Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 580837 581044 208 124 [0] [0] 136 tfaD DLP12 prophage region; ECK0553:JW5815:b0561; predicted tail fiber assembly protein

Only 100 of 136 total aligned reads displayed.

GGGGAGTTTCAGAAGTGGAACGGTACAGCCTGGGTGAAAGATG  >  W3110S.gb/581045‑581087
|                                          
ggggAGTTTCAGAATTGGAACTGTACAGCCTGGGTGaa       >  1:1308083/1‑38 (MQ=14)
ggggAGTTTCAGAAGTGGAACGGTACAGCCTGGGTGaaa      >  1:812749/1‑39 (MQ=255)
ggggAGTTTCAGAAGTGGAACGGTACAGCCTGGGTGAAAGAt   >  1:204644/1‑42 (MQ=255)
ggggAGTTTCAGAAGTGGAACGGTACAGCCTGGGTGAAAGATg  >  1:324705/1‑43 (MQ=255)
ggggAGTTTCAGAAGTGGAACGGTACAGCCTGGGTGAAAGATg  >  1:453218/1‑43 (MQ=255)
ggggAGTTTCAGAAGTGGAACGGTACAGCCTGGGTGAAAGATg  >  1:452979/1‑43 (MQ=255)
ggggAGTTTCAGAAGTGGAACGGTACAGCCTGGGTGAAAGATg  >  1:4248/1‑43 (MQ=255)
ggggAGTTTCAGAAGTGGAACGGTACAGCCTGGGTGAAAGATg  >  1:419060/1‑43 (MQ=255)
ggggAGTTTCAGAAGTGGAACGGTACAGCCTGGGTGAAAGATg  >  1:413933/1‑43 (MQ=255)
ggggAGTTTCAGAAGTGGAACGGTACAGCCTGGGTGAAAGATg  >  1:39237/1‑43 (MQ=255)
ggggAGTTTCAGAAGTGGAACGGTACAGCCTGGGTGAAAGATg  >  1:391803/1‑43 (MQ=255)
ggggAGTTTCAGAAGTGGAACGGTACAGCCTGGGTGAAAGATg  >  1:384202/1‑43 (MQ=255)
ggggAGTTTCAGAAGTGGAACGGTACAGCCTGGGTGAAAGATg  >  1:372847/1‑43 (MQ=255)
ggggAGTTTCAGAAGTGGAACGGTACAGCCTGGGTGAAAGATg  >  1:372130/1‑43 (MQ=255)
ggggAGTTTCAGAAGTGGAACGGTACAGCCTGGGTGAAAGATg  >  1:36029/1‑43 (MQ=255)
ggggAGTTTCAGAAGTGGAACGGTACAGCCTGGGTGAAAGATg  >  1:531742/1‑43 (MQ=255)
ggggAGTTTCAGAAGTGGAACGGTACAGCCTGGGTGAAAGATg  >  1:322934/1‑43 (MQ=255)
ggggAGTTTCAGAAGTGGAACGGTACAGCCTGGGTGAAAGATg  >  1:303263/1‑43 (MQ=255)
ggggAGTTTCAGAAGTGGAACGGTACAGCCTGGGTGAAAGATg  >  1:296686/1‑43 (MQ=255)
ggggAGTTTCAGAAGTGGAACGGTACAGCCTGGGTGAAAGATg  >  1:284763/1‑43 (MQ=255)
ggggAGTTTCAGAAGTGGAACGGTACAGCCTGGGTGAAAGATg  >  1:256524/1‑43 (MQ=255)
ggggAGTTTCAGAAGTGGAACGGTACAGCCTGGGTGAAAGATg  >  1:22718/1‑43 (MQ=255)
ggggAGTTTCAGAAGTGGAACGGTACAGCCTGGGTGAAAGATg  >  1:219211/1‑43 (MQ=255)
ggggAGTTTCAGAAGTGGAACGGTACAGCCTGGGTGAAAGATg  >  1:190865/1‑43 (MQ=255)
ggggAGTTTCAGAAGTGGAACGGTACAGCCTGGGTGAAAGATg  >  1:1628472/1‑43 (MQ=255)
ggggAGTTTCAGAAGTGGAACGGTACAGCCTGGGTGAAAGATg  >  1:1596155/1‑43 (MQ=255)
ggggAGTTTCAGAAGTGGAACGGTACAGCCTGGGTGAAAGATg  >  1:735073/1‑43 (MQ=255)
ggggAGTTTCAGAAGTGGAACGGTACAGCCTGGGTGAAAGATg  >  1:959968/1‑43 (MQ=255)
ggggAGTTTCAGAAGTGGAACGGTACAGCCTGGGTGAAAGATg  >  1:952694/1‑43 (MQ=255)
ggggAGTTTCAGAAGTGGAACGGTACAGCCTGGGTGAAAGATg  >  1:926032/1‑43 (MQ=255)
ggggAGTTTCAGAAGTGGAACGGTACAGCCTGGGTGAAAGATg  >  1:918112/1‑43 (MQ=255)
ggggAGTTTCAGAAGTGGAACGGTACAGCCTGGGTGAAAGATg  >  1:907848/1‑43 (MQ=255)
ggggAGTTTCAGAAGTGGAACGGTACAGCCTGGGTGAAAGATg  >  1:85179/1‑43 (MQ=255)
ggggAGTTTCAGAAGTGGAACGGTACAGCCTGGGTGAAAGATg  >  1:823243/1‑43 (MQ=255)
ggggAGTTTCAGAAGTGGAACGGTACAGCCTGGGTGAAAGATg  >  1:787885/1‑43 (MQ=255)
ggggAGTTTCAGAAGTGGAACGGTACAGCCTGGGTGAAAGATg  >  1:760835/1‑43 (MQ=255)
ggggAGTTTCAGAAGTGGAACGGTACAGCCTGGGTGAAAGATg  >  1:75794/1‑43 (MQ=255)
ggggAGTTTCAGAAGTGGAACGGTACAGCCTGGGTGAAAGATg  >  1:746754/1‑43 (MQ=255)
ggggAGTTTCAGAAGTGGAACGGTACAGCCTGGGTGAAAGATg  >  1:1595911/1‑43 (MQ=255)
ggggAGTTTCAGAAGTGGAACGGTACAGCCTGGGTGAAAGATg  >  1:707017/1‑43 (MQ=255)
ggggAGTTTCAGAAGTGGAACGGTACAGCCTGGGTGAAAGATg  >  1:698291/1‑43 (MQ=255)
ggggAGTTTCAGAAGTGGAACGGTACAGCCTGGGTGAAAGATg  >  1:643048/1‑43 (MQ=255)
ggggAGTTTCAGAAGTGGAACGGTACAGCCTGGGTGAAAGATg  >  1:613793/1‑43 (MQ=255)
ggggAGTTTCAGAAGTGGAACGGTACAGCCTGGGTGAAAGATg  >  1:612819/1‑43 (MQ=255)
ggggAGTTTCAGAAGTGGAACGGTACAGCCTGGGTGAAAGATg  >  1:60678/1‑43 (MQ=255)
ggggAGTTTCAGAAGTGGAACGGTACAGCCTGGGTGAAAGATg  >  1:58009/1‑43 (MQ=255)
ggggAGTTTCAGAAGTGGAACGGTACAGCCTGGGTGAAAGATg  >  1:577169/1‑43 (MQ=255)
ggggAGTTTCAGAAGTGGAACGGTACAGCCTGGGTGAAAGATg  >  1:562628/1‑43 (MQ=255)
ggggAGTTTCAGAAGTGGAACGGTACAGCCTGGGTGAAAGATg  >  1:542581/1‑43 (MQ=255)
ggggAGTTTCAGAAGTGGAACGGTACAGCCTGGGTGAAAGATg  >  1:539456/1‑43 (MQ=255)
ggggAGTTTCAGAAGTGGAACGGTACAGCCTGGGTGAAAGATg  >  1:1162752/1‑43 (MQ=255)
ggggAGTTTCAGAAGTGGAACGGTACAGCCTGGGTGAAAGATg  >  1:1287621/1‑43 (MQ=255)
ggggAGTTTCAGAAGTGGAACGGTACAGCCTGGGTGAAAGATg  >  1:1281160/1‑43 (MQ=255)
ggggAGTTTCAGAAGTGGAACGGTACAGCCTGGGTGAAAGATg  >  1:1264571/1‑43 (MQ=255)
ggggAGTTTCAGAAGTGGAACGGTACAGCCTGGGTGAAAGATg  >  1:1261219/1‑43 (MQ=255)
ggggAGTTTCAGAAGTGGAACGGTACAGCCTGGGTGAAAGATg  >  1:1254735/1‑43 (MQ=255)
ggggAGTTTCAGAAGTGGAACGGTACAGCCTGGGTGAAAGATg  >  1:1235315/1‑43 (MQ=255)
ggggAGTTTCAGAAGTGGAACGGTACAGCCTGGGTGAAAGATg  >  1:1234814/1‑43 (MQ=255)
ggggAGTTTCAGAAGTGGAACGGTACAGCCTGGGTGAAAGATg  >  1:1232398/1‑43 (MQ=255)
ggggAGTTTCAGAAGTGGAACGGTACAGCCTGGGTGAAAGATg  >  1:1194297/1‑43 (MQ=255)
ggggAGTTTCAGAAGTGGAACGGTACAGCCTGGGTGAAAGATg  >  1:1192570/1‑43 (MQ=255)
ggggAGTTTCAGAAGTGGAACGGTACAGCCTGGGTGAAAGATg  >  1:1177752/1‑43 (MQ=255)
ggggAGTTTCAGAAGTGGAACGGTACAGCCTGGGTGAAAGATg  >  1:1174928/1‑43 (MQ=255)
ggggAGTTTCAGAAGTGGAACGGTACAGCCTGGGTGAAAGATg  >  1:1302695/1‑43 (MQ=255)
ggggAGTTTCAGAAGTGGAACGGTACAGCCTGGGTGAAAGATg  >  1:1155320/1‑43 (MQ=255)
ggggAGTTTCAGAAGTGGAACGGTACAGCCTGGGTGAAAGATg  >  1:1136655/1‑43 (MQ=255)
ggggAGTTTCAGAAGTGGAACGGTACAGCCTGGGTGAAAGATg  >  1:1131160/1‑43 (MQ=255)
ggggAGTTTCAGAAGTGGAACGGTACAGCCTGGGTGAAAGATg  >  1:111293/1‑43 (MQ=255)
ggggAGTTTCAGAAGTGGAACGGTACAGCCTGGGTGAAAGATg  >  1:1091158/1‑43 (MQ=255)
ggggAGTTTCAGAAGTGGAACGGTACAGCCTGGGTGAAAGATg  >  1:1067334/1‑43 (MQ=255)
ggggAGTTTCAGAAGTGGAACGGTACAGCCTGGGTGAAAGATg  >  1:1043963/1‑43 (MQ=255)
ggggAGTTTCAGAAGTGGAACGGTACAGCCTGGGTGAAAGATg  >  1:1041808/1‑43 (MQ=255)
ggggAGTTTCAGAAGTGGAACGGTACAGCCTGGGTGAAAGATg  >  1:1028065/1‑43 (MQ=255)
ggggAGTTTCAGAAGTGGAACGGTACAGCCTGGGTGAAAGATg  >  1:1018480/1‑43 (MQ=255)
ggggAGTTTCAGAAGTGGAACGGTACAGCCTGGGTGAAAGATg  >  1:1016259/1‑43 (MQ=255)
ggggAGTTTCAGAAGTGGAACGGTACAGCCTGGGTGAAAGATg  >  1:1451711/1‑43 (MQ=255)
ggggAGTTTCAGAAGTGGAACGGTACAGCCTGGGTGAAAGATg  >  1:1589252/1‑43 (MQ=255)
ggggAGTTTCAGAAGTGGAACGGTACAGCCTGGGTGAAAGATg  >  1:1581734/1‑43 (MQ=255)
ggggAGTTTCAGAAGTGGAACGGTACAGCCTGGGTGAAAGATg  >  1:1561290/1‑43 (MQ=255)
ggggAGTTTCAGAAGTGGAACGGTACAGCCTGGGTGAAAGATg  >  1:1531144/1‑43 (MQ=255)
ggggAGTTTCAGAAGTGGAACGGTACAGCCTGGGTGAAAGATg  >  1:1521562/1‑43 (MQ=255)
ggggAGTTTCAGAAGTGGAACGGTACAGCCTGGGTGAAAGATg  >  1:1509397/1‑43 (MQ=255)
ggggAGTTTCAGAAGTGGAACGGTACAGCCTGGGTGAAAGATg  >  1:1495214/1‑43 (MQ=255)
ggggAGTTTCAGAAGTGGAACGGTACAGCCTGGGTGAAAGATg  >  1:1492877/1‑43 (MQ=255)
ggggAGTTTCAGAAGTGGAACGGTACAGCCTGGGTGAAAGATg  >  1:147212/1‑43 (MQ=255)
ggggAGTTTCAGAAGTGGAACGGTACAGCCTGGGTGAAAGATg  >  1:1470488/1‑43 (MQ=255)
ggggAGTTTCAGAAGTGGAACGGTACAGCCTGGGTGAAAGATg  >  1:1469328/1‑43 (MQ=255)
ggggAGTTTCAGAAGTGGAACGGTACAGCCTGGGTGAAAGATg  >  1:1016019/1‑43 (MQ=255)
ggggAGTTTCAGAAGTGGAACGGTACAGCCTGGGTGAAAGATg  >  1:1446708/1‑43 (MQ=255)
ggggAGTTTCAGAAGTGGAACGGTACAGCCTGGGTGAAAGATg  >  1:1422976/1‑43 (MQ=255)
ggggAGTTTCAGAAGTGGAACGGTACAGCCTGGGTGAAAGATg  >  1:142294/1‑43 (MQ=255)
ggggAGTTTCAGAAGTGGAACGGTACAGCCTGGGTGAAAGATg  >  1:1414152/1‑43 (MQ=255)
ggggAGTTTCAGAAGTGGAACGGTACAGCCTGGGTGAAAGATg  >  1:1376371/1‑43 (MQ=255)
ggggAGTTTCAGAAGTGGAACGGTACAGCCTGGGTGAAAGATg  >  1:1360694/1‑43 (MQ=255)
ggggAGTTTCAGAAGTGGAACGGTACAGCCTGGGTGAAAGATg  >  1:1356881/1‑43 (MQ=255)
ggggAGTTTCAGAAGTGGAACGGTACAGCCTGGGTGAAAGATg  >  1:1349306/1‑43 (MQ=255)
ggggAGTTTCAGAAGTGGAACGGTACAGCCTGGGTGAAAGATg  >  1:1341040/1‑43 (MQ=255)
ggggAGTTTCAGAAGTGGAACGGTACAGCCTGGGTGAAAGATg  >  1:1339730/1‑43 (MQ=255)
ggggAGTTTCAGAAGTGGAACGGTACAGCCTGGGTGAAAGATg  >  1:1333318/1‑43 (MQ=255)
ggggAGTTTCAGAAGTGGAACGGGACAGCCTGGGTGAAAGATg  >  1:26623/1‑43 (MQ=255)
|                                          
GGGGAGTTTCAGAAGTGGAACGGTACAGCCTGGGTGAAAGATG  >  W3110S.gb/581045‑581087

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑