Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3888722	3888910	189	36 [0]	[0] 38	yiaT	hypothetical protein

CGTGAAAGCCTCTGCAGCTGCGGACGTTCTGGATAACAGCAACGGCTGGGTGGGGGAGCTAT  >  W3110S.gb/3888911‑3888972 |                                                              cGTGAAAGCCTCTGCAGCTGCGGACGTTCTGGATAACTGCAACGGCTGGGTGGGGGAGCTAt  >  1:727067/1‑62 (MQ=255) cGTGAAAGCCTCTGCAGCTGCGGACGTTCTGGATAACAGGAACGGCTGGGTGGGGGAGCTAt  >  1:1131547/1‑62 (MQ=255) cGTGAAAGCCTCTGCAGCTGCGGACGTTCTGGATAACAGCAACg                    >  1:531954/1‑44 (MQ=255) cGTGAAAGCCTCTGCAGCTGCGGACGTTCTGGATAACAGCAACGGCagggtggg          >  1:545818/1‑54 (MQ=255) cGTGAAAGCCTCTGCAGCTGCGGACGTTCTGGATAACAGCAACGGCTGGGTGGGGGAGCTAt  >  1:727434/1‑62 (MQ=255) cGTGAAAGCCTCTGCAGCTGCGGACGTTCTGGATAACAGCAACGGCTGGGTGGGGGAGCTAt  >  1:548630/1‑62 (MQ=255) cGTGAAAGCCTCTGCAGCTGCGGACGTTCTGGATAACAGCAACGGCTGGGTGGGGGAGCTAt  >  1:557864/1‑62 (MQ=255) cGTGAAAGCCTCTGCAGCTGCGGACGTTCTGGATAACAGCAACGGCTGGGTGGGGGAGCTAt  >  1:567709/1‑62 (MQ=255) cGTGAAAGCCTCTGCAGCTGCGGACGTTCTGGATAACAGCAACGGCTGGGTGGGGGAGCTAt  >  1:645758/1‑62 (MQ=255) cGTGAAAGCCTCTGCAGCTGCGGACGTTCTGGATAACAGCAACGGCTGGGTGGGGGAGCTAt  >  1:669121/1‑62 (MQ=255) cGTGAAAGCCTCTGCAGCTGCGGACGTTCTGGATAACAGCAACGGCTGGGTGGGGGAGCTAt  >  1:687462/1‑62 (MQ=255) cGTGAAAGCCTCTGCAGCTGCGGACGTTCTGGATAACAGCAACGGCTGGGTGGGGGAGCTAt  >  1:475242/1‑62 (MQ=255) cGTGAAAGCCTCTGCAGCTGCGGACGTTCTGGATAACAGCAACGGCTGGGTGGGGGAGCTAt  >  1:74875/1‑62 (MQ=255) cGTGAAAGCCTCTGCAGCTGCGGACGTTCTGGATAACAGCAACGGCTGGGTGGGGGAGCTAt  >  1:795469/1‑62 (MQ=255) cGTGAAAGCCTCTGCAGCTGCGGACGTTCTGGATAACAGCAACGGCTGGGTGGGGGAGCTAt  >  1:807215/1‑62 (MQ=255) cGTGAAAGCCTCTGCAGCTGCGGACGTTCTGGATAACAGCAACGGCTGGGTGGGGGAGCTAt  >  1:898385/1‑62 (MQ=255) cGTGAAAGCCTCTGCAGCTGCGGACGTTCTGGATAACAGCAACGGCTGGGTGGGGGAGCTAt  >  1:919084/1‑62 (MQ=255) cGTGAAAGCCTCTGCAGCTGCGGACGTTCTGGATAACAGCAACGGCTGGGTGGGGGAGCTAt  >  1:925800/1‑62 (MQ=255) cGTGAAAGCCTCTGCAGCTGCGGACGTTCTGGATAACAGCAACGGCTGGGTGGGGGAGCTAt  >  1:995915/1‑62 (MQ=255) cGTGAAAGCCTCTGCAGCTGCGGACGTTCTGGATAACAGCAACGGCTGGGTGGGGGAGCTAt  >  1:1447781/1‑62 (MQ=255) cGTGAAAGCCTCTGCAGCTGCGGACGTTCTGGATAACAGCAACGGCTGGGTGGGGGAGCTAt  >  1:1026864/1‑62 (MQ=255) cGTGAAAGCCTCTGCAGCTGCGGACGTTCTGGATAACAGCAACGGCTGGGTGGGGGAGCTAt  >  1:1032843/1‑62 (MQ=255) cGTGAAAGCCTCTGCAGCTGCGGACGTTCTGGATAACAGCAACGGCTGGGTGGGGGAGCTAt  >  1:1117706/1‑62 (MQ=255) cGTGAAAGCCTCTGCAGCTGCGGACGTTCTGGATAACAGCAACGGCTGGGTGGGGGAGCTAt  >  1:1217827/1‑62 (MQ=255) cGTGAAAGCCTCTGCAGCTGCGGACGTTCTGGATAACAGCAACGGCTGGGTGGGGGAGCTAt  >  1:1255393/1‑62 (MQ=255) cGTGAAAGCCTCTGCAGCTGCGGACGTTCTGGATAACAGCAACGGCTGGGTGGGGGAGCTAt  >  1:1377110/1‑62 (MQ=255) cGTGAAAGCCTCTGCAGCTGCGGACGTTCTGGATAACAGCAACGGCTGGGTGGGGGAGCTAt  >  1:1388484/1‑62 (MQ=255) cGTGAAAGCCTCTGCAGCTGCGGACGTTCTGGATAACAGCAACGGCTGGGTGGGGGAGCTAt  >  1:1416526/1‑62 (MQ=255) cGTGAAAGCCTCTGCAGCTGCGGACGTTCTGGATAACAGCAACGGCTGGGTGGGGGAGCTAt  >  1:1427774/1‑62 (MQ=255) cGTGAAAGCCTCTGCAGCTGCGGACGTTCTGGATAACAGCAACGGCTGGGTGGGGGAGCTAt  >  1:100263/1‑62 (MQ=255) cGTGAAAGCCTCTGCAGCTGCGGACGTTCTGGATAACAGCAACGGCTGGGTGGGGGAGCTAt  >  1:1521914/1‑62 (MQ=255) cGTGAAAGCCTCTGCAGCTGCGGACGTTCTGGATAACAGCAACGGCTGGGTGGGGGAGCTAt  >  1:156301/1‑62 (MQ=255) cGTGAAAGCCTCTGCAGCTGCGGACGTTCTGGATAACAGCAACGGCTGGGTGGGGGAGCTAt  >  1:1600446/1‑62 (MQ=255) cGTGAAAGCCTCTGCAGCTGCGGACGTTCTGGATAACAGCAACGGCTGGGTGGGGGAGCTAt  >  1:1603200/1‑62 (MQ=255) cGTGAAAGCCTCTGCAGCTGCGGACGTTCTGGATAACAGCAACGGCTGGGTGGGGGAGCTAt  >  1:170962/1‑62 (MQ=255) cGTGAAAGCCTCTGCAGCTGCGGACGTTCTGGATAACAGCAACGGCTGGGTGGGGGAGCTAt  >  1:257348/1‑62 (MQ=255) cGTGAAAGCCTCTGCAGCTGCGGACGTTCTGGATAACAGCAACGGCTGGGTGGGGGAGCTAt  >  1:275104/1‑62 (MQ=255) cGTGAAAGCATCTGCAGCTGCGGACGTTCTGGATAACAGCAACGGCTGGGTGGGGGAGCTAt  >  1:58635/1‑62 (MQ=255) |                                                              CGTGAAAGCCTCTGCAGCTGCGGACGTTCTGGATAACAGCAACGGCTGGGTGGGGGAGCTAT  >  W3110S.gb/3888911‑3888972

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑