Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4209940	4210011	72	42 [0]	[0] 97	aroE	dehydroshikimate reductase, NAD(P)‑binding

GTGACAATAACTAATCGGACGGTATCCCGCGCGGAAGAGTTGGCTAAATTGTTTGCGCACA  >  W3110S.gb/4210012‑4210072 |                                                             gTGACAATAACTAATCGGACGGTATCCCGCGCTGAAGAGTTGGCTAAATTGTTTGCGcaca  <  1:971659/61‑1 (MQ=255) gTGACAATAACTAATCGGACGGTATCCCGCGCGGAAGAGTTGGCTAAATTGTTTGCGgaca  <  1:668875/61‑1 (MQ=255) gTGACAATAACTAATCGGACGGTATCCCGCGCGGAAGAGTTGGCTAAATTGTTTGCGcaca  <  1:575908/61‑1 (MQ=255) gTGACAATAACTAATCGGACGGTATCCCGCGCGGAAGAGTTGGCTAAATTGTTTGCGcaca  <  1:329275/61‑1 (MQ=255) gTGACAATAACTAATCGGACGGTATCCCGCGCGGAAGAGTTGGCTAAATTGTTTGCGcaca  <  1:572121/61‑1 (MQ=255) gTGACAATAACTAATCGGACGGTATCCCGCGCGGAAGAGTTGGCTAAATTGTTTGCGcaca  <  1:548417/61‑1 (MQ=255) gTGACAATAACTAATCGGACGGTATCCCGCGCGGAAGAGTTGGCTAAATTGTTTGCGcaca  <  1:532785/61‑1 (MQ=255) gTGACAATAACTAATCGGACGGTATCCCGCGCGGAAGAGTTGGCTAAATTGTTTGCGcaca  <  1:532209/61‑1 (MQ=255) gTGACAATAACTAATCGGACGGTATCCCGCGCGGAAGAGTTGGCTAAATTGTTTGCGcaca  <  1:522811/61‑1 (MQ=255) gTGACAATAACTAATCGGACGGTATCCCGCGCGGAAGAGTTGGCTAAATTGTTTGCGcaca  <  1:509821/61‑1 (MQ=255) gTGACAATAACTAATCGGACGGTATCCCGCGCGGAAGAGTTGGCTAAATTGTTTGCGcaca  <  1:498971/61‑1 (MQ=255) gTGACAATAACTAATCGGACGGTATCCCGCGCGGAAGAGTTGGCTAAATTGTTTGCGcaca  <  1:496335/61‑1 (MQ=255) gTGACAATAACTAATCGGACGGTATCCCGCGCGGAAGAGTTGGCTAAATTGTTTGCGcaca  <  1:451253/61‑1 (MQ=255) gTGACAATAACTAATCGGACGGTATCCCGCGCGGAAGAGTTGGCTAAATTGTTTGCGcaca  <  1:439199/61‑1 (MQ=255) gTGACAATAACTAATCGGACGGTATCCCGCGCGGAAGAGTTGGCTAAATTGTTTGCGcaca  <  1:434286/61‑1 (MQ=255) gTGACAATAACTAATCGGACGGTATCCCGCGCGGAAGAGTTGGCTAAATTGTTTGCGcaca  <  1:432188/61‑1 (MQ=255) gTGACAATAACTAATCGGACGGTATCCCGCGCGGAAGAGTTGGCTAAATTGTTTGCGcaca  <  1:421192/61‑1 (MQ=255) gTGACAATAACTAATCGGACGGTATCCCGCGCGGAAGAGTTGGCTAAATTGTTTGCGcaca  <  1:420238/61‑1 (MQ=255) gTGACAATAACTAATCGGACGGTATCCCGCGCGGAAGAGTTGGCTAAATTGTTTGCGcaca  <  1:40663/61‑1 (MQ=255) gTGACAATAACTAATCGGACGGTATCCCGCGCGGAAGAGTTGGCTAAATTGTTTGCGcaca  <  1:398157/61‑1 (MQ=255) gTGACAATAACTAATCGGACGGTATCCCGCGCGGAAGAGTTGGCTAAATTGTTTGCGcaca  <  1:393364/61‑1 (MQ=255) gTGACAATAACTAATCGGACGGTATCCCGCGCGGAAGAGTTGGCTAAATTGTTTGCGcaca  <  1:374608/61‑1 (MQ=255) gTGACAATAACTAATCGGACGGTATCCCGCGCGGAAGAGTTGGCTAAATTGTTTGCGcaca  <  1:365237/61‑1 (MQ=255) gTGACAATAACTAATCGGACGGTATCCCGCGCGGAAGAGTTGGCTAAATTGTTTGCGcaca  <  1:361407/61‑1 (MQ=255) gTGACAATAACTAATCGGACGGTATCCCGCGCGGAAGAGTTGGCTAAATTGTTTGCGcaca  <  1:293137/61‑1 (MQ=255) gTGACAATAACTAATCGGACGGTATCCCGCGCGGAAGAGTTGGCTAAATTGTTTGCGcaca  <  1:817027/61‑1 (MQ=255) gTGACAATAACTAATCGGACGGTATCCCGCGCGGAAGAGTTGGCTAAATTGTTTGCGcaca  <  1:96003/61‑1 (MQ=255) gTGACAATAACTAATCGGACGGTATCCCGCGCGGAAGAGTTGGCTAAATTGTTTGCGcaca  <  1:953749/61‑1 (MQ=255) gTGACAATAACTAATCGGACGGTATCCCGCGCGGAAGAGTTGGCTAAATTGTTTGCGcaca  <  1:945528/61‑1 (MQ=255) gTGACAATAACTAATCGGACGGTATCCCGCGCGGAAGAGTTGGCTAAATTGTTTGCGcaca  <  1:912168/61‑1 (MQ=255) gTGACAATAACTAATCGGACGGTATCCCGCGCGGAAGAGTTGGCTAAATTGTTTGCGcaca  <  1:912016/61‑1 (MQ=255) gTGACAATAACTAATCGGACGGTATCCCGCGCGGAAGAGTTGGCTAAATTGTTTGCGcaca  <  1:8766/61‑1 (MQ=255) gTGACAATAACTAATCGGACGGTATCCCGCGCGGAAGAGTTGGCTAAATTGTTTGCGcaca  <  1:869464/61‑1 (MQ=255) gTGACAATAACTAATCGGACGGTATCCCGCGCGGAAGAGTTGGCTAAATTGTTTGCGcaca  <  1:865393/61‑1 (MQ=255) gTGACAATAACTAATCGGACGGTATCCCGCGCGGAAGAGTTGGCTAAATTGTTTGCGcaca  <  1:859672/61‑1 (MQ=255) gTGACAATAACTAATCGGACGGTATCCCGCGCGGAAGAGTTGGCTAAATTGTTTGCGcaca  <  1:84042/61‑1 (MQ=255) gTGACAATAACTAATCGGACGGTATCCCGCGCGGAAGAGTTGGCTAAATTGTTTGCGcaca  <  1:821366/61‑1 (MQ=255) gTGACAATAACTAATCGGACGGTATCCCGCGCGGAAGAGTTGGCTAAATTGTTTGCGcaca  <  1:583797/61‑1 (MQ=255) gTGACAATAACTAATCGGACGGTATCCCGCGCGGAAGAGTTGGCTAAATTGTTTGCGcaca  <  1:815474/61‑1 (MQ=255) gTGACAATAACTAATCGGACGGTATCCCGCGCGGAAGAGTTGGCTAAATTGTTTGCGcaca  <  1:80121/61‑1 (MQ=255) gTGACAATAACTAATCGGACGGTATCCCGCGCGGAAGAGTTGGCTAAATTGTTTGCGcaca  <  1:769218/61‑1 (MQ=255) gTGACAATAACTAATCGGACGGTATCCCGCGCGGAAGAGTTGGCTAAATTGTTTGCGcaca  <  1:748246/61‑1 (MQ=255) gTGACAATAACTAATCGGACGGTATCCCGCGCGGAAGAGTTGGCTAAATTGTTTGCGcaca  <  1:711895/61‑1 (MQ=255) gTGACAATAACTAATCGGACGGTATCCCGCGCGGAAGAGTTGGCTAAATTGTTTGCGcaca  <  1:682263/61‑1 (MQ=255) gTGACAATAACTAATCGGACGGTATCCCGCGCGGAAGAGTTGGCTAAATTGTTTGCGcaca  <  1:680077/61‑1 (MQ=255) gTGACAATAACTAATCGGACGGTATCCCGCGCGGAAGAGTTGGCTAAATTGTTTGCGcaca  <  1:655319/61‑1 (MQ=255) gTGACAATAACTAATCGGACGGTATCCCGCGCGGAAGAGTTGGCTAAATTGTTTGCGcaca  <  1:609547/61‑1 (MQ=255) gTGACAATAACTAATCGGACGGTATCCCGCGCGGAAGAGTTGGCTAAATTGTTTGCGcaca  <  1:587485/61‑1 (MQ=255) gTGACAATAACTAATCGGACGGTATCCCGCGCGGAAGAGTTGGCTAAATTGTTTGCGcaca  <  1:126899/61‑1 (MQ=255) gTGACAATAACTAATCGGACGGTATCCCGCGCGGAAGAGTTGGCTAAATTGTTTGCGcaca  <  1:1008093/61‑1 (MQ=255) gTGACAATAACTAATCGGACGGTATCCCGCGCGGAAGAGTTGGCTAAATTGTTTGCGcaca  <  1:1475804/61‑1 (MQ=255) gTGACAATAACTAATCGGACGGTATCCCGCGCGGAAGAGTTGGCTAAATTGTTTGCGcaca  <  1:1454284/61‑1 (MQ=255) gTGACAATAACTAATCGGACGGTATCCCGCGCGGAAGAGTTGGCTAAATTGTTTGCGcaca  <  1:1454275/61‑1 (MQ=255) gTGACAATAACTAATCGGACGGTATCCCGCGCGGAAGAGTTGGCTAAATTGTTTGCGcaca  <  1:1454179/61‑1 (MQ=255) gTGACAATAACTAATCGGACGGTATCCCGCGCGGAAGAGTTGGCTAAATTGTTTGCGcaca  <  1:1450759/61‑1 (MQ=255) gTGACAATAACTAATCGGACGGTATCCCGCGCGGAAGAGTTGGCTAAATTGTTTGCGcaca  <  1:1427615/61‑1 (MQ=255) gTGACAATAACTAATCGGACGGTATCCCGCGCGGAAGAGTTGGCTAAATTGTTTGCGcaca  <  1:1371163/61‑1 (MQ=255) gTGACAATAACTAATCGGACGGTATCCCGCGCGGAAGAGTTGGCTAAATTGTTTGCGcaca  <  1:13018/61‑1 (MQ=255) gTGACAATAACTAATCGGACGGTATCCCGCGCGGAAGAGTTGGCTAAATTGTTTGCGcaca  <  1:1296055/61‑1 (MQ=255) gTGACAATAACTAATCGGACGGTATCCCGCGCGGAAGAGTTGGCTAAATTGTTTGCGcaca  <  1:1278810/61‑1 (MQ=255) gTGACAATAACTAATCGGACGGTATCCCGCGCGGAAGAGTTGGCTAAATTGTTTGCGcaca  <  1:1476971/61‑1 (MQ=255) gTGACAATAACTAATCGGACGGTATCCCGCGCGGAAGAGTTGGCTAAATTGTTTGCGcaca  <  1:1258012/61‑1 (MQ=255) gTGACAATAACTAATCGGACGGTATCCCGCGCGGAAGAGTTGGCTAAATTGTTTGCGcaca  <  1:1236973/61‑1 (MQ=255) gTGACAATAACTAATCGGACGGTATCCCGCGCGGAAGAGTTGGCTAAATTGTTTGCGcaca  <  1:1221352/61‑1 (MQ=255) gTGACAATAACTAATCGGACGGTATCCCGCGCGGAAGAGTTGGCTAAATTGTTTGCGcaca  <  1:1219186/61‑1 (MQ=255) gTGACAATAACTAATCGGACGGTATCCCGCGCGGAAGAGTTGGCTAAATTGTTTGCGcaca  <  1:1193972/61‑1 (MQ=255) gTGACAATAACTAATCGGACGGTATCCCGCGCGGAAGAGTTGGCTAAATTGTTTGCGcaca  <  1:1181505/61‑1 (MQ=255) gTGACAATAACTAATCGGACGGTATCCCGCGCGGAAGAGTTGGCTAAATTGTTTGCGcaca  <  1:1144221/61‑1 (MQ=255) gTGACAATAACTAATCGGACGGTATCCCGCGCGGAAGAGTTGGCTAAATTGTTTGCGcaca  <  1:1111893/61‑1 (MQ=255) gTGACAATAACTAATCGGACGGTATCCCGCGCGGAAGAGTTGGCTAAATTGTTTGCGcaca  <  1:1107711/61‑1 (MQ=255) gTGACAATAACTAATCGGACGGTATCCCGCGCGGAAGAGTTGGCTAAATTGTTTGCGcaca  <  1:1073946/61‑1 (MQ=255) gTGACAATAACTAATCGGACGGTATCCCGCGCGGAAGAGTTGGCTAAATTGTTTGCGcaca  <  1:1053208/61‑1 (MQ=255) gTGACAATAACTAATCGGACGGTATCCCGCGCGGAAGAGTTGGCTAAATTGTTTGCGcaca  <  1:198720/61‑1 (MQ=255) gTGACAATAACTAATCGGACGGTATCCCGCGCGGAAGAGTTGGCTAAATTGTTTGCGcaca  <  1:287441/61‑1 (MQ=255) gTGACAATAACTAATCGGACGGTATCCCGCGCGGAAGAGTTGGCTAAATTGTTTGCGcaca  <  1:285987/61‑1 (MQ=255) gTGACAATAACTAATCGGACGGTATCCCGCGCGGAAGAGTTGGCTAAATTGTTTGCGcaca  <  1:256744/61‑1 (MQ=255) gTGACAATAACTAATCGGACGGTATCCCGCGCGGAAGAGTTGGCTAAATTGTTTGCGcaca  <  1:25069/61‑1 (MQ=255) gTGACAATAACTAATCGGACGGTATCCCGCGCGGAAGAGTTGGCTAAATTGTTTGCGcaca  <  1:249911/61‑1 (MQ=255) gTGACAATAACTAATCGGACGGTATCCCGCGCGGAAGAGTTGGCTAAATTGTTTGCGcaca  <  1:24520/61‑1 (MQ=255) gTGACAATAACTAATCGGACGGTATCCCGCGCGGAAGAGTTGGCTAAATTGTTTGCGcaca  <  1:244461/61‑1 (MQ=255) gTGACAATAACTAATCGGACGGTATCCCGCGCGGAAGAGTTGGCTAAATTGTTTGCGcaca  <  1:239840/61‑1 (MQ=255) gTGACAATAACTAATCGGACGGTATCCCGCGCGGAAGAGTTGGCTAAATTGTTTGCGcaca  <  1:236223/61‑1 (MQ=255) gTGACAATAACTAATCGGACGGTATCCCGCGCGGAAGAGTTGGCTAAATTGTTTGCGcaca  <  1:231319/61‑1 (MQ=255) gTGACAATAACTAATCGGACGGTATCCCGCGCGGAAGAGTTGGCTAAATTGTTTGCGcaca  <  1:215616/61‑1 (MQ=255) gTGACAATAACTAATCGGACGGTATCCCGCGCGGAAGAGTTGGCTAAATTGTTTGCGcaca  <  1:215411/61‑1 (MQ=255) gTGACAATAACTAATCGGACGGTATCCCGCGCGGAAGAGTTGGCTAAATTGTTTGCGcaca  <  1:148085/61‑1 (MQ=255) gTGACAATAACTAATCGGACGGTATCCCGCGCGGAAGAGTTGGCTAAATTGTTTGCGcaca  <  1:193020/61‑1 (MQ=255) gTGACAATAACTAATCGGACGGTATCCCGCGCGGAAGAGTTGGCTAAATTGTTTGCGcaca  <  1:174159/61‑1 (MQ=255) gTGACAATAACTAATCGGACGGTATCCCGCGCGGAAGAGTTGGCTAAATTGTTTGCGcaca  <  1:1610428/61‑1 (MQ=255) gTGACAATAACTAATCGGACGGTATCCCGCGCGGAAGAGTTGGCTAAATTGTTTGCGcaca  <  1:1602693/61‑1 (MQ=255) gTGACAATAACTAATCGGACGGTATCCCGCGCGGAAGAGTTGGCTAAATTGTTTGCGcaca  <  1:1569770/61‑1 (MQ=255) gTGACAATAACTAATCGGACGGTATCCCGCGCGGAAGAGTTGGCTAAATTGTTTGCGcaca  <  1:1563166/61‑1 (MQ=255) gTGACAATAACTAATCGGACGGTATCCCGCGCGGAAGAGTTGGCTAAATTGTTTGCGcaca  <  1:1544259/61‑1 (MQ=255) gTGACAATAACTAATCGGACGGTATCCCGCGCGGAAGAGTTGGCTAAATTGTTTGCGcaca  <  1:1509987/61‑1 (MQ=255) gTGACAATAACTAATCGGACGGTATCCCGCGCGGAAGAGTTGGCTAAATTGTTTGCGcaca  <  1:1508953/61‑1 (MQ=255) gTGACAATAACTAATCGGACGGTATCCCGCGCGGAAGAGTTGGCTAAATTGATTGCGcaca  <  1:1408741/61‑1 (MQ=255) gTGACAATAACTAATCGGACCGTATCCCGCGCGGAAGAGTTGGCTAAATTGTTTGCGcaca  <  1:664356/61‑1 (MQ=255) |                                                             GTGACAATAACTAATCGGACGGTATCCCGCGCGGAAGAGTTGGCTAAATTGTTTGCGCACA  >  W3110S.gb/4210012‑4210072

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑