Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	390270	390394	125	88 [0]	[0] 68	yaiT	hypothetical protein

TGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGAATGGTCATGATTCCAACG  >  W3110S.gb/390395‑390456 |                                                              tGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGTAATAGTAATTTTGATCCGAATGGTCATGATTCCAACg  <  1:1418436/62‑1 (MQ=255) tGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGAATGGTCATGATTCCAACg  <  1:438105/62‑1 (MQ=255) tGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGAATGGTCATGATTCCAACg  <  1:579749/62‑1 (MQ=255) tGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGAATGGTCATGATTCCAACg  <  1:568576/62‑1 (MQ=255) tGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGAATGGTCATGATTCCAACg  <  1:55459/62‑1 (MQ=255) tGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGAATGGTCATGATTCCAACg  <  1:549730/62‑1 (MQ=255) tGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGAATGGTCATGATTCCAACg  <  1:548530/62‑1 (MQ=255) tGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGAATGGTCATGATTCCAACg  <  1:534563/62‑1 (MQ=255) tGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGAATGGTCATGATTCCAACg  <  1:443397/62‑1 (MQ=255) tGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGAATGGTCATGATTCCAACg  <  1:59011/62‑1 (MQ=255) tGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGAATGGTCATGATTCCAACg  <  1:434393/62‑1 (MQ=255) tGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGAATGGTCATGATTCCAACg  <  1:425116/62‑1 (MQ=255) tGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGAATGGTCATGATTCCAACg  <  1:401443/62‑1 (MQ=255) tGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGAATGGTCATGATTCCAACg  <  1:387296/62‑1 (MQ=255) tGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGAATGGTCATGATTCCAACg  <  1:379388/62‑1 (MQ=255) tGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGAATGGTCATGATTCCAACg  <  1:358136/62‑1 (MQ=255) tGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGAATGGTCATGATTCCAACg  <  1:342684/62‑1 (MQ=255) tGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGAATGGTCATGATTCCAACg  <  1:835264/62‑1 (MQ=255) tGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGAATGGTCATGATTCCAACg  <  1:957062/62‑1 (MQ=255) tGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGAATGGTCATGATTCCAACg  <  1:930377/62‑1 (MQ=255) tGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGAATGGTCATGATTCCAACg  <  1:918090/62‑1 (MQ=255) tGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGAATGGTCATGATTCCAACg  <  1:911724/62‑1 (MQ=255) tGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGAATGGTCATGATTCCAACg  <  1:902389/62‑1 (MQ=255) tGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGAATGGTCATGATTCCAACg  <  1:899660/62‑1 (MQ=255) tGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGAATGGTCATGATTCCAACg  <  1:889444/62‑1 (MQ=255) tGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGAATGGTCATGATTCCAACg  <  1:857464/62‑1 (MQ=255) tGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGAATGGTCATGATTCCAACg  <  1:288553/62‑1 (MQ=255) tGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGAATGGTCATGATTCCAACg  <  1:830043/62‑1 (MQ=255) tGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGAATGGTCATGATTCCAACg  <  1:819189/62‑1 (MQ=255) tGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGAATGGTCATGATTCCAACg  <  1:812465/62‑1 (MQ=255) tGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGAATGGTCATGATTCCAACg  <  1:712936/62‑1 (MQ=255) tGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGAATGGTCATGATTCCAACg  <  1:692826/62‑1 (MQ=255) tGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGAATGGTCATGATTCCAACg  <  1:678880/62‑1 (MQ=255) tGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGAATGGTCATGATTCCAACg  <  1:593456/62‑1 (MQ=255) tGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGAATGGTCATGATTCCAACg  <  1:1211889/62‑1 (MQ=255) tGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGAATGGTCATGATTCCAACg  <  1:1033493/62‑1 (MQ=255) tGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGAATGGTCATGATTCCAACg  <  1:1383920/62‑1 (MQ=255) tGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGAATGGTCATGATTCCAACg  <  1:1376850/62‑1 (MQ=255) tGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGAATGGTCATGATTCCAACg  <  1:1355722/62‑1 (MQ=255) tGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGAATGGTCATGATTCCAACg  <  1:1340522/62‑1 (MQ=255) tGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGAATGGTCATGATTCCAACg  <  1:1319663/62‑1 (MQ=255) tGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGAATGGTCATGATTCCAACg  <  1:1281897/62‑1 (MQ=255) tGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGAATGGTCATGATTCCAACg  <  1:1232290/62‑1 (MQ=255) tGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGAATGGTCATGATTCCAACg  <  1:1397488/62‑1 (MQ=255) tGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGAATGGTCATGATTCCAACg  <  1:1143067/62‑1 (MQ=255) tGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGAATGGTCATGATTCCAACg  <  1:1142464/62‑1 (MQ=255) tGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGAATGGTCATGATTCCAACg  <  1:1139338/62‑1 (MQ=255) tGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGAATGGTCATGATTCCAACg  <  1:1120879/62‑1 (MQ=255) tGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGAATGGTCATGATTCCAACg  <  1:1104321/62‑1 (MQ=255) tGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGAATGGTCATGATTCCAACg  <  1:1054402/62‑1 (MQ=255) tGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGAATGGTCATGATTCCAACg  <  1:1038898/62‑1 (MQ=255) tGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGAATGGTCATGATTCCAACg  <  1:1562094/62‑1 (MQ=255) tGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGAATGGTCATGATTCCAACg  <  1:267282/62‑1 (MQ=255) tGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGAATGGTCATGATTCCAACg  <  1:262794/62‑1 (MQ=255) tGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGAATGGTCATGATTCCAACg  <  1:242679/62‑1 (MQ=255) tGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGAATGGTCATGATTCCAACg  <  1:239397/62‑1 (MQ=255) tGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGAATGGTCATGATTCCAACg  <  1:202074/62‑1 (MQ=255) tGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGAATGGTCATGATTCCAACg  <  1:1619519/62‑1 (MQ=255) tGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGAATGGTCATGATTCCAACg  <  1:1589962/62‑1 (MQ=255) tGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGAATGGTCATGATTCCAACg  <  1:1539128/62‑1 (MQ=255) tGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGAATGGTCATGATTCCAACg  <  1:1531268/62‑1 (MQ=255) tGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGAATGGTCATGATTCCAACg  <  1:1495440/62‑1 (MQ=255) tGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGAATGGTCATGATTCCAACg  <  1:1466469/62‑1 (MQ=255) tGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGAATGGTCATGATTCCAACg  <  1:1437194/62‑1 (MQ=255) tGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGAATGGTCATGATTCCAACg  <  1:1433677/62‑1 (MQ=255) tGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGAATGGTCATGATTCCAACg  <  1:1422446/62‑1 (MQ=255) tGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGAATGATCATGATTCCAACg  <  1:1403512/62‑1 (MQ=255) tGATGTTGCCTTTACCAGCACCAGGAATAGTAATTTTGATCCGAATGGTCATGATTCCAACg  <  1:909757/62‑1 (MQ=255) |                                                              TGATGTTGCCTTTACCAGCACCTGGAATAGTAATTTTGATCCGAATGGTCATGATTCCAACG  >  W3110S.gb/390395‑390456

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑