Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 4329514 4329907 394 187 [0] [0] 112 [phnC] [phnC]

Only 100 of 112 total aligned reads displayed.

AAAAGTGACTAACAGATGAAGAGTTAACGGGAATT  >  W3110S.gb/4329908‑4329942
|                                  
aaaaGTGACTAACAGATGAAGAGTTAACGGGAAtt  <  1:429951/35‑1 (MQ=255)
aaaaGTGACTAACAGATGAAGAGTTAACGGGAAtt  <  1:525844/35‑1 (MQ=255)
aaaaGTGACTAACAGATGAAGAGTTAACGGGAAtt  <  1:523272/35‑1 (MQ=255)
aaaaGTGACTAACAGATGAAGAGTTAACGGGAAtt  <  1:520671/35‑1 (MQ=255)
aaaaGTGACTAACAGATGAAGAGTTAACGGGAAtt  <  1:51657/35‑1 (MQ=255)
aaaaGTGACTAACAGATGAAGAGTTAACGGGAAtt  <  1:507090/35‑1 (MQ=255)
aaaaGTGACTAACAGATGAAGAGTTAACGGGAAtt  <  1:502821/35‑1 (MQ=255)
aaaaGTGACTAACAGATGAAGAGTTAACGGGAAtt  <  1:496723/35‑1 (MQ=255)
aaaaGTGACTAACAGATGAAGAGTTAACGGGAAtt  <  1:476343/35‑1 (MQ=255)
aaaaGTGACTAACAGATGAAGAGTTAACGGGAAtt  <  1:455023/35‑1 (MQ=255)
aaaaGTGACTAACAGATGAAGAGTTAACGGGAAtt  <  1:448339/35‑1 (MQ=255)
aaaaGTGACTAACAGATGAAGAGTTAACGGGAAtt  <  1:443492/35‑1 (MQ=255)
aaaaGTGACTAACAGATGAAGAGTTAACGGGAAtt  <  1:433687/35‑1 (MQ=255)
aaaaGTGACTAACAGATGAAGAGTTAACGGGAAtt  <  1:567681/35‑1 (MQ=255)
aaaaGTGACTAACAGATGAAGAGTTAACGGGAAtt  <  1:41873/35‑1 (MQ=255)
aaaaGTGACTAACAGATGAAGAGTTAACGGGAAtt  <  1:416988/35‑1 (MQ=255)
aaaaGTGACTAACAGATGAAGAGTTAACGGGAAtt  <  1:383665/35‑1 (MQ=255)
aaaaGTGACTAACAGATGAAGAGTTAACGGGAAtt  <  1:371199/35‑1 (MQ=255)
aaaaGTGACTAACAGATGAAGAGTTAACGGGAAtt  <  1:367119/35‑1 (MQ=255)
aaaaGTGACTAACAGATGAAGAGTTAACGGGAAtt  <  1:363557/35‑1 (MQ=255)
aaaaGTGACTAACAGATGAAGAGTTAACGGGAAtt  <  1:36293/35‑1 (MQ=255)
aaaaGTGACTAACAGATGAAGAGTTAACGGGAAtt  <  1:35323/35‑1 (MQ=255)
aaaaGTGACTAACAGATGAAGAGTTAACGGGAAtt  <  1:350524/35‑1 (MQ=255)
aaaaGTGACTAACAGATGAAGAGTTAACGGGAAtt  <  1:347328/35‑1 (MQ=255)
aaaaGTGACTAACAGATGAAGAGTTAACGGGAAtt  <  1:1010300/35‑1 (MQ=255)
aaaaGTGACTAACAGATGAAGAGTTAACGGGAAtt  <  1:723616/35‑1 (MQ=255)
aaaaGTGACTAACAGATGAAGAGTTAACGGGAAtt  <  1:989376/35‑1 (MQ=255)
aaaaGTGACTAACAGATGAAGAGTTAACGGGAAtt  <  1:969781/35‑1 (MQ=255)
aaaaGTGACTAACAGATGAAGAGTTAACGGGAAtt  <  1:957818/35‑1 (MQ=255)
aaaaGTGACTAACAGATGAAGAGTTAACGGGAAtt  <  1:954545/35‑1 (MQ=255)
aaaaGTGACTAACAGATGAAGAGTTAACGGGAAtt  <  1:949159/35‑1 (MQ=255)
aaaaGTGACTAACAGATGAAGAGTTAACGGGAAtt  <  1:916292/35‑1 (MQ=255)
aaaaGTGACTAACAGATGAAGAGTTAACGGGAAtt  <  1:858536/35‑1 (MQ=255)
aaaaGTGACTAACAGATGAAGAGTTAACGGGAAtt  <  1:844723/35‑1 (MQ=255)
aaaaGTGACTAACAGATGAAGAGTTAACGGGAAtt  <  1:768411/35‑1 (MQ=255)
aaaaGTGACTAACAGATGAAGAGTTAACGGGAAtt  <  1:76493/35‑1 (MQ=255)
aaaaGTGACTAACAGATGAAGAGTTAACGGGAAtt  <  1:727750/35‑1 (MQ=255)
aaaaGTGACTAACAGATGAAGAGTTAACGGGAAtt  <  1:725709/35‑1 (MQ=255)
aaaaGTGACTAACAGATGAAGAGTTAACGGGAAtt  <  1:34356/35‑1 (MQ=255)
aaaaGTGACTAACAGATGAAGAGTTAACGGGAAtt  <  1:718132/35‑1 (MQ=255)
aaaaGTGACTAACAGATGAAGAGTTAACGGGAAtt  <  1:715418/35‑1 (MQ=255)
aaaaGTGACTAACAGATGAAGAGTTAACGGGAAtt  <  1:708461/35‑1 (MQ=255)
aaaaGTGACTAACAGATGAAGAGTTAACGGGAAtt  <  1:703505/35‑1 (MQ=255)
aaaaGTGACTAACAGATGAAGAGTTAACGGGAAtt  <  1:691403/35‑1 (MQ=255)
aaaaGTGACTAACAGATGAAGAGTTAACGGGAAtt  <  1:654484/35‑1 (MQ=255)
aaaaGTGACTAACAGATGAAGAGTTAACGGGAAtt  <  1:649471/35‑1 (MQ=255)
aaaaGTGACTAACAGATGAAGAGTTAACGGGAAtt  <  1:608280/35‑1 (MQ=255)
aaaaGTGACTAACAGATGAAGAGTTAACGGGAAtt  <  1:593162/35‑1 (MQ=255)
aaaaGTGACTAACAGATGAAGAGTTAACGGGAAtt  <  1:579055/35‑1 (MQ=255)
aaaaGTGACTAACAGATGAAGAGTTAACGGGAAtt  <  1:571829/35‑1 (MQ=255)
aaaaGTGACTAACAGATGAAGAGTTAACGGGAAtt  <  1:1291162/35‑1 (MQ=255)
aaaaGTGACTAACAGATGAAGAGTTAACGGGAAtt  <  1:143772/35‑1 (MQ=255)
aaaaGTGACTAACAGATGAAGAGTTAACGGGAAtt  <  1:143288/35‑1 (MQ=255)
aaaaGTGACTAACAGATGAAGAGTTAACGGGAAtt  <  1:1432755/35‑1 (MQ=255)
aaaaGTGACTAACAGATGAAGAGTTAACGGGAAtt  <  1:141353/35‑1 (MQ=255)
aaaaGTGACTAACAGATGAAGAGTTAACGGGAAtt  <  1:1401599/35‑1 (MQ=255)
aaaaGTGACTAACAGATGAAGAGTTAACGGGAAtt  <  1:1393287/35‑1 (MQ=255)
aaaaGTGACTAACAGATGAAGAGTTAACGGGAAtt  <  1:139124/35‑1 (MQ=255)
aaaaGTGACTAACAGATGAAGAGTTAACGGGAAtt  <  1:1387264/35‑1 (MQ=255)
aaaaGTGACTAACAGATGAAGAGTTAACGGGAAtt  <  1:1358132/35‑1 (MQ=255)
aaaaGTGACTAACAGATGAAGAGTTAACGGGAAtt  <  1:1333466/35‑1 (MQ=255)
aaaaGTGACTAACAGATGAAGAGTTAACGGGAAtt  <  1:1302812/35‑1 (MQ=255)
aaaaGTGACTAACAGATGAAGAGTTAACGGGAAtt  <  1:130223/35‑1 (MQ=255)
aaaaGTGACTAACAGATGAAGAGTTAACGGGAAtt  <  1:1448376/35‑1 (MQ=255)
aaaaGTGACTAACAGATGAAGAGTTAACGGGAAtt  <  1:1269210/35‑1 (MQ=255)
aaaaGTGACTAACAGATGAAGAGTTAACGGGAAtt  <  1:1213834/35‑1 (MQ=255)
aaaaGTGACTAACAGATGAAGAGTTAACGGGAAtt  <  1:1164466/35‑1 (MQ=255)
aaaaGTGACTAACAGATGAAGAGTTAACGGGAAtt  <  1:1115517/35‑1 (MQ=255)
aaaaGTGACTAACAGATGAAGAGTTAACGGGAAtt  <  1:1089655/35‑1 (MQ=255)
aaaaGTGACTAACAGATGAAGAGTTAACGGGAAtt  <  1:1086883/35‑1 (MQ=255)
aaaaGTGACTAACAGATGAAGAGTTAACGGGAAtt  <  1:1078489/35‑1 (MQ=255)
aaaaGTGACTAACAGATGAAGAGTTAACGGGAAtt  <  1:1064428/35‑1 (MQ=255)
aaaaGTGACTAACAGATGAAGAGTTAACGGGAAtt  <  1:1053672/35‑1 (MQ=255)
aaaaGTGACTAACAGATGAAGAGTTAACGGGAAtt  <  1:1029354/35‑1 (MQ=255)
aaaaGTGACTAACAGATGAAGAGTTAACGGGAAtt  <  1:1012661/35‑1 (MQ=255)
aaaaGTGACTAACAGATGAAGAGTTAACGGGAAtt  <  1:1462701/35‑1 (MQ=255)
aaaaGTGACTAACAGATGAAGAGTTAACGGGAAtt  <  1:285897/35‑1 (MQ=255)
aaaaGTGACTAACAGATGAAGAGTTAACGGGAAtt  <  1:277605/35‑1 (MQ=255)
aaaaGTGACTAACAGATGAAGAGTTAACGGGAAtt  <  1:256060/35‑1 (MQ=255)
aaaaGTGACTAACAGATGAAGAGTTAACGGGAAtt  <  1:253373/35‑1 (MQ=255)
aaaaGTGACTAACAGATGAAGAGTTAACGGGAAtt  <  1:237395/35‑1 (MQ=255)
aaaaGTGACTAACAGATGAAGAGTTAACGGGAAtt  <  1:212640/35‑1 (MQ=255)
aaaaGTGACTAACAGATGAAGAGTTAACGGGAAtt  <  1:210162/35‑1 (MQ=255)
aaaaGTGACTAACAGATGAAGAGTTAACGGGAAtt  <  1:176784/35‑1 (MQ=255)
aaaaGTGACTAACAGATGAAGAGTTAACGGGAAtt  <  1:171803/35‑1 (MQ=255)
aaaaGTGACTAACAGATGAAGAGTTAACGGGAAtt  <  1:1633931/35‑1 (MQ=255)
aaaaGTGACTAACAGATGAAGAGTTAACGGGAAtt  <  1:162643/35‑1 (MQ=255)
aaaaGTGACTAACAGATGAAGAGTTAACGGGAAtt  <  1:1599648/35‑1 (MQ=255)
aaaaGTGACTAACAGATGAAGAGTTAACGGGAAtt  <  1:1572187/35‑1 (MQ=255)
aaaaGTGACTAACAGATGAAGAGTTAACGGGAAtt  <  1:1569787/35‑1 (MQ=255)
aaaaGTGACTAACAGATGAAGAGTTAACGGGAAtt  <  1:1553578/35‑1 (MQ=255)
aaaaGTGACTAACAGATGAAGAGTTAACGGGAAtt  <  1:1538480/35‑1 (MQ=255)
aaaaGTGACTAACAGATGAAGAGTTAACGGGAAtt  <  1:1506424/35‑1 (MQ=255)
aaaaGTGACTAACAGATGAAGAGTTAACGGGAAtt  <  1:1495581/35‑1 (MQ=255)
aaaaGTGACTAACAGATGAAGAGTTAACGGGAAtt  <  1:149007/35‑1 (MQ=255)
aaaaGTGACTAACAGATGAAGAGTTAACGGGAAtt  <  1:1483457/35‑1 (MQ=255)
aaaaGTGACTAACAGATGAAGAGTTAACGGGAAtt  <  1:1478299/35‑1 (MQ=255)
aaaaGTGACTAACAGATGAAGAGTTAACGGGAAtt  <  1:146603/35‑1 (MQ=255)
aaaaGTGACTAACAGATGAAGAGTTAACGGGAAtt  <  1:286266/35‑1 (MQ=255)
aaaaGTGACTAACAGATGAAGAGTGAACGGGAAtt  <  1:443189/35‑1 (MQ=255)
|                                  
AAAAGTGACTAACAGATGAAGAGTTAACGGGAATT  >  W3110S.gb/4329908‑4329942

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: