Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4179147	4179224	78	94 [1]	[0] 35	gspG	pseudopilin, cryptic, general secretion pathway

ATCAAGGGCGTTTTCCAGCGCCACAATATCGCTGACGGCTTTTTGCTTATCCGCCTTTTCTT  >  W3110S.gb/4179225‑4179286 |                                                              atCAAGGGCGTTTTCCAGCGCCACAATATCGCTGACGGCTTTTTGCTTATCCGCCTTTTCtt  >  1:468695/1‑62 (MQ=255) atCAAGGGCGTTTTCCAGCGCCACAATATCGCTGACGGCTTTTTGCTTATCCGCCTTTTCtt  >  1:206512/1‑62 (MQ=255) atCAAGGGCGTTTTCCAGCGCCACAATATCGCTGACGGCTTTTTGCTTATCCGCCTTTTCtt  >  1:228985/1‑62 (MQ=255) atCAAGGGCGTTTTCCAGCGCCACAATATCGCTGACGGCTTTTTGCTTATCCGCCTTTTCtt  >  1:247076/1‑62 (MQ=255) atCAAGGGCGTTTTCCAGCGCCACAATATCGCTGACGGCTTTTTGCTTATCCGCCTTTTCtt  >  1:291234/1‑62 (MQ=255) atCAAGGGCGTTTTCCAGCGCCACAATATCGCTGACGGCTTTTTGCTTATCCGCCTTTTCtt  >  1:340105/1‑62 (MQ=255) atCAAGGGCGTTTTCCAGCGCCACAATATCGCTGACGGCTTTTTGCTTATCCGCCTTTTCtt  >  1:422975/1‑62 (MQ=255) atCAAGGGCGTTTTCCAGCGCCACAATATCGCTGACGGCTTTTTGCTTATCCGCCTTTTCtt  >  1:448024/1‑62 (MQ=255) atCAAGGGCGTTTTCCAGCGCCACAATATCGCTGACGGCTTTTTGCTTATCCGCCTTTTCtt  >  1:463082/1‑62 (MQ=255) atCAAGGGCGTTTTCCAGCGCCACAATATCGCTGACGGCTTTTTGCTTATCCGCCTTTTCtt  >  1:186711/1‑62 (MQ=255) atCAAGGGCGTTTTCCAGCGCCACAATATCGCTGACGGCTTTTTGCTTATCCGCCTTTTCtt  >  1:501044/1‑62 (MQ=255) atCAAGGGCGTTTTCCAGCGCCACAATATCGCTGACGGCTTTTTGCTTATCCGCCTTTTCtt  >  1:511383/1‑62 (MQ=255) atCAAGGGCGTTTTCCAGCGCCACAATATCGCTGACGGCTTTTTGCTTATCCGCCTTTTCtt  >  1:526490/1‑62 (MQ=255) atCAAGGGCGTTTTCCAGCGCCACAATATCGCTGACGGCTTTTTGCTTATCCGCCTTTTCtt  >  1:569623/1‑62 (MQ=255) atCAAGGGCGTTTTCCAGCGCCACAATATCGCTGACGGCTTTTTGCTTATCCGCCTTTTCtt  >  1:795163/1‑62 (MQ=255) atCAAGGGCGTTTTCCAGCGCCACAATATCGCTGACGGCTTTTTGCTTATCCGCCTTTTCtt  >  1:912918/1‑62 (MQ=255) atCAAGGGCGTTTTCCAGCGCCACAATATCGCTGACGGCTTTTTGCTTATCCGCCTTTTCtt  >  1:973397/1‑62 (MQ=255) atCAAGGGCGTTTTCCAGCGCCACAATATCGCTGACGGCTTTTTGCTTATCCGCCTTTTCtt  >  1:1417377/1‑62 (MQ=255) atCAAGGGCGTTTTCCAGCGCCACAATATCGCTGACGGCTTTTTGCTTATCCGCCTTTTCtt  >  1:1143114/1‑62 (MQ=255) atCAAGGGCGTTTTCCAGCGCCACAATATCGCTGACGGCTTTTTGCTTATCCGCCTTTTCtt  >  1:1153438/1‑62 (MQ=255) atCAAGGGCGTTTTCCAGCGCCACAATATCGCTGACGGCTTTTTGCTTATCCGCCTTTTCtt  >  1:1238364/1‑62 (MQ=255) atCAAGGGCGTTTTCCAGCGCCACAATATCGCTGACGGCTTTTTGCTTATCCGCCTTTTCtt  >  1:1240343/1‑62 (MQ=255) atCAAGGGCGTTTTCCAGCGCCACAATATCGCTGACGGCTTTTTGCTTATCCGCCTTTTCtt  >  1:1260477/1‑62 (MQ=255) atCAAGGGCGTTTTCCAGCGCCACAATATCGCTGACGGCTTTTTGCTTATCCGCCTTTTCtt  >  1:1304436/1‑62 (MQ=255) atCAAGGGCGTTTTCCAGCGCCACAATATCGCTGACGGCTTTTTGCTTATCCGCCTTTTCtt  >  1:1320337/1‑62 (MQ=255) atCAAGGGCGTTTTCCAGCGCCACAATATCGCTGACGGCTTTTTGCTTATCCGCCTTTTCtt  >  1:1416919/1‑62 (MQ=255) atCAAGGGCGTTTTCCAGCGCCACAATATCGCTGACGGCTTTTTGCTTATCCGCCTTTTCtt  >  1:1027589/1‑62 (MQ=255) atCAAGGGCGTTTTCCAGCGCCACAATATCGCTGACGGCTTTTTGCTTATCCGCCTTTTCtt  >  1:1465482/1‑62 (MQ=255) atCAAGGGCGTTTTCCAGCGCCACAATATCGCTGACGGCTTTTTGCTTATCCGCCTTTTCtt  >  1:1488278/1‑62 (MQ=255) atCAAGGGCGTTTTCCAGCGCCACAATATCGCTGACGGCTTTTTGCTTATCCGCCTTTTCtt  >  1:1529803/1‑62 (MQ=255) atCAAGGGCGTTTTCCAGCGCCACAATATCGCTGACGGCTTTTTGCTTATCCGCCTTTTCtt  >  1:1534058/1‑62 (MQ=255) atCAAGGGCGTTTTCCAGCGCCACAATATCGCTGACGGCTTTTTGCTTATCCGCCTTTTCtt  >  1:1620317/1‑62 (MQ=255) atCAAGGGCGTTTTCCAGCGCCACAATATCGCTGACGGCTTTTTGCTTATCCGCCTTTTCtt  >  1:1630623/1‑62 (MQ=255) atCAAGGGCGTTTTCCAGCGCCACAATATCGCTGACGGCTTTTTGCTTATCCGCCTTTTCt   >  1:1459907/1‑61 (MQ=255) atCAAGGGCGTTTTCCAGCGCCACAATATCGCTGACGGCTTTTTGCTTATCCGCCTTTTCt   >  1:36374/1‑61 (MQ=255) |                                                              ATCAAGGGCGTTTTCCAGCGCCACAATATCGCTGACGGCTTTTTGCTTATCCGCCTTTTCTT  >  W3110S.gb/4179225‑4179286

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑