Missing coverage evidence...
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ATGCGGAGACGGTCCCTTTCGGTAACTTATTGGAAAACAGCGTAAAGCGGAATAAGGTCGG  >  W3110S.gb/4572160‑4572220 |                                                             aTGCGGAGACGGTCCCTTTCGGTAACTTATTGGAAAACAGCGTaaa                 >  1:1138195/1‑46 (MQ=255) aTGCGGAGACGGTCCCTTTCGGTAACTTATTGGAAAACAGCGTAAAGCGGAATAAGGTCgg  >  1:1459201/1‑61 (MQ=255) aTGCGGAGACGGTCCCTTTCGGTAACTTATTGGAAAACAGCGTAAAGCGGAATAAGGTCgg  >  1:957515/1‑61 (MQ=255) aTGCGGAGACGGTCCCTTTCGGTAACTTATTGGAAAACAGCGTAAAGCGGAATAAGGTCgg  >  1:926578/1‑61 (MQ=255) aTGCGGAGACGGTCCCTTTCGGTAACTTATTGGAAAACAGCGTAAAGCGGAATAAGGTCgg  >  1:869187/1‑61 (MQ=255) aTGCGGAGACGGTCCCTTTCGGTAACTTATTGGAAAACAGCGTAAAGCGGAATAAGGTCgg  >  1:857454/1‑61 (MQ=255) aTGCGGAGACGGTCCCTTTCGGTAACTTATTGGAAAACAGCGTAAAGCGGAATAAGGTCgg  >  1:744879/1‑61 (MQ=255) aTGCGGAGACGGTCCCTTTCGGTAACTTATTGGAAAACAGCGTAAAGCGGAATAAGGTCgg  >  1:420475/1‑61 (MQ=255) aTGCGGAGACGGTCCCTTTCGGTAACTTATTGGAAAACAGCGTAAAGCGGAATAAGGTCgg  >  1:366079/1‑61 (MQ=255) aTGCGGAGACGGTCCCTTTCGGTAACTTATTGGAAAACAGCGTAAAGCGGAATAAGGTCgg  >  1:1623188/1‑61 (MQ=255) aTGCGGAGACGGTCCCTTTCGGTAACTTATTGGAAAACAGCGTAAAGCGGAATAAGGTCgg  >  1:1516902/1‑61 (MQ=255) aTGCGGAGACGGTCCCTTTCGGTAACTTATTGGAAAACAGCGTAAAGCGGAATAAGGTCgg  >  1:15/1‑61 (MQ=255) aTGCGGAGACGGTCCCTTTCGGTAACTTATTGGAAAACAGCGTAAAGCGGAATAAGGTCgg  >  1:100224/1‑61 (MQ=255) aTGCGGAGACGGTCCCTTTCGGTAACTTATTGGAAAACAGCGTAAAGCGGAATAAGGTCgg  >  1:1355647/1‑61 (MQ=255) aTGCGGAGACGGTCCCTTTCGGTAACTTATTGGAAAACAGCGTAAAGCGGAATAAGGTCgg  >  1:1327159/1‑61 (MQ=255) aTGCGGAGACGGTCCCTTTCGGTAACTTATTGGAAAACAGCGTAAAGCGGAATAAGGTCgg  >  1:1305686/1‑61 (MQ=255) aTGCGGAGACGGTCCCTTTCGGTAACTTATTGGAAAACAGCGTAAAGCGGAATAAGGTCgg  >  1:1252099/1‑61 (MQ=255) aTGCGGAGACGGTCCCTTTCGGTAACTTATTGGAAAACAGCGTAAAGCGGAATAAGGTCgg  >  1:1245749/1‑61 (MQ=255) aTGCGGAGACGGTCCCTTTCGGTAACTTATTGGAAAACAGCGTAAAGCGGAATAAGGTCgg  >  1:1216435/1‑61 (MQ=255) aTGCGGAGACGGTCCCTTTCGGTAACTTATTGGAAAACAGCGTAAAGCGGAATAAGGTCgg  >  1:1122580/1‑61 (MQ=255) aTGCGGAGACGGTCCCTTTCGGTAACTTATTGGAAAACAGCGTAAAGCGGAATAAGGTCg   >  1:1454160/1‑60 (MQ=255) |                                                             ATGCGGAGACGGTCCCTTTCGGTAACTTATTGGAAAACAGCGTAAAGCGGAATAAGGTCGG  >  W3110S.gb/4572160‑4572220

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑