Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3947769	3948063	295	42 [0]	[0] 29	[bcsA]–[bcsB]	[bcsA],[bcsB]

CAGCATGGTGCTACGTGGCATTAACCCGAACGGCAGCATTGAGTTTGGTATGCGCAGCGATG  >  W3110S.gb/3948064‑3948125 |                                                              cagcaTGGTGCTACGTGGCATTAACCCGAACGGCAGCATTGAGTTTGGTATGCGCAGCGATg  <  1:1552624/62‑1 (MQ=255) cagcaTGGTGCTACGTGGCATTAACCCGAACGGCAGCATTGAGTTTGGTATGCGCAGCGATg  <  1:940065/62‑1 (MQ=255) cagcaTGGTGCTACGTGGCATTAACCCGAACGGCAGCATTGAGTTTGGTATGCGCAGCGATg  <  1:909865/62‑1 (MQ=255) cagcaTGGTGCTACGTGGCATTAACCCGAACGGCAGCATTGAGTTTGGTATGCGCAGCGATg  <  1:829864/62‑1 (MQ=255) cagcaTGGTGCTACGTGGCATTAACCCGAACGGCAGCATTGAGTTTGGTATGCGCAGCGATg  <  1:813722/62‑1 (MQ=255) cagcaTGGTGCTACGTGGCATTAACCCGAACGGCAGCATTGAGTTTGGTATGCGCAGCGATg  <  1:527369/62‑1 (MQ=255) cagcaTGGTGCTACGTGGCATTAACCCGAACGGCAGCATTGAGTTTGGTATGCGCAGCGATg  <  1:515712/62‑1 (MQ=255) cagcaTGGTGCTACGTGGCATTAACCCGAACGGCAGCATTGAGTTTGGTATGCGCAGCGATg  <  1:511615/62‑1 (MQ=255) cagcaTGGTGCTACGTGGCATTAACCCGAACGGCAGCATTGAGTTTGGTATGCGCAGCGATg  <  1:46033/62‑1 (MQ=255) cagcaTGGTGCTACGTGGCATTAACCCGAACGGCAGCATTGAGTTTGGTATGCGCAGCGATg  <  1:417611/62‑1 (MQ=255) cagcaTGGTGCTACGTGGCATTAACCCGAACGGCAGCATTGAGTTTGGTATGCGCAGCGATg  <  1:403337/62‑1 (MQ=255) cagcaTGGTGCTACGTGGCATTAACCCGAACGGCAGCATTGAGTTTGGTATGCGCAGCGATg  <  1:377816/62‑1 (MQ=255) cagcaTGGTGCTACGTGGCATTAACCCGAACGGCAGCATTGAGTTTGGTATGCGCAGCGATg  <  1:282286/62‑1 (MQ=255) cagcaTGGTGCTACGTGGCATTAACCCGAACGGCAGCATTGAGTTTGGTATGCGCAGCGATg  <  1:1604315/62‑1 (MQ=255) cagcaTGGTGCTACGTGGCATTAACCCGAACGGCAGCATTGAGTTTGGTATGCGCAGCGATg  <  1:1600891/62‑1 (MQ=255) cagcaTGGTGCTACGTGGCATTAACCCGAACGGCAGCATTGAGTTTGGTATGCGCAGCGATg  <  1:1014063/62‑1 (MQ=255) cagcaTGGTGCTACGTGGCATTAACCCGAACGGCAGCATTGAGTTTGGTATGCGCAGCGATg  <  1:1526843/62‑1 (MQ=255) cagcaTGGTGCTACGTGGCATTAACCCGAACGGCAGCATTGAGTTTGGTATGCGCAGCGATg  <  1:1525805/62‑1 (MQ=255) cagcaTGGTGCTACGTGGCATTAACCCGAACGGCAGCATTGAGTTTGGTATGCGCAGCGATg  <  1:1522867/62‑1 (MQ=255) cagcaTGGTGCTACGTGGCATTAACCCGAACGGCAGCATTGAGTTTGGTATGCGCAGCGATg  <  1:1475898/62‑1 (MQ=255) cagcaTGGTGCTACGTGGCATTAACCCGAACGGCAGCATTGAGTTTGGTATGCGCAGCGATg  <  1:1457451/62‑1 (MQ=255) cagcaTGGTGCTACGTGGCATTAACCCGAACGGCAGCATTGAGTTTGGTATGCGCAGCGATg  <  1:139710/62‑1 (MQ=255) cagcaTGGTGCTACGTGGCATTAACCCGAACGGCAGCATTGAGTTTGGTATGCGCAGCGATg  <  1:1333948/62‑1 (MQ=255) cagcaTGGTGCTACGTGGCATTAACCCGAACGGCAGCATTGAGTTTGGTATGCGCAGCGATg  <  1:1283145/62‑1 (MQ=255) cagcaTGGTGCTACGTGGCATTAACCCGAACGGCAGCATTGAGTTTGGTATGCGCAGCGATg  <  1:1281534/62‑1 (MQ=255) cagcaTGGTGCTACGTGGCATTAACCCGAACGGCAGCATTGAGTTTGGTATGCGCAGCGATg  <  1:1241794/62‑1 (MQ=255) cagcaTGGTGCTACGTGGCATTAACCCGAACGGCAGCATTGAGTTTGGTATGCGCAGCGATg  <  1:1204940/62‑1 (MQ=255) cagcaTGGTGCTACGTGGCATTAACCCGAACGGCAGCATTGAGTTTGGTATGCGCAGCGATg  <  1:111337/62‑1 (MQ=255) cagcaTGGTGCTACGTGGCATTAACCCGAACGGCAGCATTGAGTTTGGTATGCGCAGCGATg  <  1:1102811/62‑1 (MQ=255) |                                                              CAGCATGGTGCTACGTGGCATTAACCCGAACGGCAGCATTGAGTTTGGTATGCGCAGCGATG  >  W3110S.gb/3948064‑3948125

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑