Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4254304	4254363	60	23 [0]	[0] 88	malM/yjbI	maltose regulon periplasmic protein/conserved hypothetical protein

AATATAGTAGATCTTGATTTACTACGTAATTTAAATGGGGTGCCAGGTTTAAACAGAGATAA  >  W3110S.gb/4254364‑4254425 |                                                              aataTAGTGGATCTTGATTTACTACGTAATTTAAATGGGGTGCCAGGTTTAAACAGAGATaa  <  1:401632/62‑1 (MQ=255) aataTAGTAGATCTTGATTTACTACGTAATTTAAATGGGGTTCCAGGTTTAAACAGAGATaa  <  1:1264781/62‑1 (MQ=255) aataTAGTAGATCTTGATTTACTACGTAATTTAAATGGGGTGCCAGGTTTAAACAGAGATaa  <  1:490125/62‑1 (MQ=255) aataTAGTAGATCTTGATTTACTACGTAATTTAAATGGGGTGCCAGGTTTAAACAGAGATaa  <  1:662874/62‑1 (MQ=255) aataTAGTAGATCTTGATTTACTACGTAATTTAAATGGGGTGCCAGGTTTAAACAGAGATaa  <  1:633913/62‑1 (MQ=255) aataTAGTAGATCTTGATTTACTACGTAATTTAAATGGGGTGCCAGGTTTAAACAGAGATaa  <  1:612962/62‑1 (MQ=255) aataTAGTAGATCTTGATTTACTACGTAATTTAAATGGGGTGCCAGGTTTAAACAGAGATaa  <  1:590410/62‑1 (MQ=255) aataTAGTAGATCTTGATTTACTACGTAATTTAAATGGGGTGCCAGGTTTAAACAGAGATaa  <  1:585665/62‑1 (MQ=255) aataTAGTAGATCTTGATTTACTACGTAATTTAAATGGGGTGCCAGGTTTAAACAGAGATaa  <  1:559748/62‑1 (MQ=255) aataTAGTAGATCTTGATTTACTACGTAATTTAAATGGGGTGCCAGGTTTAAACAGAGATaa  <  1:554936/62‑1 (MQ=255) aataTAGTAGATCTTGATTTACTACGTAATTTAAATGGGGTGCCAGGTTTAAACAGAGATaa  <  1:552998/62‑1 (MQ=255) aataTAGTAGATCTTGATTTACTACGTAATTTAAATGGGGTGCCAGGTTTAAACAGAGATaa  <  1:499542/62‑1 (MQ=255) aataTAGTAGATCTTGATTTACTACGTAATTTAAATGGGGTGCCAGGTTTAAACAGAGATaa  <  1:492153/62‑1 (MQ=255) aataTAGTAGATCTTGATTTACTACGTAATTTAAATGGGGTGCCAGGTTTAAACAGAGATaa  <  1:666373/62‑1 (MQ=255) aataTAGTAGATCTTGATTTACTACGTAATTTAAATGGGGTGCCAGGTTTAAACAGAGATaa  <  1:440688/62‑1 (MQ=255) aataTAGTAGATCTTGATTTACTACGTAATTTAAATGGGGTGCCAGGTTTAAACAGAGATaa  <  1:428156/62‑1 (MQ=255) aataTAGTAGATCTTGATTTACTACGTAATTTAAATGGGGTGCCAGGTTTAAACAGAGATaa  <  1:40526/62‑1 (MQ=255) aataTAGTAGATCTTGATTTACTACGTAATTTAAATGGGGTGCCAGGTTTAAACAGAGATaa  <  1:401122/62‑1 (MQ=255) aataTAGTAGATCTTGATTTACTACGTAATTTAAATGGGGTGCCAGGTTTAAACAGAGATaa  <  1:399452/62‑1 (MQ=255) aataTAGTAGATCTTGATTTACTACGTAATTTAAATGGGGTGCCAGGTTTAAACAGAGATaa  <  1:394192/62‑1 (MQ=255) aataTAGTAGATCTTGATTTACTACGTAATTTAAATGGGGTGCCAGGTTTAAACAGAGATaa  <  1:346070/62‑1 (MQ=255) aataTAGTAGATCTTGATTTACTACGTAATTTAAATGGGGTGCCAGGTTTAAACAGAGATaa  <  1:314611/62‑1 (MQ=255) aataTAGTAGATCTTGATTTACTACGTAATTTAAATGGGGTGCCAGGTTTAAACAGAGATaa  <  1:1043473/62‑1 (MQ=255) aataTAGTAGATCTTGATTTACTACGTAATTTAAATGGGGTGCCAGGTTTAAACAGAGATaa  <  1:842805/62‑1 (MQ=255) aataTAGTAGATCTTGATTTACTACGTAATTTAAATGGGGTGCCAGGTTTAAACAGAGATaa  <  1:967750/62‑1 (MQ=255) aataTAGTAGATCTTGATTTACTACGTAATTTAAATGGGGTGCCAGGTTTAAACAGAGATaa  <  1:959726/62‑1 (MQ=255) aataTAGTAGATCTTGATTTACTACGTAATTTAAATGGGGTGCCAGGTTTAAACAGAGATaa  <  1:959459/62‑1 (MQ=255) aataTAGTAGATCTTGATTTACTACGTAATTTAAATGGGGTGCCAGGTTTAAACAGAGATaa  <  1:959147/62‑1 (MQ=255) aataTAGTAGATCTTGATTTACTACGTAATTTAAATGGGGTGCCAGGTTTAAACAGAGATaa  <  1:946363/62‑1 (MQ=255) aataTAGTAGATCTTGATTTACTACGTAATTTAAATGGGGTGCCAGGTTTAAACAGAGATaa  <  1:917134/62‑1 (MQ=255) aataTAGTAGATCTTGATTTACTACGTAATTTAAATGGGGTGCCAGGTTTAAACAGAGATaa  <  1:880762/62‑1 (MQ=255) aataTAGTAGATCTTGATTTACTACGTAATTTAAATGGGGTGCCAGGTTTAAACAGAGATaa  <  1:867608/62‑1 (MQ=255) aataTAGTAGATCTTGATTTACTACGTAATTTAAATGGGGTGCCAGGTTTAAACAGAGATaa  <  1:860767/62‑1 (MQ=255) aataTAGTAGATCTTGATTTACTACGTAATTTAAATGGGGTGCCAGGTTTAAACAGAGATaa  <  1:858957/62‑1 (MQ=255) aataTAGTAGATCTTGATTTACTACGTAATTTAAATGGGGTGCCAGGTTTAAACAGAGATaa  <  1:301179/62‑1 (MQ=255) aataTAGTAGATCTTGATTTACTACGTAATTTAAATGGGGTGCCAGGTTTAAACAGAGATaa  <  1:779206/62‑1 (MQ=255) aataTAGTAGATCTTGATTTACTACGTAATTTAAATGGGGTGCCAGGTTTAAACAGAGATaa  <  1:763782/62‑1 (MQ=255) aataTAGTAGATCTTGATTTACTACGTAATTTAAATGGGGTGCCAGGTTTAAACAGAGATaa  <  1:743875/62‑1 (MQ=255) aataTAGTAGATCTTGATTTACTACGTAATTTAAATGGGGTGCCAGGTTTAAACAGAGATaa  <  1:735454/62‑1 (MQ=255) aataTAGTAGATCTTGATTTACTACGTAATTTAAATGGGGTGCCAGGTTTAAACAGAGATaa  <  1:719940/62‑1 (MQ=255) aataTAGTAGATCTTGATTTACTACGTAATTTAAATGGGGTGCCAGGTTTAAACAGAGATaa  <  1:706637/62‑1 (MQ=255) aataTAGTAGATCTTGATTTACTACGTAATTTAAATGGGGTGCCAGGTTTAAACAGAGATaa  <  1:699960/62‑1 (MQ=255) aataTAGTAGATCTTGATTTACTACGTAATTTAAATGGGGTGCCAGGTTTAAACAGAGATaa  <  1:697719/62‑1 (MQ=255) aataTAGTAGATCTTGATTTACTACGTAATTTAAATGGGGTGCCAGGTTTAAACAGAGATaa  <  1:683804/62‑1 (MQ=255) aataTAGTAGATCTTGATTTACTACGTAATTTAAATGGGGTGCCAGGTTTAAACAGAGATaa  <  1:1184330/62‑1 (MQ=255) aataTAGTAGATCTTGATTTACTACGTAATTTAAATGGGGTGCCAGGTTTAAACAGAGATaa  <  1:290420/62‑1 (MQ=255) aataTAGTAGATCTTGATTTACTACGTAATTTAAATGGGGTGCCAGGTTTAAACAGAGATaa  <  1:1476074/62‑1 (MQ=255) aataTAGTAGATCTTGATTTACTACGTAATTTAAATGGGGTGCCAGGTTTAAACAGAGATaa  <  1:1473726/62‑1 (MQ=255) aataTAGTAGATCTTGATTTACTACGTAATTTAAATGGGGTGCCAGGTTTAAACAGAGATaa  <  1:1470216/62‑1 (MQ=255) aataTAGTAGATCTTGATTTACTACGTAATTTAAATGGGGTGCCAGGTTTAAACAGAGATaa  <  1:1419089/62‑1 (MQ=255) aataTAGTAGATCTTGATTTACTACGTAATTTAAATGGGGTGCCAGGTTTAAACAGAGATaa  <  1:1414142/62‑1 (MQ=255) aataTAGTAGATCTTGATTTACTACGTAATTTAAATGGGGTGCCAGGTTTAAACAGAGATaa  <  1:1390187/62‑1 (MQ=255) aataTAGTAGATCTTGATTTACTACGTAATTTAAATGGGGTGCCAGGTTTAAACAGAGATaa  <  1:1387267/62‑1 (MQ=255) aataTAGTAGATCTTGATTTACTACGTAATTTAAATGGGGTGCCAGGTTTAAACAGAGATaa  <  1:1351027/62‑1 (MQ=255) aataTAGTAGATCTTGATTTACTACGTAATTTAAATGGGGTGCCAGGTTTAAACAGAGATaa  <  1:1299892/62‑1 (MQ=255) aataTAGTAGATCTTGATTTACTACGTAATTTAAATGGGGTGCCAGGTTTAAACAGAGATaa  <  1:148336/62‑1 (MQ=255) aataTAGTAGATCTTGATTTACTACGTAATTTAAATGGGGTGCCAGGTTTAAACAGAGATaa  <  1:117309/62‑1 (MQ=255) aataTAGTAGATCTTGATTTACTACGTAATTTAAATGGGGTGCCAGGTTTAAACAGAGATaa  <  1:1161523/62‑1 (MQ=255) aataTAGTAGATCTTGATTTACTACGTAATTTAAATGGGGTGCCAGGTTTAAACAGAGATaa  <  1:1135781/62‑1 (MQ=255) aataTAGTAGATCTTGATTTACTACGTAATTTAAATGGGGTGCCAGGTTTAAACAGAGATaa  <  1:1111836/62‑1 (MQ=255) aataTAGTAGATCTTGATTTACTACGTAATTTAAATGGGGTGCCAGGTTTAAACAGAGATaa  <  1:110706/62‑1 (MQ=255) aataTAGTAGATCTTGATTTACTACGTAATTTAAATGGGGTGCCAGGTTTAAACAGAGATaa  <  1:109542/62‑1 (MQ=255) aataTAGTAGATCTTGATTTACTACGTAATTTAAATGGGGTGCCAGGTTTAAACAGAGATaa  <  1:1066160/62‑1 (MQ=255) aataTAGTAGATCTTGATTTACTACGTAATTTAAATGGGGTGCCAGGTTTAAACAGAGATaa  <  1:1060156/62‑1 (MQ=255) aataTAGTAGATCTTGATTTACTACGTAATTTAAATGGGGTGCCAGGTTTAAACAGAGATaa  <  1:1051048/62‑1 (MQ=255) aataTAGTAGATCTTGATTTACTACGTAATTTAAATGGGGTGCCAGGTTTAAACAGAGATaa  <  1:15252/62‑1 (MQ=255) aataTAGTAGATCTTGATTTACTACGTAATTTAAATGGGGTGCCAGGTTTAAACAGAGATaa  <  1:288151/62‑1 (MQ=255) aataTAGTAGATCTTGATTTACTACGTAATTTAAATGGGGTGCCAGGTTTAAACAGAGATaa  <  1:262986/62‑1 (MQ=255) aataTAGTAGATCTTGATTTACTACGTAATTTAAATGGGGTGCCAGGTTTAAACAGAGATaa  <  1:257755/62‑1 (MQ=255) aataTAGTAGATCTTGATTTACTACGTAATTTAAATGGGGTGCCAGGTTTAAACAGAGATaa  <  1:25407/62‑1 (MQ=255) aataTAGTAGATCTTGATTTACTACGTAATTTAAATGGGGTGCCAGGTTTAAACAGAGATaa  <  1:242596/62‑1 (MQ=255) aataTAGTAGATCTTGATTTACTACGTAATTTAAATGGGGTGCCAGGTTTAAACAGAGATaa  <  1:238244/62‑1 (MQ=255) aataTAGTAGATCTTGATTTACTACGTAATTTAAATGGGGTGCCAGGTTTAAACAGAGATaa  <  1:226809/62‑1 (MQ=255) aataTAGTAGATCTTGATTTACTACGTAATTTAAATGGGGTGCCAGGTTTAAACAGAGATaa  <  1:224866/62‑1 (MQ=255) aataTAGTAGATCTTGATTTACTACGTAATTTAAATGGGGTGCCAGGTTTAAACAGAGATaa  <  1:220537/62‑1 (MQ=255) aataTAGTAGATCTTGATTTACTACGTAATTTAAATGGGGTGCCAGGTTTAAACAGAGATaa  <  1:213022/62‑1 (MQ=255) aataTAGTAGATCTTGATTTACTACGTAATTTAAATGGGGTGCCAGGTTTAAACAGAGATaa  <  1:206982/62‑1 (MQ=255) aataTAGTAGATCTTGATTTACTACGTAATTTAAATGGGGTGCCAGGTTTAAACAGAGATaa  <  1:202718/62‑1 (MQ=255) aataTAGTAGATCTTGATTTACTACGTAATTTAAATGGGGTGCCAGGTTTAAACAGAGATaa  <  1:182000/62‑1 (MQ=255) aataTAGTAGATCTTGATTTACTACGTAATTTAAATGGGGTGCCAGGTTTAAACAGAGATaa  <  1:1628267/62‑1 (MQ=255) aataTAGTAGATCTTGATTTACTACGTAATTTAAATGGGGTGCCAGGTTTAAACAGAGATaa  <  1:1618008/62‑1 (MQ=255) aataTAGTAGATCTTGATTTACTACGTAATTTAAATGGGGTGCCAGGTTTAAACAGAGATaa  <  1:1607893/62‑1 (MQ=255) aataTAGTAGATCTTGATTTACTACGTAATTTAAATGGGGTGCCAGGTTTAAACAGAGATaa  <  1:1598193/62‑1 (MQ=255) aataTAGTAGATCTTGATTTACTACGTAATTTAAATGGGGTGCCAGGTTTAAACAGAGATaa  <  1:1561532/62‑1 (MQ=255) aataTAGTAGATCTTGATTTACTACGTAATTTAAATGGGGTGCCAGGTTTAAACAGAGATaa  <  1:1517840/62‑1 (MQ=255) aataTAGTAGATCTTGATTTACTACGTAATTTAAATGGGGTGCCAGGGTTAAACAGAGATaa  <  1:416308/62‑1 (MQ=255) aataTAGTAGATCTTGATTTACTACATAATTTAAATGGGGTGCCAGGTTTAAACAGAGATaa  <  1:1155087/62‑1 (MQ=255) aataTAGTAGATCTTGAATTACTACGTAATTTAAATGGGGTGCCAGGTTTAAACAGAGATaa  <  1:82036/62‑1 (MQ=255) |                                                              AATATAGTAGATCTTGATTTACTACGTAATTTAAATGGGGTGCCAGGTTTAAACAGAGATAA  >  W3110S.gb/4254364‑4254425

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑