Missing coverage evidence...
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*	*	÷	W3110S.gb	4180998	4181116	119	28 [0]	[0] 44	gspE	general secretory pathway component, cryptic

ACGAATTTCCCCCACCATGACGACATCCGGGTCCTGGCGAAGTATGGCGCGCAGGCCGCGAG  >  W3110S.gb/4181117‑4181178 |                                                              aCGAATTTCCCCCTCCATGACGACATCCGGGTCCTGGCGAAGTATGGCGCGCAGGCCgcgag  <  1:1234497/62‑1 (MQ=255) aCGAATTTCCCCCACCATGACGACATCCGGGTCCTGGCGAAGTATGGCGCGCAGGCCgcgag  <  1:767959/62‑1 (MQ=255) aCGAATTTCCCCCACCATGACGACATCCGGGTCCTGGCGAAGTATGGCGCGCAGGCCgcgag  <  1:454205/62‑1 (MQ=255) aCGAATTTCCCCCACCATGACGACATCCGGGTCCTGGCGAAGTATGGCGCGCAGGCCgcgag  <  1:482268/62‑1 (MQ=255) aCGAATTTCCCCCACCATGACGACATCCGGGTCCTGGCGAAGTATGGCGCGCAGGCCgcgag  <  1:503369/62‑1 (MQ=255) aCGAATTTCCCCCACCATGACGACATCCGGGTCCTGGCGAAGTATGGCGCGCAGGCCgcgag  <  1:5185/62‑1 (MQ=255) aCGAATTTCCCCCACCATGACGACATCCGGGTCCTGGCGAAGTATGGCGCGCAGGCCgcgag  <  1:560675/62‑1 (MQ=255) aCGAATTTCCCCCACCATGACGACATCCGGGTCCTGGCGAAGTATGGCGCGCAGGCCgcgag  <  1:626678/62‑1 (MQ=255) aCGAATTTCCCCCACCATGACGACATCCGGGTCCTGGCGAAGTATGGCGCGCAGGCCgcgag  <  1:628405/62‑1 (MQ=255) aCGAATTTCCCCCACCATGACGACATCCGGGTCCTGGCGAAGTATGGCGCGCAGGCCgcgag  <  1:655894/62‑1 (MQ=255) aCGAATTTCCCCCACCATGACGACATCCGGGTCCTGGCGAAGTATGGCGCGCAGGCCgcgag  <  1:675240/62‑1 (MQ=255) aCGAATTTCCCCCACCATGACGACATCCGGGTCCTGGCGAAGTATGGCGCGCAGGCCgcgag  <  1:697264/62‑1 (MQ=255) aCGAATTTCCCCCACCATGACGACATCCGGGTCCTGGCGAAGTATGGCGCGCAGGCCgcgag  <  1:714473/62‑1 (MQ=255) aCGAATTTCCCCCACCATGACGACATCCGGGTCCTGGCGAAGTATGGCGCGCAGGCCgcgag  <  1:453085/62‑1 (MQ=255) aCGAATTTCCCCCACCATGACGACATCCGGGTCCTGGCGAAGTATGGCGCGCAGGCCgcgag  <  1:769705/62‑1 (MQ=255) aCGAATTTCCCCCACCATGACGACATCCGGGTCCTGGCGAAGTATGGCGCGCAGGCCgcgag  <  1:774247/62‑1 (MQ=255) aCGAATTTCCCCCACCATGACGACATCCGGGTCCTGGCGAAGTATGGCGCGCAGGCCgcgag  <  1:800973/62‑1 (MQ=255) aCGAATTTCCCCCACCATGACGACATCCGGGTCCTGGCGAAGTATGGCGCGCAGGCCgcgag  <  1:891891/62‑1 (MQ=255) aCGAATTTCCCCCACCATGACGACATCCGGGTCCTGGCGAAGTATGGCGCGCAGGCCgcgag  <  1:892009/62‑1 (MQ=255) aCGAATTTCCCCCACCATGACGACATCCGGGTCCTGGCGAAGTATGGCGCGCAGGCCgcgag  <  1:913854/62‑1 (MQ=255) aCGAATTTCCCCCACCATGACGACATCCGGGTCCTGGCGAAGTATGGCGCGCAGGCCgcgag  <  1:993270/62‑1 (MQ=255) aCGAATTTCCCCCACCATGACGACATCCGGGTCCTGGCGAAGTATGGCGCGCAGGCCgcgag  <  1:9993/62‑1 (MQ=255) aCGAATTTCCCCCACCATGACGACATCCGGGTCCTGGCGAAGTATGGCGCGCAGGCCgcgag  <  1:99963/62‑1 (MQ=255) aCGAATTTCCCCCACCATGACGACATCCGGGTCCTGGCGAAGTATGGCGCGCAGGCCgcgag  <  1:1491055/62‑1 (MQ=255) aCGAATTTCCCCCACCATGACGACATCCGGGTCCTGGCGAAGTATGGCGCGCAGGCCgcgag  <  1:1098623/62‑1 (MQ=255) aCGAATTTCCCCCACCATGACGACATCCGGGTCCTGGCGAAGTATGGCGCGCAGGCCgcgag  <  1:1111989/62‑1 (MQ=255) aCGAATTTCCCCCACCATGACGACATCCGGGTCCTGGCGAAGTATGGCGCGCAGGCCgcgag  <  1:1117655/62‑1 (MQ=255) aCGAATTTCCCCCACCATGACGACATCCGGGTCCTGGCGAAGTATGGCGCGCAGGCCgcgag  <  1:1117941/62‑1 (MQ=255) aCGAATTTCCCCCACCATGACGACATCCGGGTCCTGGCGAAGTATGGCGCGCAGGCCgcgag  <  1:1161970/62‑1 (MQ=255) aCGAATTTCCCCCACCATGACGACATCCGGGTCCTGGCGAAGTATGGCGCGCAGGCCgcgag  <  1:1174319/62‑1 (MQ=255) aCGAATTTCCCCCACCATGACGACATCCGGGTCCTGGCGAAGTATGGCGCGCAGGCCgcgag  <  1:1202211/62‑1 (MQ=255) aCGAATTTCCCCCACCATGACGACATCCGGGTCCTGGCGAAGTATGGCGCGCAGGCCgcgag  <  1:1313889/62‑1 (MQ=255) aCGAATTTCCCCCACCATGACGACATCCGGGTCCTGGCGAAGTATGGCGCGCAGGCCgcgag  <  1:1322620/62‑1 (MQ=255) aCGAATTTCCCCCACCATGACGACATCCGGGTCCTGGCGAAGTATGGCGCGCAGGCCgcgag  <  1:1355529/62‑1 (MQ=255) aCGAATTTCCCCCACCATGACGACATCCGGGTCCTGGCGAAGTATGGCGCGCAGGCCgcgag  <  1:1096075/62‑1 (MQ=255) aCGAATTTCCCCCACCATGACGACATCCGGGTCCTGGCGAAGTATGGCGCGCAGGCCgcgag  <  1:1512275/62‑1 (MQ=255) aCGAATTTCCCCCACCATGACGACATCCGGGTCCTGGCGAAGTATGGCGCGCAGGCCgcgag  <  1:1524399/62‑1 (MQ=255) aCGAATTTCCCCCACCATGACGACATCCGGGTCCTGGCGAAGTATGGCGCGCAGGCCgcgag  <  1:1577827/62‑1 (MQ=255) aCGAATTTCCCCCACCATGACGACATCCGGGTCCTGGCGAAGTATGGCGCGCAGGCCgcgag  <  1:1603888/62‑1 (MQ=255) aCGAATTTCCCCCACCATGACGACATCCGGGTCCTGGCGAAGTATGGCGCGCAGGCCgcgag  <  1:172947/62‑1 (MQ=255) aCGAATTTCCCCCACCATGACGACATCCGGGTCCTGGCGAAGTATGGCGCGCAGGCCgcgag  <  1:221894/62‑1 (MQ=255) aCGAATTTCCCCCACCATGACGACATCCGGGTCCTGGCGAAGTATGGCGCGCAGGCCgcgag  <  1:316117/62‑1 (MQ=255) aCGAATTTCCCCCACCATGACGACATCCGGGTCCTGGCGAAGTATGGCGCGCAGGCCgcgag  <  1:366041/62‑1 (MQ=255) aCGAATTTCCCCCACCATGACGACATCCGGGTCCTGGCGAAGTATGGCGCGCAGGCCgcgag  <  1:451/62‑1 (MQ=255) |                                                              ACGAATTTCCCCCACCATGACGACATCCGGGTCCTGGCGAAGTATGGCGCGCAGGCCGCGAG  >  W3110S.gb/4181117‑4181178

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑