Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3868222	3868243	22	69 [0]	[5] 74	mtlA/yibI	fused mannitol‑specific PTS enzyme IIABC components/predicted inner membrane protein

GCGAAATCTGGCACTGAATCGGTTAACTGTCCAGTCGACGGCCTTTTGTGTGATATCAATC  >  W3110S.gb/3868232‑3868292             |                                                 gCGAAATCTGGCACTGAATCGGTTAACTGTCCAGTCGACGGCCTTTTGTGTGATatcaatc  <  1:925215/61‑1 (MQ=255) gCGAAATCTGGCACTGAATCGGTTAACTGTCCAGTCGACGGCCTTTTGTGTGATatcaatc  <  1:70463/61‑1 (MQ=255) gCGAAATCTGGCACTGAATCGGTTAACTGTCCAGTCGACGGCCTTTTGTGTGATatcaatc  <  1:186538/61‑1 (MQ=255) gCGAAATCTGGCACTGAATCGGGTAACTGTCCAGTCGACGGCCTTTTGTGTGATatcaatc  <  1:1447886/61‑1 (MQ=255) gCGAAATCTGGAACTGAATCGGTTAACTGTCCAGTCGACGGCCTTTTGTGTGATatcaatc  <  1:256253/61‑1 (MQ=255)             aCTGAATCTGTTAACTGTCCAGTCGACGGCCTTTTGTGTGATatcaatc  <  1:64173/49‑1 (MQ=255)             aCTGAATCTGTTAACTGTCCAGTCGACGGCCTTTTGTGTGATatcaatc  <  1:1168863/49‑1 (MQ=255)             aCTGAATCGGTTAACTGTCCAGTCTACGGCCTTTTGTGTGATatcaatc  <  1:217820/49‑1 (MQ=255)             aCTGAATCGGTTAACTGTCCAGTCGACGGCCTTTTGTGTGATatcaatc  <  1:413376/49‑1 (MQ=255)             aCTGAATCGGTTAACTGTCCAGTCGACGGCCTTTTGTGTGATatcaatc  <  1:523979/49‑1 (MQ=255)             aCTGAATCGGTTAACTGTCCAGTCGACGGCCTTTTGTGTGATatcaatc  <  1:51994/49‑1 (MQ=255)             aCTGAATCGGTTAACTGTCCAGTCGACGGCCTTTTGTGTGATatcaatc  <  1:514690/49‑1 (MQ=255)             aCTGAATCGGTTAACTGTCCAGTCGACGGCCTTTTGTGTGATatcaatc  <  1:472823/49‑1 (MQ=255)             aCTGAATCGGTTAACTGTCCAGTCGACGGCCTTTTGTGTGATatcaatc  <  1:464684/49‑1 (MQ=255)             aCTGAATCGGTTAACTGTCCAGTCGACGGCCTTTTGTGTGATatcaatc  <  1:433335/49‑1 (MQ=255)             aCTGAATCGGTTAACTGTCCAGTCGACGGCCTTTTGTGTGATatcaatc  <  1:424772/49‑1 (MQ=255)             aCTGAATCGGTTAACTGTCCAGTCGACGGCCTTTTGTGTGATatcaatc  <  1:662962/49‑1 (MQ=255)             aCTGAATCGGTTAACTGTCCAGTCGACGGCCTTTTGTGTGATatcaatc  <  1:40835/49‑1 (MQ=255)             aCTGAATCGGTTAACTGTCCAGTCGACGGCCTTTTGTGTGATatcaatc  <  1:381146/49‑1 (MQ=255)             aCTGAATCGGTTAACTGTCCAGTCGACGGCCTTTTGTGTGATatcaatc  <  1:378778/49‑1 (MQ=255)             aCTGAATCGGTTAACTGTCCAGTCGACGGCCTTTTGTGTGATatcaatc  <  1:377878/49‑1 (MQ=255)             aCTGAATCGGTTAACTGTCCAGTCGACGGCCTTTTGTGTGATatcaatc  <  1:3371/49‑1 (MQ=255)             aCTGAATCGGTTAACTGTCCAGTCGACGGCCTTTTGTGTGATatcaatc  <  1:310874/49‑1 (MQ=255)             aCTGAATCGGTTAACTGTCCAGTCGACGGCCTTTTGTGTGATatcaatc  <  1:765510/49‑1 (MQ=255)             aCTGAATCGGTTAACTGTCCAGTCGACGGCCTTTTGTGTGATatcaatc  <  1:972521/49‑1 (MQ=255)             aCTGAATCGGTTAACTGTCCAGTCGACGGCCTTTTGTGTGATatcaatc  <  1:930929/49‑1 (MQ=255)             aCTGAATCGGTTAACTGTCCAGTCGACGGCCTTTTGTGTGATatcaatc  <  1:91987/49‑1 (MQ=255)             aCTGAATCGGTTAACTGTCCAGTCGACGGCCTTTTGTGTGATatcaatc  <  1:896339/49‑1 (MQ=255)             aCTGAATCGGTTAACTGTCCAGTCGACGGCCTTTTGTGTGATatcaatc  <  1:872557/49‑1 (MQ=255)             aCTGAATCGGTTAACTGTCCAGTCGACGGCCTTTTGTGTGATatcaatc  <  1:814724/49‑1 (MQ=255)             aCTGAATCGGTTAACTGTCCAGTCGACGGCCTTTTGTGTGATatcaatc  <  1:806659/49‑1 (MQ=255)             aCTGAATCGGTTAACTGTCCAGTCGACGGCCTTTTGTGTGATatcaatc  <  1:771645/49‑1 (MQ=255)             aCTGAATCGGTTAACTGTCCAGTCGACGGCCTTTTGTGTGATatcaatc  <  1:537911/49‑1 (MQ=255)             aCTGAATCGGTTAACTGTCCAGTCGACGGCCTTTTGTGTGATatcaatc  <  1:760009/49‑1 (MQ=255)             aCTGAATCGGTTAACTGTCCAGTCGACGGCCTTTTGTGTGATatcaatc  <  1:756746/49‑1 (MQ=255)             aCTGAATCGGTTAACTGTCCAGTCGACGGCCTTTTGTGTGATatcaatc  <  1:72105/49‑1 (MQ=255)             aCTGAATCGGTTAACTGTCCAGTCGACGGCCTTTTGTGTGATatcaatc  <  1:714079/49‑1 (MQ=255)             aCTGAATCGGTTAACTGTCCAGTCGACGGCCTTTTGTGTGATatcaatc  <  1:705075/49‑1 (MQ=255)             aCTGAATCGGTTAACTGTCCAGTCGACGGCCTTTTGTGTGATatcaatc  <  1:703483/49‑1 (MQ=255)             aCTGAATCGGTTAACTGTCCAGTCGACGGCCTTTTGTGTGATatcaatc  <  1:277130/49‑1 (MQ=255)             aCTGAATCGGTTAACTGTCCAGTCGACGGCCTTTTGTGTGATatcaatc  <  1:1140566/49‑1 (MQ=255)             aCTGAATCGGTTAACTGTCCAGTCGACGGCCTTTTGTGTGATatcaatc  <  1:1465238/49‑1 (MQ=255)             aCTGAATCGGTTAACTGTCCAGTCGACGGCCTTTTGTGTGATatcaatc  <  1:1449092/49‑1 (MQ=255)             aCTGAATCGGTTAACTGTCCAGTCGACGGCCTTTTGTGTGATatcaatc  <  1:1428934/49‑1 (MQ=255)             aCTGAATCGGTTAACTGTCCAGTCGACGGCCTTTTGTGTGATatcaatc  <  1:1396833/49‑1 (MQ=255)             aCTGAATCGGTTAACTGTCCAGTCGACGGCCTTTTGTGTGATatcaatc  <  1:1385802/49‑1 (MQ=255)             aCTGAATCGGTTAACTGTCCAGTCGACGGCCTTTTGTGTGATatcaatc  <  1:1261596/49‑1 (MQ=255)             aCTGAATCGGTTAACTGTCCAGTCGACGGCCTTTTGTGTGATatcaatc  <  1:1250232/49‑1 (MQ=255)             aCTGAATCGGTTAACTGTCCAGTCGACGGCCTTTTGTGTGATatcaatc  <  1:1169300/49‑1 (MQ=255)             aCTGAATCGGTTAACTGTCCAGTCGACGGCCTTTTGTGTGATatcaatc  <  1:1503550/49‑1 (MQ=255)             aCTGAATCGGTTAACTGTCCAGTCGACGGCCTTTTGTGTGATatcaatc  <  1:112133/49‑1 (MQ=255)             aCTGAATCGGTTAACTGTCCAGTCGACGGCCTTTTGTGTGATatcaatc  <  1:1106556/49‑1 (MQ=255)             aCTGAATCGGTTAACTGTCCAGTCGACGGCCTTTTGTGTGATatcaatc  <  1:1087975/49‑1 (MQ=255)             aCTGAATCGGTTAACTGTCCAGTCGACGGCCTTTTGTGTGATatcaatc  <  1:1082592/49‑1 (MQ=255)             aCTGAATCGGTTAACTGTCCAGTCGACGGCCTTTTGTGTGATatcaatc  <  1:1073704/49‑1 (MQ=255)             aCTGAATCGGTTAACTGTCCAGTCGACGGCCTTTTGTGTGATatcaatc  <  1:1072281/49‑1 (MQ=255)             aCTGAATCGGTTAACTGTCCAGTCGACGGCCTTTTGTGTGATatcaatc  <  1:106571/49‑1 (MQ=255)             aCTGAATCGGTTAACTGTCCAGTCGACGGCCTTTTGTGTGATatcaatc  <  1:1507582/49‑1 (MQ=255)             aCTGAATCGGTTAACTGTCCAGTCGACGGCCTTTTGTGTGATatcaatc  <  1:288341/49‑1 (MQ=255)             aCTGAATCGGTTAACTGTCCAGTCGACGGCCTTTTGTGTGATatcaatc  <  1:1006350/49‑1 (MQ=255)             aCTGAATCGGTTAACTGTCCAGTCGACGGCCTTTTGTGTGATatcaatc  <  1:251197/49‑1 (MQ=255)             aCTGAATCGGTTAACTGTCCAGTCGACGGCCTTTTGTGTGATatcaatc  <  1:24368/49‑1 (MQ=255)             aCTGAATCGGTTAACTGTCCAGTCGACGGCCTTTTGTGTGATatcaatc  <  1:220229/49‑1 (MQ=255)             aCTGAATCGGTTAACTGTCCAGTCGACGGCCTTTTGTGTGATatcaatc  <  1:214176/49‑1 (MQ=255)             aCTGAATCGGTTAACTGTCCAGTCGACGGCCTTTTGTGTGATatcaatc  <  1:211558/49‑1 (MQ=255)             aCTGAATCGGTTAACTGTCCAGTCGACGGCCTTTTGTGTGATatcaatc  <  1:193985/49‑1 (MQ=255)             aCTGAATCGGTTAACTGTCCAGTCGACGGCCTTTTGTGTGATatcaatc  <  1:1619911/49‑1 (MQ=255)             aCTGAATCGGTTAACTGTCCAGTCGACGGCCTTTTGTGTGATatcaatc  <  1:1619248/49‑1 (MQ=255)             aCTGAATCGGTTAACTGTCCAGTCGACGGCCTTTTGTGTGATatcaatc  <  1:1619216/49‑1 (MQ=255)             aCTGAATCGGTTAACTGTCCAGTCGACGGCCTTTTGTGTGATatcaatc  <  1:1601459/49‑1 (MQ=255)             aCTGAATCGGTTAACTGTCCAGTCGACGGCCTTTTGTGTGATatcaatc  <  1:1565373/49‑1 (MQ=255)             aCTGAATCGGTTAACTGTCCAGTCGACGGCCTTTTGTGTGATatcaatc  <  1:1547433/49‑1 (MQ=255)             aCTGAATCGGTTAACTGTCCAGTCGACGGCCTTTTGTGTGATatcaatc  <  1:294143/49‑1 (MQ=255)             aCTGAATCGGTTAACTGTCCAGTCGACGGCCTTT‑‑TGTGATatcaatc  <  1:1635265/47‑1 (MQ=38)             |                                                 GCGAAATCTGGCACTGAATCGGTTAACTGTCCAGTCGACGGCCTTTTGTGTGATATCAATC  >  W3110S.gb/3868232‑3868292

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑