Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3972952	3974328	1377	93 [0]	[0] 69	[gadA]	[gadA]

TATTCATCGTGTTGATAAGATATATGTTATATGAATGTTTATTAAATGTAGCGATTAC  >  W3110S.gb/3974329‑3974386 |                                                          tATTCATGGTGTTGATAAGATATATGTTATATGAATGTTTATTAAATGTAGCGATTAc  <  1:1521081/58‑1 (MQ=255) tATTCATCGTGTTTATAAGATATATGTTATATGAATGTTTATTAAATGTAGCGATTAc  <  1:158973/58‑1 (MQ=255) tATTCATCGTGTTGATAAGATATATGTTATATGAATGTTTATTAAATGTATCGATTAc  <  1:612370/58‑1 (MQ=255) tATTCATCGTGTTGATAAGATATATGTTATATGAATGTTTATTAAATGTAGCGATTAc  <  1:412204/58‑1 (MQ=255) tATTCATCGTGTTGATAAGATATATGTTATATGAATGTTTATTAAATGTAGCGATTAc  <  1:530929/58‑1 (MQ=255) tATTCATCGTGTTGATAAGATATATGTTATATGAATGTTTATTAAATGTAGCGATTAc  <  1:481364/58‑1 (MQ=255) tATTCATCGTGTTGATAAGATATATGTTATATGAATGTTTATTAAATGTAGCGATTAc  <  1:463449/58‑1 (MQ=255) tATTCATCGTGTTGATAAGATATATGTTATATGAATGTTTATTAAATGTAGCGATTAc  <  1:461600/58‑1 (MQ=255) tATTCATCGTGTTGATAAGATATATGTTATATGAATGTTTATTAAATGTAGCGATTAc  <  1:445205/58‑1 (MQ=255) tATTCATCGTGTTGATAAGATATATGTTATATGAATGTTTATTAAATGTAGCGATTAc  <  1:434545/58‑1 (MQ=255) tATTCATCGTGTTGATAAGATATATGTTATATGAATGTTTATTAAATGTAGCGATTAc  <  1:430027/58‑1 (MQ=255) tATTCATCGTGTTGATAAGATATATGTTATATGAATGTTTATTAAATGTAGCGATTAc  <  1:545853/58‑1 (MQ=255) tATTCATCGTGTTGATAAGATATATGTTATATGAATGTTTATTAAATGTAGCGATTAc  <  1:347519/58‑1 (MQ=255) tATTCATCGTGTTGATAAGATATATGTTATATGAATGTTTATTAAATGTAGCGATTAc  <  1:338857/58‑1 (MQ=255) tATTCATCGTGTTGATAAGATATATGTTATATGAATGTTTATTAAATGTAGCGATTAc  <  1:324642/58‑1 (MQ=255) tATTCATCGTGTTGATAAGATATATGTTATATGAATGTTTATTAAATGTAGCGATTAc  <  1:323782/58‑1 (MQ=255) tATTCATCGTGTTGATAAGATATATGTTATATGAATGTTTATTAAATGTAGCGATTAc  <  1:308918/58‑1 (MQ=255) tATTCATCGTGTTGATAAGATATATGTTATATGAATGTTTATTAAATGTAGCGATTAc  <  1:260188/58‑1 (MQ=255) tATTCATCGTGTTGATAAGATATATGTTATATGAATGTTTATTAAATGTAGCGATTAc  <  1:224497/58‑1 (MQ=255) tATTCATCGTGTTGATAAGATATATGTTATATGAATGTTTATTAAATGTAGCGATTAc  <  1:777569/58‑1 (MQ=255) tATTCATCGTGTTGATAAGATATATGTTATATGAATGTTTATTAAATGTAGCGATTAc  <  1:983837/58‑1 (MQ=255) tATTCATCGTGTTGATAAGATATATGTTATATGAATGTTTATTAAATGTAGCGATTAc  <  1:968447/58‑1 (MQ=255) tATTCATCGTGTTGATAAGATATATGTTATATGAATGTTTATTAAATGTAGCGATTAc  <  1:951788/58‑1 (MQ=255) tATTCATCGTGTTGATAAGATATATGTTATATGAATGTTTATTAAATGTAGCGATTAc  <  1:933347/58‑1 (MQ=255) tATTCATCGTGTTGATAAGATATATGTTATATGAATGTTTATTAAATGTAGCGATTAc  <  1:908782/58‑1 (MQ=255) tATTCATCGTGTTGATAAGATATATGTTATATGAATGTTTATTAAATGTAGCGATTAc  <  1:90795/58‑1 (MQ=255) tATTCATCGTGTTGATAAGATATATGTTATATGAATGTTTATTAAATGTAGCGATTAc  <  1:847110/58‑1 (MQ=255) tATTCATCGTGTTGATAAGATATATGTTATATGAATGTTTATTAAATGTAGCGATTAc  <  1:830522/58‑1 (MQ=255) tATTCATCGTGTTGATAAGATATATGTTATATGAATGTTTATTAAATGTAGCGATTAc  <  1:1631336/58‑1 (MQ=255) tATTCATCGTGTTGATAAGATATATGTTATATGAATGTTTATTAAATGTAGCGATTAc  <  1:769816/58‑1 (MQ=255) tATTCATCGTGTTGATAAGATATATGTTATATGAATGTTTATTAAATGTAGCGATTAc  <  1:735006/58‑1 (MQ=255) tATTCATCGTGTTGATAAGATATATGTTATATGAATGTTTATTAAATGTAGCGATTAc  <  1:68738/58‑1 (MQ=255) tATTCATCGTGTTGATAAGATATATGTTATATGAATGTTTATTAAATGTAGCGATTAc  <  1:685109/58‑1 (MQ=255) tATTCATCGTGTTGATAAGATATATGTTATATGAATGTTTATTAAATGTAGCGATTAc  <  1:618333/58‑1 (MQ=255) tATTCATCGTGTTGATAAGATATATGTTATATGAATGTTTATTAAATGTAGCGATTAc  <  1:581778/58‑1 (MQ=255) tATTCATCGTGTTGATAAGATATATGTTATATGAATGTTTATTAAATGTAGCGATTAc  <  1:564321/58‑1 (MQ=255) tATTCATCGTGTTGATAAGATATATGTTATATGAATGTTTATTAAATGTAGCGATTAc  <  1:1392105/58‑1 (MQ=255) tATTCATCGTGTTGATAAGATATATGTTATATGAATGTTTATTAAATGTAGCGATTAc  <  1:1033815/58‑1 (MQ=255) tATTCATCGTGTTGATAAGATATATGTTATATGAATGTTTATTAAATGTAGCGATTAc  <  1:1043463/58‑1 (MQ=255) tATTCATCGTGTTGATAAGATATATGTTATATGAATGTTTATTAAATGTAGCGATTAc  <  1:1054581/58‑1 (MQ=255) tATTCATCGTGTTGATAAGATATATGTTATATGAATGTTTATTAAATGTAGCGATTAc  <  1:1074992/58‑1 (MQ=255) tATTCATCGTGTTGATAAGATATATGTTATATGAATGTTTATTAAATGTAGCGATTAc  <  1:108022/58‑1 (MQ=255) tATTCATCGTGTTGATAAGATATATGTTATATGAATGTTTATTAAATGTAGCGATTAc  <  1:1108822/58‑1 (MQ=255) tATTCATCGTGTTGATAAGATATATGTTATATGAATGTTTATTAAATGTAGCGATTAc  <  1:1113414/58‑1 (MQ=255) tATTCATCGTGTTGATAAGATATATGTTATATGAATGTTTATTAAATGTAGCGATTAc  <  1:1130242/58‑1 (MQ=255) tATTCATCGTGTTGATAAGATATATGTTATATGAATGTTTATTAAATGTAGCGATTAc  <  1:1177435/58‑1 (MQ=255) tATTCATCGTGTTGATAAGATATATGTTATATGAATGTTTATTAAATGTAGCGATTAc  <  1:1265725/58‑1 (MQ=255) tATTCATCGTGTTGATAAGATATATGTTATATGAATGTTTATTAAATGTAGCGATTAc  <  1:1267417/58‑1 (MQ=255) tATTCATCGTGTTGATAAGATATATGTTATATGAATGTTTATTAAATGTAGCGATTAc  <  1:1327709/58‑1 (MQ=255) tATTCATCGTGTTGATAAGATATATGTTATATGAATGTTTATTAAATGTAGCGATTAc  <  1:1342130/58‑1 (MQ=255) tATTCATCGTGTTGATAAGATATATGTTATATGAATGTTTATTAAATGTAGCGATTAc  <  1:1369142/58‑1 (MQ=255) tATTCATCGTGTTGATAAGATATATGTTATATGAATGTTTATTAAATGTAGCGATTAc  <  1:1386405/58‑1 (MQ=255) tATTCATCGTGTTGATAAGATATATGTTATATGAATGTTTATTAAATGTAGCGATTAc  <  1:1542306/58‑1 (MQ=255) tATTCATCGTGTTGATAAGATATATGTTATATGAATGTTTATTAAATGTAGCGATTAc  <  1:10306/58‑1 (MQ=255) tATTCATCGTGTTGATAAGATATATGTTATATGAATGTTTATTAAATGTAGCGATTAc  <  1:1622116/58‑1 (MQ=255) tATTCATCGTGTTGATAAGATATATGTTATATGAATGTTTATTAAATGTAGCGATTAc  <  1:1618242/58‑1 (MQ=255) tATTCATCGTGTTGATAAGATATATGTTATATGAATGTTTATTAAATGTAGCGATTAc  <  1:1611113/58‑1 (MQ=255) tATTCATCGTGTTGATAAGATATATGTTATATGAATGTTTATTAAATGTAGCGATTAc  <  1:1574038/58‑1 (MQ=255) tATTCATCGTGTTGATAAGATATATGTTATATGAATGTTTATTAAATGTAGCGATTAc  <  1:1568499/58‑1 (MQ=255) tATTCATCGTGTTGATAAGATATATGTTATATGAATGTTTATTAAATGTAGCGATTAc  <  1:156610/58‑1 (MQ=255) tATTCATCGTGTTGATAAGATATATGTTATATGAATGTTTATTAAATGTAGCGATTAc  <  1:155956/58‑1 (MQ=255) tATTCATCGTGTTGATAAGATATATGTTATATGAATGTTTATTAAATGTAGCGATTAc  <  1:170390/58‑1 (MQ=255) tATTCATCGTGTTGATAAGATATATGTTATATGAATGTTTATTAAATGTAGCGATTAc  <  1:1539461/58‑1 (MQ=255) tATTCATCGTGTTGATAAGATATATGTTATATGAATGTTTATTAAATGTAGCGATTAc  <  1:153729/58‑1 (MQ=255) tATTCATCGTGTTGATAAGATATATGTTATATGAATGTTTATTAAATGTAGCGATTAc  <  1:1535013/58‑1 (MQ=255) tATTCATCGTGTTGATAAGATATATGTTATATGAATGTTTATTAAATGTAGCGATTAc  <  1:1501315/58‑1 (MQ=255) tATTCATCGTGTTGATAAGATATATGTTATATGAATGTTTATTAAATGTAGCGATTAc  <  1:1452938/58‑1 (MQ=255) tATTCATCGTGTTGATAAGATATATGTTATATGAATGTTTATTAAATGTAGCGATTAc  <  1:1433936/58‑1 (MQ=255) tATTCATCGTGATGATAAGATATATGTTATATGAATGTTTATTAAATGTAGCGATTAc  <  1:13188/58‑1 (MQ=255) |                                                          TATTCATCGTGTTGATAAGATATATGTTATATGAATGTTTATTAAATGTAGCGATTAC  >  W3110S.gb/3974329‑3974386

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑