Missing coverage evidence...
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TACCCCGTCACCACCTCACCCGCCGGTGGCGTTTCCAGCA  >  W3110S.gb/500787‑500826 |                                        tACCCCGTCACCACCTCACCCGCCGGTGGCGTTTCcagca  <  1:697965/40‑1 (MQ=255) tACCCCGTCACCACCTCACCCGCCGGTGGCGTTTCcagca  <  1:464305/40‑1 (MQ=255) tACCCCGTCACCACCTCACCCGCCGGTGGCGTTTCcagca  <  1:505708/40‑1 (MQ=255) tACCCCGTCACCACCTCACCCGCCGGTGGCGTTTCcagca  <  1:513988/40‑1 (MQ=255) tACCCCGTCACCACCTCACCCGCCGGTGGCGTTTCcagca  <  1:522429/40‑1 (MQ=255) tACCCCGTCACCACCTCACCCGCCGGTGGCGTTTCcagca  <  1:562114/40‑1 (MQ=255) tACCCCGTCACCACCTCACCCGCCGGTGGCGTTTCcagca  <  1:587092/40‑1 (MQ=255) tACCCCGTCACCACCTCACCCGCCGGTGGCGTTTCcagca  <  1:620831/40‑1 (MQ=255) tACCCCGTCACCACCTCACCCGCCGGTGGCGTTTCcagca  <  1:671796/40‑1 (MQ=255) tACCCCGTCACCACCTCACCCGCCGGTGGCGTTTCcagca  <  1:678900/40‑1 (MQ=255) tACCCCGTCACCACCTCACCCGCCGGTGGCGTTTCcagca  <  1:423557/40‑1 (MQ=255) tACCCCGTCACCACCTCACCCGCCGGTGGCGTTTCcagca  <  1:768441/40‑1 (MQ=255) tACCCCGTCACCACCTCACCCGCCGGTGGCGTTTCcagca  <  1:776815/40‑1 (MQ=255) tACCCCGTCACCACCTCACCCGCCGGTGGCGTTTCcagca  <  1:797798/40‑1 (MQ=255) tACCCCGTCACCACCTCACCCGCCGGTGGCGTTTCcagca  <  1:948356/40‑1 (MQ=255) tACCCCGTCACCACCTCACCCGCCGGTGGCGTTTCcagca  <  1:964459/40‑1 (MQ=255) tACCCCGTCACCACCTCACCCGCCGGTGGCGTTTCcagca  <  1:969857/40‑1 (MQ=255) tACCCCGTCACCACCTCACCCGCCGGTGGCGTTTCcagca  <  1:972651/40‑1 (MQ=255) tACCCCGTCACCACCTCACCCGCCGGTGGCGTTTCcagca  <  1:983076/40‑1 (MQ=255) tACCCCGTCACCACCTCACCCGCCGGTGGCGTTTCcagca  <  1:986001/40‑1 (MQ=255) tACCCCGTCACCACCTCACCCGCCGGTGGCGTTTCcagca  <  1:1499120/40‑1 (MQ=255) tACCCCGTCACCACCTCACCCGCCGGTGGCGTTTCcagca  <  1:1100114/40‑1 (MQ=255) tACCCCGTCACCACCTCACCCGCCGGTGGCGTTTCcagca  <  1:1133170/40‑1 (MQ=255) tACCCCGTCACCACCTCACCCGCCGGTGGCGTTTCcagca  <  1:1207915/40‑1 (MQ=255) tACCCCGTCACCACCTCACCCGCCGGTGGCGTTTCcagca  <  1:1232686/40‑1 (MQ=255) tACCCCGTCACCACCTCACCCGCCGGTGGCGTTTCcagca  <  1:1312607/40‑1 (MQ=255) tACCCCGTCACCACCTCACCCGCCGGTGGCGTTTCcagca  <  1:1315548/40‑1 (MQ=255) tACCCCGTCACCACCTCACCCGCCGGTGGCGTTTCcagca  <  1:1436751/40‑1 (MQ=255) tACCCCGTCACCACCTCACCCGCCGGTGGCGTTTCcagca  <  1:1485628/40‑1 (MQ=255) tACCCCGTCACCACCTCACCCGCCGGTGGCGTTTCcagca  <  1:1486841/40‑1 (MQ=255) tACCCCGTCACCACCTCACCCGCCGGTGGCGTTTCcagca  <  1:1083692/40‑1 (MQ=255) tACCCCGTCACCACCTCACCCGCCGGTGGCGTTTCcagca  <  1:1536622/40‑1 (MQ=255) tACCCCGTCACCACCTCACCCGCCGGTGGCGTTTCcagca  <  1:1566948/40‑1 (MQ=255) tACCCCGTCACCACCTCACCCGCCGGTGGCGTTTCcagca  <  1:170550/40‑1 (MQ=255) tACCCCGTCACCACCTCACCCGCCGGTGGCGTTTCcagca  <  1:230795/40‑1 (MQ=255) tACCCCGTCACCACCTCACCCGCCGGTGGCGTTTCcagca  <  1:260896/40‑1 (MQ=255) tACCCCGTCACCACCTCACCCGCCGGTGGCGTTTCcagca  <  1:335174/40‑1 (MQ=255) tACCCCGTCACCACCTCACCCGCCGGTGGCGTTTCcagca  <  1:357510/40‑1 (MQ=255) tACCCCGTCACCACCTCACCCGCCGGTGGCGTTTCcagca  <  1:404811/40‑1 (MQ=255) tACCCCGTCACCACCTCACCCGCCGGTGGCGTTTCcagca  <  1:414446/40‑1 (MQ=255) |                                        TACCCCGTCACCACCTCACCCGCCGGTGGCGTTTCCAGCA  >  W3110S.gb/500787‑500826

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑