Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	493476	493964	489	21 [0]	[0] 33	[ybaB]–[recR]	[ybaB],[recR]

TCACCGCTGGACGGCATCGGTCCGGATGATATCGGGCTTGATCGTCTGGAACAGCGTCT  >  W3110S.gb/493965‑494023 |                                                           tCACCGCTGGCCGGCATCGGTCCGGATGATATCGGGCTTGATCg                 >  1:985431/1‑44 (MQ=255) tCACCGCTGGACGGCATCGGTCCGGATGATATCGGGCTTGATCGTCTGGAACAGCGTc   >  1:203191/1‑58 (MQ=255) tCACCGCTGGACGGCATCGGTCCGGATGATATCGGGCTTGATCGTCTGGAACAGCGTc   >  1:1650249/1‑58 (MQ=255) tCACCGCTGGACGGCATCGGTCCGGATGATATCGGGCTTGATCGTCTGGAACAGCGTc   >  1:1534130/1‑58 (MQ=255) tCACCGCTGGACGGCATCGGTCCGGATGATATCGGGCTTGATCGTCTGGAACAGCGTCt  >  1:769560/1‑59 (MQ=255) tCACCGCTGGACGGCATCGGTCCGGATGATATCGGGCTTGATCGTCTGGAACAGCGTCt  >  1:72580/1‑59 (MQ=255) tCACCGCTGGACGGCATCGGTCCGGATGATATCGGGCTTGATCGTCTGGAACAGCGTCt  >  1:552731/1‑59 (MQ=255) tCACCGCTGGACGGCATCGGTCCGGATGATATCGGGCTTGATCGTCTGGAACAGCGTCt  >  1:552426/1‑59 (MQ=255) tCACCGCTGGACGGCATCGGTCCGGATGATATCGGGCTTGATCGTCTGGAACAGCGTCt  >  1:41222/1‑59 (MQ=255) tCACCGCTGGACGGCATCGGTCCGGATGATATCGGGCTTGATCGTCTGGAACAGCGTCt  >  1:40782/1‑59 (MQ=255) tCACCGCTGGACGGCATCGGTCCGGATGATATCGGGCTTGATCGTCTGGAACAGCGTCt  >  1:407674/1‑59 (MQ=255) tCACCGCTGGACGGCATCGGTCCGGATGATATCGGGCTTGATCGTCTGGAACAGCGTCt  >  1:401088/1‑59 (MQ=255) tCACCGCTGGACGGCATCGGTCCGGATGATATCGGGCTTGATCGTCTGGAACAGCGTCt  >  1:818199/1‑59 (MQ=255) tCACCGCTGGACGGCATCGGTCCGGATGATATCGGGCTTGATCGTCTGGAACAGCGTCt  >  1:301426/1‑59 (MQ=255) tCACCGCTGGACGGCATCGGTCCGGATGATATCGGGCTTGATCGTCTGGAACAGCGTCt  >  1:275994/1‑59 (MQ=255) tCACCGCTGGACGGCATCGGTCCGGATGATATCGGGCTTGATCGTCTGGAACAGCGTCt  >  1:929109/1‑59 (MQ=255) tCACCGCTGGACGGCATCGGTCCGGATGATATCGGGCTTGATCGTCTGGAACAGCGTCt  >  1:239497/1‑59 (MQ=255) tCACCGCTGGACGGCATCGGTCCGGATGATATCGGGCTTGATCGTCTGGAACAGCGTCt  >  1:200603/1‑59 (MQ=255) tCACCGCTGGACGGCATCGGTCCGGATGATATCGGGCTTGATCGTCTGGAACAGCGTCt  >  1:234314/1‑59 (MQ=255) tCACCGCTGGACGGCATCGGTCCGGATGATATCGGGCTTGATCGTCTGGAACAGCGTCt  >  1:1052502/1‑59 (MQ=255) tCACCGCTGGACGGCATCGGTCCGGATGATATCGGGCTTGATCGTCTGGAACAGCGTCt  >  1:161608/1‑59 (MQ=255) tCACCGCTGGACGGCATCGGTCCGGATGATATCGGGCTTGATCGTCTGGAACAGCGTCt  >  1:1542819/1‑59 (MQ=255) tCACCGCTGGACGGCATCGGTCCGGATGATATCGGGCTTGATCGTCTGGAACAGCGTCt  >  1:1523992/1‑59 (MQ=255) tCACCGCTGGACGGCATCGGTCCGGATGATATCGGGCTTGATCGTCTGGAACAGCGTCt  >  1:1521055/1‑59 (MQ=255) tCACCGCTGGACGGCATCGGTCCGGATGATATCGGGCTTGATCGTCTGGAACAGCGTCt  >  1:1410697/1‑59 (MQ=255) tCACCGCTGGACGGCATCGGTCCGGATGATATCGGGCTTGATCGTCTGGAACAGCGTCt  >  1:1382544/1‑59 (MQ=255) tCACCGCTGGACGGCATCGGTCCGGATGATATCGGGCTTGATCGTCTGGAACAGCGTCt  >  1:1365037/1‑59 (MQ=255) tCACCGCTGGACGGCATCGGTCCGGATGATATCGGGCTTGATCGTCTGGAACAGCGTCt  >  1:1364759/1‑59 (MQ=255) tCACCGCTGGACGGCATCGGTCCGGATGATATCGGGCTTGATCGTCTGGAACAGCGTCt  >  1:1284141/1‑59 (MQ=255) tCACCGCTGGACGGCATCGGTCCGGATGATATCGGGCTTGATCGTCTGGAACAGCGTCt  >  1:1227247/1‑59 (MQ=255) tCACCGCTGGACGGCATCGGTCCGGATGATATCGGGCTTGATCGTCTGGAACAGCGTCt  >  1:1186005/1‑59 (MQ=255) tCACCGCTGGACGGCATCGGTCCGGATGATATCGGGCTTGATCGTCTGGAACAGCGTCt  >  1:1092681/1‑59 (MQ=255) tCACCGCTGGACGGCATCGGTCCGGATGATATCGGGCTTGATCGTCTGGAACAGCGTCt  >  1:1062687/1‑59 (MQ=255) |                                                           TCACCGCTGGACGGCATCGGTCCGGATGATATCGGGCTTGATCGTCTGGAACAGCGTCT  >  W3110S.gb/493965‑494023

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑