Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4108311	4108339	29	58 [0]	[0] 55	yhgE	predicted inner membrane protein

GCCTTCGCATCCGCAATGACAGTAGCCGCTATCGCTATTTTTACCAGTCAGTATGGCATAAC  >  W3110S.gb/4108340‑4108401 |                                                              gCCTTCTCATCCGCAATGACAGTAGCCGCTATCGCTATTTTTACCAGTCAGTATGGCATAAc  <  1:587709/62‑1 (MQ=255) gCCTTCGCATCCGCAATGACAGTAGCCGCTTTCGCTATTTTTACCAGTCAGTATGGCATAAc  <  1:1439273/62‑1 (MQ=255) gCCTTCGCATCCGCAATGACAGTAGCCGCTATCTCTATTTTTACCAGTCAGTATGGCATAAc  <  1:1237865/62‑1 (MQ=255) gCCTTCGCATCCGCAATGACAGTAGCCGCTATCGCTATTTTTACCAGTCAGTATGGCATAAc  <  1:60184/62‑1 (MQ=255) gCCTTCGCATCCGCAATGACAGTAGCCGCTATCGCTATTTTTACCAGTCAGTATGGCATAAc  <  1:22089/62‑1 (MQ=255) gCCTTCGCATCCGCAATGACAGTAGCCGCTATCGCTATTTTTACCAGTCAGTATGGCATAAc  <  1:244198/62‑1 (MQ=255) gCCTTCGCATCCGCAATGACAGTAGCCGCTATCGCTATTTTTACCAGTCAGTATGGCATAAc  <  1:254851/62‑1 (MQ=255) gCCTTCGCATCCGCAATGACAGTAGCCGCTATCGCTATTTTTACCAGTCAGTATGGCATAAc  <  1:262211/62‑1 (MQ=255) gCCTTCGCATCCGCAATGACAGTAGCCGCTATCGCTATTTTTACCAGTCAGTATGGCATAAc  <  1:266877/62‑1 (MQ=255) gCCTTCGCATCCGCAATGACAGTAGCCGCTATCGCTATTTTTACCAGTCAGTATGGCATAAc  <  1:330220/62‑1 (MQ=255) gCCTTCGCATCCGCAATGACAGTAGCCGCTATCGCTATTTTTACCAGTCAGTATGGCATAAc  <  1:341932/62‑1 (MQ=255) gCCTTCGCATCCGCAATGACAGTAGCCGCTATCGCTATTTTTACCAGTCAGTATGGCATAAc  <  1:349559/62‑1 (MQ=255) gCCTTCGCATCCGCAATGACAGTAGCCGCTATCGCTATTTTTACCAGTCAGTATGGCATAAc  <  1:388752/62‑1 (MQ=255) gCCTTCGCATCCGCAATGACAGTAGCCGCTATCGCTATTTTTACCAGTCAGTATGGCATAAc  <  1:413703/62‑1 (MQ=255) gCCTTCGCATCCGCAATGACAGTAGCCGCTATCGCTATTTTTACCAGTCAGTATGGCATAAc  <  1:425424/62‑1 (MQ=255) gCCTTCGCATCCGCAATGACAGTAGCCGCTATCGCTATTTTTACCAGTCAGTATGGCATAAc  <  1:437440/62‑1 (MQ=255) gCCTTCGCATCCGCAATGACAGTAGCCGCTATCGCTATTTTTACCAGTCAGTATGGCATAAc  <  1:197130/62‑1 (MQ=255) gCCTTCGCATCCGCAATGACAGTAGCCGCTATCGCTATTTTTACCAGTCAGTATGGCATAAc  <  1:617177/62‑1 (MQ=255) gCCTTCGCATCCGCAATGACAGTAGCCGCTATCGCTATTTTTACCAGTCAGTATGGCATAAc  <  1:646146/62‑1 (MQ=255) gCCTTCGCATCCGCAATGACAGTAGCCGCTATCGCTATTTTTACCAGTCAGTATGGCATAAc  <  1:685793/62‑1 (MQ=255) gCCTTCGCATCCGCAATGACAGTAGCCGCTATCGCTATTTTTACCAGTCAGTATGGCATAAc  <  1:716251/62‑1 (MQ=255) gCCTTCGCATCCGCAATGACAGTAGCCGCTATCGCTATTTTTACCAGTCAGTATGGCATAAc  <  1:72495/62‑1 (MQ=255) gCCTTCGCATCCGCAATGACAGTAGCCGCTATCGCTATTTTTACCAGTCAGTATGGCATAAc  <  1:753685/62‑1 (MQ=255) gCCTTCGCATCCGCAATGACAGTAGCCGCTATCGCTATTTTTACCAGTCAGTATGGCATAAc  <  1:768124/62‑1 (MQ=255) gCCTTCGCATCCGCAATGACAGTAGCCGCTATCGCTATTTTTACCAGTCAGTATGGCATAAc  <  1:801936/62‑1 (MQ=255) gCCTTCGCATCCGCAATGACAGTAGCCGCTATCGCTATTTTTACCAGTCAGTATGGCATAAc  <  1:841217/62‑1 (MQ=255) gCCTTCGCATCCGCAATGACAGTAGCCGCTATCGCTATTTTTACCAGTCAGTATGGCATAAc  <  1:845294/62‑1 (MQ=255) gCCTTCGCATCCGCAATGACAGTAGCCGCTATCGCTATTTTTACCAGTCAGTATGGCATAAc  <  1:918101/62‑1 (MQ=255) gCCTTCGCATCCGCAATGACAGTAGCCGCTATCGCTATTTTTACCAGTCAGTATGGCATAAc  <  1:961008/62‑1 (MQ=255) gCCTTCGCATCCGCAATGACAGTAGCCGCTATCGCTATTTTTACCAGTCAGTATGGCATAAc  <  1:142206/62‑1 (MQ=255) gCCTTCGCATCCGCAATGACAGTAGCCGCTATCGCTATTTTTACCAGTCAGTATGGCATAAc  <  1:110304/62‑1 (MQ=255) gCCTTCGCATCCGCAATGACAGTAGCCGCTATCGCTATTTTTACCAGTCAGTATGGCATAAc  <  1:1164437/62‑1 (MQ=255) gCCTTCGCATCCGCAATGACAGTAGCCGCTATCGCTATTTTTACCAGTCAGTATGGCATAAc  <  1:1171684/62‑1 (MQ=255) gCCTTCGCATCCGCAATGACAGTAGCCGCTATCGCTATTTTTACCAGTCAGTATGGCATAAc  <  1:1203355/62‑1 (MQ=255) gCCTTCGCATCCGCAATGACAGTAGCCGCTATCGCTATTTTTACCAGTCAGTATGGCATAAc  <  1:1212948/62‑1 (MQ=255) gCCTTCGCATCCGCAATGACAGTAGCCGCTATCGCTATTTTTACCAGTCAGTATGGCATAAc  <  1:1277370/62‑1 (MQ=255) gCCTTCGCATCCGCAATGACAGTAGCCGCTATCGCTATTTTTACCAGTCAGTATGGCATAAc  <  1:1290604/62‑1 (MQ=255) gCCTTCGCATCCGCAATGACAGTAGCCGCTATCGCTATTTTTACCAGTCAGTATGGCATAAc  <  1:1339273/62‑1 (MQ=255) gCCTTCGCATCCGCAATGACAGTAGCCGCTATCGCTATTTTTACCAGTCAGTATGGCATAAc  <  1:1359052/62‑1 (MQ=255) gCCTTCGCATCCGCAATGACAGTAGCCGCTATCGCTATTTTTACCAGTCAGTATGGCATAAc  <  1:1381158/62‑1 (MQ=255) gCCTTCGCATCCGCAATGACAGTAGCCGCTATCGCTATTTTTACCAGTCAGTATGGCATAAc  <  1:1384459/62‑1 (MQ=255) gCCTTCGCATCCGCAATGACAGTAGCCGCTATCGCTATTTTTACCAGTCAGTATGGCATAAc  <  1:1403286/62‑1 (MQ=255) gCCTTCGCATCCGCAATGACAGTAGCCGCTATCGCTATTTTTACCAGTCAGTATGGCATAAc  <  1:208343/62‑1 (MQ=255) gCCTTCGCATCCGCAATGACAGTAGCCGCTATCGCTATTTTTACCAGTCAGTATGGCATAAc  <  1:1426876/62‑1 (MQ=255) gCCTTCGCATCCGCAATGACAGTAGCCGCTATCGCTATTTTTACCAGTCAGTATGGCATAAc  <  1:1437745/62‑1 (MQ=255) gCCTTCGCATCCGCAATGACAGTAGCCGCTATCGCTATTTTTACCAGTCAGTATGGCATAAc  <  1:1467226/62‑1 (MQ=255) gCCTTCGCATCCGCAATGACAGTAGCCGCTATCGCTATTTTTACCAGTCAGTATGGCATAAc  <  1:1482630/62‑1 (MQ=255) gCCTTCGCATCCGCAATGACAGTAGCCGCTATCGCTATTTTTACCAGTCAGTATGGCATAAc  <  1:1490731/62‑1 (MQ=255) gCCTTCGCATCCGCAATGACAGTAGCCGCTATCGCTATTTTTACCAGTCAGTATGGCATAAc  <  1:1501308/62‑1 (MQ=255) gCCTTCGCATCCGCAATGACAGTAGCCGCTATCGCTATTTTTACCAGTCAGTATGGCATAAc  <  1:1505208/62‑1 (MQ=255) gCCTTCGCATCCGCAATGACAGTAGCCGCTATCGCTATTTTTACCAGTCAGTATGGCATAAc  <  1:1527070/62‑1 (MQ=255) gCCTTCGCATCCGCAATGACAGTAGCCGCTATCGCTATTTTTACCAGTCAGTATGGCATAAc  <  1:1540404/62‑1 (MQ=255) gCCTTCGCATCCGCAATGACAGTAGCCGCTATCGCTATTTTTACCAGTCAGTATGGCATAAc  <  1:1569605/62‑1 (MQ=255) gCCTTCGCATCCGCAATGACAGTAGCCGCTATCGCTATTTTTACCAGTCAGTATGGCATAAc  <  1:1600665/62‑1 (MQ=255) gCCTTCGCATCCGCAATGACAGTAGCCGCTATCGCTATTTTTACCAGTCAGTATGGCATAAc  <  1:1012842/62‑1 (MQ=255) |                                                              GCCTTCGCATCCGCAATGACAGTAGCCGCTATCGCTATTTTTACCAGTCAGTATGGCATAAC  >  W3110S.gb/4108340‑4108401

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑