Missing coverage evidence...
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GACTCCACCGGACGCAGGGTGTGGGCAATCACTTTGTCGATCTCCGCCTGATTATTGATATC  >  W3110S.gb/631691‑631752 |                                                              gACTCCCCCGGACGCAGGGTGTGGGCAATCACTTTGTCGATCTCCGCCTGa             >  1:1466466/1‑51 (MQ=255) gACTCCACCGGCCGCAGGGTGTGGGCAATCACTTTGTCGATCTCCGCCTGATTATTGATATc  >  1:493244/1‑62 (MQ=255) gACTCCACCGGCCGCAGGGTGTGGGCAATCACTTTGTCGATCTCCGCCTGATTATTGATATc  >  1:678474/1‑62 (MQ=255) gACTCCACCGGACGCAGGGTGTGGGCAATCACTTTGTc                          >  1:1585605/1‑38 (MQ=255) gACTCCACCGGACGCAGGGTGTGGGCAATCACTTTGTCGAt                       >  1:1624759/1‑41 (MQ=255) gACTCCACCGGACGCAGGGTGTGGGCAATCACTTTGTCGATCTCCGCCTGATTATTGatacc  >  1:1093119/1‑60 (MQ=255) gACTCCACCGGACGCAGGGTGTGGGCAATCACTTTGTCGATCTCCGCCTGATTATTGATATc  >  1:594165/1‑62 (MQ=255) gACTCCACCGGACGCAGGGTGTGGGCAATCACTTTGTCGATCTCCGCCTGATTATTGATATc  >  1:190665/1‑62 (MQ=255) gACTCCACCGGACGCAGGGTGTGGGCAATCACTTTGTCGATCTCCGCCTGATTATTGATATc  >  1:258599/1‑62 (MQ=255) gACTCCACCGGACGCAGGGTGTGGGCAATCACTTTGTCGATCTCCGCCTGATTATTGATATc  >  1:368482/1‑62 (MQ=255) gACTCCACCGGACGCAGGGTGTGGGCAATCACTTTGTCGATCTCCGCCTGATTATTGATATc  >  1:449386/1‑62 (MQ=255) gACTCCACCGGACGCAGGGTGTGGGCAATCACTTTGTCGATCTCCGCCTGATTATTGATATc  >  1:505/1‑62 (MQ=255) gACTCCACCGGACGCAGGGTGTGGGCAATCACTTTGTCGATCTCCGCCTGATTATTGATATc  >  1:538271/1‑62 (MQ=255) gACTCCACCGGACGCAGGGTGTGGGCAATCACTTTGTCGATCTCCGCCTGATTATTGATATc  >  1:549777/1‑62 (MQ=255) gACTCCACCGGACGCAGGGTGTGGGCAATCACTTTGTCGATCTCCGCCTGATTATTGATATc  >  1:557602/1‑62 (MQ=255) gACTCCACCGGACGCAGGGTGTGGGCAATCACTTTGTCGATCTCCGCCTGATTATTGATATc  >  1:1629526/1‑62 (MQ=255) gACTCCACCGGACGCAGGGTGTGGGCAATCACTTTGTCGATCTCCGCCTGATTATTGATATc  >  1:606617/1‑62 (MQ=255) gACTCCACCGGACGCAGGGTGTGGGCAATCACTTTGTCGATCTCCGCCTGATTATTGATATc  >  1:722464/1‑62 (MQ=255) gACTCCACCGGACGCAGGGTGTGGGCAATCACTTTGTCGATCTCCGCCTGATTATTGATATc  >  1:727940/1‑62 (MQ=255) gACTCCACCGGACGCAGGGTGTGGGCAATCACTTTGTCGATCTCCGCCTGATTATTGATATc  >  1:738732/1‑62 (MQ=255) gACTCCACCGGACGCAGGGTGTGGGCAATCACTTTGTCGATCTCCGCCTGATTATTGATATc  >  1:84277/1‑62 (MQ=255) gACTCCACCGGACGCAGGGTGTGGGCAATCACTTTGTCGATCTCCGCCTGATTATTGATATc  >  1:862620/1‑62 (MQ=255) gACTCCACCGGACGCAGGGTGTGGGCAATCACTTTGTCGATCTCCGCCTGATTATTGATATc  >  1:887751/1‑62 (MQ=255) gACTCCACCGGACGCAGGGTGTGGGCAATCACTTTGTCGATCTCCGCCTGATTATTGATATc  >  1:897158/1‑62 (MQ=255) gACTCCACCGGACGCAGGGTGTGGGCAATCACTTTGTCGATCTCCGCCTGATTATTGATATc  >  1:906951/1‑62 (MQ=255) gACTCCACCGGACGCAGGGTGTGGGCAATCACTTTGTCGATCTCCGCCTGATTATTGATATc  >  1:952704/1‑62 (MQ=255) gACTCCACCGGACGCAGGGTGTGGGCAATCACTTTGTCGATCTCCGCCTGATTATTGATATc  >  1:139993/1‑62 (MQ=255) gACTCCACCGGACGCAGGGTGTGGGCAATCACTTTGTCGATCTCCGCCTGATTATTGATATc  >  1:1092995/1‑62 (MQ=255) gACTCCACCGGACGCAGGGTGTGGGCAATCACTTTGTCGATCTCCGCCTGATTATTGATATc  >  1:1152768/1‑62 (MQ=255) gACTCCACCGGACGCAGGGTGTGGGCAATCACTTTGTCGATCTCCGCCTGATTATTGATATc  >  1:1186428/1‑62 (MQ=255) gACTCCACCGGACGCAGGGTGTGGGCAATCACTTTGTCGATCTCCGCCTGATTATTGATATc  >  1:123981/1‑62 (MQ=255) gACTCCACCGGACGCAGGGTGTGGGCAATCACTTTGTCGATCTCCGCCTGATTATTGATATc  >  1:1259806/1‑62 (MQ=255) gACTCCACCGGACGCAGGGTGTGGGCAATCACTTTGTCGATCTCCGCCTGATTATTGATATc  >  1:1291382/1‑62 (MQ=255) gACTCCACCGGACGCAGGGTGTGGGCAATCACTTTGTCGATCTCCGCCTGATTATTGATATc  >  1:1323517/1‑62 (MQ=255) gACTCCACCGGACGCAGGGTGTGGGCAATCACTTTGTCGATCTCCGCCTGATTATTGATATc  >  1:1349139/1‑62 (MQ=255) gACTCCACCGGACGCAGGGTGTGGGCAATCACTTTGTCGATCTCCGCCTGATTATTGATATc  >  1:1386574/1‑62 (MQ=255) gACTCCACCGGACGCAGGGTGTGGGCAATCACTTTGTCGATCTCCGCCTGATTATTGATATc  >  1:169242/1‑62 (MQ=255) gACTCCACCGGACGCAGGGTGTGGGCAATCACTTTGTCGATCTCCGCCTGATTATTGATATc  >  1:1400633/1‑62 (MQ=255) gACTCCACCGGACGCAGGGTGTGGGCAATCACTTTGTCGATCTCCGCCTGATTATTGATATc  >  1:1457097/1‑62 (MQ=255) gACTCCACCGGACGCAGGGTGTGGGCAATCACTTTGTCGATCTCCGCCTGATTATTGATATc  >  1:1473546/1‑62 (MQ=255) gACTCCACCGGACGCAGGGTGTGGGCAATCACTTTGTCGATCTCCGCCTGATTATTGATATc  >  1:1512595/1‑62 (MQ=255) gACTCCACCGGACGCAGGGTGTGGGCAATCACTTTGTCGATCTCCGCCTGATTATTGATATc  >  1:1558205/1‑62 (MQ=255) gACTCCACCGGACGCAGGGTGTGGGCAATCACTTTGTCGATCTCCGCCTGATTATTGATATc  >  1:1562090/1‑62 (MQ=255) gACTCCACCGGACGCAGGGTGTGGGCAATCACTTTGTCGATCTCCGCCTGATTATTGATATc  >  1:156798/1‑62 (MQ=255) gACTCCACCGGACGCAGGGTGTGGGCAATCACTTTGTCGATCTCCGCCTGATTATTGATATc  >  1:1577493/1‑62 (MQ=255) gACTCCACCGGACGCAGGGTGTGGGCAATCACTTTGTCGATCTCCGCCTGATTATTGATATc  >  1:1609582/1‑62 (MQ=255) gACTCCACCGGACGCAGGGTGTGGGCAATCACTTTGTCGATCTCCGCCTGATTATTGATATc  >  1:1054559/1‑62 (MQ=255) gACTCCACCGGACGCAGGGTGTGGGCAATCACTTTGTCGATCTACGCCTGATTATTGatata  >  1:879838/1‑61 (MQ=255) gACTCCACCGGACGCAGGGTGTGGGCAATCACTATGTCGATCTCCGCCTGAATATTGATATc  >  1:8691/1‑62 (MQ=255) |                                                              GACTCCACCGGACGCAGGGTGTGGGCAATCACTTTGTCGATCTCCGCCTGATTATTGATATC  >  W3110S.gb/631691‑631752

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑