Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 448481 448557 77 95 [0] [2] 121 cyoB cytochrome o ubiquinol oxidase subunit I

Only 100 of 121 total aligned reads displayed.

TAGGTCATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTGC  >  W3110S.gb/448553‑448612
     |                                                      
gtggTCATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:45419/58‑1 (MQ=255)
 tggTCATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:343852/58‑1 (MQ=255)
     cATCCGTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:379065/55‑1 (MQ=255)
     cATCCGTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:162761/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCTCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:1187800/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:318418/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:51143/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:467530/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:408240/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:40126/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:3910/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:366294/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:337510/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:334389/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:536005/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:314107/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:307927/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:294065/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:288483/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:279545/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:274941/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:254592/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:242825/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:235167/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:234731/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:220220/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:707516/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:972343/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:964239/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:957562/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:938670/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:922965/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:797179/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:795672/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:784265/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:725498/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:721493/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:720007/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:714591/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:514792/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:698733/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:689756/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:680427/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:673294/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:659156/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:658246/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:602101/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:597086/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:588402/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:578491/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:192125/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:1139077/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:1412346/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:140371/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:1370959/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:1355140/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:1345616/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:1296764/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:1292789/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:1279489/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:1267981/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:1259954/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:1170629/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:1149880/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:1420907/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:1115753/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:1106248/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:1098090/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:1085291/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:108378/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:1079078/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:107804/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:1068674/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:1061677/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:1025995/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:101832/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:1550438/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:1011608/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:191764/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:179322/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:164918/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:1644915/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:1643638/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:1636480/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:1615095/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:1586068/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:1584531/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:1576519/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:206397/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:1549141/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:1548397/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:1512509/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:151205/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:1492303/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:1486229/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:1475364/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:146335/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:1454795/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:1432696/55‑1 (MQ=255)
     cATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTgc  <  1:1422718/55‑1 (MQ=255)
     |                                                      
TAGGTCATCCCTGCGAAGCAGCCGAAGACCACGCCGCCGATGATCACGTTATGGAAGTGC  >  W3110S.gb/448553‑448612

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: