Missing coverage evidence...
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*	*	÷	W3110S.gb	249622	249761	140	48 [0]	[0] 50	fhiA	ECK0230:JW5811:b0229; flagellar system protein, promoterless fragment

GGCGCTCAGGTTGTATTTGAAGATCCCGATACAGACGCCGCCGATCAGGTTGATCGCCAGAA  >  W3110S.gb/249762‑249823 |                                                              ggCGCTCAGGTTGTATTTGAAGATCCCGATACAGACGCCGCCGATCAGGTTGATTGCCAGaa  <  1:1425589/62‑1 (MQ=255) ggCGCTCAGGTTGTATTTGAAGATCCCGATACAGACGCCGCCGATCAGGTTGATCTCCAGaa  <  1:1014282/62‑1 (MQ=255) ggCGCTCAGGTTGTATTTGAAGATCCCGATACAGACGCCGCCGATCAGGTTGATCGCCAGat  <  1:887001/62‑2 (MQ=255) ggCGCTCAGGTTGTATTTGAAGATCCCGATACAGACGCCGCCGATCAGGTTGATCGCCAGaa  <  1:282886/62‑1 (MQ=255) ggCGCTCAGGTTGTATTTGAAGATCCCGATACAGACGCCGCCGATCAGGTTGATCGCCAGaa  <  1:98609/62‑1 (MQ=255) ggCGCTCAGGTTGTATTTGAAGATCCCGATACAGACGCCGCCGATCAGGTTGATCGCCAGaa  <  1:285710/62‑1 (MQ=255) ggCGCTCAGGTTGTATTTGAAGATCCCGATACAGACGCCGCCGATCAGGTTGATCGCCAGaa  <  1:342508/62‑1 (MQ=255) ggCGCTCAGGTTGTATTTGAAGATCCCGATACAGACGCCGCCGATCAGGTTGATCGCCAGaa  <  1:344117/62‑1 (MQ=255) ggCGCTCAGGTTGTATTTGAAGATCCCGATACAGACGCCGCCGATCAGGTTGATCGCCAGaa  <  1:347094/62‑1 (MQ=255) ggCGCTCAGGTTGTATTTGAAGATCCCGATACAGACGCCGCCGATCAGGTTGATCGCCAGaa  <  1:397018/62‑1 (MQ=255) ggCGCTCAGGTTGTATTTGAAGATCCCGATACAGACGCCGCCGATCAGGTTGATCGCCAGaa  <  1:424332/62‑1 (MQ=255) ggCGCTCAGGTTGTATTTGAAGATCCCGATACAGACGCCGCCGATCAGGTTGATCGCCAGaa  <  1:438054/62‑1 (MQ=255) ggCGCTCAGGTTGTATTTGAAGATCCCGATACAGACGCCGCCGATCAGGTTGATCGCCAGaa  <  1:503274/62‑1 (MQ=255) ggCGCTCAGGTTGTATTTGAAGATCCCGATACAGACGCCGCCGATCAGGTTGATCGCCAGaa  <  1:527440/62‑1 (MQ=255) ggCGCTCAGGTTGTATTTGAAGATCCCGATACAGACGCCGCCGATCAGGTTGATCGCCAGaa  <  1:548317/62‑1 (MQ=255) ggCGCTCAGGTTGTATTTGAAGATCCCGATACAGACGCCGCCGATCAGGTTGATCGCCAGaa  <  1:598193/62‑1 (MQ=255) ggCGCTCAGGTTGTATTTGAAGATCCCGATACAGACGCCGCCGATCAGGTTGATCGCCAGaa  <  1:625229/62‑1 (MQ=255) ggCGCTCAGGTTGTATTTGAAGATCCCGATACAGACGCCGCCGATCAGGTTGATCGCCAGaa  <  1:664182/62‑1 (MQ=255) ggCGCTCAGGTTGTATTTGAAGATCCCGATACAGACGCCGCCGATCAGGTTGATCGCCAGaa  <  1:667874/62‑1 (MQ=255) ggCGCTCAGGTTGTATTTGAAGATCCCGATACAGACGCCGCCGATCAGGTTGATCGCCAGaa  <  1:696641/62‑1 (MQ=255) ggCGCTCAGGTTGTATTTGAAGATCCCGATACAGACGCCGCCGATCAGGTTGATCGCCAGaa  <  1:767056/62‑1 (MQ=255) ggCGCTCAGGTTGTATTTGAAGATCCCGATACAGACGCCGCCGATCAGGTTGATCGCCAGaa  <  1:850546/62‑1 (MQ=255) ggCGCTCAGGTTGTATTTGAAGATCCCGATACAGACGCCGCCGATCAGGTTGATCGCCAGaa  <  1:854922/62‑1 (MQ=255) ggCGCTCAGGTTGTATTTGAAGATCCCGATACAGACGCCGCCGATCAGGTTGATCGCCAGaa  <  1:885231/62‑1 (MQ=255) ggCGCTCAGGTTGTATTTGAAGATCCCGATACAGACGCCGCCGATCAGGTTGATCGCCAGaa  <  1:908070/62‑1 (MQ=255) ggCGCTCAGGTTGTATTTGAAGATCCCGATACAGACGCCGCCGATCAGGTTGATCGCCAGaa  <  1:1011870/62‑1 (MQ=255) ggCGCTCAGGTTGTATTTGAAGATCCCGATACAGACGCCGCCGATCAGGTTGATCGCCAGaa  <  1:1351502/62‑1 (MQ=255) ggCGCTCAGGTTGTATTTGAAGATCCCGATACAGACGCCGCCGATCAGGTTGATCGCCAGaa  <  1:1034490/62‑1 (MQ=255) ggCGCTCAGGTTGTATTTGAAGATCCCGATACAGACGCCGCCGATCAGGTTGATCGCCAGaa  <  1:1055059/62‑1 (MQ=255) ggCGCTCAGGTTGTATTTGAAGATCCCGATACAGACGCCGCCGATCAGGTTGATCGCCAGaa  <  1:1061803/62‑1 (MQ=255) ggCGCTCAGGTTGTATTTGAAGATCCCGATACAGACGCCGCCGATCAGGTTGATCGCCAGaa  <  1:1118129/62‑1 (MQ=255) ggCGCTCAGGTTGTATTTGAAGATCCCGATACAGACGCCGCCGATCAGGTTGATCGCCAGaa  <  1:119318/62‑1 (MQ=255) ggCGCTCAGGTTGTATTTGAAGATCCCGATACAGACGCCGCCGATCAGGTTGATCGCCAGaa  <  1:1238623/62‑1 (MQ=255) ggCGCTCAGGTTGTATTTGAAGATCCCGATACAGACGCCGCCGATCAGGTTGATCGCCAGaa  <  1:1306024/62‑1 (MQ=255) ggCGCTCAGGTTGTATTTGAAGATCCCGATACAGACGCCGCCGATCAGGTTGATCGCCAGaa  <  1:1341638/62‑1 (MQ=255) ggCGCTCAGGTTGTATTTGAAGATCCCGATACAGACGCCGCCGATCAGGTTGATCGCCAGaa  <  1:243626/62‑1 (MQ=255) ggCGCTCAGGTTGTATTTGAAGATCCCGATACAGACGCCGCCGATCAGGTTGATCGCCAGaa  <  1:1377439/62‑1 (MQ=255) ggCGCTCAGGTTGTATTTGAAGATCCCGATACAGACGCCGCCGATCAGGTTGATCGCCAGaa  <  1:1435949/62‑1 (MQ=255) ggCGCTCAGGTTGTATTTGAAGATCCCGATACAGACGCCGCCGATCAGGTTGATCGCCAGaa  <  1:1441528/62‑1 (MQ=255) ggCGCTCAGGTTGTATTTGAAGATCCCGATACAGACGCCGCCGATCAGGTTGATCGCCAGaa  <  1:1456291/62‑1 (MQ=255) ggCGCTCAGGTTGTATTTGAAGATCCCGATACAGACGCCGCCGATCAGGTTGATCGCCAGaa  <  1:1487520/62‑1 (MQ=255) ggCGCTCAGGTTGTATTTGAAGATCCCGATACAGACGCCGCCGATCAGGTTGATCGCCAGaa  <  1:15265/62‑1 (MQ=255) ggCGCTCAGGTTGTATTTGAAGATCCCGATACAGACGCCGCCGATCAGGTTGATCGCCAGaa  <  1:1528111/62‑1 (MQ=255) ggCGCTCAGGTTGTATTTGAAGATCCCGATACAGACGCCGCCGATCAGGTTGATCGCCAGaa  <  1:1558166/62‑1 (MQ=255) ggCGCTCAGGTTGTATTTGAAGATCCCGATACAGACGCCGCCGATCAGGTTGATCGCCAGaa  <  1:1643481/62‑1 (MQ=255) ggCGCTCAGGTTGTATTTGAAGATCCCGATACAGACGCCGCCGATCAGGTTGATCGCCAGaa  <  1:207070/62‑1 (MQ=255) ggCGCTCAGGTTGTATTTGAAGATCCCGATACAGACGACGCCGATCAGGTTGATCGCCAGaa  <  1:1324295/62‑1 (MQ=255) ggCGCTCAGGTTGTATCTGAAGATCCCGATACAGACGCCGCCGATCAGGTTGATCGCCAGaa  <  1:211276/62‑1 (MQ=255) ggCGCTCAGGTCGTATTTGAAGATCCCGATACAGACGCCGCCGATCAGGTTGATCGCCAGaa  <  1:974672/62‑1 (MQ=255) ggCGCTCAGGGTGTATTTGAAGATCCCGATACAGACGCCGCCGATCAGGTTGATCGCCAGaa  <  1:1316802/62‑1 (MQ=255) |                                                              GGCGCTCAGGTTGTATTTGAAGATCCCGATACAGACGCCGCCGATCAGGTTGATCGCCAGAA  >  W3110S.gb/249762‑249823

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑