Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4408980	4409051	72	67 [5]	[0] 38	[hflC]	[hflC]

TCTATAAGGATAATGAATGAATTCGACAATCTGGCTGGCGCTTGCCCTGGTTTTGGTACT  >  W3110S.gb/4409052‑4409111 |                                                            tctATAAGGATAATGAATGAATTCGACAATCTGGCTGGCGCTTGCCCTGGTTTTGGTAc   >  1:888777/1‑59 (MQ=255) tctATAAGGATAATGAATGAATTCGACAATCTGGCTGGCGCTTGCCCTGGTTTTGGTACt  >  1:782756/1‑60 (MQ=255) tctATAAGGATAATGAATGAATTCGACAATCTGGCTGGCGCTTGCCCTGGTTTTGGTACt  >  1:367142/1‑60 (MQ=255) tctATAAGGATAATGAATGAATTCGACAATCTGGCTGGCGCTTGCCCTGGTTTTGGTACt  >  1:389410/1‑60 (MQ=255) tctATAAGGATAATGAATGAATTCGACAATCTGGCTGGCGCTTGCCCTGGTTTTGGTACt  >  1:391365/1‑60 (MQ=255) tctATAAGGATAATGAATGAATTCGACAATCTGGCTGGCGCTTGCCCTGGTTTTGGTACt  >  1:415252/1‑60 (MQ=255) tctATAAGGATAATGAATGAATTCGACAATCTGGCTGGCGCTTGCCCTGGTTTTGGTACt  >  1:447049/1‑60 (MQ=255) tctATAAGGATAATGAATGAATTCGACAATCTGGCTGGCGCTTGCCCTGGTTTTGGTACt  >  1:462372/1‑60 (MQ=255) tctATAAGGATAATGAATGAATTCGACAATCTGGCTGGCGCTTGCCCTGGTTTTGGTACt  >  1:550138/1‑60 (MQ=255) tctATAAGGATAATGAATGAATTCGACAATCTGGCTGGCGCTTGCCCTGGTTTTGGTACt  >  1:68980/1‑60 (MQ=255) tctATAAGGATAATGAATGAATTCGACAATCTGGCTGGCGCTTGCCCTGGTTTTGGTACt  >  1:695454/1‑60 (MQ=255) tctATAAGGATAATGAATGAATTCGACAATCTGGCTGGCGCTTGCCCTGGTTTTGGTACt  >  1:360107/1‑60 (MQ=255) tctATAAGGATAATGAATGAATTCGACAATCTGGCTGGCGCTTGCCCTGGTTTTGGTACt  >  1:790351/1‑60 (MQ=255) tctATAAGGATAATGAATGAATTCGACAATCTGGCTGGCGCTTGCCCTGGTTTTGGTACt  >  1:802002/1‑60 (MQ=255) tctATAAGGATAATGAATGAATTCGACAATCTGGCTGGCGCTTGCCCTGGTTTTGGTACt  >  1:803573/1‑60 (MQ=255) tctATAAGGATAATGAATGAATTCGACAATCTGGCTGGCGCTTGCCCTGGTTTTGGTACt  >  1:80722/1‑60 (MQ=255) tctATAAGGATAATGAATGAATTCGACAATCTGGCTGGCGCTTGCCCTGGTTTTGGTACt  >  1:835524/1‑60 (MQ=255) tctATAAGGATAATGAATGAATTCGACAATCTGGCTGGCGCTTGCCCTGGTTTTGGTACt  >  1:837969/1‑60 (MQ=255) tctATAAGGATAATGAATGAATTCGACAATCTGGCTGGCGCTTGCCCTGGTTTTGGTACt  >  1:929177/1‑60 (MQ=255) tctATAAGGATAATGAATGAATTCGACAATCTGGCTGGCGCTTGCCCTGGTTTTGGTACt  >  1:1464965/1‑60 (MQ=255) tctATAAGGATAATGAATGAATTCGACAATCTGGCTGGCGCTTGCCCTGGTTTTGGTACt  >  1:1100495/1‑60 (MQ=255) tctATAAGGATAATGAATGAATTCGACAATCTGGCTGGCGCTTGCCCTGGTTTTGGTACt  >  1:1121518/1‑60 (MQ=255) tctATAAGGATAATGAATGAATTCGACAATCTGGCTGGCGCTTGCCCTGGTTTTGGTACt  >  1:1213908/1‑60 (MQ=255) tctATAAGGATAATGAATGAATTCGACAATCTGGCTGGCGCTTGCCCTGGTTTTGGTACt  >  1:1221298/1‑60 (MQ=255) tctATAAGGATAATGAATGAATTCGACAATCTGGCTGGCGCTTGCCCTGGTTTTGGTACt  >  1:1246298/1‑60 (MQ=255) tctATAAGGATAATGAATGAATTCGACAATCTGGCTGGCGCTTGCCCTGGTTTTGGTACt  >  1:1271662/1‑60 (MQ=255) tctATAAGGATAATGAATGAATTCGACAATCTGGCTGGCGCTTGCCCTGGTTTTGGTACt  >  1:131984/1‑60 (MQ=255) tctATAAGGATAATGAATGAATTCGACAATCTGGCTGGCGCTTGCCCTGGTTTTGGTACt  >  1:1356731/1‑60 (MQ=255) tctATAAGGATAATGAATGAATTCGACAATCTGGCTGGCGCTTGCCCTGGTTTTGGTACt  >  1:1451181/1‑60 (MQ=255) tctATAAGGATAATGAATGAATTCGACAATCTGGCTGGCGCTTGCCCTGGTTTTGGTACt  >  1:1520345/1‑60 (MQ=255) tctATAAGGATAATGAATGAATTCGACAATCTGGCTGGCGCTTGCCCTGGTTTTGGTACt  >  1:1529728/1‑60 (MQ=255) tctATAAGGATAATGAATGAATTCGACAATCTGGCTGGCGCTTGCCCTGGTTTTGGTACt  >  1:1535728/1‑60 (MQ=255) tctATAAGGATAATGAATGAATTCGACAATCTGGCTGGCGCTTGCCCTGGTTTTGGTACt  >  1:1606661/1‑60 (MQ=255) tctATAAGGATAATGAATGAATTCGACAATCTGGCTGGCGCTTGCCCTGGTTTTGGTACt  >  1:183483/1‑60 (MQ=255) tctATAAGGATAATGAATGAATTCGACAATCTGGCTGGCGCTTGCCCTGGTTTTGGTACt  >  1:199713/1‑60 (MQ=255) tctATAAGGATAATGAATGAATTCGACAATCTGGCTGGCGCTTGCCCTGGTTTTGGTACt  >  1:293447/1‑60 (MQ=255) tctATAAGGATAATGAATGAATTCGACAATCTGGCTGGCGCTTGCCCTGGTTTTGGTACt  >  1:335788/1‑60 (MQ=255) tctATAAGGATAATGAATCAATTCGACAAACTGGCTGGCGCATGccc               >  1:1025483/1‑47 (MQ=38) |                                                            TCTATAAGGATAATGAATGAATTCGACAATCTGGCTGGCGCTTGCCCTGGTTTTGGTACT  >  W3110S.gb/4409052‑4409111

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑