Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 457218 457826 609 17 [0] [0] 90 clpX ATPase and specificity subunit of ClpX‑ClpP ATP‑dependent serine protease

TCGAAAAAGTGGTTATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTAT  >  W3110S.gb/457827‑457888
|                                                             
tCGAAAAATTGGTTATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTAt  >  1:540158/1‑62 (MQ=255)
tCGAAAAAGTGGTTATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCa                        >  1:1570504/1‑40 (MQ=255)
tCGAAAAAGTGGTTATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCaaa                 >  1:644122/1‑47 (MQ=255)
tCGAAAAAGTGGTTATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTa   >  1:640406/1‑61 (MQ=255)
tCGAAAAAGTGGTTATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTa   >  1:1121261/1‑61 (MQ=255)
tCGAAAAAGTGGTTATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTa   >  1:711534/1‑61 (MQ=255)
tCGAAAAAGTGGTTATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTa   >  1:1211912/1‑61 (MQ=255)
tCGAAAAAGTGGTTATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTAt  >  1:499334/1‑62 (MQ=255)
tCGAAAAAGTGGTTATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTAt  >  1:654596/1‑62 (MQ=255)
tCGAAAAAGTGGTTATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTAt  >  1:645203/1‑62 (MQ=255)
tCGAAAAAGTGGTTATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTAt  >  1:605035/1‑62 (MQ=255)
tCGAAAAAGTGGTTATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTAt  >  1:597343/1‑62 (MQ=255)
tCGAAAAAGTGGTTATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTAt  >  1:562127/1‑62 (MQ=255)
tCGAAAAAGTGGTTATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTAt  >  1:53111/1‑62 (MQ=255)
tCGAAAAAGTGGTTATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTAt  >  1:514463/1‑62 (MQ=255)
tCGAAAAAGTGGTTATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTAt  >  1:666656/1‑62 (MQ=255)
tCGAAAAAGTGGTTATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTAt  >  1:496842/1‑62 (MQ=255)
tCGAAAAAGTGGTTATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTAt  >  1:494744/1‑62 (MQ=255)
tCGAAAAAGTGGTTATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTAt  >  1:421673/1‑62 (MQ=255)
tCGAAAAAGTGGTTATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTAt  >  1:366011/1‑62 (MQ=255)
tCGAAAAAGTGGTTATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTAt  >  1:290995/1‑62 (MQ=255)
tCGAAAAAGTGGTTATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTAt  >  1:28103/1‑62 (MQ=255)
tCGAAAAAGTGGTTATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTAt  >  1:232211/1‑62 (MQ=255)
tCGAAAAAGTGGTTATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTAt  >  1:211783/1‑62 (MQ=255)
tCGAAAAAGTGGTTATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTAt  >  1:2016/1‑62 (MQ=255)
tCGAAAAAGTGGTTATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTAt  >  1:783662/1‑62 (MQ=255)
tCGAAAAAGTGGTTATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTAt  >  1:974396/1‑62 (MQ=255)
tCGAAAAAGTGGTTATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTAt  >  1:972726/1‑62 (MQ=255)
tCGAAAAAGTGGTTATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTAt  >  1:939337/1‑62 (MQ=255)
tCGAAAAAGTGGTTATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTAt  >  1:891332/1‑62 (MQ=255)
tCGAAAAAGTGGTTATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTAt  >  1:880099/1‑62 (MQ=255)
tCGAAAAAGTGGTTATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTAt  >  1:866889/1‑62 (MQ=255)
tCGAAAAAGTGGTTATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTAt  >  1:82585/1‑62 (MQ=255)
tCGAAAAAGTGGTTATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTAt  >  1:822483/1‑62 (MQ=255)
tCGAAAAAGTGGTTATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTAt  >  1:814493/1‑62 (MQ=255)
tCGAAAAAGTGGTTATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTAt  >  1:786120/1‑62 (MQ=255)
tCGAAAAAGTGGTTATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTAt  >  1:654734/1‑62 (MQ=255)
tCGAAAAAGTGGTTATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTAt  >  1:749676/1‑62 (MQ=255)
tCGAAAAAGTGGTTATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTAt  >  1:723969/1‑62 (MQ=255)
tCGAAAAAGTGGTTATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTAt  >  1:707389/1‑62 (MQ=255)
tCGAAAAAGTGGTTATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTAt  >  1:697433/1‑62 (MQ=255)
tCGAAAAAGTGGTTATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTAt  >  1:693210/1‑62 (MQ=255)
tCGAAAAAGTGGTTATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTAt  >  1:691361/1‑62 (MQ=255)
tCGAAAAAGTGGTTATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTAt  >  1:687253/1‑62 (MQ=255)
tCGAAAAAGTGGTTATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTAt  >  1:673043/1‑62 (MQ=255)
tCGAAAAAGTGGTTATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTAt  >  1:1605059/1‑62 (MQ=255)
tCGAAAAAGTGGTTATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTAt  >  1:1205862/1‑62 (MQ=255)
tCGAAAAAGTGGTTATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTAt  >  1:1357129/1‑62 (MQ=255)
tCGAAAAAGTGGTTATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTAt  >  1:1326524/1‑62 (MQ=255)
tCGAAAAAGTGGTTATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTAt  >  1:1312938/1‑62 (MQ=255)
tCGAAAAAGTGGTTATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTAt  >  1:1296591/1‑62 (MQ=255)
tCGAAAAAGTGGTTATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTAt  >  1:1283916/1‑62 (MQ=255)
tCGAAAAAGTGGTTATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTAt  >  1:1255449/1‑62 (MQ=255)
tCGAAAAAGTGGTTATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTAt  >  1:1250966/1‑62 (MQ=255)
tCGAAAAAGTGGTTATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTAt  >  1:1231970/1‑62 (MQ=255)
tCGAAAAAGTGGTTATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTAt  >  1:123057/1‑62 (MQ=255)
tCGAAAAAGTGGTTATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTAt  >  1:1226234/1‑62 (MQ=255)
tCGAAAAAGTGGTTATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTAt  >  1:1370198/1‑62 (MQ=255)
tCGAAAAAGTGGTTATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTAt  >  1:120359/1‑62 (MQ=255)
tCGAAAAAGTGGTTATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTAt  >  1:1200636/1‑62 (MQ=255)
tCGAAAAAGTGGTTATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTAt  >  1:1182125/1‑62 (MQ=255)
tCGAAAAAGTGGTTATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTAt  >  1:117255/1‑62 (MQ=255)
tCGAAAAAGTGGTTATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTAt  >  1:1154643/1‑62 (MQ=255)
tCGAAAAAGTGGTTATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTAt  >  1:1114877/1‑62 (MQ=255)
tCGAAAAAGTGGTTATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTAt  >  1:1097869/1‑62 (MQ=255)
tCGAAAAAGTGGTTATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTAt  >  1:1084825/1‑62 (MQ=255)
tCGAAAAAGTGGTTATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTAt  >  1:1064071/1‑62 (MQ=255)
tCGAAAAAGTGGTTATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTAt  >  1:1029235/1‑62 (MQ=255)
tCGAAAAAGTGGTTATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTAt  >  1:1506408/1‑62 (MQ=255)
tCGAAAAAGTGGTTATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTAt  >  1:1027629/1‑62 (MQ=255)
tCGAAAAAGTGGTTATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTAt  >  1:1604733/1‑62 (MQ=255)
tCGAAAAAGTGGTTATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTAt  >  1:1597008/1‑62 (MQ=255)
tCGAAAAAGTGGTTATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTAt  >  1:1584490/1‑62 (MQ=255)
tCGAAAAAGTGGTTATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTAt  >  1:1582960/1‑62 (MQ=255)
tCGAAAAAGTGGTTATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTAt  >  1:1562945/1‑62 (MQ=255)
tCGAAAAAGTGGTTATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTAt  >  1:1542074/1‑62 (MQ=255)
tCGAAAAAGTGGTTATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTAt  >  1:1531840/1‑62 (MQ=255)
tCGAAAAAGTGGTTATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTAt  >  1:1531143/1‑62 (MQ=255)
tCGAAAAAGTGGTTATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTAt  >  1:1642002/1‑62 (MQ=255)
tCGAAAAAGTGGTTATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTAt  >  1:149965/1‑62 (MQ=255)
tCGAAAAAGTGGTTATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTAt  >  1:148750/1‑62 (MQ=255)
tCGAAAAAGTGGTTATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTAt  >  1:1474097/1‑62 (MQ=255)
tCGAAAAAGTGGTTATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTAt  >  1:1451970/1‑62 (MQ=255)
tCGAAAAAGTGGTTATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTAt  >  1:144899/1‑62 (MQ=255)
tCGAAAAAGTGGTTATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTAt  >  1:144403/1‑62 (MQ=255)
tCGAAAAAGTGGTTATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTAt  >  1:1415899/1‑62 (MQ=255)
tCGAAAAAGTGGTTATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTAt  >  1:1415602/1‑62 (MQ=255)
tCGAAAAAGTGGTTATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTAt  >  1:1401860/1‑62 (MQ=255)
tCGAAAAAGTGGTTATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTAt  >  1:1393701/1‑62 (MQ=255)
tCGAAAAAGTGGTTATCGACGAGACGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTAt  >  1:43357/1‑62 (MQ=255)
|                                                             
TCGAAAAAGTGGTTATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTAT  >  W3110S.gb/457827‑457888

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: