Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 4613940 4614493 554 135 [0] [1] 70 [yjjG]–[prfC] [yjjG],[prfC]

CGTCTGCGCGACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGACC  >  W3110S.gb/4614486‑4614546
        |                                                    
tatCTGCGCGACACGCCGATCCTCACCTTAATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGAcc  <  1:1041755/59‑1 (MQ=255)
        cgACACGCCTATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGAcc  <  1:245689/53‑1 (MQ=255)
        cgACACGCCGATCCTCACCTTTTTGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGAcc  <  1:773218/53‑1 (MQ=255)
        cgACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGAcc  <  1:681740/53‑1 (MQ=255)
        cgACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGAcc  <  1:682956/53‑1 (MQ=255)
        cgACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGAcc  <  1:653069/53‑1 (MQ=255)
        cgACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGAcc  <  1:602353/53‑1 (MQ=255)
        cgACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGAcc  <  1:586992/53‑1 (MQ=255)
        cgACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGAcc  <  1:545753/53‑1 (MQ=255)
        cgACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGAcc  <  1:539560/53‑1 (MQ=255)
        cgACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGAcc  <  1:536192/53‑1 (MQ=255)
        cgACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGAcc  <  1:373664/53‑1 (MQ=255)
        cgACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGAcc  <  1:362556/53‑1 (MQ=255)
        cgACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGAcc  <  1:352185/53‑1 (MQ=255)
        cgACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGAcc  <  1:347833/53‑1 (MQ=255)
        cgACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGAcc  <  1:325860/53‑1 (MQ=255)
        cgACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGAcc  <  1:317420/53‑1 (MQ=255)
        cgACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGAcc  <  1:313986/53‑1 (MQ=255)
        cgACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGAcc  <  1:30671/53‑1 (MQ=255)
        cgACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGAcc  <  1:797520/53‑1 (MQ=255)
        cgACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGAcc  <  1:958337/53‑1 (MQ=255)
        cgACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGAcc  <  1:920711/53‑1 (MQ=255)
        cgACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGAcc  <  1:893326/53‑1 (MQ=255)
        cgACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGAcc  <  1:893218/53‑1 (MQ=255)
        cgACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGAcc  <  1:876984/53‑1 (MQ=255)
        cgACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGAcc  <  1:863509/53‑1 (MQ=255)
        cgACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGAcc  <  1:819555/53‑1 (MQ=255)
        cgACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGAcc  <  1:798680/53‑1 (MQ=255)
        cgACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGAcc  <  1:252153/53‑1 (MQ=255)
        cgACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGAcc  <  1:768254/53‑1 (MQ=255)
        cgACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGAcc  <  1:763791/53‑1 (MQ=255)
        cgACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGAcc  <  1:746160/53‑1 (MQ=255)
        cgACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGAcc  <  1:743717/53‑1 (MQ=255)
        cgACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGAcc  <  1:738910/53‑1 (MQ=255)
        cgACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGAcc  <  1:705756/53‑1 (MQ=255)
        cgACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGAcc  <  1:701217/53‑1 (MQ=255)
        cgACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGAcc  <  1:1155870/53‑1 (MQ=255)
        cgACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGAcc  <  1:1283001/53‑1 (MQ=255)
        cgACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGAcc  <  1:1273861/53‑1 (MQ=255)
        cgACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGAcc  <  1:1264452/53‑1 (MQ=255)
        cgACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGAcc  <  1:1242301/53‑1 (MQ=255)
        cgACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGAcc  <  1:1193583/53‑1 (MQ=255)
        cgACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGAcc  <  1:118928/53‑1 (MQ=255)
        cgACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGAcc  <  1:1181246/53‑1 (MQ=255)
        cgACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGAcc  <  1:1163385/53‑1 (MQ=255)
        cgACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGAcc  <  1:1303499/53‑1 (MQ=255)
        cgACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGAcc  <  1:1135200/53‑1 (MQ=255)
        cgACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGAcc  <  1:112342/53‑1 (MQ=255)
        cgACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGAcc  <  1:1113029/53‑1 (MQ=255)
        cgACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGAcc  <  1:1101515/53‑1 (MQ=255)
        cgACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGAcc  <  1:1072073/53‑1 (MQ=255)
        cgACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGAcc  <  1:1059871/53‑1 (MQ=255)
        cgACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGAcc  <  1:104267/53‑1 (MQ=255)
        cgACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGAcc  <  1:1477793/53‑1 (MQ=255)
        cgACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGAcc  <  1:217745/53‑1 (MQ=255)
        cgACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGAcc  <  1:19113/53‑1 (MQ=255)
        cgACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGAcc  <  1:1631333/53‑1 (MQ=255)
        cgACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGAcc  <  1:1598856/53‑1 (MQ=255)
        cgACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGAcc  <  1:1543280/53‑1 (MQ=255)
        cgACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGAcc  <  1:1532649/53‑1 (MQ=255)
        cgACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGAcc  <  1:1526670/53‑1 (MQ=255)
        cgACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGAcc  <  1:1502755/53‑1 (MQ=255)
        cgACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGAcc  <  1:297768/53‑1 (MQ=255)
        cgACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGAcc  <  1:1465448/53‑1 (MQ=255)
        cgACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGAcc  <  1:1463498/53‑1 (MQ=255)
        cgACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGAcc  <  1:1449817/53‑1 (MQ=255)
        cgACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGAcc  <  1:1391058/53‑1 (MQ=255)
        cgACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGAcc  <  1:1383664/53‑1 (MQ=255)
        cgACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGAcc  <  1:1351736/53‑1 (MQ=255)
        cgACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGAcc  <  1:1348283/53‑1 (MQ=255)
        |                                                    
CGTCTGCGCGACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGACC  >  W3110S.gb/4614486‑4614546

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: