Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4538275	4538687	413	22 [0]	[0] 59	[yjhQ]–[yjhX]	[yjhQ],[yjhX]

TTTAGCGAGAACGTGTAAGGTATGTTGTTCCTGACGGGATAAATTCATACTGAAGAACCT  >  W3110S.gb/4538688‑4538747 |                                                            tttAGCGAGAACGTGTAATGTATGTTGTTCCTGACGGGATAAATTCATACTGAAGAACCt  <  1:1379805/60‑1 (MQ=255) tttAGCGAGAACGTGTAAGGTATGTTGTTCCTGACTGGATAAATTCATACTGAAGAACCt  <  1:1293247/60‑1 (MQ=255) tttAGCGAGAACGTGTAAGGTATGTTGTTCCTGACGGGATAAATTCATACTGAAGAACCt  <  1:422136/60‑1 (MQ=255) tttAGCGAGAACGTGTAAGGTATGTTGTTCCTGACGGGATAAATTCATACTGAAGAACCt  <  1:543303/60‑1 (MQ=255) tttAGCGAGAACGTGTAAGGTATGTTGTTCCTGACGGGATAAATTCATACTGAAGAACCt  <  1:533234/60‑1 (MQ=255) tttAGCGAGAACGTGTAAGGTATGTTGTTCCTGACGGGATAAATTCATACTGAAGAACCt  <  1:521780/60‑1 (MQ=255) tttAGCGAGAACGTGTAAGGTATGTTGTTCCTGACGGGATAAATTCATACTGAAGAACCt  <  1:503108/60‑1 (MQ=255) tttAGCGAGAACGTGTAAGGTATGTTGTTCCTGACGGGATAAATTCATACTGAAGAACCt  <  1:434717/60‑1 (MQ=255) tttAGCGAGAACGTGTAAGGTATGTTGTTCCTGACGGGATAAATTCATACTGAAGAACCt  <  1:425073/60‑1 (MQ=255) tttAGCGAGAACGTGTAAGGTATGTTGTTCCTGACGGGATAAATTCATACTGAAGAACCt  <  1:575192/60‑1 (MQ=255) tttAGCGAGAACGTGTAAGGTATGTTGTTCCTGACGGGATAAATTCATACTGAAGAACCt  <  1:406087/60‑1 (MQ=255) tttAGCGAGAACGTGTAAGGTATGTTGTTCCTGACGGGATAAATTCATACTGAAGAACCt  <  1:363058/60‑1 (MQ=255) tttAGCGAGAACGTGTAAGGTATGTTGTTCCTGACGGGATAAATTCATACTGAAGAACCt  <  1:360438/60‑1 (MQ=255) tttAGCGAGAACGTGTAAGGTATGTTGTTCCTGACGGGATAAATTCATACTGAAGAACCt  <  1:344625/60‑1 (MQ=255) tttAGCGAGAACGTGTAAGGTATGTTGTTCCTGACGGGATAAATTCATACTGAAGAACCt  <  1:339953/60‑1 (MQ=255) tttAGCGAGAACGTGTAAGGTATGTTGTTCCTGACGGGATAAATTCATACTGAAGAACCt  <  1:335673/60‑1 (MQ=255) tttAGCGAGAACGTGTAAGGTATGTTGTTCCTGACGGGATAAATTCATACTGAAGAACCt  <  1:311895/60‑1 (MQ=255) tttAGCGAGAACGTGTAAGGTATGTTGTTCCTGACGGGATAAATTCATACTGAAGAACCt  <  1:545299/60‑1 (MQ=255) tttAGCGAGAACGTGTAAGGTATGTTGTTCCTGACGGGATAAATTCATACTGAAGAACCt  <  1:305464/60‑1 (MQ=255) tttAGCGAGAACGTGTAAGGTATGTTGTTCCTGACGGGATAAATTCATACTGAAGAACCt  <  1:57833/60‑1 (MQ=255) tttAGCGAGAACGTGTAAGGTATGTTGTTCCTGACGGGATAAATTCATACTGAAGAACCt  <  1:590838/60‑1 (MQ=255) tttAGCGAGAACGTGTAAGGTATGTTGTTCCTGACGGGATAAATTCATACTGAAGAACCt  <  1:608913/60‑1 (MQ=255) tttAGCGAGAACGTGTAAGGTATGTTGTTCCTGACGGGATAAATTCATACTGAAGAACCt  <  1:637587/60‑1 (MQ=255) tttAGCGAGAACGTGTAAGGTATGTTGTTCCTGACGGGATAAATTCATACTGAAGAACCt  <  1:643348/60‑1 (MQ=255) tttAGCGAGAACGTGTAAGGTATGTTGTTCCTGACGGGATAAATTCATACTGAAGAACCt  <  1:65589/60‑1 (MQ=255) tttAGCGAGAACGTGTAAGGTATGTTGTTCCTGACGGGATAAATTCATACTGAAGAACCt  <  1:664742/60‑1 (MQ=255) tttAGCGAGAACGTGTAAGGTATGTTGTTCCTGACGGGATAAATTCATACTGAAGAACCt  <  1:665510/60‑1 (MQ=255) tttAGCGAGAACGTGTAAGGTATGTTGTTCCTGACGGGATAAATTCATACTGAAGAACCt  <  1:721232/60‑1 (MQ=255) tttAGCGAGAACGTGTAAGGTATGTTGTTCCTGACGGGATAAATTCATACTGAAGAACCt  <  1:808075/60‑1 (MQ=255) tttAGCGAGAACGTGTAAGGTATGTTGTTCCTGACGGGATAAATTCATACTGAAGAACCt  <  1:819110/60‑1 (MQ=255) tttAGCGAGAACGTGTAAGGTATGTTGTTCCTGACGGGATAAATTCATACTGAAGAACCt  <  1:824770/60‑1 (MQ=255) tttAGCGAGAACGTGTAAGGTATGTTGTTCCTGACGGGATAAATTCATACTGAAGAACCt  <  1:1466493/60‑1 (MQ=255) tttAGCGAGAACGTGTAAGGTATGTTGTTCCTGACGGGATAAATTCATACTGAAGAACCt  <  1:1036963/60‑1 (MQ=255) tttAGCGAGAACGTGTAAGGTATGTTGTTCCTGACGGGATAAATTCATACTGAAGAACCt  <  1:1134304/60‑1 (MQ=255) tttAGCGAGAACGTGTAAGGTATGTTGTTCCTGACGGGATAAATTCATACTGAAGAACCt  <  1:1134883/60‑1 (MQ=255) tttAGCGAGAACGTGTAAGGTATGTTGTTCCTGACGGGATAAATTCATACTGAAGAACCt  <  1:1165667/60‑1 (MQ=255) tttAGCGAGAACGTGTAAGGTATGTTGTTCCTGACGGGATAAATTCATACTGAAGAACCt  <  1:1193276/60‑1 (MQ=255) tttAGCGAGAACGTGTAAGGTATGTTGTTCCTGACGGGATAAATTCATACTGAAGAACCt  <  1:1239452/60‑1 (MQ=255) tttAGCGAGAACGTGTAAGGTATGTTGTTCCTGACGGGATAAATTCATACTGAAGAACCt  <  1:12658/60‑1 (MQ=255) tttAGCGAGAACGTGTAAGGTATGTTGTTCCTGACGGGATAAATTCATACTGAAGAACCt  <  1:128519/60‑1 (MQ=255) tttAGCGAGAACGTGTAAGGTATGTTGTTCCTGACGGGATAAATTCATACTGAAGAACCt  <  1:1324686/60‑1 (MQ=255) tttAGCGAGAACGTGTAAGGTATGTTGTTCCTGACGGGATAAATTCATACTGAAGAACCt  <  1:1334818/60‑1 (MQ=255) tttAGCGAGAACGTGTAAGGTATGTTGTTCCTGACGGGATAAATTCATACTGAAGAACCt  <  1:1395871/60‑1 (MQ=255) tttAGCGAGAACGTGTAAGGTATGTTGTTCCTGACGGGATAAATTCATACTGAAGAACCt  <  1:1462998/60‑1 (MQ=255) tttAGCGAGAACGTGTAAGGTATGTTGTTCCTGACGGGATAAATTCATACTGAAGAACCt  <  1:311057/60‑1 (MQ=255) tttAGCGAGAACGTGTAAGGTATGTTGTTCCTGACGGGATAAATTCATACTGAAGAACCt  <  1:1470129/60‑1 (MQ=255) tttAGCGAGAACGTGTAAGGTATGTTGTTCCTGACGGGATAAATTCATACTGAAGAACCt  <  1:148224/60‑1 (MQ=255) tttAGCGAGAACGTGTAAGGTATGTTGTTCCTGACGGGATAAATTCATACTGAAGAACCt  <  1:151008/60‑1 (MQ=255) tttAGCGAGAACGTGTAAGGTATGTTGTTCCTGACGGGATAAATTCATACTGAAGAACCt  <  1:1512064/60‑1 (MQ=255) tttAGCGAGAACGTGTAAGGTATGTTGTTCCTGACGGGATAAATTCATACTGAAGAACCt  <  1:1513623/60‑1 (MQ=255) tttAGCGAGAACGTGTAAGGTATGTTGTTCCTGACGGGATAAATTCATACTGAAGAACCt  <  1:154274/60‑1 (MQ=255) tttAGCGAGAACGTGTAAGGTATGTTGTTCCTGACGGGATAAATTCATACTGAAGAACCt  <  1:1547874/60‑1 (MQ=255) tttAGCGAGAACGTGTAAGGTATGTTGTTCCTGACGGGATAAATTCATACTGAAGAACCt  <  1:1558797/60‑1 (MQ=255) tttAGCGAGAACGTGTAAGGTATGTTGTTCCTGACGGGATAAATTCATACTGAAGAACCt  <  1:243373/60‑1 (MQ=255) tttAGCGAGAACGTGTAAGGTATGTTGTTCCTGACGGGATAAATTCATACTGAAGAACCt  <  1:292829/60‑1 (MQ=255) tttAGCGAGAACGTGTAAGGTATGTTGTTCCTGACGGGATAAATTCATACTGAAGAACCt  <  1:30282/60‑1 (MQ=255) tttAGCGAGAACGTGTAAGGTATGTTGTTCCTGACGGGATAAATTCATACTGAAGAACCt  <  1:101322/60‑1 (MQ=255) tttAGCGAGAACGTGTAAGGTATGTTGTTCCTGACGGGATAAATTCATAATGAAGAACCt  <  1:1135837/60‑1 (MQ=255) tttAGCGAGAACGTGTAAGGTATGTTGTTCATGACGGGATAAATTCATACTTAAGAACCt  <  1:1588790/60‑1 (MQ=255) |                                                            TTTAGCGAGAACGTGTAAGGTATGTTGTTCCTGACGGGATAAATTCATACTGAAGAACCT  >  W3110S.gb/4538688‑4538747

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑