Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4607099	4607209	111	6 [5]	[3] 72	yjjP	predicted inner membrane protein

ACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCAA  >  W3110S.gb/4607202‑4607269         |                                                            aCGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCt        <  1:1572263/62‑1 (MQ=255) aCGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCt        <  1:532686/62‑1 (MQ=255)        ggCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTTTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCaa  <  1:986745/61‑1 (MQ=255)         gCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCTTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCAGCaa  <  1:1053004/60‑1 (MQ=39)         gCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCaa  <  1:552076/60‑1 (MQ=255)         gCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCaa  <  1:1571802/60‑1 (MQ=255)         gCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCaa  <  1:523645/60‑1 (MQ=255)         gCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCaa  <  1:484514/60‑1 (MQ=255)         gCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCaa  <  1:481671/60‑1 (MQ=255)         gCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCaa  <  1:466790/60‑1 (MQ=255)         gCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCaa  <  1:46598/60‑1 (MQ=255)         gCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCaa  <  1:407218/60‑1 (MQ=255)         gCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCaa  <  1:239523/60‑1 (MQ=255)         gCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCaa  <  1:226461/60‑1 (MQ=255)         gCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCaa  <  1:1638874/60‑1 (MQ=255)         gCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCaa  <  1:1626962/60‑1 (MQ=255)         gCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCaa  <  1:1619771/60‑1 (MQ=255)         gCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCaa  <  1:1606423/60‑1 (MQ=255)         gCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCaa  <  1:15688/60‑1 (MQ=255)         gCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCaa  <  1:836160/60‑1 (MQ=255)         gCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCaa  <  1:95436/60‑1 (MQ=255)         gCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCaa  <  1:945825/60‑1 (MQ=255)         gCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCaa  <  1:937542/60‑1 (MQ=255)         gCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCaa  <  1:914311/60‑1 (MQ=255)         gCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCaa  <  1:902170/60‑1 (MQ=255)         gCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCaa  <  1:897874/60‑1 (MQ=255)         gCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCaa  <  1:885553/60‑1 (MQ=255)         gCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCaa  <  1:848345/60‑1 (MQ=255)         gCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCaa  <  1:576/60‑1 (MQ=255)         gCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCaa  <  1:819799/60‑1 (MQ=255)         gCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCaa  <  1:718102/60‑1 (MQ=255)         gCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCaa  <  1:676963/60‑1 (MQ=255)         gCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCaa  <  1:623494/60‑1 (MQ=255)         gCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCaa  <  1:618011/60‑1 (MQ=255)         gCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCaa  <  1:614276/60‑1 (MQ=255)         gCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCaa  <  1:584870/60‑1 (MQ=255)         gCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCaa  <  1:1107550/60‑1 (MQ=255)         gCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCaa  <  1:1193811/60‑1 (MQ=255)         gCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCaa  <  1:1176452/60‑1 (MQ=255)         gCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCaa  <  1:1168753/60‑1 (MQ=255)         gCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCaa  <  1:1146330/60‑1 (MQ=255)         gCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCaa  <  1:1131967/60‑1 (MQ=255)         gCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCaa  <  1:1122572/60‑1 (MQ=255)         gCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCaa  <  1:1109009/60‑1 (MQ=255)         gCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCaa  <  1:1108169/60‑1 (MQ=255)         gCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCaa  <  1:1206843/60‑1 (MQ=255)         gCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCaa  <  1:109648/60‑1 (MQ=255)         gCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCaa  <  1:1079753/60‑1 (MQ=255)         gCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCaa  <  1:1077676/60‑1 (MQ=255)         gCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCaa  <  1:1055134/60‑1 (MQ=255)         gCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCaa  <  1:1053959/60‑1 (MQ=255)         gCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCaa  <  1:1038296/60‑1 (MQ=255)         gCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCaa  <  1:1033927/60‑1 (MQ=255)         gCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCaa  <  1:1024161/60‑1 (MQ=255)         gCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCaa  <  1:1401849/60‑1 (MQ=255)         gCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCaa  <  1:1538433/60‑1 (MQ=255)         gCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCaa  <  1:1519856/60‑1 (MQ=255)         gCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCaa  <  1:1518987/60‑1 (MQ=255)         gCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCaa  <  1:1510664/60‑1 (MQ=255)         gCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCaa  <  1:145144/60‑1 (MQ=255)         gCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCaa  <  1:1445546/60‑1 (MQ=255)         gCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCaa  <  1:1435219/60‑1 (MQ=255)         gCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCaa  <  1:1431339/60‑1 (MQ=255)         gCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCaa  <  1:1003356/60‑1 (MQ=255)         gCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCaa  <  1:1395607/60‑1 (MQ=255)         gCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCaa  <  1:1387868/60‑1 (MQ=255)         gCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCaa  <  1:1368268/60‑1 (MQ=255)         gCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCaa  <  1:135919/60‑1 (MQ=255)         gCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCaa  <  1:1344089/60‑1 (MQ=255)         gCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCaa  <  1:1301834/60‑1 (MQ=255)         gCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCaa  <  1:1210355/60‑1 (MQ=255)         gCTGAATTTGGCTAAATCGCTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCaa  <  1:473970/60‑1 (MQ=255)         |                                                            ACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCAA  >  W3110S.gb/4607202‑4607269

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑