Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3981323	3981482	160	18 [0]	[0] 99	mdtE/gadE	multidrug resistance efflux transporter/DNA‑binding transcriptional activator

CTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGATGTGATACCC  >  W3110S.gb/3981483‑3981545 |                                                               cTCGTCATTCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGATGTGATa     >  1:547494/1‑60 (MQ=255) cTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCt                          >  1:1308711/1‑39 (MQ=255) cTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGATGTGAt      >  1:983632/1‑59 (MQ=255) cTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGATGTGAt      >  1:453287/1‑59 (MQ=255) cTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGATGTGATa     >  1:347745/1‑60 (MQ=255) cTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGATGTGATa     >  1:154194/1‑60 (MQ=255) cTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGATGTGATa     >  1:497626/1‑60 (MQ=255) cTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGATGTGATa     >  1:491343/1‑60 (MQ=255) cTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGATGTGATa     >  1:460100/1‑60 (MQ=255) cTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGATGTGATa     >  1:1498667/1‑60 (MQ=255) cTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGATGTGATa     >  1:1555307/1‑60 (MQ=255) cTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGATGTGATa     >  1:433764/1‑60 (MQ=255) cTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGATGTGATa     >  1:425313/1‑60 (MQ=255) cTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGATGTGATa     >  1:408006/1‑60 (MQ=255) cTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGATGTGATa     >  1:390825/1‑60 (MQ=255) cTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGATGTGATa     >  1:378250/1‑60 (MQ=255) cTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGATGTGATa     >  1:1575677/1‑60 (MQ=255) cTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGATGTGATa     >  1:335809/1‑60 (MQ=255) cTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGATGTGATa     >  1:27508/1‑60 (MQ=255) cTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGATGTGATa     >  1:23041/1‑60 (MQ=255) cTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGATGTGATa     >  1:176803/1‑60 (MQ=255) cTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGATGTGATa     >  1:173265/1‑60 (MQ=255) cTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGATGTGATa     >  1:1650071/1‑60 (MQ=255) cTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGATGTGATa     >  1:1628753/1‑60 (MQ=255) cTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGATGTGATa     >  1:1600978/1‑60 (MQ=255) cTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGATGTGATa     >  1:1585522/1‑60 (MQ=255) cTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGATGTGATa     >  1:1577199/1‑60 (MQ=255) cTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGATGTGATa     >  1:640530/1‑60 (MQ=255) cTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGATGTGATa     >  1:974122/1‑60 (MQ=255) cTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGATGTGATa     >  1:963992/1‑60 (MQ=255) cTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGATGTGATa     >  1:908872/1‑60 (MQ=255) cTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGATGTGATa     >  1:84978/1‑60 (MQ=255) cTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGATGTGATa     >  1:828714/1‑60 (MQ=255) cTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGATGTGATa     >  1:762678/1‑60 (MQ=255) cTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGATGTGATa     >  1:749487/1‑60 (MQ=255) cTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGATGTGATa     >  1:740881/1‑60 (MQ=255) cTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGATGTGATa     >  1:733998/1‑60 (MQ=255) cTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGATGTGATa     >  1:7338/1‑60 (MQ=255) cTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGATGTGATa     >  1:71702/1‑60 (MQ=255) cTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGATGTGATa     >  1:506690/1‑60 (MQ=255) cTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGATGTGATa     >  1:625894/1‑60 (MQ=255) cTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGATGTGATa     >  1:623341/1‑60 (MQ=255) cTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGATGTGATa     >  1:619748/1‑60 (MQ=255) cTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGATGTGATa     >  1:618545/1‑60 (MQ=255) cTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGATGTGATa     >  1:587401/1‑60 (MQ=255) cTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGATGTGATa     >  1:57897/1‑60 (MQ=255) cTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGATGTGATa     >  1:550670/1‑60 (MQ=255) cTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGATGTGATa     >  1:54077/1‑60 (MQ=255) cTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGATGTGATa     >  1:535799/1‑60 (MQ=255) cTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGATGTGATa     >  1:514402/1‑60 (MQ=255) cTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGATGTGATa     >  1:1206862/1‑60 (MQ=255) cTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGATGTGATa     >  1:1288669/1‑60 (MQ=255) cTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGATGTGATa     >  1:1282806/1‑60 (MQ=255) cTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGATGTGATa     >  1:1276532/1‑60 (MQ=255) cTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGATGTGATa     >  1:1275630/1‑60 (MQ=255) cTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGATGTGATa     >  1:1273851/1‑60 (MQ=255) cTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGATGTGATa     >  1:1268491/1‑60 (MQ=255) cTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGATGTGATa     >  1:1265336/1‑60 (MQ=255) cTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGATGTGATa     >  1:1263166/1‑60 (MQ=255) cTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGATGTGATa     >  1:1263151/1‑60 (MQ=255) cTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGATGTGATa     >  1:1228649/1‑60 (MQ=255) cTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGATGTGATa     >  1:1217459/1‑60 (MQ=255) cTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGATGTGATa     >  1:1208760/1‑60 (MQ=255) cTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGATGTGATa     >  1:1300264/1‑60 (MQ=255) cTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGATGTGATa     >  1:1193803/1‑60 (MQ=255) cTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGATGTGATa     >  1:116437/1‑60 (MQ=255) cTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGATGTGATa     >  1:1149796/1‑60 (MQ=255) cTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGATGTGATa     >  1:1137080/1‑60 (MQ=255) cTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGATGTGATa     >  1:111809/1‑60 (MQ=255) cTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGATGTGATa     >  1:109817/1‑60 (MQ=255) cTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGATGTGATa     >  1:1068123/1‑60 (MQ=255) cTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGATGTGATa     >  1:1061678/1‑60 (MQ=255) cTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGATGTGATa     >  1:105506/1‑60 (MQ=255) cTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGATGTGATa     >  1:104451/1‑60 (MQ=255) cTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGATGTGATa     >  1:1042592/1‑60 (MQ=255) cTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGATGTGATa     >  1:1439876/1‑60 (MQ=255) cTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGATGTGATa     >  1:1030579/1‑60 (MQ=255) cTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGATGTGATa     >  1:1497664/1‑60 (MQ=255) cTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGATGTGATa     >  1:1495716/1‑60 (MQ=255) cTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGATGTGATa     >  1:1491494/1‑60 (MQ=255) cTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGATGTGATa     >  1:1481474/1‑60 (MQ=255) cTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGATGTGATa     >  1:1480824/1‑60 (MQ=255) cTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGATGTGATa     >  1:1478927/1‑60 (MQ=255) cTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGATGTGATa     >  1:1468776/1‑60 (MQ=255) cTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGATGTGATa     >  1:1464164/1‑60 (MQ=255) cTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGATGTGATa     >  1:1459900/1‑60 (MQ=255) cTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGATGTGATa     >  1:1441319/1‑60 (MQ=255) cTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGATGTGATa     >  1:1536073/1‑60 (MQ=255) cTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGATGTGATa     >  1:1430573/1‑60 (MQ=255) cTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGATGTGATa     >  1:1412111/1‑60 (MQ=255) cTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGATGTGATa     >  1:1393235/1‑60 (MQ=255) cTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGATGTGATa     >  1:1384093/1‑60 (MQ=255) cTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGATGTGATa     >  1:136326/1‑60 (MQ=255) cTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGATGTGATa     >  1:1362486/1‑60 (MQ=255) cTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGATGTGATa     >  1:1360370/1‑60 (MQ=255) cTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGATGTGATa     >  1:1354956/1‑60 (MQ=255) cTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGATGTGATa     >  1:1336786/1‑60 (MQ=255) cTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGAC‑AAAAATAAGATGTGATAccc  >  1:1357771/1‑62 (MQ=255) cTCGTCATGCCAGCCATCAATTTAAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGATGTGATa     >  1:1332023/1‑60 (MQ=255) |                                                               CTCGTCATGCCAGCCATCAATTTCAGTTGCTTATGTCCTGACTAAAAATAAGATGTGATACCC  >  W3110S.gb/3981483‑3981545

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑