Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	416526	416566	41	13 [0]	[0] 40	phoB	DNA‑binding response regulator in two‑component regulatory system with PhoR (or CreC)

CTCAAGCGCGAGTCGATGACCCGGGATATTCCAGTGGTGATGTTGACCGCCAGAGGGGA  >  W3110S.gb/416567‑416625 |                                                           cTCAAGCGCGAGTCGATGCCCCGGGATATTCCAGTGGTGATGTTGACCGCCAGAGGGga  >  1:1289440/1‑59 (MQ=255) cTCAAGCGCGAGTCGATGACCCGGGATATTCCAGTGGTGATGTTGACCGCCAGAGGGga  >  1:566544/1‑59 (MQ=255) cTCAAGCGCGAGTCGATGACCCGGGATATTCCAGTGGTGATGTTGACCGCCAGAGGGga  >  1:256070/1‑59 (MQ=255) cTCAAGCGCGAGTCGATGACCCGGGATATTCCAGTGGTGATGTTGACCGCCAGAGGGga  >  1:25896/1‑59 (MQ=255) cTCAAGCGCGAGTCGATGACCCGGGATATTCCAGTGGTGATGTTGACCGCCAGAGGGga  >  1:291394/1‑59 (MQ=255) cTCAAGCGCGAGTCGATGACCCGGGATATTCCAGTGGTGATGTTGACCGCCAGAGGGga  >  1:368712/1‑59 (MQ=255) cTCAAGCGCGAGTCGATGACCCGGGATATTCCAGTGGTGATGTTGACCGCCAGAGGGga  >  1:389860/1‑59 (MQ=255) cTCAAGCGCGAGTCGATGACCCGGGATATTCCAGTGGTGATGTTGACCGCCAGAGGGga  >  1:490379/1‑59 (MQ=255) cTCAAGCGCGAGTCGATGACCCGGGATATTCCAGTGGTGATGTTGACCGCCAGAGGGga  >  1:527230/1‑59 (MQ=255) cTCAAGCGCGAGTCGATGACCCGGGATATTCCAGTGGTGATGTTGACCGCCAGAGGGga  >  1:547634/1‑59 (MQ=255) cTCAAGCGCGAGTCGATGACCCGGGATATTCCAGTGGTGATGTTGACCGCCAGAGGGga  >  1:550757/1‑59 (MQ=255) cTCAAGCGCGAGTCGATGACCCGGGATATTCCAGTGGTGATGTTGACCGCCAGAGGGga  >  1:212214/1‑59 (MQ=255) cTCAAGCGCGAGTCGATGACCCGGGATATTCCAGTGGTGATGTTGACCGCCAGAGGGga  >  1:578637/1‑59 (MQ=255) cTCAAGCGCGAGTCGATGACCCGGGATATTCCAGTGGTGATGTTGACCGCCAGAGGGga  >  1:690545/1‑59 (MQ=255) cTCAAGCGCGAGTCGATGACCCGGGATATTCCAGTGGTGATGTTGACCGCCAGAGGGga  >  1:693056/1‑59 (MQ=255) cTCAAGCGCGAGTCGATGACCCGGGATATTCCAGTGGTGATGTTGACCGCCAGAGGGga  >  1:697231/1‑59 (MQ=255) cTCAAGCGCGAGTCGATGACCCGGGATATTCCAGTGGTGATGTTGACCGCCAGAGGGga  >  1:823648/1‑59 (MQ=255) cTCAAGCGCGAGTCGATGACCCGGGATATTCCAGTGGTGATGTTGACCGCCAGAGGGga  >  1:910313/1‑59 (MQ=255) cTCAAGCGCGAGTCGATGACCCGGGATATTCCAGTGGTGATGTTGACCGCCAGAGGGga  >  1:935915/1‑59 (MQ=255) cTCAAGCGCGAGTCGATGACCCGGGATATTCCAGTGGTGATGTTGACCGCCAGAGGGga  >  1:93845/1‑59 (MQ=255) cTCAAGCGCGAGTCGATGACCCGGGATATTCCAGTGGTGATGTTGACCGCCAGAGGGga  >  1:1435142/1‑59 (MQ=255) cTCAAGCGCGAGTCGATGACCCGGGATATTCCAGTGGTGATGTTGACCGCCAGAGGGga  >  1:954863/1‑59 (MQ=255) cTCAAGCGCGAGTCGATGACCCGGGATATTCCAGTGGTGATGTTGACCGCCAGAGGGga  >  1:1202672/1‑59 (MQ=255) cTCAAGCGCGAGTCGATGACCCGGGATATTCCAGTGGTGATGTTGACCGCCAGAGGGga  >  1:1238495/1‑59 (MQ=255) cTCAAGCGCGAGTCGATGACCCGGGATATTCCAGTGGTGATGTTGACCGCCAGAGGGga  >  1:1296110/1‑59 (MQ=255) cTCAAGCGCGAGTCGATGACCCGGGATATTCCAGTGGTGATGTTGACCGCCAGAGGGga  >  1:1329319/1‑59 (MQ=255) cTCAAGCGCGAGTCGATGACCCGGGATATTCCAGTGGTGATGTTGACCGCCAGAGGGga  >  1:1394423/1‑59 (MQ=255) cTCAAGCGCGAGTCGATGACCCGGGATATTCCAGTGGTGATGTTGACCGCCAGAGGGga  >  1:1413847/1‑59 (MQ=255) cTCAAGCGCGAGTCGATGACCCGGGATATTCCAGTGGTGATGTTGACCGCCAGAGGGga  >  1:1421142/1‑59 (MQ=255) cTCAAGCGCGAGTCGATGACCCGGGATATTCCAGTGGTGATGTTGACCGCCAGAGGGga  >  1:143317/1‑59 (MQ=255) cTCAAGCGCGAGTCGATGACCCGGGATATTCCAGTGGTGATGTTGACCGCCAGAGGGga  >  1:1115217/1‑59 (MQ=255) cTCAAGCGCGAGTCGATGACCCGGGATATTCCAGTGGTGATGTTGACCGCCAGAGGGga  >  1:1495369/1‑59 (MQ=255) cTCAAGCGCGAGTCGATGACCCGGGATATTCCAGTGGTGATGTTGACCGCCAGAGGGga  >  1:1505433/1‑59 (MQ=255) cTCAAGCGCGAGTCGATGACCCGGGATATTCCAGTGGTGATGTTGACCGCCAGAGGGga  >  1:1544191/1‑59 (MQ=255) cTCAAGCGCGAGTCGATGACCCGGGATATTCCAGTGGTGATGTTGACCGCCAGAGGGga  >  1:1553676/1‑59 (MQ=255) cTCAAGCGCGAGTCGATGACCCGGGATATTCCAGTGGTGATGTTGACCGCCAGAGGGga  >  1:1559876/1‑59 (MQ=255) cTCAAGCGCGAGTCGATGACCCGGGATATTCCAGTGGTGATGTTGACCGCCAGAGGGga  >  1:175351/1‑59 (MQ=255) cTCAAGCGCGAGTCGATGACCCGGGATATTCCAGTGGTGATGTTGACCGCCAGAGGGga  >  1:208852/1‑59 (MQ=255) cTCAAGCGCGAGTCGATGACCCGGGATATTCCAGTGGTGATGATGACCGCCAGAGGGga  >  1:221830/1‑59 (MQ=255) cTCAAGCGCGAGTCGATGACCCGGGATATTCCAGTGGTGATCTTGACCGCCAGAGGGga  >  1:1175663/1‑59 (MQ=255) |                                                           CTCAAGCGCGAGTCGATGACCCGGGATATTCCAGTGGTGATGTTGACCGCCAGAGGGGA  >  W3110S.gb/416567‑416625

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑