Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4178616	4178678	63	53 [1]	[0] 70	gspH	predicted general secretory pathway component, cryptic

AATGGAACCCAGCGCCAGGCTGATGGTGTTTTGCCCGGTACCATAATGCGCCATGCTGAAT  >  W3110S.gb/4178679‑4178739 |                                                             aaTGGAACCCAGCGCCAGGCTGATGGTGTTTTGccc                           >  1:212646/1‑36 (MQ=255) aaTGGAACCCAGCGCCAGGCTGATGGTGTTTTGCCCGGTACCGTAATGCGCCATGCTGa    >  1:509295/1‑59 (MQ=255) aaTGGAACCCAGCGCCAGGCTGATGGTGTTTTGCCCGGTACCATAATgcgc            >  1:833392/1‑51 (MQ=255) aaTGGAACCCAGCGCCAGGCTGATGGTGTTTTGCCCGGTACCATAATgcg             >  1:1476366/1‑50 (MQ=255) aaTGGAACCCAGCGCCAGGCTGATGGTGTTTTGCCCGGTACCATAATGCGCCATGCt      >  1:1160725/1‑57 (MQ=255) aaTGGAACCCAGCGCCAGGCTGATGGTGTTTTGCCCGGTACCATAATGCGCCATGCTGa    >  1:593910/1‑59 (MQ=255) aaTGGAACCCAGCGCCAGGCTGATGGTGTTTTGCCCGGTACCATAATGCGCCATGCTGa    >  1:697646/1‑59 (MQ=255) aaTGGAACCCAGCGCCAGGCTGATGGTGTTTTGCCCGGTACCATAATGCGCCATGCTGa    >  1:688163/1‑59 (MQ=255) aaTGGAACCCAGCGCCAGGCTGATGGTGTTTTGCCCGGTACCATAATGCGCCATGCTGa    >  1:672731/1‑59 (MQ=255) aaTGGAACCCAGCGCCAGGCTGATGGTGTTTTGCCCGGTACCATAATGCGCCATGCTGa    >  1:645639/1‑59 (MQ=255) aaTGGAACCCAGCGCCAGGCTGATGGTGTTTTGCCCGGTACCATAATGCGCCATGCTGa    >  1:633834/1‑59 (MQ=255) aaTGGAACCCAGCGCCAGGCTGATGGTGTTTTGCCCGGTACCATAATGCGCCATGCTGa    >  1:605503/1‑59 (MQ=255) aaTGGAACCCAGCGCCAGGCTGATGGTGTTTTGCCCGGTACCATAATGCGCCATGCTGa    >  1:714465/1‑59 (MQ=255) aaTGGAACCCAGCGCCAGGCTGATGGTGTTTTGCCCGGTACCATAATGCGCCATGCTGa    >  1:556964/1‑59 (MQ=255) aaTGGAACCCAGCGCCAGGCTGATGGTGTTTTGCCCGGTACCATAATGCGCCATGCTGa    >  1:536752/1‑59 (MQ=255) aaTGGAACCCAGCGCCAGGCTGATGGTGTTTTGCCCGGTACCATAATGCGCCATGCTGa    >  1:488703/1‑59 (MQ=255) aaTGGAACCCAGCGCCAGGCTGATGGTGTTTTGCCCGGTACCATAATGCGCCATGCTGa    >  1:467199/1‑59 (MQ=255) aaTGGAACCCAGCGCCAGGCTGATGGTGTTTTGCCCGGTACCATAATGCGCCATGCTGa    >  1:457994/1‑59 (MQ=255) aaTGGAACCCAGCGCCAGGCTGATGGTGTTTTGCCCGGTACCATAATGCGCCATGCTGa    >  1:1009853/1‑59 (MQ=255) aaTGGAACCCAGCGCCAGGCTGATGGTGTTTTGCCCGGTACCATAATGCGCCATGCTGa    >  1:7063/1‑59 (MQ=255) aaTGGAACCCAGCGCCAGGCTGATGGTGTTTTGCCCGGTACCATAATGCGCCATGCTGa    >  1:457150/1‑59 (MQ=255) aaTGGAACCCAGCGCCAGGCTGATGGTGTTTTGCCCGGTACCATAATGCGCCATGCTGa    >  1:71885/1‑59 (MQ=255) aaTGGAACCCAGCGCCAGGCTGATGGTGTTTTGCCCGGTACCATAATGCGCCATGCTGa    >  1:727637/1‑59 (MQ=255) aaTGGAACCCAGCGCCAGGCTGATGGTGTTTTGCCCGGTACCATAATGCGCCATGCTGa    >  1:756972/1‑59 (MQ=255) aaTGGAACCCAGCGCCAGGCTGATGGTGTTTTGCCCGGTACCATAATGCGCCATGCTGa    >  1:795024/1‑59 (MQ=255) aaTGGAACCCAGCGCCAGGCTGATGGTGTTTTGCCCGGTACCATAATGCGCCATGCTGa    >  1:79762/1‑59 (MQ=255) aaTGGAACCCAGCGCCAGGCTGATGGTGTTTTGCCCGGTACCATAATGCGCCATGCTGa    >  1:831993/1‑59 (MQ=255) aaTGGAACCCAGCGCCAGGCTGATGGTGTTTTGCCCGGTACCATAATGCGCCATGCTGa    >  1:835928/1‑59 (MQ=255) aaTGGAACCCAGCGCCAGGCTGATGGTGTTTTGCCCGGTACCATAATGCGCCATGCTGa    >  1:837174/1‑59 (MQ=255) aaTGGAACCCAGCGCCAGGCTGATGGTGTTTTGCCCGGTACCATAATGCGCCATGCTGa    >  1:902971/1‑59 (MQ=255) aaTGGAACCCAGCGCCAGGCTGATGGTGTTTTGCCCGGTACCATAATGCGCCATGCTGa    >  1:917412/1‑59 (MQ=255) aaTGGAACCCAGCGCCAGGCTGATGGTGTTTTGCCCGGTACCATAATGCGCCATGCTGa    >  1:928341/1‑59 (MQ=255) aaTGGAACCCAGCGCCAGGCTGATGGTGTTTTGCCCGGTACCATAATGCGCCATGCTGa    >  1:93324/1‑59 (MQ=255) aaTGGAACCCAGCGCCAGGCTGATGGTGTTTTGCCCGGTACCATAATGCGCCATGCTGa    >  1:977476/1‑59 (MQ=255) aaTGGAACCCAGCGCCAGGCTGATGGTGTTTTGCCCGGTACCATAATGCGCCATGCTGa    >  1:993312/1‑59 (MQ=255) aaTGGAACCCAGCGCCAGGCTGATGGTGTTTTGCCCGGTACCATAATGCGCCATGCTGa    >  1:1383813/1‑59 (MQ=255) aaTGGAACCCAGCGCCAGGCTGATGGTGTTTTGCCCGGTACCATAATGCGCCATGCTGa    >  1:1014108/1‑59 (MQ=255) aaTGGAACCCAGCGCCAGGCTGATGGTGTTTTGCCCGGTACCATAATGCGCCATGCTGa    >  1:1014970/1‑59 (MQ=255) aaTGGAACCCAGCGCCAGGCTGATGGTGTTTTGCCCGGTACCATAATGCGCCATGCTGa    >  1:1018531/1‑59 (MQ=255) aaTGGAACCCAGCGCCAGGCTGATGGTGTTTTGCCCGGTACCATAATGCGCCATGCTGa    >  1:1019569/1‑59 (MQ=255) aaTGGAACCCAGCGCCAGGCTGATGGTGTTTTGCCCGGTACCATAATGCGCCATGCTGa    >  1:1022351/1‑59 (MQ=255) aaTGGAACCCAGCGCCAGGCTGATGGTGTTTTGCCCGGTACCATAATGCGCCATGCTGa    >  1:1180451/1‑59 (MQ=255) aaTGGAACCCAGCGCCAGGCTGATGGTGTTTTGCCCGGTACCATAATGCGCCATGCTGa    >  1:1186012/1‑59 (MQ=255) aaTGGAACCCAGCGCCAGGCTGATGGTGTTTTGCCCGGTACCATAATGCGCCATGCTGa    >  1:1260604/1‑59 (MQ=255) aaTGGAACCCAGCGCCAGGCTGATGGTGTTTTGCCCGGTACCATAATGCGCCATGCTGa    >  1:1262458/1‑59 (MQ=255) aaTGGAACCCAGCGCCAGGCTGATGGTGTTTTGCCCGGTACCATAATGCGCCATGCTGa    >  1:1264576/1‑59 (MQ=255) aaTGGAACCCAGCGCCAGGCTGATGGTGTTTTGCCCGGTACCATAATGCGCCATGCTGa    >  1:1284759/1‑59 (MQ=255) aaTGGAACCCAGCGCCAGGCTGATGGTGTTTTGCCCGGTACCATAATGCGCCATGCTGa    >  1:1303789/1‑59 (MQ=255) aaTGGAACCCAGCGCCAGGCTGATGGTGTTTTGCCCGGTACCATAATGCGCCATGCTGa    >  1:1320638/1‑59 (MQ=255) aaTGGAACCCAGCGCCAGGCTGATGGTGTTTTGCCCGGTACCATAATGCGCCATGCTGa    >  1:1334079/1‑59 (MQ=255) aaTGGAACCCAGCGCCAGGCTGATGGTGTTTTGCCCGGTACCATAATGCGCCATGCTGa    >  1:448627/1‑59 (MQ=255) aaTGGAACCCAGCGCCAGGCTGATGGTGTTTTGCCCGGTACCATAATGCGCCATGCTGa    >  1:315254/1‑59 (MQ=255) aaTGGAACCCAGCGCCAGGCTGATGGTGTTTTGCCCGGTACCATAATGCGCCATGCTGa    >  1:44082/1‑59 (MQ=255) aaTGGAACCCAGCGCCAGGCTGATGGTGTTTTGCCCGGTACCATAATGCGCCATGCTGa    >  1:413725/1‑59 (MQ=255) aaTGGAACCCAGCGCCAGGCTGATGGTGTTTTGCCCGGTACCATAATGCGCCATGCTGa    >  1:412803/1‑59 (MQ=255) aaTGGAACCCAGCGCCAGGCTGATGGTGTTTTGCCCGGTACCATAATGCGCCATGCTGa    >  1:393145/1‑59 (MQ=255) aaTGGAACCCAGCGCCAGGCTGATGGTGTTTTGCCCGGTACCATAATGCGCCATGCTGa    >  1:354849/1‑59 (MQ=255) aaTGGAACCCAGCGCCAGGCTGATGGTGTTTTGCCCGGTACCATAATGCGCCATGCTGa    >  1:352801/1‑59 (MQ=255) aaTGGAACCCAGCGCCAGGCTGATGGTGTTTTGCCCGGTACCATAATGCGCCATGCTGa    >  1:318276/1‑59 (MQ=255) aaTGGAACCCAGCGCCAGGCTGATGGTGTTTTGCCCGGTACCATAATGCGCCATGCTGa    >  1:1423824/1‑59 (MQ=255) aaTGGAACCCAGCGCCAGGCTGATGGTGTTTTGCCCGGTACCATAATGCGCCATGCTGa    >  1:311238/1‑59 (MQ=255) aaTGGAACCCAGCGCCAGGCTGATGGTGTTTTGCCCGGTACCATAATGCGCCATGCTGa    >  1:202061/1‑59 (MQ=255) aaTGGAACCCAGCGCCAGGCTGATGGTGTTTTGCCCGGTACCATAATGCGCCATGCTGa    >  1:179688/1‑59 (MQ=255) aaTGGAACCCAGCGCCAGGCTGATGGTGTTTTGCCCGGTACCATAATGCGCCATGCTGa    >  1:1633160/1‑59 (MQ=255) aaTGGAACCCAGCGCCAGGCTGATGGTGTTTTGCCCGGTACCATAATGCGCCATGCTGa    >  1:1624765/1‑59 (MQ=255) aaTGGAACCCAGCGCCAGGCTGATGGTGTTTTGCCCGGTACCATAATGCGCCATGCTGa    >  1:1450844/1‑59 (MQ=255) aaTGGAACCCAGCGCCAGGCTGATGGTGTTTTGCCCGGTACCATAATGAGCCATGCTg     >  1:762099/1‑58 (MQ=255) aaTGGAACCCAGCGCCAGGCTGATGGTGTTTTGCCCGGTACCATAATCCGCCATGCTGa    >  1:897617/1‑59 (MQ=255) aaTGGAACCCAGCGCCAGGCTGATGGTGTTTTGCCCGGTACCAAAATGCGCCATGCTGa    >  1:62258/1‑59 (MQ=255) aaTGGAACCCAGCGCCAGGCTGATGGTG‑TTTGCCCGGTACCATAATGCGCCATGCTGAAt  >  1:859633/1‑60 (MQ=255) |                                                             AATGGAACCCAGCGCCAGGCTGATGGTGTTTTGCCCGGTACCATAATGCGCCATGCTGAAT  >  W3110S.gb/4178679‑4178739

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑