQ=255) gCCAATTGTGTAGTGTAGGGATAATGACAATGAATGGTTAACTaaa  <  1:1209122/46‑1 (MQ=255) gCCAATAGTGTTGTGTAGGGATAATGACAATGAATGGTTAACTaaa  <  1:735103/46‑1 (MQ=255) |                                              GCCAATTGTGTTGTGTAGGGATAATGACAATGAATGGTTAACTAAA  >  W3110S.gb/3863101‑3863146

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑