Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4646006	4646072	67	17 [0]	[1] 88	yjtD	predicted rRNA methyltransferase

GTCTATTGCTATCAATTAGCAACATTAATACAACAACCGGCGAAAAGTGATGCAACGGCAGAC  >  W3110S.gb/4646071‑4646133   |                                                             gTCTATTGCTATCAATTAGCAACATTAATACAACAACCGGCG‑AAAGTGATGCAACGGCAGAc  <  1:740191/62‑1 (MQ=255)   cTATTGCTATCAATTAGCAACATTAATACAACAACCGGGGAAAAGTGATGCAACGGCAGAc  <  1:805156/61‑1 (MQ=255)   cTATTGCTATCAATTAGCAACATTAATACAACAACCGGCGAAAAGTGATGCAACGGCAGAc  <  1:623816/61‑1 (MQ=255)   cTATTGCTATCAATTAGCAACATTAATACAACAACCGGCGAAAAGTGATGCAACGGCAGAc  <  1:636986/61‑1 (MQ=255)   cTATTGCTATCAATTAGCAACATTAATACAACAACCGGCGAAAAGTGATGCAACGGCAGAc  <  1:61141/61‑1 (MQ=255)   cTATTGCTATCAATTAGCAACATTAATACAACAACCGGCGAAAAGTGATGCAACGGCAGAc  <  1:60385/61‑1 (MQ=255)   cTATTGCTATCAATTAGCAACATTAATACAACAACCGGCGAAAAGTGATGCAACGGCAGAc  <  1:583362/61‑1 (MQ=255)   cTATTGCTATCAATTAGCAACATTAATACAACAACCGGCGAAAAGTGATGCAACGGCAGAc  <  1:571352/61‑1 (MQ=255)   cTATTGCTATCAATTAGCAACATTAATACAACAACCGGCGAAAAGTGATGCAACGGCAGAc  <  1:558299/61‑1 (MQ=255)   cTATTGCTATCAATTAGCAACATTAATACAACAACCGGCGAAAAGTGATGCAACGGCAGAc  <  1:554971/61‑1 (MQ=255)   cTATTGCTATCAATTAGCAACATTAATACAACAACCGGCGAAAAGTGATGCAACGGCAGAc  <  1:548352/61‑1 (MQ=255)   cTATTGCTATCAATTAGCAACATTAATACAACAACCGGCGAAAAGTGATGCAACGGCAGAc  <  1:548291/61‑1 (MQ=255)   cTATTGCTATCAATTAGCAACATTAATACAACAACCGGCGAAAAGTGATGCAACGGCAGAc  <  1:520955/61‑1 (MQ=255)   cTATTGCTATCAATTAGCAACATTAATACAACAACCGGCGAAAAGTGATGCAACGGCAGAc  <  1:504965/61‑1 (MQ=255)   cTATTGCTATCAATTAGCAACATTAATACAACAACCGGCGAAAAGTGATGCAACGGCAGAc  <  1:493337/61‑1 (MQ=255)   cTATTGCTATCAATTAGCAACATTAATACAACAACCGGCGAAAAGTGATGCAACGGCAGAc  <  1:49050/61‑1 (MQ=255)   cTATTGCTATCAATTAGCAACATTAATACAACAACCGGCGAAAAGTGATGCAACGGCAGAc  <  1:477735/61‑1 (MQ=255)   cTATTGCTATCAATTAGCAACATTAATACAACAACCGGCGAAAAGTGATGCAACGGCAGAc  <  1:464216/61‑1 (MQ=255)   cTATTGCTATCAATTAGCAACATTAATACAACAACCGGCGAAAAGTGATGCAACGGCAGAc  <  1:448964/61‑1 (MQ=255)   cTATTGCTATCAATTAGCAACATTAATACAACAACCGGCGAAAAGTGATGCAACGGCAGAc  <  1:419006/61‑1 (MQ=255)   cTATTGCTATCAATTAGCAACATTAATACAACAACCGGCGAAAAGTGATGCAACGGCAGAc  <  1:400988/61‑1 (MQ=255)   cTATTGCTATCAATTAGCAACATTAATACAACAACCGGCGAAAAGTGATGCAACGGCAGAc  <  1:360183/61‑1 (MQ=255)   cTATTGCTATCAATTAGCAACATTAATACAACAACCGGCGAAAAGTGATGCAACGGCAGAc  <  1:31828/61‑1 (MQ=255)   cTATTGCTATCAATTAGCAACATTAATACAACAACCGGCGAAAAGTGATGCAACGGCAGAc  <  1:726016/61‑1 (MQ=255)   cTATTGCTATCAATTAGCAACATTAATACAACAACCGGCGAAAAGTGATGCAACGGCAGAc  <  1:952573/61‑1 (MQ=255)   cTATTGCTATCAATTAGCAACATTAATACAACAACCGGCGAAAAGTGATGCAACGGCAGAc  <  1:940155/61‑1 (MQ=255)   cTATTGCTATCAATTAGCAACATTAATACAACAACCGGCGAAAAGTGATGCAACGGCAGAc  <  1:939827/61‑1 (MQ=255)   cTATTGCTATCAATTAGCAACATTAATACAACAACCGGCGAAAAGTGATGCAACGGCAGAc  <  1:916769/61‑1 (MQ=255)   cTATTGCTATCAATTAGCAACATTAATACAACAACCGGCGAAAAGTGATGCAACGGCAGAc  <  1:900000/61‑1 (MQ=255)   cTATTGCTATCAATTAGCAACATTAATACAACAACCGGCGAAAAGTGATGCAACGGCAGAc  <  1:809238/61‑1 (MQ=255)   cTATTGCTATCAATTAGCAACATTAATACAACAACCGGCGAAAAGTGATGCAACGGCAGAc  <  1:7706/61‑1 (MQ=255)   cTATTGCTATCAATTAGCAACATTAATACAACAACCGGCGAAAAGTGATGCAACGGCAGAc  <  1:750885/61‑1 (MQ=255)   cTATTGCTATCAATTAGCAACATTAATACAACAACCGGCGAAAAGTGATGCAACGGCAGAc  <  1:748978/61‑1 (MQ=255)   cTATTGCTATCAATTAGCAACATTAATACAACAACCGGCGAAAAGTGATGCAACGGCAGAc  <  1:73401/61‑1 (MQ=255)   cTATTGCTATCAATTAGCAACATTAATACAACAACCGGCGAAAAGTGATGCAACGGCAGAc  <  1:626052/61‑1 (MQ=255)   cTATTGCTATCAATTAGCAACATTAATACAACAACCGGCGAAAAGTGATGCAACGGCAGAc  <  1:717408/61‑1 (MQ=255)   cTATTGCTATCAATTAGCAACATTAATACAACAACCGGCGAAAAGTGATGCAACGGCAGAc  <  1:713252/61‑1 (MQ=255)   cTATTGCTATCAATTAGCAACATTAATACAACAACCGGCGAAAAGTGATGCAACGGCAGAc  <  1:713158/61‑1 (MQ=255)   cTATTGCTATCAATTAGCAACATTAATACAACAACCGGCGAAAAGTGATGCAACGGCAGAc  <  1:702468/61‑1 (MQ=255)   cTATTGCTATCAATTAGCAACATTAATACAACAACCGGCGAAAAGTGATGCAACGGCAGAc  <  1:690883/61‑1 (MQ=255)   cTATTGCTATCAATTAGCAACATTAATACAACAACCGGCGAAAAGTGATGCAACGGCAGAc  <  1:683485/61‑1 (MQ=255)   cTATTGCTATCAATTAGCAACATTAATACAACAACCGGCGAAAAGTGATGCAACGGCAGAc  <  1:672224/61‑1 (MQ=255)   cTATTGCTATCAATTAGCAACATTAATACAACAACCGGCGAAAAGTGATGCAACGGCAGAc  <  1:671039/61‑1 (MQ=255)   cTATTGCTATCAATTAGCAACATTAATACAACAACCGGCGAAAAGTGATGCAACGGCAGAc  <  1:1016703/61‑1 (MQ=255)   cTATTGCTATCAATTAGCAACATTAATACAACAACCGGCGAAAAGTGATGCAACGGCAGAc  <  1:1144256/61‑1 (MQ=255)   cTATTGCTATCAATTAGCAACATTAATACAACAACCGGCGAAAAGTGATGCAACGGCAGAc  <  1:1438004/61‑1 (MQ=255)   cTATTGCTATCAATTAGCAACATTAATACAACAACCGGCGAAAAGTGATGCAACGGCAGAc  <  1:1430044/61‑1 (MQ=255)   cTATTGCTATCAATTAGCAACATTAATACAACAACCGGCGAAAAGTGATGCAACGGCAGAc  <  1:1379406/61‑1 (MQ=255)   cTATTGCTATCAATTAGCAACATTAATACAACAACCGGCGAAAAGTGATGCAACGGCAGAc  <  1:1365957/61‑1 (MQ=255)   cTATTGCTATCAATTAGCAACATTAATACAACAACCGGCGAAAAGTGATGCAACGGCAGAc  <  1:1356062/61‑1 (MQ=255)   cTATTGCTATCAATTAGCAACATTAATACAACAACCGGCGAAAAGTGATGCAACGGCAGAc  <  1:1352734/61‑1 (MQ=255)   cTATTGCTATCAATTAGCAACATTAATACAACAACCGGCGAAAAGTGATGCAACGGCAGAc  <  1:1282996/61‑1 (MQ=255)   cTATTGCTATCAATTAGCAACATTAATACAACAACCGGCGAAAAGTGATGCAACGGCAGAc  <  1:1228433/61‑1 (MQ=255)   cTATTGCTATCAATTAGCAACATTAATACAACAACCGGCGAAAAGTGATGCAACGGCAGAc  <  1:121023/61‑1 (MQ=255)   cTATTGCTATCAATTAGCAACATTAATACAACAACCGGCGAAAAGTGATGCAACGGCAGAc  <  1:117591/61‑1 (MQ=255)   cTATTGCTATCAATTAGCAACATTAATACAACAACCGGCGAAAAGTGATGCAACGGCAGAc  <  1:1451069/61‑1 (MQ=255)   cTATTGCTATCAATTAGCAACATTAATACAACAACCGGCGAAAAGTGATGCAACGGCAGAc  <  1:1143765/61‑1 (MQ=255)   cTATTGCTATCAATTAGCAACATTAATACAACAACCGGCGAAAAGTGATGCAACGGCAGAc  <  1:1141844/61‑1 (MQ=255)   cTATTGCTATCAATTAGCAACATTAATACAACAACCGGCGAAAAGTGATGCAACGGCAGAc  <  1:1138841/61‑1 (MQ=255)   cTATTGCTATCAATTAGCAACATTAATACAACAACCGGCGAAAAGTGATGCAACGGCAGAc  <  1:1124696/61‑1 (MQ=255)   cTATTGCTATCAATTAGCAACATTAATACAACAACCGGCGAAAAGTGATGCAACGGCAGAc  <  1:11092/61‑1 (MQ=255)   cTATTGCTATCAATTAGCAACATTAATACAACAACCGGCGAAAAGTGATGCAACGGCAGAc  <  1:1067697/61‑1 (MQ=255)   cTATTGCTATCAATTAGCAACATTAATACAACAACCGGCGAAAAGTGATGCAACGGCAGAc  <  1:1046371/61‑1 (MQ=255)   cTATTGCTATCAATTAGCAACATTAATACAACAACCGGCGAAAAGTGATGCAACGGCAGAc  <  1:1022328/61‑1 (MQ=255)   cTATTGCTATCAATTAGCAACATTAATACAACAACCGGCGAAAAGTGATGCAACGGCAGAc  <  1:101053/61‑1 (MQ=255)   cTATTGCTATCAATTAGCAACATTAATACAACAACCGGCGAAAAGTGATGCAACGGCAGAc  <  1:1582839/61‑1 (MQ=255)   cTATTGCTATCAATTAGCAACATTAATACAACAACCGGCGAAAAGTGATGCAACGGCAGAc  <  1:267083/61‑1 (MQ=255)   cTATTGCTATCAATTAGCAACATTAATACAACAACCGGCGAAAAGTGATGCAACGGCAGAc  <  1:254859/61‑1 (MQ=255)   cTATTGCTATCAATTAGCAACATTAATACAACAACCGGCGAAAAGTGATGCAACGGCAGAc  <  1:245400/61‑1 (MQ=255)   cTATTGCTATCAATTAGCAACATTAATACAACAACCGGCGAAAAGTGATGCAACGGCAGAc  <  1:24419/61‑1 (MQ=255)   cTATTGCTATCAATTAGCAACATTAATACAACAACCGGCGAAAAGTGATGCAACGGCAGAc  <  1:232401/61‑1 (MQ=255)   cTATTGCTATCAATTAGCAACATTAATACAACAACCGGCGAAAAGTGATGCAACGGCAGAc  <  1:223504/61‑1 (MQ=255)   cTATTGCTATCAATTAGCAACATTAATACAACAACCGGCGAAAAGTGATGCAACGGCAGAc  <  1:205663/61‑1 (MQ=255)   cTATTGCTATCAATTAGCAACATTAATACAACAACCGGCGAAAAGTGATGCAACGGCAGAc  <  1:17227/61‑1 (MQ=255)   cTATTGCTATCAATTAGCAACATTAATACAACAACCGGCGAAAAGTGATGCAACGGCAGAc  <  1:167613/61‑1 (MQ=255)   cTATTGCTATCAATTAGCAACATTAATACAACAACCGGCGAAAAGTGATGCAACGGCAGAc  <  1:1640824/61‑1 (MQ=255)   cTATTGCTATCAATTAGCAACATTAATACAACAACCGGCGAAAAGTGATGCAACGGCAGAc  <  1:1613569/61‑1 (MQ=255)   cTATTGCTATCAATTAGCAACATTAATACAACAACCGGCGAAAAGTGATGCAACGGCAGAc  <  1:1459555/61‑1 (MQ=255)   cTATTGCTATCAATTAGCAACATTAATACAACAACCGGCGAAAAGTGATGCAACGGCAGAc  <  1:1572012/61‑1 (MQ=255)   cTATTGCTATCAATTAGCAACATTAATACAACAACCGGCGAAAAGTGATGCAACGGCAGAc  <  1:1548795/61‑1 (MQ=255)   cTATTGCTATCAATTAGCAACATTAATACAACAACCGGCGAAAAGTGATGCAACGGCAGAc  <  1:1540214/61‑1 (MQ=255)   cTATTGCTATCAATTAGCAACATTAATACAACAACCGGCGAAAAGTGATGCAACGGCAGAc  <  1:1538043/61‑1 (MQ=255)   cTATTGCTATCAATTAGCAACATTAATACAACAACCGGCGAAAAGTGATGCAACGGCAGAc  <  1:1502613/61‑1 (MQ=255)   cTATTGCTATCAATTAGCAACATTAATACAACAACCGGCGAAAAGTGATGCAACGGCAGAc  <  1:1492073/61‑1 (MQ=255)   cTATTGCTATCAATTAGCAACATTAATACAACAACCGGCGAAAAGTGATGCAACGGCAGAc  <  1:1483783/61‑1 (MQ=255)   cTATTGCTATCAATTAGCAACATTAATACAACAACCGGCGAAAAGTGATGCAACGGCAGAc  <  1:1468299/61‑1 (MQ=255)   cTATTGCTATCAATTAGCAACATTAATACAACAACCGGCGAAAAGTCATGCAACGGCAGAc  <  1:297586/61‑1 (MQ=255)   cTATTGCTAACAATTAGCAACATTAATACAACAACCGGCGAAAAGTGATGCAACGGCAGAc  <  1:144464/61‑1 (MQ=255)   |                                                             GTCTATTGCTATCAATTAGCAACATTAATACAACAACCGGCGAAAAGTGATGCAACGGCAGAC  >  W3110S.gb/4646071‑4646133

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑