Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4511562	4511601	40	54 [0]	[0] 41	yjhE	ECK4272:JW4242:b4282; KpLE2 phage‑like element; predicted membrane protein

GAAGTATGTGGGAATTGCCAGCGGATTGATGAACGCCGGTTCCGCTGTCGCCGACATTATTT  >  W3110S.gb/4511602‑4511663 |                                                              gAAGTATGTGGGAATTGCCAGCGGATTGATGAACGCCGGTTCCGCTGTCGCCGACattatt   >  1:542132/1‑61 (MQ=255) gAAGTATGTGGGAATTGCCAGCGGATTGATGAACGCCGGTTCCGCTGTCGCCGACattatt   >  1:211710/1‑61 (MQ=255) gAAGTATGTGGGAATTGCCAGCGGATTGATGAACGCCGGTTCCGCTGTCGCCGACATTAttt  >  1:696233/1‑62 (MQ=255) gAAGTATGTGGGAATTGCCAGCGGATTGATGAACGCCGGTTCCGCTGTCGCCGACATTAttt  >  1:428171/1‑62 (MQ=255) gAAGTATGTGGGAATTGCCAGCGGATTGATGAACGCCGGTTCCGCTGTCGCCGACATTAttt  >  1:529580/1‑62 (MQ=255) gAAGTATGTGGGAATTGCCAGCGGATTGATGAACGCCGGTTCCGCTGTCGCCGACATTAttt  >  1:540846/1‑62 (MQ=255) gAAGTATGTGGGAATTGCCAGCGGATTGATGAACGCCGGTTCCGCTGTCGCCGACATTAttt  >  1:559097/1‑62 (MQ=255) gAAGTATGTGGGAATTGCCAGCGGATTGATGAACGCCGGTTCCGCTGTCGCCGACATTAttt  >  1:560816/1‑62 (MQ=255) gAAGTATGTGGGAATTGCCAGCGGATTGATGAACGCCGGTTCCGCTGTCGCCGACATTAttt  >  1:576448/1‑62 (MQ=255) gAAGTATGTGGGAATTGCCAGCGGATTGATGAACGCCGGTTCCGCTGTCGCCGACATTAttt  >  1:633213/1‑62 (MQ=255) gAAGTATGTGGGAATTGCCAGCGGATTGATGAACGCCGGTTCCGCTGTCGCCGACATTAttt  >  1:655934/1‑62 (MQ=255) gAAGTATGTGGGAATTGCCAGCGGATTGATGAACGCCGGTTCCGCTGTCGCCGACATTAttt  >  1:375153/1‑62 (MQ=255) gAAGTATGTGGGAATTGCCAGCGGATTGATGAACGCCGGTTCCGCTGTCGCCGACATTAttt  >  1:735699/1‑62 (MQ=255) gAAGTATGTGGGAATTGCCAGCGGATTGATGAACGCCGGTTCCGCTGTCGCCGACATTAttt  >  1:742756/1‑62 (MQ=255) gAAGTATGTGGGAATTGCCAGCGGATTGATGAACGCCGGTTCCGCTGTCGCCGACATTAttt  >  1:763130/1‑62 (MQ=255) gAAGTATGTGGGAATTGCCAGCGGATTGATGAACGCCGGTTCCGCTGTCGCCGACATTAttt  >  1:770156/1‑62 (MQ=255) gAAGTATGTGGGAATTGCCAGCGGATTGATGAACGCCGGTTCCGCTGTCGCCGACATTAttt  >  1:781421/1‑62 (MQ=255) gAAGTATGTGGGAATTGCCAGCGGATTGATGAACGCCGGTTCCGCTGTCGCCGACATTAttt  >  1:833628/1‑62 (MQ=255) gAAGTATGTGGGAATTGCCAGCGGATTGATGAACGCCGGTTCCGCTGTCGCCGACATTAttt  >  1:837870/1‑62 (MQ=255) gAAGTATGTGGGAATTGCCAGCGGATTGATGAACGCCGGTTCCGCTGTCGCCGACATTAttt  >  1:90656/1‑62 (MQ=255) gAAGTATGTGGGAATTGCCAGCGGATTGATGAACGCCGGTTCCGCTGTCGCCGACATTAttt  >  1:987365/1‑62 (MQ=255) gAAGTATGTGGGAATTGCCAGCGGATTGATGAACGCCGGTTCCGCTGTCGCCGACATTAttt  >  1:1475691/1‑62 (MQ=255) gAAGTATGTGGGAATTGCCAGCGGATTGATGAACGCCGGTTCCGCTGTCGCCGACATTAttt  >  1:1055032/1‑62 (MQ=255) gAAGTATGTGGGAATTGCCAGCGGATTGATGAACGCCGGTTCCGCTGTCGCCGACATTAttt  >  1:1068135/1‑62 (MQ=255) gAAGTATGTGGGAATTGCCAGCGGATTGATGAACGCCGGTTCCGCTGTCGCCGACATTAttt  >  1:1108877/1‑62 (MQ=255) gAAGTATGTGGGAATTGCCAGCGGATTGATGAACGCCGGTTCCGCTGTCGCCGACATTAttt  >  1:1191543/1‑62 (MQ=255) gAAGTATGTGGGAATTGCCAGCGGATTGATGAACGCCGGTTCCGCTGTCGCCGACATTAttt  >  1:1316976/1‑62 (MQ=255) gAAGTATGTGGGAATTGCCAGCGGATTGATGAACGCCGGTTCCGCTGTCGCCGACATTAttt  >  1:1332895/1‑62 (MQ=255) gAAGTATGTGGGAATTGCCAGCGGATTGATGAACGCCGGTTCCGCTGTCGCCGACATTAttt  >  1:1414775/1‑62 (MQ=255) gAAGTATGTGGGAATTGCCAGCGGATTGATGAACGCCGGTTCCGCTGTCGCCGACATTAttt  >  1:1421501/1‑62 (MQ=255) gAAGTATGTGGGAATTGCCAGCGGATTGATGAACGCCGGTTCCGCTGTCGCCGACATTAttt  >  1:1456199/1‑62 (MQ=255) gAAGTATGTGGGAATTGCCAGCGGATTGATGAACGCCGGTTCCGCTGTCGCCGACATTAttt  >  1:423210/1‑62 (MQ=255) gAAGTATGTGGGAATTGCCAGCGGATTGATGAACGCCGGTTCCGCTGTCGCCGACATTAttt  >  1:1580389/1‑62 (MQ=255) gAAGTATGTGGGAATTGCCAGCGGATTGATGAACGCCGGTTCCGCTGTCGCCGACATTAttt  >  1:1619126/1‑62 (MQ=255) gAAGTATGTGGGAATTGCCAGCGGATTGATGAACGCCGGTTCCGCTGTCGCCGACATTAttt  >  1:1641499/1‑62 (MQ=255) gAAGTATGTGGGAATTGCCAGCGGATTGATGAACGCCGGTTCCGCTGTCGCCGACATTAttt  >  1:165210/1‑62 (MQ=255) gAAGTATGTGGGAATTGCCAGCGGATTGATGAACGCCGGTTCCGCTGTCGCCGACATTAttt  >  1:192471/1‑62 (MQ=255) gAAGTATGTGGGAATTGCCAGCGGATTGATGAACGCCGGTTCCGCTGTCGCCGACATTAttt  >  1:260784/1‑62 (MQ=255) gAAGTATGTGGGAATTGCCAGCGGATTGATGAACGCCGGTTCCGCTGTCGCCGACATTAttt  >  1:288527/1‑62 (MQ=255) gAAGTATGTGGGAATTGCCAGCGGATTGATGAACGCCGGTTCCGCTGTCGCCGACATTAttt  >  1:324475/1‑62 (MQ=255) gAAGTATGTGGGAATTGCCAGCGGATTGATGAACGCCGGTTCCGCTGTCGCCGACATTAttt  >  1:1023828/1‑62 (MQ=255) |                                                              GAAGTATGTGGGAATTGCCAGCGGATTGATGAACGCCGGTTCCGCTGTCGCCGACATTATTT  >  W3110S.gb/4511602‑4511663

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑