Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4398912	4399145	234	42 [0]	[1] 37	yjeF	predicted carbohydrate kinase

TTGTTGATGCGCTGCTCGGTACCGGTTTGCGGCAAGCGCCCCGCGAATCCATTAGCCAGTT  >  W3110S.gb/4399145‑4399205  |                                                            ttgttgATGCGCTGCTCGGTACCGGTTTGCGGCAAGCGCCCCGCGAATCCATTAGCCAGtt  <  1:743586/61‑1 (MQ=255)  tgttgATGCGCTGCTCGGTACCGGTTTGCGGCAAGCGCCCCGCGCATCCATTAGCCAGtt  <  1:1511992/60‑1 (MQ=255)  tgttgATGCGCTGCTCGGTACCGGTTTGCGGCAAGCGCCCCGCGAATCCATTAGCCAGtt  <  1:451937/60‑1 (MQ=255)  tgttgATGCGCTGCTCGGTACCGGTTTGCGGCAAGCGCCCCGCGAATCCATTAGCCAGtt  <  1:412148/60‑1 (MQ=255)  tgttgATGCGCTGCTCGGTACCGGTTTGCGGCAAGCGCCCCGCGAATCCATTAGCCAGtt  <  1:470836/60‑1 (MQ=255)  tgttgATGCGCTGCTCGGTACCGGTTTGCGGCAAGCGCCCCGCGAATCCATTAGCCAGtt  <  1:478359/60‑1 (MQ=255)  tgttgATGCGCTGCTCGGTACCGGTTTGCGGCAAGCGCCCCGCGAATCCATTAGCCAGtt  <  1:504771/60‑1 (MQ=255)  tgttgATGCGCTGCTCGGTACCGGTTTGCGGCAAGCGCCCCGCGAATCCATTAGCCAGtt  <  1:514668/60‑1 (MQ=255)  tgttgATGCGCTGCTCGGTACCGGTTTGCGGCAAGCGCCCCGCGAATCCATTAGCCAGtt  <  1:54147/60‑1 (MQ=255)  tgttgATGCGCTGCTCGGTACCGGTTTGCGGCAAGCGCCCCGCGAATCCATTAGCCAGtt  <  1:567344/60‑1 (MQ=255)  tgttgATGCGCTGCTCGGTACCGGTTTGCGGCAAGCGCCCCGCGAATCCATTAGCCAGtt  <  1:611247/60‑1 (MQ=255)  tgttgATGCGCTGCTCGGTACCGGTTTGCGGCAAGCGCCCCGCGAATCCATTAGCCAGtt  <  1:640400/60‑1 (MQ=255)  tgttgATGCGCTGCTCGGTACCGGTTTGCGGCAAGCGCCCCGCGAATCCATTAGCCAGtt  <  1:72319/60‑1 (MQ=255)  tgttgATGCGCTGCTCGGTACCGGTTTGCGGCAAGCGCCCCGCGAATCCATTAGCCAGtt  <  1:776945/60‑1 (MQ=255)  tgttgATGCGCTGCTCGGTACCGGTTTGCGGCAAGCGCCCCGCGAATCCATTAGCCAGtt  <  1:780673/60‑1 (MQ=255)  tgttgATGCGCTGCTCGGTACCGGTTTGCGGCAAGCGCCCCGCGAATCCATTAGCCAGtt  <  1:838932/60‑1 (MQ=255)  tgttgATGCGCTGCTCGGTACCGGTTTGCGGCAAGCGCCCCGCGAATCCATTAGCCAGtt  <  1:865569/60‑1 (MQ=255)  tgttgATGCGCTGCTCGGTACCGGTTTGCGGCAAGCGCCCCGCGAATCCATTAGCCAGtt  <  1:887344/60‑1 (MQ=255)  tgttgATGCGCTGCTCGGTACCGGTTTGCGGCAAGCGCCCCGCGAATCCATTAGCCAGtt  <  1:908783/60‑1 (MQ=255)  tgttgATGCGCTGCTCGGTACCGGTTTGCGGCAAGCGCCCCGCGAATCCATTAGCCAGtt  <  1:1569044/60‑1 (MQ=255)  tgttgATGCGCTGCTCGGTACCGGTTTGCGGCAAGCGCCCCGCGAATCCATTAGCCAGtt  <  1:1081961/60‑1 (MQ=255)  tgttgATGCGCTGCTCGGTACCGGTTTGCGGCAAGCGCCCCGCGAATCCATTAGCCAGtt  <  1:1136109/60‑1 (MQ=255)  tgttgATGCGCTGCTCGGTACCGGTTTGCGGCAAGCGCCCCGCGAATCCATTAGCCAGtt  <  1:1150257/60‑1 (MQ=255)  tgttgATGCGCTGCTCGGTACCGGTTTGCGGCAAGCGCCCCGCGAATCCATTAGCCAGtt  <  1:1221358/60‑1 (MQ=255)  tgttgATGCGCTGCTCGGTACCGGTTTGCGGCAAGCGCCCCGCGAATCCATTAGCCAGtt  <  1:1269319/60‑1 (MQ=255)  tgttgATGCGCTGCTCGGTACCGGTTTGCGGCAAGCGCCCCGCGAATCCATTAGCCAGtt  <  1:1325291/60‑1 (MQ=255)  tgttgATGCGCTGCTCGGTACCGGTTTGCGGCAAGCGCCCCGCGAATCCATTAGCCAGtt  <  1:1402599/60‑1 (MQ=255)  tgttgATGCGCTGCTCGGTACCGGTTTGCGGCAAGCGCCCCGCGAATCCATTAGCCAGtt  <  1:1408522/60‑1 (MQ=255)  tgttgATGCGCTGCTCGGTACCGGTTTGCGGCAAGCGCCCCGCGAATCCATTAGCCAGtt  <  1:426104/60‑1 (MQ=255)  tgttgATGCGCTGCTCGGTACCGGTTTGCGGCAAGCGCCCCGCGAATCCATTAGCCAGtt  <  1:1590586/60‑1 (MQ=255)  tgttgATGCGCTGCTCGGTACCGGTTTGCGGCAAGCGCCCCGCGAATCCATTAGCCAGtt  <  1:169210/60‑1 (MQ=255)  tgttgATGCGCTGCTCGGTACCGGTTTGCGGCAAGCGCCCCGCGAATCCATTAGCCAGtt  <  1:207896/60‑1 (MQ=255)  tgttgATGCGCTGCTCGGTACCGGTTTGCGGCAAGCGCCCCGCGAATCCATTAGCCAGtt  <  1:287227/60‑1 (MQ=255)  tgttgATGCGCTGCTCGGTACCGGTTTGCGGCAAGCGCCCCGCGAATCCATTAGCCAGtt  <  1:353567/60‑1 (MQ=255)  tgttgATGCGCTGCTCGGTACCGGTTTGCGGCAAGCGCCCCGCGAATCCATTAGCCAGtt  <  1:370612/60‑1 (MQ=255)  tgttgATGCGCTGCTCGGTACCGGTTTGCGGCAAGCGCCCCGCGAATCCATTAGCCAGtt  <  1:374779/60‑1 (MQ=255)  tgttgATGCGCTGCTCGGTACCGGTTTGCGGCAAGCGCCCCGCGAATCCATTAGCCAGtt  <  1:1046595/60‑1 (MQ=255)  |                                                            TTGTTGATGCGCTGCTCGGTACCGGTTTGCGGCAAGCGCCCCGCGAATCCATTAGCCAGTT  >  W3110S.gb/4399145‑4399205

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑