Missing coverage evidence...
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*	*	÷	W3110S.gb	638386	639195	810	31 [0]	[0] 47	[ahpC]–[ahpF]	[ahpC],[ahpF]

AGGGGCCACGTTTTGCAGGCTCCCCGCTGGGCCACGAGTTCACCTCGCTGG  >  W3110S.gb/639196‑639246 |                                                   aGGGGCCCCGTTTTGCAGGCTCCCCGCTGGGCCACGAGTTCCCCTCGCt    >  1:154472/1‑49 (MQ=255) aGGGGCCACGTTTTGCAGGCTGCCCGCTGGGCCACGAGTTCACCTCGCTgg  >  1:1588612/1‑51 (MQ=255) aGGGGCCACGTTTTGCAGGCTCCCCGCTGGGCCCCGAGTTCACCTCGCTgg  >  1:745778/1‑51 (MQ=255) aGGGGCCACGTTTTGCAGGCTCCCCGCTGGGCCACGAg               >  1:129713/1‑38 (MQ=255) aGGGGCCACGTTTTGCAGGCTCCCCGCTGGGCCACGAGTTCACCt        >  1:19865/1‑45 (MQ=255) aGGGGCCACGTTTTGCAGGCTCCCCGCTGGGCCACGAGTTCACCTCGCTgg  >  1:541382/1‑51 (MQ=255) aGGGGCCACGTTTTGCAGGCTCCCCGCTGGGCCACGAGTTCACCTCGCTgg  >  1:304494/1‑51 (MQ=255) aGGGGCCACGTTTTGCAGGCTCCCCGCTGGGCCACGAGTTCACCTCGCTgg  >  1:369067/1‑51 (MQ=255) aGGGGCCACGTTTTGCAGGCTCCCCGCTGGGCCACGAGTTCACCTCGCTgg  >  1:372108/1‑51 (MQ=255) aGGGGCCACGTTTTGCAGGCTCCCCGCTGGGCCACGAGTTCACCTCGCTgg  >  1:388805/1‑51 (MQ=255) aGGGGCCACGTTTTGCAGGCTCCCCGCTGGGCCACGAGTTCACCTCGCTgg  >  1:393387/1‑51 (MQ=255) aGGGGCCACGTTTTGCAGGCTCCCCGCTGGGCCACGAGTTCACCTCGCTgg  >  1:436533/1‑51 (MQ=255) aGGGGCCACGTTTTGCAGGCTCCCCGCTGGGCCACGAGTTCACCTCGCTgg  >  1:444573/1‑51 (MQ=255) aGGGGCCACGTTTTGCAGGCTCCCCGCTGGGCCACGAGTTCACCTCGCTgg  >  1:461036/1‑51 (MQ=255) aGGGGCCACGTTTTGCAGGCTCCCCGCTGGGCCACGAGTTCACCTCGCTgg  >  1:501432/1‑51 (MQ=255) aGGGGCCACGTTTTGCAGGCTCCCCGCTGGGCCACGAGTTCACCTCGCTgg  >  1:27211/1‑51 (MQ=255) aGGGGCCACGTTTTGCAGGCTCCCCGCTGGGCCACGAGTTCACCTCGCTgg  >  1:565590/1‑51 (MQ=255) aGGGGCCACGTTTTGCAGGCTCCCCGCTGGGCCACGAGTTCACCTCGCTgg  >  1:588099/1‑51 (MQ=255) aGGGGCCACGTTTTGCAGGCTCCCCGCTGGGCCACGAGTTCACCTCGCTgg  >  1:637798/1‑51 (MQ=255) aGGGGCCACGTTTTGCAGGCTCCCCGCTGGGCCACGAGTTCACCTCGCTgg  >  1:654246/1‑51 (MQ=255) aGGGGCCACGTTTTGCAGGCTCCCCGCTGGGCCACGAGTTCACCTCGCTgg  >  1:705165/1‑51 (MQ=255) aGGGGCCACGTTTTGCAGGCTCCCCGCTGGGCCACGAGTTCACCTCGCTgg  >  1:764553/1‑51 (MQ=255) aGGGGCCACGTTTTGCAGGCTCCCCGCTGGGCCACGAGTTCACCTCGCTgg  >  1:778366/1‑51 (MQ=255) aGGGGCCACGTTTTGCAGGCTCCCCGCTGGGCCACGAGTTCACCTCGCTgg  >  1:8566/1‑51 (MQ=255) aGGGGCCACGTTTTGCAGGCTCCCCGCTGGGCCACGAGTTCACCTCGCTgg  >  1:86390/1‑51 (MQ=255) aGGGGCCACGTTTTGCAGGCTCCCCGCTGGGCCACGAGTTCACCTCGCTgg  >  1:871617/1‑51 (MQ=255) aGGGGCCACGTTTTGCAGGCTCCCCGCTGGGCCACGAGTTCACCTCGCTgg  >  1:1508255/1‑51 (MQ=255) aGGGGCCACGTTTTGCAGGCTCCCCGCTGGGCCACGAGTTCACCTCGCTgg  >  1:1037864/1‑51 (MQ=255) aGGGGCCACGTTTTGCAGGCTCCCCGCTGGGCCACGAGTTCACCTCGCTgg  >  1:1124997/1‑51 (MQ=255) aGGGGCCACGTTTTGCAGGCTCCCCGCTGGGCCACGAGTTCACCTCGCTgg  >  1:1198986/1‑51 (MQ=255) aGGGGCCACGTTTTGCAGGCTCCCCGCTGGGCCACGAGTTCACCTCGCTgg  >  1:1200088/1‑51 (MQ=255) aGGGGCCACGTTTTGCAGGCTCCCCGCTGGGCCACGAGTTCACCTCGCTgg  >  1:1201784/1‑51 (MQ=255) aGGGGCCACGTTTTGCAGGCTCCCCGCTGGGCCACGAGTTCACCTCGCTgg  >  1:1308988/1‑51 (MQ=255) aGGGGCCACGTTTTGCAGGCTCCCCGCTGGGCCACGAGTTCACCTCGCTgg  >  1:1359168/1‑51 (MQ=255) aGGGGCCACGTTTTGCAGGCTCCCCGCTGGGCCACGAGTTCACCTCGCTgg  >  1:1364660/1‑51 (MQ=255) aGGGGCCACGTTTTGCAGGCTCCCCGCTGGGCCACGAGTTCACCTCGCTgg  >  1:1428289/1‑51 (MQ=255) aGGGGCCACGTTTTGCAGGCTCCCCGCTGGGCCACGAGTTCACCTCGCTgg  >  1:1491431/1‑51 (MQ=255) aGGGGCCACGTTTTGCAGGCTCCCCGCTGGGCCACGAGTTCACCTCGCTgg  >  1:284304/1‑51 (MQ=255) aGGGGCCACGTTTTGCAGGCTCCCCGCTGGGCCACGAGTTCACCTCGCTgg  >  1:1534063/1‑51 (MQ=255) aGGGGCCACGTTTTGCAGGCTCCCCGCTGGGCCACGAGTTCACCTCGCTgg  >  1:1535795/1‑51 (MQ=255) aGGGGCCACGTTTTGCAGGCTCCCCGCTGGGCCACGAGTTCACCTCGCTgg  >  1:1599484/1‑51 (MQ=255) aGGGGCCACGTTTTGCAGGCTCCCCGCTGGGCCACGAGTTCACCTCGCTgg  >  1:1600998/1‑51 (MQ=255) aGGGGCCACGTTTTGCAGGCTCCCCGCTGGGCCACGAGTTCACCTCGCTgg  >  1:1606431/1‑51 (MQ=255) aGGGGCCACGTTTTGCAGGCTCCCCGCTGGGCCACGAGTTCACCTCGCTgg  >  1:1638939/1‑51 (MQ=255) aGGGGCCACGTTTTGCAGGCTCCCCGCTGGGCCACGAGTTCACCTCGCTgg  >  1:228255/1‑51 (MQ=255) aGGGGCCACGTTTTGCAGGCTCCCCGCTGGGCCACGAGTTCACCTCGCTgg  >  1:102136/1‑51 (MQ=255) aGGGGCCACGTTTTGCAGGCTCCCCGCTGGGCCACGAGTTCACCTCGCTgg  >  1:273193/1‑51 (MQ=255) |                                                   AGGGGCCACGTTTTGCAGGCTCCCCGCTGGGCCACGAGTTCACCTCGCTGG  >  W3110S.gb/639196‑639246

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑