Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	114745	115134	390	85 [0]	[1] 39	hofC	assembly protein in type IV pilin biogenesis, transmembrane protein

GGGTGTTGAAGGTCTTATAGATAGCGGCAAACTCCGGCAGAACAAAATGCAGCATTGCCACAA  >  W3110S.gb/115133‑115195   |                                                             gggTGTTGAAGGTCTTATAGATAGCGGCAAACTCCGGCAGAACAAAATGCAGCATTGCcaca   <  1:726559/62‑1 (MQ=255)   gtgtTGAAGGTCTTATAGATAGCGGCAAACTCCGGCAGAACAAAATGCAGCATTGCCACaa  <  1:490076/61‑1 (MQ=255)   gtgtTGAAGGTCTTATAGATAGCGGCAAACTCCGGCAGAACAAAATGCAGCATTGCCACaa  <  1:203775/61‑1 (MQ=255)   gtgtTGAAGGTCTTATAGATAGCGGCAAACTCCGGCAGAACAAAATGCAGCATTGCCACaa  <  1:204574/61‑1 (MQ=255)   gtgtTGAAGGTCTTATAGATAGCGGCAAACTCCGGCAGAACAAAATGCAGCATTGCCACaa  <  1:217686/61‑1 (MQ=255)   gtgtTGAAGGTCTTATAGATAGCGGCAAACTCCGGCAGAACAAAATGCAGCATTGCCACaa  <  1:218488/61‑1 (MQ=255)   gtgtTGAAGGTCTTATAGATAGCGGCAAACTCCGGCAGAACAAAATGCAGCATTGCCACaa  <  1:235094/61‑1 (MQ=255)   gtgtTGAAGGTCTTATAGATAGCGGCAAACTCCGGCAGAACAAAATGCAGCATTGCCACaa  <  1:264061/61‑1 (MQ=255)   gtgtTGAAGGTCTTATAGATAGCGGCAAACTCCGGCAGAACAAAATGCAGCATTGCCACaa  <  1:326026/61‑1 (MQ=255)   gtgtTGAAGGTCTTATAGATAGCGGCAAACTCCGGCAGAACAAAATGCAGCATTGCCACaa  <  1:353994/61‑1 (MQ=255)   gtgtTGAAGGTCTTATAGATAGCGGCAAACTCCGGCAGAACAAAATGCAGCATTGCCACaa  <  1:429217/61‑1 (MQ=255)   gtgtTGAAGGTCTTATAGATAGCGGCAAACTCCGGCAGAACAAAATGCAGCATTGCCACaa  <  1:167812/61‑1 (MQ=255)   gtgtTGAAGGTCTTATAGATAGCGGCAAACTCCGGCAGAACAAAATGCAGCATTGCCACaa  <  1:513583/61‑1 (MQ=255)   gtgtTGAAGGTCTTATAGATAGCGGCAAACTCCGGCAGAACAAAATGCAGCATTGCCACaa  <  1:553959/61‑1 (MQ=255)   gtgtTGAAGGTCTTATAGATAGCGGCAAACTCCGGCAGAACAAAATGCAGCATTGCCACaa  <  1:70372/61‑1 (MQ=255)   gtgtTGAAGGTCTTATAGATAGCGGCAAACTCCGGCAGAACAAAATGCAGCATTGCCACaa  <  1:739175/61‑1 (MQ=255)   gtgtTGAAGGTCTTATAGATAGCGGCAAACTCCGGCAGAACAAAATGCAGCATTGCCACaa  <  1:750659/61‑1 (MQ=255)   gtgtTGAAGGTCTTATAGATAGCGGCAAACTCCGGCAGAACAAAATGCAGCATTGCCACaa  <  1:828732/61‑1 (MQ=255)   gtgtTGAAGGTCTTATAGATAGCGGCAAACTCCGGCAGAACAAAATGCAGCATTGCCACaa  <  1:841685/61‑1 (MQ=255)   gtgtTGAAGGTCTTATAGATAGCGGCAAACTCCGGCAGAACAAAATGCAGCATTGCCACaa  <  1:96869/61‑1 (MQ=255)   gtgtTGAAGGTCTTATAGATAGCGGCAAACTCCGGCAGAACAAAATGCAGCATTGCCACaa  <  1:1346649/61‑1 (MQ=255)   gtgtTGAAGGTCTTATAGATAGCGGCAAACTCCGGCAGAACAAAATGCAGCATTGCCACaa  <  1:1034939/61‑1 (MQ=255)   gtgtTGAAGGTCTTATAGATAGCGGCAAACTCCGGCAGAACAAAATGCAGCATTGCCACaa  <  1:1187009/61‑1 (MQ=255)   gtgtTGAAGGTCTTATAGATAGCGGCAAACTCCGGCAGAACAAAATGCAGCATTGCCACaa  <  1:1233449/61‑1 (MQ=255)   gtgtTGAAGGTCTTATAGATAGCGGCAAACTCCGGCAGAACAAAATGCAGCATTGCCACaa  <  1:1291257/61‑1 (MQ=255)   gtgtTGAAGGTCTTATAGATAGCGGCAAACTCCGGCAGAACAAAATGCAGCATTGCCACaa  <  1:1308062/61‑1 (MQ=255)   gtgtTGAAGGTCTTATAGATAGCGGCAAACTCCGGCAGAACAAAATGCAGCATTGCCACaa  <  1:1328330/61‑1 (MQ=255)   gtgtTGAAGGTCTTATAGATAGCGGCAAACTCCGGCAGAACAAAATGCAGCATTGCCACaa  <  1:1341402/61‑1 (MQ=255)   gtgtTGAAGGTCTTATAGATAGCGGCAAACTCCGGCAGAACAAAATGCAGCATTGCCACaa  <  1:1341782/61‑1 (MQ=255)   gtgtTGAAGGTCTTATAGATAGCGGCAAACTCCGGCAGAACAAAATGCAGCATTGCCACaa  <  1:1023518/61‑1 (MQ=255)   gtgtTGAAGGTCTTATAGATAGCGGCAAACTCCGGCAGAACAAAATGCAGCATTGCCACaa  <  1:1395011/61‑1 (MQ=255)   gtgtTGAAGGTCTTATAGATAGCGGCAAACTCCGGCAGAACAAAATGCAGCATTGCCACaa  <  1:1418036/61‑1 (MQ=255)   gtgtTGAAGGTCTTATAGATAGCGGCAAACTCCGGCAGAACAAAATGCAGCATTGCCACaa  <  1:1439142/61‑1 (MQ=255)   gtgtTGAAGGTCTTATAGATAGCGGCAAACTCCGGCAGAACAAAATGCAGCATTGCCACaa  <  1:1490739/61‑1 (MQ=255)   gtgtTGAAGGTCTTATAGATAGCGGCAAACTCCGGCAGAACAAAATGCAGCATTGCCACaa  <  1:1504536/61‑1 (MQ=255)   gtgtTGAAGGTCTTATAGATAGCGGCAAACTCCGGCAGAACAAAATGCAGCATTGCCACaa  <  1:1553027/61‑1 (MQ=255)   gtgtTGAAGGTCTTATAGATAGCGGCAAACTCCGGCAGAACAAAATGCAGCATTGCCACaa  <  1:1561116/61‑1 (MQ=255)   gtgtTGAAGGTCTTATAGATAGCGGCAAACTCCGGCAGAACAAAATGCAGCATTGCCACaa  <  1:1638855/61‑1 (MQ=255)   gtgtTGAAGGTCTTATAGATAGCGGCAAACTCCGGCAGAACAAAATGAAGCATTGCCACaa  <  1:1197690/61‑1 (MQ=255)   |                                                             GGGTGTTGAAGGTCTTATAGATAGCGGCAAACTCCGGCAGAACAAAATGCAGCATTGCCACAA  >  W3110S.gb/115133‑115195

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑