Missing coverage evidence...
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GCTTTGCTGGCGACCAGTTGCTGGCACCAGTTCGCCAGATTCA  >  W3110S.gb/75768‑75810 |                                           gCTTTGCTGGCGACCAGTTGCTGGCACCAGTTCGCCAGATTCa  <  1:700853/43‑1 (MQ=255) gCTTTGCTGGCGACCAGTTGCTGGCACCAGTTCGCCAGATTCa  <  1:359818/43‑1 (MQ=255) gCTTTGCTGGCGACCAGTTGCTGGCACCAGTTCGCCAGATTCa  <  1:393539/43‑1 (MQ=255) gCTTTGCTGGCGACCAGTTGCTGGCACCAGTTCGCCAGATTCa  <  1:435905/43‑1 (MQ=255) gCTTTGCTGGCGACCAGTTGCTGGCACCAGTTCGCCAGATTCa  <  1:523597/43‑1 (MQ=255) gCTTTGCTGGCGACCAGTTGCTGGCACCAGTTCGCCAGATTCa  <  1:529017/43‑1 (MQ=255) gCTTTGCTGGCGACCAGTTGCTGGCACCAGTTCGCCAGATTCa  <  1:608786/43‑1 (MQ=255) gCTTTGCTGGCGACCAGTTGCTGGCACCAGTTCGCCAGATTCa  <  1:62382/43‑1 (MQ=255) gCTTTGCTGGCGACCAGTTGCTGGCACCAGTTCGCCAGATTCa  <  1:676605/43‑1 (MQ=255) gCTTTGCTGGCGACCAGTTGCTGGCACCAGTTCGCCAGATTCa  <  1:684195/43‑1 (MQ=255) gCTTTGCTGGCGACCAGTTGCTGGCACCAGTTCGCCAGATTCa  <  1:345428/43‑1 (MQ=255) gCTTTGCTGGCGACCAGTTGCTGGCACCAGTTCGCCAGATTCa  <  1:707813/43‑1 (MQ=255) gCTTTGCTGGCGACCAGTTGCTGGCACCAGTTCGCCAGATTCa  <  1:740296/43‑1 (MQ=255) gCTTTGCTGGCGACCAGTTGCTGGCACCAGTTCGCCAGATTCa  <  1:743589/43‑1 (MQ=255) gCTTTGCTGGCGACCAGTTGCTGGCACCAGTTCGCCAGATTCa  <  1:755644/43‑1 (MQ=255) gCTTTGCTGGCGACCAGTTGCTGGCACCAGTTCGCCAGATTCa  <  1:785836/43‑1 (MQ=255) gCTTTGCTGGCGACCAGTTGCTGGCACCAGTTCGCCAGATTCa  <  1:790693/43‑1 (MQ=255) gCTTTGCTGGCGACCAGTTGCTGGCACCAGTTCGCCAGATTCa  <  1:803136/43‑1 (MQ=255) gCTTTGCTGGCGACCAGTTGCTGGCACCAGTTCGCCAGATTCa  <  1:999674/43‑1 (MQ=255) gCTTTGCTGGCGACCAGTTGCTGGCACCAGTTCGCCAGATTCa  <  1:1303225/43‑1 (MQ=255) gCTTTGCTGGCGACCAGTTGCTGGCACCAGTTCGCCAGATTCa  <  1:1036063/43‑1 (MQ=255) gCTTTGCTGGCGACCAGTTGCTGGCACCAGTTCGCCAGATTCa  <  1:104711/43‑1 (MQ=255) gCTTTGCTGGCGACCAGTTGCTGGCACCAGTTCGCCAGATTCa  <  1:1101098/43‑1 (MQ=255) gCTTTGCTGGCGACCAGTTGCTGGCACCAGTTCGCCAGATTCa  <  1:1122790/43‑1 (MQ=255) gCTTTGCTGGCGACCAGTTGCTGGCACCAGTTCGCCAGATTCa  <  1:1157798/43‑1 (MQ=255) gCTTTGCTGGCGACCAGTTGCTGGCACCAGTTCGCCAGATTCa  <  1:1185127/43‑1 (MQ=255) gCTTTGCTGGCGACCAGTTGCTGGCACCAGTTCGCCAGATTCa  <  1:1187233/43‑1 (MQ=255) gCTTTGCTGGCGACCAGTTGCTGGCACCAGTTCGCCAGATTCa  <  1:1192363/43‑1 (MQ=255) gCTTTGCTGGCGACCAGTTGCTGGCACCAGTTCGCCAGATTCa  <  1:1239638/43‑1 (MQ=255) gCTTTGCTGGCGACCAGTTGCTGGCACCAGTTCGCCAGATTCa  <  1:1006766/43‑1 (MQ=255) gCTTTGCTGGCGACCAGTTGCTGGCACCAGTTCGCCAGATTCa  <  1:1320000/43‑1 (MQ=255) gCTTTGCTGGCGACCAGTTGCTGGCACCAGTTCGCCAGATTCa  <  1:1352961/43‑1 (MQ=255) gCTTTGCTGGCGACCAGTTGCTGGCACCAGTTCGCCAGATTCa  <  1:1374130/43‑1 (MQ=255) gCTTTGCTGGCGACCAGTTGCTGGCACCAGTTCGCCAGATTCa  <  1:1425326/43‑1 (MQ=255) gCTTTGCTGGCGACCAGTTGCTGGCACCAGTTCGCCAGATTCa  <  1:1485753/43‑1 (MQ=255) gCTTTGCTGGCGACCAGTTGCTGGCACCAGTTCGCCAGATTCa  <  1:1511680/43‑1 (MQ=255) gCTTTGCTGGCGACCAGTTGCTGGCACCAGTTCGCCAGATTCa  <  1:1592446/43‑1 (MQ=255) gCTTTGCTGGCGACCAGTTGCTGGCACCAGTTCGCCAGATTCa  <  1:229798/43‑1 (MQ=255) |                                           GCTTTGCTGGCGACCAGTTGCTGGCACCAGTTCGCCAGATTCA  >  W3110S.gb/75768‑75810

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑