Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4540563	4540992	430	72 [1]	[0] 47	[yjhR]	[yjhR]

CGGCATATCAGGACGGTGCTGCGAACGCTGTGGCCCAAAACGTTCCAGTAAACTGTGTAGAT  >  W3110S.gb/4540993‑4541054 |                                                              cGGCATATCAGGACGGTGCTGCGAACGCTGTGGCCCAAAACGTTCCAGTAAACTGTGTAGAt  <  1:600152/62‑1 (MQ=255) cGGCATATCAGGACGGTGCTGCGAACGCTGTGGCCCAAAACGTTCCAGTAAACTGTGTAGAt  <  1:30453/62‑1 (MQ=255) cGGCATATCAGGACGGTGCTGCGAACGCTGTGGCCCAAAACGTTCCAGTAAACTGTGTAGAt  <  1:324162/62‑1 (MQ=255) cGGCATATCAGGACGGTGCTGCGAACGCTGTGGCCCAAAACGTTCCAGTAAACTGTGTAGAt  <  1:327654/62‑1 (MQ=255) cGGCATATCAGGACGGTGCTGCGAACGCTGTGGCCCAAAACGTTCCAGTAAACTGTGTAGAt  <  1:351028/62‑1 (MQ=255) cGGCATATCAGGACGGTGCTGCGAACGCTGTGGCCCAAAACGTTCCAGTAAACTGTGTAGAt  <  1:435075/62‑1 (MQ=255) cGGCATATCAGGACGGTGCTGCGAACGCTGTGGCCCAAAACGTTCCAGTAAACTGTGTAGAt  <  1:435550/62‑1 (MQ=255) cGGCATATCAGGACGGTGCTGCGAACGCTGTGGCCCAAAACGTTCCAGTAAACTGTGTAGAt  <  1:4611/62‑1 (MQ=255) cGGCATATCAGGACGGTGCTGCGAACGCTGTGGCCCAAAACGTTCCAGTAAACTGTGTAGAt  <  1:504752/62‑1 (MQ=255) cGGCATATCAGGACGGTGCTGCGAACGCTGTGGCCCAAAACGTTCCAGTAAACTGTGTAGAt  <  1:505915/62‑1 (MQ=255) cGGCATATCAGGACGGTGCTGCGAACGCTGTGGCCCAAAACGTTCCAGTAAACTGTGTAGAt  <  1:515995/62‑1 (MQ=255) cGGCATATCAGGACGGTGCTGCGAACGCTGTGGCCCAAAACGTTCCAGTAAACTGTGTAGAt  <  1:559380/62‑1 (MQ=255) cGGCATATCAGGACGGTGCTGCGAACGCTGTGGCCCAAAACGTTCCAGTAAACTGTGTAGAt  <  1:30006/62‑1 (MQ=255) cGGCATATCAGGACGGTGCTGCGAACGCTGTGGCCCAAAACGTTCCAGTAAACTGTGTAGAt  <  1:639129/62‑1 (MQ=255) cGGCATATCAGGACGGTGCTGCGAACGCTGTGGCCCAAAACGTTCCAGTAAACTGTGTAGAt  <  1:757789/62‑1 (MQ=255) cGGCATATCAGGACGGTGCTGCGAACGCTGTGGCCCAAAACGTTCCAGTAAACTGTGTAGAt  <  1:771169/62‑1 (MQ=255) cGGCATATCAGGACGGTGCTGCGAACGCTGTGGCCCAAAACGTTCCAGTAAACTGTGTAGAt  <  1:800529/62‑1 (MQ=255) cGGCATATCAGGACGGTGCTGCGAACGCTGTGGCCCAAAACGTTCCAGTAAACTGTGTAGAt  <  1:804714/62‑1 (MQ=255) cGGCATATCAGGACGGTGCTGCGAACGCTGTGGCCCAAAACGTTCCAGTAAACTGTGTAGAt  <  1:815126/62‑1 (MQ=255) cGGCATATCAGGACGGTGCTGCGAACGCTGTGGCCCAAAACGTTCCAGTAAACTGTGTAGAt  <  1:841264/62‑1 (MQ=255) cGGCATATCAGGACGGTGCTGCGAACGCTGTGGCCCAAAACGTTCCAGTAAACTGTGTAGAt  <  1:849077/62‑1 (MQ=255) cGGCATATCAGGACGGTGCTGCGAACGCTGTGGCCCAAAACGTTCCAGTAAACTGTGTAGAt  <  1:854233/62‑1 (MQ=255) cGGCATATCAGGACGGTGCTGCGAACGCTGTGGCCCAAAACGTTCCAGTAAACTGTGTAGAt  <  1:961383/62‑1 (MQ=255) cGGCATATCAGGACGGTGCTGCGAACGCTGTGGCCCAAAACGTTCCAGTAAACTGTGTAGAt  <  1:976841/62‑1 (MQ=255) cGGCATATCAGGACGGTGCTGCGAACGCTGTGGCCCAAAACGTTCCAGTAAACTGTGTAGAt  <  1:1397773/62‑1 (MQ=255) cGGCATATCAGGACGGTGCTGCGAACGCTGTGGCCCAAAACGTTCCAGTAAACTGTGTAGAt  <  1:1051556/62‑1 (MQ=255) cGGCATATCAGGACGGTGCTGCGAACGCTGTGGCCCAAAACGTTCCAGTAAACTGTGTAGAt  <  1:106583/62‑1 (MQ=255) cGGCATATCAGGACGGTGCTGCGAACGCTGTGGCCCAAAACGTTCCAGTAAACTGTGTAGAt  <  1:1111857/62‑1 (MQ=255) cGGCATATCAGGACGGTGCTGCGAACGCTGTGGCCCAAAACGTTCCAGTAAACTGTGTAGAt  <  1:1161544/62‑1 (MQ=255) cGGCATATCAGGACGGTGCTGCGAACGCTGTGGCCCAAAACGTTCCAGTAAACTGTGTAGAt  <  1:1161848/62‑1 (MQ=255) cGGCATATCAGGACGGTGCTGCGAACGCTGTGGCCCAAAACGTTCCAGTAAACTGTGTAGAt  <  1:1176822/62‑1 (MQ=255) cGGCATATCAGGACGGTGCTGCGAACGCTGTGGCCCAAAACGTTCCAGTAAACTGTGTAGAt  <  1:1229904/62‑1 (MQ=255) cGGCATATCAGGACGGTGCTGCGAACGCTGTGGCCCAAAACGTTCCAGTAAACTGTGTAGAt  <  1:1269188/62‑1 (MQ=255) cGGCATATCAGGACGGTGCTGCGAACGCTGTGGCCCAAAACGTTCCAGTAAACTGTGTAGAt  <  1:130038/62‑1 (MQ=255) cGGCATATCAGGACGGTGCTGCGAACGCTGTGGCCCAAAACGTTCCAGTAAACTGTGTAGAt  <  1:1305401/62‑1 (MQ=255) cGGCATATCAGGACGGTGCTGCGAACGCTGTGGCCCAAAACGTTCCAGTAAACTGTGTAGAt  <  1:1359433/62‑1 (MQ=255) cGGCATATCAGGACGGTGCTGCGAACGCTGTGGCCCAAAACGTTCCAGTAAACTGTGTAGAt  <  1:1028889/62‑1 (MQ=255) cGGCATATCAGGACGGTGCTGCGAACGCTGTGGCCCAAAACGTTCCAGTAAACTGTGTAGAt  <  1:1483108/62‑1 (MQ=255) cGGCATATCAGGACGGTGCTGCGAACGCTGTGGCCCAAAACGTTCCAGTAAACTGTGTAGAt  <  1:1540850/62‑1 (MQ=255) cGGCATATCAGGACGGTGCTGCGAACGCTGTGGCCCAAAACGTTCCAGTAAACTGTGTAGAt  <  1:1566027/62‑1 (MQ=255) cGGCATATCAGGACGGTGCTGCGAACGCTGTGGCCCAAAACGTTCCAGTAAACTGTGTAGAt  <  1:1627111/62‑1 (MQ=255) cGGCATATCAGGACGGTGCTGCGAACGCTGTGGCCCAAAACGTTCCAGTAAACTGTGTAGAt  <  1:219201/62‑1 (MQ=255) cGGCATATCAGGACGGTGCTGCGAACGCTGTGGCCCAAAACGTTCCAGTAAACTGTGTAGAt  <  1:221215/62‑1 (MQ=255) cGGCATATCAGGACGGTGCTGCGAACGCTGTGGCCCAAAACGTTCCAGTAAACTGTGTAGAt  <  1:229171/62‑1 (MQ=255) cGGCATATCAGGACGGTGCTGCGAACGCTGTGGCCCAAAACGTTCCAGTAAACTGTGTAGAt  <  1:273917/62‑1 (MQ=255) cGGCATATCAGGACGGTGCTGCGAACGCTGTGGCCCAAAACGTTCCAGTAAACTGTGTAGAt  <  1:299491/62‑1 (MQ=255) cGGCATATCAGGACGGTGCTGCGAACGCTGTGGCACAAAACGTTCCAGTAAACTGTGTAGAt  <  1:192385/62‑1 (MQ=255) |                                                              CGGCATATCAGGACGGTGCTGCGAACGCTGTGGCCCAAAACGTTCCAGTAAACTGTGTAGAT  >  W3110S.gb/4540993‑4541054

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑