Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4354282	4354346	65	62 [0]	[0] 34	dcuR	DNA‑binding response regulator in two‑component regulatory system with DcuS

TTTTGCCGCCAGCCGGTGAGCGCCTCTTCAAAGCGGGAAGCCTGGAAGGGTTTGATCAGGT  >  W3110S.gb/4354347‑4354407 |                                                             ttttGCCGCCAGCCGGTGAGCGCCTCTTCAAAGCGGGAAGCCTGGAAGGGTTTGATCAGGt  <  1:666445/61‑1 (MQ=255) ttttGCCGCCAGCCGGTGAGCGCCTCTTCAAAGCGGGAAGCCTGGAAGGGTTTGATCAGGt  <  1:18509/61‑1 (MQ=255) ttttGCCGCCAGCCGGTGAGCGCCTCTTCAAAGCGGGAAGCCTGGAAGGGTTTGATCAGGt  <  1:275115/61‑1 (MQ=255) ttttGCCGCCAGCCGGTGAGCGCCTCTTCAAAGCGGGAAGCCTGGAAGGGTTTGATCAGGt  <  1:377571/61‑1 (MQ=255) ttttGCCGCCAGCCGGTGAGCGCCTCTTCAAAGCGGGAAGCCTGGAAGGGTTTGATCAGGt  <  1:473061/61‑1 (MQ=255) ttttGCCGCCAGCCGGTGAGCGCCTCTTCAAAGCGGGAAGCCTGGAAGGGTTTGATCAGGt  <  1:487717/61‑1 (MQ=255) ttttGCCGCCAGCCGGTGAGCGCCTCTTCAAAGCGGGAAGCCTGGAAGGGTTTGATCAGGt  <  1:510997/61‑1 (MQ=255) ttttGCCGCCAGCCGGTGAGCGCCTCTTCAAAGCGGGAAGCCTGGAAGGGTTTGATCAGGt  <  1:535406/61‑1 (MQ=255) ttttGCCGCCAGCCGGTGAGCGCCTCTTCAAAGCGGGAAGCCTGGAAGGGTTTGATCAGGt  <  1:640509/61‑1 (MQ=255) ttttGCCGCCAGCCGGTGAGCGCCTCTTCAAAGCGGGAAGCCTGGAAGGGTTTGATCAGGt  <  1:177063/61‑1 (MQ=255) ttttGCCGCCAGCCGGTGAGCGCCTCTTCAAAGCGGGAAGCCTGGAAGGGTTTGATCAGGt  <  1:684269/61‑1 (MQ=255) ttttGCCGCCAGCCGGTGAGCGCCTCTTCAAAGCGGGAAGCCTGGAAGGGTTTGATCAGGt  <  1:7301/61‑1 (MQ=255) ttttGCCGCCAGCCGGTGAGCGCCTCTTCAAAGCGGGAAGCCTGGAAGGGTTTGATCAGGt  <  1:818405/61‑1 (MQ=255) ttttGCCGCCAGCCGGTGAGCGCCTCTTCAAAGCGGGAAGCCTGGAAGGGTTTGATCAGGt  <  1:857884/61‑1 (MQ=255) ttttGCCGCCAGCCGGTGAGCGCCTCTTCAAAGCGGGAAGCCTGGAAGGGTTTGATCAGGt  <  1:897301/61‑1 (MQ=255) ttttGCCGCCAGCCGGTGAGCGCCTCTTCAAAGCGGGAAGCCTGGAAGGGTTTGATCAGGt  <  1:957111/61‑1 (MQ=255) ttttGCCGCCAGCCGGTGAGCGCCTCTTCAAAGCGGGAAGCCTGGAAGGGTTTGATCAGGt  <  1:960366/61‑1 (MQ=255) ttttGCCGCCAGCCGGTGAGCGCCTCTTCAAAGCGGGAAGCCTGGAAGGGTTTGATCAGGt  <  1:1403609/61‑1 (MQ=255) ttttGCCGCCAGCCGGTGAGCGCCTCTTCAAAGCGGGAAGCCTGGAAGGGTTTGATCAGGt  <  1:1051438/61‑1 (MQ=255) ttttGCCGCCAGCCGGTGAGCGCCTCTTCAAAGCGGGAAGCCTGGAAGGGTTTGATCAGGt  <  1:105397/61‑1 (MQ=255) ttttGCCGCCAGCCGGTGAGCGCCTCTTCAAAGCGGGAAGCCTGGAAGGGTTTGATCAGGt  <  1:1111402/61‑1 (MQ=255) ttttGCCGCCAGCCGGTGAGCGCCTCTTCAAAGCGGGAAGCCTGGAAGGGTTTGATCAGGt  <  1:1169904/61‑1 (MQ=255) ttttGCCGCCAGCCGGTGAGCGCCTCTTCAAAGCGGGAAGCCTGGAAGGGTTTGATCAGGt  <  1:12297/61‑1 (MQ=255) ttttGCCGCCAGCCGGTGAGCGCCTCTTCAAAGCGGGAAGCCTGGAAGGGTTTGATCAGGt  <  1:1352526/61‑1 (MQ=255) ttttGCCGCCAGCCGGTGAGCGCCTCTTCAAAGCGGGAAGCCTGGAAGGGTTTGATCAGGt  <  1:1391095/61‑1 (MQ=255) ttttGCCGCCAGCCGGTGAGCGCCTCTTCAAAGCGGGAAGCCTGGAAGGGTTTGATCAGGt  <  1:1392807/61‑1 (MQ=255) ttttGCCGCCAGCCGGTGAGCGCCTCTTCAAAGCGGGAAGCCTGGAAGGGTTTGATCAGGt  <  1:1005236/61‑1 (MQ=255) ttttGCCGCCAGCCGGTGAGCGCCTCTTCAAAGCGGGAAGCCTGGAAGGGTTTGATCAGGt  <  1:140631/61‑1 (MQ=255) ttttGCCGCCAGCCGGTGAGCGCCTCTTCAAAGCGGGAAGCCTGGAAGGGTTTGATCAGGt  <  1:1420505/61‑1 (MQ=255) ttttGCCGCCAGCCGGTGAGCGCCTCTTCAAAGCGGGAAGCCTGGAAGGGTTTGATCAGGt  <  1:1422128/61‑1 (MQ=255) ttttGCCGCCAGCCGGTGAGCGCCTCTTCAAAGCGGGAAGCCTGGAAGGGTTTGATCAGGt  <  1:1428561/61‑1 (MQ=255) ttttGCCGCCAGCCGGTGAGCGCCTCTTCAAAGCGGGAAGCCTGGAAGGGTTTGATCAGGt  <  1:1513612/61‑1 (MQ=255) ttttGCCGCCAGCCGGTGAGCGCCTCTTCAAAGCGGGAAGCCTGGAAGGGTTTGATCAGGt  <  1:1620170/61‑1 (MQ=255) ttttGCCGCCAGCCGGTGAGCGCCTCTTCAAAGCGGGAAGCCTGGAAGGGTTTGATCAGGt  <  1:1629028/61‑1 (MQ=255) |                                                             TTTTGCCGCCAGCCGGTGAGCGCCTCTTCAAAGCGGGAAGCCTGGAAGGGTTTGATCAGGT  >  W3110S.gb/4354347‑4354407

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑