Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4504399	4505278	880	37 [0]	[0] 49	yjgX	ECK4266:JW5764+JW4234+JW5763:b4575; KpLE2 phage‑like element; hypothetical protein

TAATGTGTCAGTTGTCCCCACAACTGTTCCTTTAACCATCCGC  >  W3110S.gb/4505279‑4505321 |                                           tAATGTGTCAGTTGTCCCCACAACTGTTCCTTTAACCa       >  1:1363552/1‑38 (MQ=255) tAATGTGTCAGTTGTCCCCACAACTGTTCCTTTAACCATCCGc  >  1:745446/1‑43 (MQ=255) tAATGTGTCAGTTGTCCCCACAACTGTTCCTTTAACCATCCGc  >  1:327425/1‑43 (MQ=255) tAATGTGTCAGTTGTCCCCACAACTGTTCCTTTAACCATCCGc  >  1:33852/1‑43 (MQ=255) tAATGTGTCAGTTGTCCCCACAACTGTTCCTTTAACCATCCGc  >  1:341471/1‑43 (MQ=255) tAATGTGTCAGTTGTCCCCACAACTGTTCCTTTAACCATCCGc  >  1:368639/1‑43 (MQ=255) tAATGTGTCAGTTGTCCCCACAACTGTTCCTTTAACCATCCGc  >  1:408636/1‑43 (MQ=255) tAATGTGTCAGTTGTCCCCACAACTGTTCCTTTAACCATCCGc  >  1:44531/1‑43 (MQ=255) tAATGTGTCAGTTGTCCCCACAACTGTTCCTTTAACCATCCGc  >  1:472619/1‑43 (MQ=255) tAATGTGTCAGTTGTCCCCACAACTGTTCCTTTAACCATCCGc  >  1:480261/1‑43 (MQ=255) tAATGTGTCAGTTGTCCCCACAACTGTTCCTTTAACCATCCGc  >  1:489202/1‑43 (MQ=255) tAATGTGTCAGTTGTCCCCACAACTGTTCCTTTAACCATCCGc  >  1:490971/1‑43 (MQ=255) tAATGTGTCAGTTGTCCCCACAACTGTTCCTTTAACCATCCGc  >  1:538490/1‑43 (MQ=255) tAATGTGTCAGTTGTCCCCACAACTGTTCCTTTAACCATCCGc  >  1:726488/1‑43 (MQ=255) tAATGTGTCAGTTGTCCCCACAACTGTTCCTTTAACCATCCGc  >  1:278509/1‑43 (MQ=255) tAATGTGTCAGTTGTCCCCACAACTGTTCCTTTAACCATCCGc  >  1:757255/1‑43 (MQ=255) tAATGTGTCAGTTGTCCCCACAACTGTTCCTTTAACCATCCGc  >  1:784799/1‑43 (MQ=255) tAATGTGTCAGTTGTCCCCACAACTGTTCCTTTAACCATCCGc  >  1:828083/1‑43 (MQ=255) tAATGTGTCAGTTGTCCCCACAACTGTTCCTTTAACCATCCGc  >  1:845750/1‑43 (MQ=255) tAATGTGTCAGTTGTCCCCACAACTGTTCCTTTAACCATCCGc  >  1:887036/1‑43 (MQ=255) tAATGTGTCAGTTGTCCCCACAACTGTTCCTTTAACCATCCGc  >  1:890548/1‑43 (MQ=255) tAATGTGTCAGTTGTCCCCACAACTGTTCCTTTAACCATCCGc  >  1:891494/1‑43 (MQ=255) tAATGTGTCAGTTGTCCCCACAACTGTTCCTTTAACCATCCGc  >  1:938423/1‑43 (MQ=255) tAATGTGTCAGTTGTCCCCACAACTGTTCCTTTAACCATCCGc  >  1:948568/1‑43 (MQ=255) tAATGTGTCAGTTGTCCCCACAACTGTTCCTTTAACCATCCGc  >  1:994939/1‑43 (MQ=255) tAATGTGTCAGTTGTCCCCACAACTGTTCCTTTAACCATCCGc  >  1:154132/1‑43 (MQ=255) tAATGTGTCAGTTGTCCCCACAACTGTTCCTTTAACCATCCGc  >  1:1124040/1‑43 (MQ=255) tAATGTGTCAGTTGTCCCCACAACTGTTCCTTTAACCATCCGc  >  1:1130565/1‑43 (MQ=255) tAATGTGTCAGTTGTCCCCACAACTGTTCCTTTAACCATCCGc  >  1:1179773/1‑43 (MQ=255) tAATGTGTCAGTTGTCCCCACAACTGTTCCTTTAACCATCCGc  >  1:1225764/1‑43 (MQ=255) tAATGTGTCAGTTGTCCCCACAACTGTTCCTTTAACCATCCGc  >  1:1306264/1‑43 (MQ=255) tAATGTGTCAGTTGTCCCCACAACTGTTCCTTTAACCATCCGc  >  1:1316028/1‑43 (MQ=255) tAATGTGTCAGTTGTCCCCACAACTGTTCCTTTAACCATCCGc  >  1:1494773/1‑43 (MQ=255) tAATGTGTCAGTTGTCCCCACAACTGTTCCTTTAACCATCCGc  >  1:1509251/1‑43 (MQ=255) tAATGTGTCAGTTGTCCCCACAACTGTTCCTTTAACCATCCGc  >  1:1527585/1‑43 (MQ=255) tAATGTGTCAGTTGTCCCCACAACTGTTCCTTTAACCATCCGc  >  1:1531701/1‑43 (MQ=255) tAATGTGTCAGTTGTCCCCACAACTGTTCCTTTAACCATCCGc  >  1:1534370/1‑43 (MQ=255) tAATGTGTCAGTTGTCCCCACAACTGTTCCTTTAACCATCCGc  >  1:322612/1‑43 (MQ=255) tAATGTGTCAGTTGTCCCCACAACTGTTCCTTTAACCATCCGc  >  1:1543295/1‑43 (MQ=255) tAATGTGTCAGTTGTCCCCACAACTGTTCCTTTAACCATCCGc  >  1:1580997/1‑43 (MQ=255) tAATGTGTCAGTTGTCCCCACAACTGTTCCTTTAACCATCCGc  >  1:1583577/1‑43 (MQ=255) tAATGTGTCAGTTGTCCCCACAACTGTTCCTTTAACCATCCGc  >  1:1609776/1‑43 (MQ=255) tAATGTGTCAGTTGTCCCCACAACTGTTCCTTTAACCATCCGc  >  1:1610934/1‑43 (MQ=255) tAATGTGTCAGTTGTCCCCACAACTGTTCCTTTAACCATCCGc  >  1:171430/1‑43 (MQ=255) tAATGTGTCAGTTGTCCCCACAACTGTTCCTTTAACCATCCGc  >  1:239487/1‑43 (MQ=255) tAATGTGTCAGTTGTCCCCACAACTGTTCCTTTAACCATCCGc  >  1:276741/1‑43 (MQ=255) tAATGTGTCAGTTGTCCCCACAACTGTTCCTTTAACCATCCGc  >  1:277676/1‑43 (MQ=255) tAATGTGTCAGTTGTCCCCACAACTGTTCCTTTAACCATCCGc  >  1:1106342/1‑43 (MQ=255) tAATGTGTCAGTTGTCCCCACAAATGTTCCTTTAACCATCCGc  >  1:1598806/1‑43 (MQ=255) |                                           TAATGTGTCAGTTGTCCCCACAACTGTTCCTTTAACCATCCGC  >  W3110S.gb/4505279‑4505321

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑