Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3968171	3968294	124	103 [0]	[0] 91	yhjC/yhjB	predicted DNA‑binding transcriptional regulator/predicted DNA‑binding response regulator in two‑component regulatory system

TGCATGCGTACTAACCACCAATATAAGGAAATCCTCAAAATTGTTTTAAATAGTGCCCTCG  >  W3110S.gb/3968295‑3968355 |                                                             tGCATGCGTTCTAACCACCAATATAAGGTAATCCTCAAAATTGTTTTAAATAGTGCCCTCg  <  1:822706/61‑1 (MQ=255) tGCATGCGTACTAACCACCAATATAAGGAAATCCTCAAAATTGTTTTAAATAGTGCCCTCg  <  1:531069/61‑1 (MQ=255) tGCATGCGTACTAACCACCAATATAAGGAAATCCTCAAAATTGTTTTAAATAGTGCCCTCg  <  1:663556/61‑1 (MQ=255) tGCATGCGTACTAACCACCAATATAAGGAAATCCTCAAAATTGTTTTAAATAGTGCCCTCg  <  1:653807/61‑1 (MQ=255) tGCATGCGTACTAACCACCAATATAAGGAAATCCTCAAAATTGTTTTAAATAGTGCCCTCg  <  1:629152/61‑1 (MQ=255) tGCATGCGTACTAACCACCAATATAAGGAAATCCTCAAAATTGTTTTAAATAGTGCCCTCg  <  1:623483/61‑1 (MQ=255) tGCATGCGTACTAACCACCAATATAAGGAAATCCTCAAAATTGTTTTAAATAGTGCCCTCg  <  1:594912/61‑1 (MQ=255) tGCATGCGTACTAACCACCAATATAAGGAAATCCTCAAAATTGTTTTAAATAGTGCCCTCg  <  1:593348/61‑1 (MQ=255) tGCATGCGTACTAACCACCAATATAAGGAAATCCTCAAAATTGTTTTAAATAGTGCCCTCg  <  1:5783/61‑1 (MQ=255) tGCATGCGTACTAACCACCAATATAAGGAAATCCTCAAAATTGTTTTAAATAGTGCCCTCg  <  1:577648/61‑1 (MQ=255) tGCATGCGTACTAACCACCAATATAAGGAAATCCTCAAAATTGTTTTAAATAGTGCCCTCg  <  1:541930/61‑1 (MQ=255) tGCATGCGTACTAACCACCAATATAAGGAAATCCTCAAAATTGTTTTAAATAGTGCCCTCg  <  1:539893/61‑1 (MQ=255) tGCATGCGTACTAACCACCAATATAAGGAAATCCTCAAAATTGTTTTAAATAGTGCCCTCg  <  1:663571/61‑1 (MQ=255) tGCATGCGTACTAACCACCAATATAAGGAAATCCTCAAAATTGTTTTAAATAGTGCCCTCg  <  1:469384/61‑1 (MQ=255) tGCATGCGTACTAACCACCAATATAAGGAAATCCTCAAAATTGTTTTAAATAGTGCCCTCg  <  1:46192/61‑1 (MQ=255) tGCATGCGTACTAACCACCAATATAAGGAAATCCTCAAAATTGTTTTAAATAGTGCCCTCg  <  1:452373/61‑1 (MQ=255) tGCATGCGTACTAACCACCAATATAAGGAAATCCTCAAAATTGTTTTAAATAGTGCCCTCg  <  1:426015/61‑1 (MQ=255) tGCATGCGTACTAACCACCAATATAAGGAAATCCTCAAAATTGTTTTAAATAGTGCCCTCg  <  1:403302/61‑1 (MQ=255) tGCATGCGTACTAACCACCAATATAAGGAAATCCTCAAAATTGTTTTAAATAGTGCCCTCg  <  1:397207/61‑1 (MQ=255) tGCATGCGTACTAACCACCAATATAAGGAAATCCTCAAAATTGTTTTAAATAGTGCCCTCg  <  1:375350/61‑1 (MQ=255) tGCATGCGTACTAACCACCAATATAAGGAAATCCTCAAAATTGTTTTAAATAGTGCCCTCg  <  1:36990/61‑1 (MQ=255) tGCATGCGTACTAACCACCAATATAAGGAAATCCTCAAAATTGTTTTAAATAGTGCCCTCg  <  1:363346/61‑1 (MQ=255) tGCATGCGTACTAACCACCAATATAAGGAAATCCTCAAAATTGTTTTAAATAGTGCCCTCg  <  1:308980/61‑1 (MQ=255) tGCATGCGTACTAACCACCAATATAAGGAAATCCTCAAAATTGTTTTAAATAGTGCCCTCg  <  1:299911/61‑1 (MQ=255) tGCATGCGTACTAACCACCAATATAAGGAAATCCTCAAAATTGTTTTAAATAGTGCCCTCg  <  1:868417/61‑1 (MQ=255) tGCATGCGTACTAACCACCAATATAAGGAAATCCTCAAAATTGTTTTAAATAGTGCCCTCg  <  1:997435/61‑1 (MQ=255) tGCATGCGTACTAACCACCAATATAAGGAAATCCTCAAAATTGTTTTAAATAGTGCCCTCg  <  1:997116/61‑1 (MQ=255) tGCATGCGTACTAACCACCAATATAAGGAAATCCTCAAAATTGTTTTAAATAGTGCCCTCg  <  1:989195/61‑1 (MQ=255) tGCATGCGTACTAACCACCAATATAAGGAAATCCTCAAAATTGTTTTAAATAGTGCCCTCg  <  1:957156/61‑1 (MQ=255) tGCATGCGTACTAACCACCAATATAAGGAAATCCTCAAAATTGTTTTAAATAGTGCCCTCg  <  1:954619/61‑1 (MQ=255) tGCATGCGTACTAACCACCAATATAAGGAAATCCTCAAAATTGTTTTAAATAGTGCCCTCg  <  1:946081/61‑1 (MQ=255) tGCATGCGTACTAACCACCAATATAAGGAAATCCTCAAAATTGTTTTAAATAGTGCCCTCg  <  1:916861/61‑1 (MQ=255) tGCATGCGTACTAACCACCAATATAAGGAAATCCTCAAAATTGTTTTAAATAGTGCCCTCg  <  1:910438/61‑1 (MQ=255) tGCATGCGTACTAACCACCAATATAAGGAAATCCTCAAAATTGTTTTAAATAGTGCCCTCg  <  1:903434/61‑1 (MQ=255) tGCATGCGTACTAACCACCAATATAAGGAAATCCTCAAAATTGTTTTAAATAGTGCCCTCg  <  1:870348/61‑1 (MQ=255) tGCATGCGTACTAACCACCAATATAAGGAAATCCTCAAAATTGTTTTAAATAGTGCCCTCg  <  1:293198/61‑1 (MQ=255) tGCATGCGTACTAACCACCAATATAAGGAAATCCTCAAAATTGTTTTAAATAGTGCCCTCg  <  1:838041/61‑1 (MQ=255) tGCATGCGTACTAACCACCAATATAAGGAAATCCTCAAAATTGTTTTAAATAGTGCCCTCg  <  1:826173/61‑1 (MQ=255) tGCATGCGTACTAACCACCAATATAAGGAAATCCTCAAAATTGTTTTAAATAGTGCCCTCg  <  1:817694/61‑1 (MQ=255) tGCATGCGTACTAACCACCAATATAAGGAAATCCTCAAAATTGTTTTAAATAGTGCCCTCg  <  1:768544/61‑1 (MQ=255) tGCATGCGTACTAACCACCAATATAAGGAAATCCTCAAAATTGTTTTAAATAGTGCCCTCg  <  1:757000/61‑1 (MQ=255) tGCATGCGTACTAACCACCAATATAAGGAAATCCTCAAAATTGTTTTAAATAGTGCCCTCg  <  1:741416/61‑1 (MQ=255) tGCATGCGTACTAACCACCAATATAAGGAAATCCTCAAAATTGTTTTAAATAGTGCCCTCg  <  1:71043/61‑1 (MQ=255) tGCATGCGTACTAACCACCAATATAAGGAAATCCTCAAAATTGTTTTAAATAGTGCCCTCg  <  1:695126/61‑1 (MQ=255) tGCATGCGTACTAACCACCAATATAAGGAAATCCTCAAAATTGTTTTAAATAGTGCCCTCg  <  1:694342/61‑1 (MQ=255) tGCATGCGTACTAACCACCAATATAAGGAAATCCTCAAAATTGTTTTAAATAGTGCCCTCg  <  1:685355/61‑1 (MQ=255) tGCATGCGTACTAACCACCAATATAAGGAAATCCTCAAAATTGTTTTAAATAGTGCCCTCg  <  1:1137260/61‑1 (MQ=255) tGCATGCGTACTAACCACCAATATAAGGAAATCCTCAAAATTGTTTTAAATAGTGCCCTCg  <  1:1336680/61‑1 (MQ=255) tGCATGCGTACTAACCACCAATATAAGGAAATCCTCAAAATTGTTTTAAATAGTGCCCTCg  <  1:1332625/61‑1 (MQ=255) tGCATGCGTACTAACCACCAATATAAGGAAATCCTCAAAATTGTTTTAAATAGTGCCCTCg  <  1:1321177/61‑1 (MQ=255) tGCATGCGTACTAACCACCAATATAAGGAAATCCTCAAAATTGTTTTAAATAGTGCCCTCg  <  1:1273569/61‑1 (MQ=255) tGCATGCGTACTAACCACCAATATAAGGAAATCCTCAAAATTGTTTTAAATAGTGCCCTCg  <  1:1260263/61‑1 (MQ=255) tGCATGCGTACTAACCACCAATATAAGGAAATCCTCAAAATTGTTTTAAATAGTGCCCTCg  <  1:1260143/61‑1 (MQ=255) tGCATGCGTACTAACCACCAATATAAGGAAATCCTCAAAATTGTTTTAAATAGTGCCCTCg  <  1:1236676/61‑1 (MQ=255) tGCATGCGTACTAACCACCAATATAAGGAAATCCTCAAAATTGTTTTAAATAGTGCCCTCg  <  1:1230115/61‑1 (MQ=255) tGCATGCGTACTAACCACCAATATAAGGAAATCCTCAAAATTGTTTTAAATAGTGCCCTCg  <  1:1225747/61‑1 (MQ=255) tGCATGCGTACTAACCACCAATATAAGGAAATCCTCAAAATTGTTTTAAATAGTGCCCTCg  <  1:1161335/61‑1 (MQ=255) tGCATGCGTACTAACCACCAATATAAGGAAATCCTCAAAATTGTTTTAAATAGTGCCCTCg  <  1:1338332/61‑1 (MQ=255) tGCATGCGTACTAACCACCAATATAAGGAAATCCTCAAAATTGTTTTAAATAGTGCCCTCg  <  1:1127076/61‑1 (MQ=255) tGCATGCGTACTAACCACCAATATAAGGAAATCCTCAAAATTGTTTTAAATAGTGCCCTCg  <  1:1125359/61‑1 (MQ=255) tGCATGCGTACTAACCACCAATATAAGGAAATCCTCAAAATTGTTTTAAATAGTGCCCTCg  <  1:1102474/61‑1 (MQ=255) tGCATGCGTACTAACCACCAATATAAGGAAATCCTCAAAATTGTTTTAAATAGTGCCCTCg  <  1:1096692/61‑1 (MQ=255) tGCATGCGTACTAACCACCAATATAAGGAAATCCTCAAAATTGTTTTAAATAGTGCCCTCg  <  1:1095937/61‑1 (MQ=255) tGCATGCGTACTAACCACCAATATAAGGAAATCCTCAAAATTGTTTTAAATAGTGCCCTCg  <  1:1087650/61‑1 (MQ=255) tGCATGCGTACTAACCACCAATATAAGGAAATCCTCAAAATTGTTTTAAATAGTGCCCTCg  <  1:1070656/61‑1 (MQ=255) tGCATGCGTACTAACCACCAATATAAGGAAATCCTCAAAATTGTTTTAAATAGTGCCCTCg  <  1:1070242/61‑1 (MQ=255) tGCATGCGTACTAACCACCAATATAAGGAAATCCTCAAAATTGTTTTAAATAGTGCCCTCg  <  1:1056220/61‑1 (MQ=255) tGCATGCGTACTAACCACCAATATAAGGAAATCCTCAAAATTGTTTTAAATAGTGCCCTCg  <  1:1023365/61‑1 (MQ=255) tGCATGCGTACTAACCACCAATATAAGGAAATCCTCAAAATTGTTTTAAATAGTGCCCTCg  <  1:1587285/61‑1 (MQ=255) tGCATGCGTACTAACCACCAATATAAGGAAATCCTCAAAATTGTTTTAAATAGTGCCCTCg  <  1:274792/61‑1 (MQ=255) tGCATGCGTACTAACCACCAATATAAGGAAATCCTCAAAATTGTTTTAAATAGTGCCCTCg  <  1:229625/61‑1 (MQ=255) tGCATGCGTACTAACCACCAATATAAGGAAATCCTCAAAATTGTTTTAAATAGTGCCCTCg  <  1:224472/61‑1 (MQ=255) tGCATGCGTACTAACCACCAATATAAGGAAATCCTCAAAATTGTTTTAAATAGTGCCCTCg  <  1:212044/61‑1 (MQ=255) tGCATGCGTACTAACCACCAATATAAGGAAATCCTCAAAATTGTTTTAAATAGTGCCCTCg  <  1:202464/61‑1 (MQ=255) tGCATGCGTACTAACCACCAATATAAGGAAATCCTCAAAATTGTTTTAAATAGTGCCCTCg  <  1:187914/61‑1 (MQ=255) tGCATGCGTACTAACCACCAATATAAGGAAATCCTCAAAATTGTTTTAAATAGTGCCCTCg  <  1:183503/61‑1 (MQ=255) tGCATGCGTACTAACCACCAATATAAGGAAATCCTCAAAATTGTTTTAAATAGTGCCCTCg  <  1:180473/61‑1 (MQ=255) tGCATGCGTACTAACCACCAATATAAGGAAATCCTCAAAATTGTTTTAAATAGTGCCCTCg  <  1:1635691/61‑1 (MQ=255) tGCATGCGTACTAACCACCAATATAAGGAAATCCTCAAAATTGTTTTAAATAGTGCCCTCg  <  1:1632984/61‑1 (MQ=255) tGCATGCGTACTAACCACCAATATAAGGAAATCCTCAAAATTGTTTTAAATAGTGCCCTCg  <  1:1018741/61‑1 (MQ=255) tGCATGCGTACTAACCACCAATATAAGGAAATCCTCAAAATTGTTTTAAATAGTGCCCTCg  <  1:1583575/61‑1 (MQ=255) tGCATGCGTACTAACCACCAATATAAGGAAATCCTCAAAATTGTTTTAAATAGTGCCCTCg  <  1:1511760/61‑1 (MQ=255) tGCATGCGTACTAACCACCAATATAAGGAAATCCTCAAAATTGTTTTAAATAGTGCCCTCg  <  1:1505930/61‑1 (MQ=255) tGCATGCGTACTAACCACCAATATAAGGAAATCCTCAAAATTGTTTTAAATAGTGCCCTCg  <  1:1477138/61‑1 (MQ=255) tGCATGCGTACTAACCACCAATATAAGGAAATCCTCAAAATTGTTTTAAATAGTGCCCTCg  <  1:1438104/61‑1 (MQ=255) tGCATGCGTACTAACCACCAATATAAGGAAATCCTCAAAATTGTTTTAAATAGTGCCCTCg  <  1:1435443/61‑1 (MQ=255) tGCATGCGTACTAACCACCAATATAAGGAAATCCTCAAAATTGTTTTAAATAGTGCCCTCg  <  1:1376988/61‑1 (MQ=255) tGCATGCGTACTAACCACCAATATAAGGAAATCCTCAAAATTGTTTTAAATAGTGCCCTCg  <  1:1350382/61‑1 (MQ=255) tGCATGCGTACTAACCACCAATATAAGGAAATCCTCAAAATTGTTTTAAATAGTGCCCTCg  <  1:134377/61‑1 (MQ=255) tGCATGCGTACTAACCACCAATATAAGGAAATCCTCAAAATTGTTTTAAATAGTGCCATCg  <  1:1638865/61‑1 (MQ=255) tGCATGCGTACTAACAACCAATATAAGGAAATCCTCAAAATTGTTTTAAATAGTGCCCTCg  <  1:1260913/61‑1 (MQ=255) |                                                             TGCATGCGTACTAACCACCAATATAAGGAAATCCTCAAAATTGTTTTAAATAGTGCCCTCG  >  W3110S.gb/3968295‑3968355

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑