Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	540669	541246	578	41 [0]	[0] 80	[ybbY]–[glxK]	[ybbY],[glxK]

GAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTGC  >  W3110S.gb/541247‑541309 |                                                               gaagggaaggTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTg   >  1:422020/1‑62 (MQ=255) gAAGGGACGGTGGTTGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGa         >  1:1347413/1‑56 (MQ=255) gAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGCCGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTg   >  1:468621/1‑62 (MQ=255) gAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAATATCGTGACGCTTGAAGTCTg   >  1:527810/1‑62 (MQ=255) gAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGCCGCTTGAAGTCTg   >  1:969946/1‑62 (MQ=255) gAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCt    >  1:1451287/1‑61 (MQ=255) gAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTg   >  1:477654/1‑62 (MQ=255) gAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTg   >  1:658852/1‑62 (MQ=255) gAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTg   >  1:651807/1‑62 (MQ=255) gAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTg   >  1:642429/1‑62 (MQ=255) gAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTg   >  1:582279/1‑62 (MQ=255) gAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTg   >  1:566390/1‑62 (MQ=255) gAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTg   >  1:562038/1‑62 (MQ=255) gAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTg   >  1:515681/1‑62 (MQ=255) gAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTg   >  1:701050/1‑62 (MQ=255) gAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTg   >  1:467319/1‑62 (MQ=255) gAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTg   >  1:461168/1‑62 (MQ=255) gAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTg   >  1:456506/1‑62 (MQ=255) gAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTg   >  1:439569/1‑62 (MQ=255) gAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTg   >  1:402984/1‑62 (MQ=255) gAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTg   >  1:389521/1‑62 (MQ=255) gAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTg   >  1:353791/1‑62 (MQ=255) gAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTg   >  1:885196/1‑62 (MQ=255) gAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTg   >  1:975355/1‑62 (MQ=255) gAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTg   >  1:934028/1‑62 (MQ=255) gAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTg   >  1:928991/1‑62 (MQ=255) gAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTg   >  1:919246/1‑62 (MQ=255) gAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTg   >  1:903184/1‑62 (MQ=255) gAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTg   >  1:900009/1‑62 (MQ=255) gAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTg   >  1:898021/1‑62 (MQ=255) gAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTg   >  1:895028/1‑62 (MQ=255) gAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTg   >  1:890642/1‑62 (MQ=255) gAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTg   >  1:669767/1‑62 (MQ=255) gAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTg   >  1:863070/1‑62 (MQ=255) gAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTg   >  1:828037/1‑62 (MQ=255) gAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTg   >  1:808764/1‑62 (MQ=255) gAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTg   >  1:799904/1‑62 (MQ=255) gAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTg   >  1:760942/1‑62 (MQ=255) gAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTg   >  1:755814/1‑62 (MQ=255) gAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTg   >  1:74135/1‑62 (MQ=255) gAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTg   >  1:302594/1‑62 (MQ=255) gAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTg   >  1:1194763/1‑62 (MQ=255) gAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTg   >  1:1394307/1‑62 (MQ=255) gAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTg   >  1:1371728/1‑62 (MQ=255) gAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTg   >  1:1369523/1‑62 (MQ=255) gAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTg   >  1:133656/1‑62 (MQ=255) gAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTg   >  1:1310579/1‑62 (MQ=255) gAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTg   >  1:1307047/1‑62 (MQ=255) gAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTg   >  1:1276122/1‑62 (MQ=255) gAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTg   >  1:1258043/1‑62 (MQ=255) gAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTg   >  1:1250853/1‑62 (MQ=255) gAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTg   >  1:288671/1‑62 (MQ=255) gAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTg   >  1:1163360/1‑62 (MQ=255) gAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTg   >  1:1162606/1‑62 (MQ=255) gAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTg   >  1:1148800/1‑62 (MQ=255) gAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTg   >  1:1138623/1‑62 (MQ=255) gAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTg   >  1:1122397/1‑62 (MQ=255) gAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTg   >  1:1065288/1‑62 (MQ=255) gAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTg   >  1:1057280/1‑62 (MQ=255) gAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTg   >  1:1049852/1‑62 (MQ=255) gAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTg   >  1:1040775/1‑62 (MQ=255) gAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTg   >  1:1585688/1‑62 (MQ=255) gAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTg   >  1:1017423/1‑62 (MQ=255) gAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTg   >  1:249801/1‑62 (MQ=255) gAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTg   >  1:224862/1‑62 (MQ=255) gAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTg   >  1:219189/1‑62 (MQ=255) gAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTg   >  1:197734/1‑62 (MQ=255) gAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTg   >  1:19620/1‑62 (MQ=255) gAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTg   >  1:176305/1‑62 (MQ=255) gAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTg   >  1:1634751/1‑62 (MQ=255) gAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTg   >  1:1596038/1‑62 (MQ=255) gAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTg   >  1:1570902/1‑62 (MQ=255) gAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTg   >  1:1548390/1‑62 (MQ=255) gAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTg   >  1:1544567/1‑62 (MQ=255) gAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTg   >  1:1523749/1‑62 (MQ=255) gAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTg   >  1:1476916/1‑62 (MQ=255) gAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTg   >  1:1458010/1‑62 (MQ=255) gAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTg   >  1:1440529/1‑62 (MQ=255) gAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTg   >  1:1428754/1‑62 (MQ=255) gAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTT‑AAGTCTGc  >  1:694294/1‑62 (MQ=255) |                                                               GAAGGGACGGTGGATGCGATGGTCGCCGCGACGGGCGGCAACATCGTGACGCTTGAAGTCTGC  >  W3110S.gb/541247‑541309

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑