Missing coverage evidence...
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ATTAACGATTGCCCTGGTCGCCGGAGAAACCTCCGGCGATATCCTGG  >  W3110S.gb/203365‑203411 |                                               aTTAACGATTGCCCTGGTCGCCGGAGAAACCTCCGGCGATATCCTgg  >  1:708568/1‑47 (MQ=255) aTTAACGATTGCCCTGGTCGCCGGAGAAACCTCCGGCGATATCCTgg  >  1:1010099/1‑47 (MQ=255) aTTAACGATTGCCCTGGTCGCCGGAGAAACCTCCGGCGATATCCTgg  >  1:176085/1‑47 (MQ=255) aTTAACGATTGCCCTGGTCGCCGGAGAAACCTCCGGCGATATCCTgg  >  1:201931/1‑47 (MQ=255) aTTAACGATTGCCCTGGTCGCCGGAGAAACCTCCGGCGATATCCTgg  >  1:246697/1‑47 (MQ=255) aTTAACGATTGCCCTGGTCGCCGGAGAAACCTCCGGCGATATCCTgg  >  1:333683/1‑47 (MQ=255) aTTAACGATTGCCCTGGTCGCCGGAGAAACCTCCGGCGATATCCTgg  >  1:447306/1‑47 (MQ=255) aTTAACGATTGCCCTGGTCGCCGGAGAAACCTCCGGCGATATCCTgg  >  1:607647/1‑47 (MQ=255) aTTAACGATTGCCCTGGTCGCCGGAGAAACCTCCGGCGATATCCTgg  >  1:624559/1‑47 (MQ=255) aTTAACGATTGCCCTGGTCGCCGGAGAAACCTCCGGCGATATCCTgg  >  1:677913/1‑47 (MQ=255) aTTAACGATTGCCCTGGTCGCCGGAGAAACCTCCGGCGATATCCTgg  >  1:699448/1‑47 (MQ=255) aTTAACGATTGCCCTGGTCGCCGGAGAAACCTCCGGCGATATCCTgg  >  1:703291/1‑47 (MQ=255) aTTAACGATTGCCCTGGTCGCCGGAGAAACCTCCGGCGATATCCTgg  >  1:171421/1‑47 (MQ=255) aTTAACGATTGCCCTGGTCGCCGGAGAAACCTCCGGCGATATCCTgg  >  1:77179/1‑47 (MQ=255) aTTAACGATTGCCCTGGTCGCCGGAGAAACCTCCGGCGATATCCTgg  >  1:788624/1‑47 (MQ=255) aTTAACGATTGCCCTGGTCGCCGGAGAAACCTCCGGCGATATCCTgg  >  1:791245/1‑47 (MQ=255) aTTAACGATTGCCCTGGTCGCCGGAGAAACCTCCGGCGATATCCTgg  >  1:792225/1‑47 (MQ=255) aTTAACGATTGCCCTGGTCGCCGGAGAAACCTCCGGCGATATCCTgg  >  1:810583/1‑47 (MQ=255) aTTAACGATTGCCCTGGTCGCCGGAGAAACCTCCGGCGATATCCTgg  >  1:831797/1‑47 (MQ=255) aTTAACGATTGCCCTGGTCGCCGGAGAAACCTCCGGCGATATCCTgg  >  1:862836/1‑47 (MQ=255) aTTAACGATTGCCCTGGTCGCCGGAGAAACCTCCGGCGATATCCTgg  >  1:86400/1‑47 (MQ=255) aTTAACGATTGCCCTGGTCGCCGGAGAAACCTCCGGCGATATCCTgg  >  1:953005/1‑47 (MQ=255) aTTAACGATTGCCCTGGTCGCCGGAGAAACCTCCGGCGATATCCTgg  >  1:966571/1‑47 (MQ=255) aTTAACGATTGCCCTGGTCGCCGGAGAAACCTCCGGCGATATCCTgg  >  1:988610/1‑47 (MQ=255) aTTAACGATTGCCCTGGTCGCCGGAGAAACCTCCGGCGATATCCTgg  >  1:1345174/1‑47 (MQ=255) aTTAACGATTGCCCTGGTCGCCGGAGAAACCTCCGGCGATATCCTgg  >  1:1011497/1‑47 (MQ=255) aTTAACGATTGCCCTGGTCGCCGGAGAAACCTCCGGCGATATCCTgg  >  1:1042750/1‑47 (MQ=255) aTTAACGATTGCCCTGGTCGCCGGAGAAACCTCCGGCGATATCCTgg  >  1:1089135/1‑47 (MQ=255) aTTAACGATTGCCCTGGTCGCCGGAGAAACCTCCGGCGATATCCTgg  >  1:1106559/1‑47 (MQ=255) aTTAACGATTGCCCTGGTCGCCGGAGAAACCTCCGGCGATATCCTgg  >  1:1179620/1‑47 (MQ=255) aTTAACGATTGCCCTGGTCGCCGGAGAAACCTCCGGCGATATCCTgg  >  1:1212398/1‑47 (MQ=255) aTTAACGATTGCCCTGGTCGCCGGAGAAACCTCCGGCGATATCCTgg  >  1:123271/1‑47 (MQ=255) aTTAACGATTGCCCTGGTCGCCGGAGAAACCTCCGGCGATATCCTgg  >  1:1234386/1‑47 (MQ=255) aTTAACGATTGCCCTGGTCGCCGGAGAAACCTCCGGCGATATCCTgg  >  1:1315676/1‑47 (MQ=255) aTTAACGATTGCCCTGGTCGCCGGAGAAACCTCCGGCGATATCCTgg  >  1:133383/1‑47 (MQ=255) aTTAACGATTGCCCTGGTCGCCGGAGAAACCTCCGGCGATATCCTgg  >  1:1611435/1‑47 (MQ=255) aTTAACGATTGCCCTGGTCGCCGGAGAAACCTCCGGCGATATCCTgg  >  1:1361279/1‑47 (MQ=255) aTTAACGATTGCCCTGGTCGCCGGAGAAACCTCCGGCGATATCCTgg  >  1:1377421/1‑47 (MQ=255) aTTAACGATTGCCCTGGTCGCCGGAGAAACCTCCGGCGATATCCTgg  >  1:1382126/1‑47 (MQ=255) aTTAACGATTGCCCTGGTCGCCGGAGAAACCTCCGGCGATATCCTgg  >  1:1425888/1‑47 (MQ=255) aTTAACGATTGCCCTGGTCGCCGGAGAAACCTCCGGCGATATCCTgg  >  1:1441724/1‑47 (MQ=255) aTTAACGATTGCCCTGGTCGCCGGAGAAACCTCCGGCGATATCCTgg  >  1:1449351/1‑47 (MQ=255) aTTAACGATTGCCCTGGTCGCCGGAGAAACCTCCGGCGATATCCTgg  >  1:1474071/1‑47 (MQ=255) aTTAACGATTGCCCTGGTCGCCGGAGAAACCTCCGGCGATATCCTgg  >  1:1519549/1‑47 (MQ=255) aTTAACGATTGCCCTGGTCGCCGGAGAAACCTCCGGCGATATCCTgg  >  1:152208/1‑47 (MQ=255) aTTAACGATTGCCCTGGTCGCCGGAGAAACCTCCGGCGATATCCTgg  >  1:1580696/1‑47 (MQ=255) aTTAACGATTGCCCTGGTCGCCGGAGAAACCTCCGGCGATATCCTgg  >  1:1597432/1‑47 (MQ=255) aTTAACGATTGCCCTGGTCGCCGGACAAACCTCCGGCGATATCCTg   >  1:896716/1‑46 (MQ=255) |                                               ATTAACGATTGCCCTGGTCGCCGGAGAAACCTCCGGCGATATCCTGG  >  W3110S.gb/203365‑203411

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑