Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4550011	4550133	123	73 [0]	[0] 43	fimD	outer membrane usher protein, type 1 fimbrial synthesis

GAATACGGCTTCTGTCGCCGGTATGAATCTGCTGGCGGATGATGCCTGTGTGCCATTAACC  >  W3110S.gb/4550134‑4550194 |                                                             gAATACGGCTTCTGTCGCCGGTATGAATCTGCTGGCGGatgatg                   >  1:1396276/1‑44 (MQ=255) gAATACGGCTTCTGTCGCCGGTATGAATCTGCTGGCGGATGATGCCTGTGTGCCATTa     >  1:1254627/1‑58 (MQ=255) gAATACGGCTTCTGTCGCCGGTATGAATCTGCTGGCGGATGATGCCTGTGTGCCATTAAcc  >  1:1516074/1‑61 (MQ=255) gAATACGGCTTCTGTCGCCGGTATGAATCTGCTGGCGGATGATGCCTGTGTGCCATTAAcc  >  1:1482643/1‑61 (MQ=255) gAATACGGCTTCTGTCGCCGGTATGAATCTGCTGGCGGATGATGCCTGTGTGCCATTAAcc  >  1:1566499/1‑61 (MQ=255) gAATACGGCTTCTGTCGCCGGTATGAATCTGCTGGCGGATGATGCCTGTGTGCCATTAAcc  >  1:1574106/1‑61 (MQ=255) gAATACGGCTTCTGTCGCCGGTATGAATCTGCTGGCGGATGATGCCTGTGTGCCATTAAcc  >  1:218743/1‑61 (MQ=255) gAATACGGCTTCTGTCGCCGGTATGAATCTGCTGGCGGATGATGCCTGTGTGCCATTAAcc  >  1:261038/1‑61 (MQ=255) gAATACGGCTTCTGTCGCCGGTATGAATCTGCTGGCGGATGATGCCTGTGTGCCATTAAcc  >  1:264112/1‑61 (MQ=255) gAATACGGCTTCTGTCGCCGGTATGAATCTGCTGGCGGATGATGCCTGTGTGCCATTAAcc  >  1:322422/1‑61 (MQ=255) gAATACGGCTTCTGTCGCCGGTATGAATCTGCTGGCGGATGATGCCTGTGTGCCATTAAcc  >  1:453208/1‑61 (MQ=255) gAATACGGCTTCTGTCGCCGGTATGAATCTGCTGGCGGATGATGCCTGTGTGCCATTAAcc  >  1:460131/1‑61 (MQ=255) gAATACGGCTTCTGTCGCCGGTATGAATCTGCTGGCGGATGATGCCTGTGTGCCATTAAcc  >  1:471219/1‑61 (MQ=255) gAATACGGCTTCTGTCGCCGGTATGAATCTGCTGGCGGATGATGCCTGTGTGCCATTAAcc  >  1:52930/1‑61 (MQ=255) gAATACGGCTTCTGTCGCCGGTATGAATCTGCTGGCGGATGATGCCTGTGTGCCATTAAcc  >  1:633507/1‑61 (MQ=255) gAATACGGCTTCTGTCGCCGGTATGAATCTGCTGGCGGATGATGCCTGTGTGCCATTAAcc  >  1:641866/1‑61 (MQ=255) gAATACGGCTTCTGTCGCCGGTATGAATCTGCTGGCGGATGATGCCTGTGTGCCATTAAcc  >  1:671376/1‑61 (MQ=255) gAATACGGCTTCTGTCGCCGGTATGAATCTGCTGGCGGATGATGCCTGTGTGCCATTAAcc  >  1:71426/1‑61 (MQ=255) gAATACGGCTTCTGTCGCCGGTATGAATCTGCTGGCGGATGATGCCTGTGTGCCATTAAcc  >  1:722672/1‑61 (MQ=255) gAATACGGCTTCTGTCGCCGGTATGAATCTGCTGGCGGATGATGCCTGTGTGCCATTAAcc  >  1:79706/1‑61 (MQ=255) gAATACGGCTTCTGTCGCCGGTATGAATCTGCTGGCGGATGATGCCTGTGTGCCATTAAcc  >  1:82373/1‑61 (MQ=255) gAATACGGCTTCTGTCGCCGGTATGAATCTGCTGGCGGATGATGCCTGTGTGCCATTAAcc  >  1:973119/1‑61 (MQ=255) gAATACGGCTTCTGTCGCCGGTATGAATCTGCTGGCGGATGATGCCTGTGTGCCATTAAcc  >  1:1301316/1‑61 (MQ=255) gAATACGGCTTCTGTCGCCGGTATGAATCTGCTGGCGGATGATGCCTGTGTGCCATTAAcc  >  1:1110084/1‑61 (MQ=255) gAATACGGCTTCTGTCGCCGGTATGAATCTGCTGGCGGATGATGCCTGTGTGCCATTAAcc  >  1:1121859/1‑61 (MQ=255) gAATACGGCTTCTGTCGCCGGTATGAATCTGCTGGCGGATGATGCCTGTGTGCCATTAAcc  >  1:1132807/1‑61 (MQ=255) gAATACGGCTTCTGTCGCCGGTATGAATCTGCTGGCGGATGATGCCTGTGTGCCATTAAcc  >  1:1193785/1‑61 (MQ=255) gAATACGGCTTCTGTCGCCGGTATGAATCTGCTGGCGGATGATGCCTGTGTGCCATTAAcc  >  1:1193863/1‑61 (MQ=255) gAATACGGCTTCTGTCGCCGGTATGAATCTGCTGGCGGATGATGCCTGTGTGCCATTAAcc  >  1:1198045/1‑61 (MQ=255) gAATACGGCTTCTGTCGCCGGTATGAATCTGCTGGCGGATGATGCCTGTGTGCCATTAAcc  >  1:1219420/1‑61 (MQ=255) gAATACGGCTTCTGTCGCCGGTATGAATCTGCTGGCGGATGATGCCTGTGTGCCATTAAcc  >  1:1222613/1‑61 (MQ=255) gAATACGGCTTCTGTCGCCGGTATGAATCTGCTGGCGGATGATGCCTGTGTGCCATTAAcc  >  1:1223705/1‑61 (MQ=255) gAATACGGCTTCTGTCGCCGGTATGAATCTGCTGGCGGATGATGCCTGTGTGCCATTAAcc  >  1:1234252/1‑61 (MQ=255) gAATACGGCTTCTGTCGCCGGTATGAATCTGCTGGCGGATGATGCCTGTGTGCCATTAAcc  >  1:1513338/1‑61 (MQ=255) gAATACGGCTTCTGTCGCCGGTATGAATCTGCTGGCGGATGATGCCTGTGTGCCATTAAcc  >  1:1312143/1‑61 (MQ=255) gAATACGGCTTCTGTCGCCGGTATGAATCTGCTGGCGGATGATGCCTGTGTGCCATTAAcc  >  1:1379516/1‑61 (MQ=255) gAATACGGCTTCTGTCGCCGGTATGAATCTGCTGGCGGATGATGCCTGTGTGCCATTAAcc  >  1:1401327/1‑61 (MQ=255) gAATACGGCTTCTGTCGCCGGTATGAATCTGCTGGCGGATGATGCCTGTGTGCCATTAAcc  >  1:1403114/1‑61 (MQ=255) gAATACGGCTTCTGTCGCCGGTATGAATCTGCTGGCGGATGATGCCTGTGTGCCATTAAcc  >  1:1446135/1‑61 (MQ=255) gAATACGGCTTCTGTCGCCGGTATGAATCTGCTGGCGGATGATGCCTGTGTGCCATTAAcc  >  1:1447127/1‑61 (MQ=255) gAATACGGCTTCTGTCGCCGGTATGAATCTGCTGGCGGATGATGCCTGTGTGCCATTAAcc  >  1:1055181/1‑61 (MQ=255) gAATACGGCTTCTGTCGCCGGTATGAATCTGCTGGCGGATGATGACTGTGTGCCATTAAcc  >  1:1370480/1‑61 (MQ=255) gAATACGGCTTCTGTCGCCGGTATGAATCGGCTGGCGGATGATGCCTGTGTGCCATTAAcc  >  1:274985/1‑61 (MQ=255) |                                                             GAATACGGCTTCTGTCGCCGGTATGAATCTGCTGGCGGATGATGCCTGTGTGCCATTAACC  >  W3110S.gb/4550134‑4550194

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑