Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	86207	86358	152	57 [0]	[0] 79	ilvI	acetolactate synthase III, large subunit

CTGGGGGCGTTTCCGGCAACGCATCGTCAGGCACTGGGCATGCTGGGAATGCACGGTACCTA  >  W3110S.gb/86359‑86420 |                                                              cTGGGTGCGTTTCCGTCAACGCATCGTCAGGCACTGGGCATGCTGGGAATGCACGGTACCTa  <  1:311792/62‑1 (MQ=255) cTGGGGGCTTTTCCGGCAACGCATCGTCAGGCACTGGGCATGCTGGGAATGCACGGTACCTa  <  1:544243/62‑1 (MQ=255) cTGGGGGCGTTTCCGGCAACGCATCGTCAGGCACTGGGCATGCTGGGAATGCACGGTACCTa  <  1:32135/62‑1 (MQ=255) cTGGGGGCGTTTCCGGCAACGCATCGTCAGGCACTGGGCATGCTGGGAATGCACGGTACCTa  <  1:489702/62‑1 (MQ=255) cTGGGGGCGTTTCCGGCAACGCATCGTCAGGCACTGGGCATGCTGGGAATGCACGGTACCTa  <  1:440032/62‑1 (MQ=255) cTGGGGGCGTTTCCGGCAACGCATCGTCAGGCACTGGGCATGCTGGGAATGCACGGTACCTa  <  1:399013/62‑1 (MQ=255) cTGGGGGCGTTTCCGGCAACGCATCGTCAGGCACTGGGCATGCTGGGAATGCACGGTACCTa  <  1:366455/62‑1 (MQ=255) cTGGGGGCGTTTCCGGCAACGCATCGTCAGGCACTGGGCATGCTGGGAATGCACGGTACCTa  <  1:340552/62‑1 (MQ=255) cTGGGGGCGTTTCCGGCAACGCATCGTCAGGCACTGGGCATGCTGGGAATGCACGGTACCTa  <  1:338590/62‑1 (MQ=255) cTGGGGGCGTTTCCGGCAACGCATCGTCAGGCACTGGGCATGCTGGGAATGCACGGTACCTa  <  1:33397/62‑1 (MQ=255) cTGGGGGCGTTTCCGGCAACGCATCGTCAGGCACTGGGCATGCTGGGAATGCACGGTACCTa  <  1:331020/62‑1 (MQ=255) cTGGGGGCGTTTCCGGCAACGCATCGTCAGGCACTGGGCATGCTGGGAATGCACGGTACCTa  <  1:1048601/62‑1 (MQ=255) cTGGGGGCGTTTCCGGCAACGCATCGTCAGGCACTGGGCATGCTGGGAATGCACGGTACCTa  <  1:319624/62‑1 (MQ=255) cTGGGGGCGTTTCCGGCAACGCATCGTCAGGCACTGGGCATGCTGGGAATGCACGGTACCTa  <  1:310039/62‑1 (MQ=255) cTGGGGGCGTTTCCGGCAACGCATCGTCAGGCACTGGGCATGCTGGGAATGCACGGTACCTa  <  1:291487/62‑1 (MQ=255) cTGGGGGCGTTTCCGGCAACGCATCGTCAGGCACTGGGCATGCTGGGAATGCACGGTACCTa  <  1:286770/62‑1 (MQ=255) cTGGGGGCGTTTCCGGCAACGCATCGTCAGGCACTGGGCATGCTGGGAATGCACGGTACCTa  <  1:275299/62‑1 (MQ=255) cTGGGGGCGTTTCCGGCAACGCATCGTCAGGCACTGGGCATGCTGGGAATGCACGGTACCTa  <  1:245361/62‑1 (MQ=255) cTGGGGGCGTTTCCGGCAACGCATCGTCAGGCACTGGGCATGCTGGGAATGCACGGTACCTa  <  1:239585/62‑1 (MQ=255) cTGGGGGCGTTTCCGGCAACGCATCGTCAGGCACTGGGCATGCTGGGAATGCACGGTACCTa  <  1:213999/62‑1 (MQ=255) cTGGGGGCGTTTCCGGCAACGCATCGTCAGGCACTGGGCATGCTGGGAATGCACGGTACCTa  <  1:752402/62‑1 (MQ=255) cTGGGGGCGTTTCCGGCAACGCATCGTCAGGCACTGGGCATGCTGGGAATGCACGGTACCTa  <  1:993330/62‑1 (MQ=255) cTGGGGGCGTTTCCGGCAACGCATCGTCAGGCACTGGGCATGCTGGGAATGCACGGTACCTa  <  1:859887/62‑1 (MQ=255) cTGGGGGCGTTTCCGGCAACGCATCGTCAGGCACTGGGCATGCTGGGAATGCACGGTACCTa  <  1:825814/62‑1 (MQ=255) cTGGGGGCGTTTCCGGCAACGCATCGTCAGGCACTGGGCATGCTGGGAATGCACGGTACCTa  <  1:818103/62‑1 (MQ=255) cTGGGGGCGTTTCCGGCAACGCATCGTCAGGCACTGGGCATGCTGGGAATGCACGGTACCTa  <  1:814540/62‑1 (MQ=255) cTGGGGGCGTTTCCGGCAACGCATCGTCAGGCACTGGGCATGCTGGGAATGCACGGTACCTa  <  1:804200/62‑1 (MQ=255) cTGGGGGCGTTTCCGGCAACGCATCGTCAGGCACTGGGCATGCTGGGAATGCACGGTACCTa  <  1:789343/62‑1 (MQ=255) cTGGGGGCGTTTCCGGCAACGCATCGTCAGGCACTGGGCATGCTGGGAATGCACGGTACCTa  <  1:769106/62‑1 (MQ=255) cTGGGGGCGTTTCCGGCAACGCATCGTCAGGCACTGGGCATGCTGGGAATGCACGGTACCTa  <  1:768712/62‑1 (MQ=255) cTGGGGGCGTTTCCGGCAACGCATCGTCAGGCACTGGGCATGCTGGGAATGCACGGTACCTa  <  1:510062/62‑1 (MQ=255) cTGGGGGCGTTTCCGGCAACGCATCGTCAGGCACTGGGCATGCTGGGAATGCACGGTACCTa  <  1:726589/62‑1 (MQ=255) cTGGGGGCGTTTCCGGCAACGCATCGTCAGGCACTGGGCATGCTGGGAATGCACGGTACCTa  <  1:716590/62‑1 (MQ=255) cTGGGGGCGTTTCCGGCAACGCATCGTCAGGCACTGGGCATGCTGGGAATGCACGGTACCTa  <  1:711478/62‑1 (MQ=255) cTGGGGGCGTTTCCGGCAACGCATCGTCAGGCACTGGGCATGCTGGGAATGCACGGTACCTa  <  1:671767/62‑1 (MQ=255) cTGGGGGCGTTTCCGGCAACGCATCGTCAGGCACTGGGCATGCTGGGAATGCACGGTACCTa  <  1:642250/62‑1 (MQ=255) cTGGGGGCGTTTCCGGCAACGCATCGTCAGGCACTGGGCATGCTGGGAATGCACGGTACCTa  <  1:572693/62‑1 (MQ=255) cTGGGGGCGTTTCCGGCAACGCATCGTCAGGCACTGGGCATGCTGGGAATGCACGGTACCTa  <  1:557232/62‑1 (MQ=255) cTGGGGGCGTTTCCGGCAACGCATCGTCAGGCACTGGGCATGCTGGGAATGCACGGTACCTa  <  1:553085/62‑1 (MQ=255) cTGGGGGCGTTTCCGGCAACGCATCGTCAGGCACTGGGCATGCTGGGAATGCACGGTACCTa  <  1:1247738/62‑1 (MQ=255) cTGGGGGCGTTTCCGGCAACGCATCGTCAGGCACTGGGCATGCTGGGAATGCACGGTACCTa  <  1:142987/62‑1 (MQ=255) cTGGGGGCGTTTCCGGCAACGCATCGTCAGGCACTGGGCATGCTGGGAATGCACGGTACCTa  <  1:202503/62‑1 (MQ=255) cTGGGGGCGTTTCCGGCAACGCATCGTCAGGCACTGGGCATGCTGGGAATGCACGGTACCTa  <  1:1419353/62‑1 (MQ=255) cTGGGGGCGTTTCCGGCAACGCATCGTCAGGCACTGGGCATGCTGGGAATGCACGGTACCTa  <  1:1397157/62‑1 (MQ=255) cTGGGGGCGTTTCCGGCAACGCATCGTCAGGCACTGGGCATGCTGGGAATGCACGGTACCTa  <  1:1396505/62‑1 (MQ=255) cTGGGGGCGTTTCCGGCAACGCATCGTCAGGCACTGGGCATGCTGGGAATGCACGGTACCTa  <  1:1382088/62‑1 (MQ=255) cTGGGGGCGTTTCCGGCAACGCATCGTCAGGCACTGGGCATGCTGGGAATGCACGGTACCTa  <  1:1372188/62‑1 (MQ=255) cTGGGGGCGTTTCCGGCAACGCATCGTCAGGCACTGGGCATGCTGGGAATGCACGGTACCTa  <  1:1308364/62‑1 (MQ=255) cTGGGGGCGTTTCCGGCAACGCATCGTCAGGCACTGGGCATGCTGGGAATGCACGGTACCTa  <  1:1274491/62‑1 (MQ=255) cTGGGGGCGTTTCCGGCAACGCATCGTCAGGCACTGGGCATGCTGGGAATGCACGGTACCTa  <  1:1423259/62‑1 (MQ=255) cTGGGGGCGTTTCCGGCAACGCATCGTCAGGCACTGGGCATGCTGGGAATGCACGGTACCTa  <  1:117998/62‑1 (MQ=255) cTGGGGGCGTTTCCGGCAACGCATCGTCAGGCACTGGGCATGCTGGGAATGCACGGTACCTa  <  1:1131314/62‑1 (MQ=255) cTGGGGGCGTTTCCGGCAACGCATCGTCAGGCACTGGGCATGCTGGGAATGCACGGTACCTa  <  1:1121161/62‑1 (MQ=255) cTGGGGGCGTTTCCGGCAACGCATCGTCAGGCACTGGGCATGCTGGGAATGCACGGTACCTa  <  1:1113659/62‑1 (MQ=255) cTGGGGGCGTTTCCGGCAACGCATCGTCAGGCACTGGGCATGCTGGGAATGCACGGTACCTa  <  1:1104839/62‑1 (MQ=255) cTGGGGGCGTTTCCGGCAACGCATCGTCAGGCACTGGGCATGCTGGGAATGCACGGTACCTa  <  1:110124/62‑1 (MQ=255) cTGGGGGCGTTTCCGGCAACGCATCGTCAGGCACTGGGCATGCTGGGAATGCACGGTACCTa  <  1:1081677/62‑1 (MQ=255) cTGGGGGCGTTTCCGGCAACGCATCGTCAGGCACTGGGCATGCTGGGAATGCACGGTACCTa  <  1:1055025/62‑1 (MQ=255) cTGGGGGCGTTTCCGGCAACGCATCGTCAGGCACTGGGCATGCTGGGAATGCACGGTACCTa  <  1:1582526/62‑1 (MQ=255) cTGGGGGCGTTTCCGGCAACGCATCGTCAGGCACTGGGCATGCTGGGAATGCACGGTACCTa  <  1:19920/62‑1 (MQ=255) cTGGGGGCGTTTCCGGCAACGCATCGTCAGGCACTGGGCATGCTGGGAATGCACGGTACCTa  <  1:175064/62‑1 (MQ=255) cTGGGGGCGTTTCCGGCAACGCATCGTCAGGCACTGGGCATGCTGGGAATGCACGGTACCTa  <  1:1646368/62‑1 (MQ=255) cTGGGGGCGTTTCCGGCAACGCATCGTCAGGCACTGGGCATGCTGGGAATGCACGGTACCTa  <  1:1615101/62‑1 (MQ=255) cTGGGGGCGTTTCCGGCAACGCATCGTCAGGCACTGGGCATGCTGGGAATGCACGGTACCTa  <  1:1592788/62‑1 (MQ=255) cTGGGGGCGTTTCCGGCAACGCATCGTCAGGCACTGGGCATGCTGGGAATGCACGGTACCTa  <  1:144973/62‑1 (MQ=255) cTGGGGGCGTTTCCGGCAACGCATCGTCAGGCACTGGGCATGCTGGGAATGCACGGTACCTa  <  1:157559/62‑1 (MQ=255) cTGGGGGCGTTTCCGGCAACGCATCGTCAGGCACTGGGCATGCTGGGAATGCACGGTACCTa  <  1:1559044/62‑1 (MQ=255) cTGGGGGCGTTTCCGGCAACGCATCGTCAGGCACTGGGCATGCTGGGAATGCACGGTACCTa  <  1:1532040/62‑1 (MQ=255) cTGGGGGCGTTTCCGGCAACGCATCGTCAGGCACTGGGCATGCTGGGAATGCACGGTACCTa  <  1:1524910/62‑1 (MQ=255) cTGGGGGCGTTTCCGGCAACGCATCGTCAGGCACTGGGCATGCTGGGAATGCACGGTACCTa  <  1:1504457/62‑1 (MQ=255) cTGGGGGCGTTTCCGGCAACGCATCGTCAGGCACTGGGCATGCTGGGAATGCACGGTACCTa  <  1:1487820/62‑1 (MQ=255) cTGGGGGCGTTTCCGGCAACGCATCGTCAGGCACTGGGCATGCTGGGAATGCACGGTACCTa  <  1:1485730/62‑1 (MQ=255) cTGGGGGCGTTTCCGGCAACGCATCGTCAGGCACTGGGCATGCTGGGAATGCACGGTACATa  <  1:413717/62‑1 (MQ=255) cTGGGGGCGTTTCCGGCAACGCATCGTCAGGCACTGGGCATGCGGGGAATGCACGGTACCTa  <  1:1636610/62‑1 (MQ=255) cTGGGGGCGTTTCCGGCAACGCAGCGTCAGGCACTGGGCATGCTGGGAATGCACGGTACCTa  <  1:107552/62‑1 (MQ=255) cTGGGGGCGTTGCCGGCAACGCATCGTCAGGCACTGGGCATGCTGGGAATGCACGGTACCTa  <  1:1596216/62‑1 (MQ=255) cTGGGGGCGTGTCCGGCAACGCATCGTCAGGCACTGGGCATGCTGGGAATGCACGGTACCTa  <  1:1628968/62‑1 (MQ=255) cTGGGGGCGGTTCCGGCAACGCATCGTCAGGCACTGGGCATGCTGGGAATGCACGGTACCTa  <  1:977559/62‑1 (MQ=255) cTGGGGCCGTTTCCGGCAACGCATCGTCAGGCACTGGGCATGCTGGGAATGCACGGTACCTa  <  1:1399831/62‑1 (MQ=255) |                                                              CTGGGGGCGTTTCCGGCAACGCATCGTCAGGCACTGGGCATGCTGGGAATGCACGGTACCTA  >  W3110S.gb/86359‑86420

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑