Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	683325	683684	360	33 [0]	[0] 64	hscC	Hsp70 family chaperone Hsc62, binds to RpoD and inhibits transcription

CTAATTATGGATGGTGTTAAATATTCACCGAACTTATTTGGAATTAATTGCGCGGCACC  >  W3110S.gb/683685‑683743 |                                                           cTAATTATGTATGGTGTTAAATATTCACCGAACTTATTTGGAATTAATTGCGCGGCAcc  <  1:1486299/59‑1 (MQ=255) cTAATTATGGATGGTGTTAAATATTCACCGAACTTATTTGGAATTAATTGCGCGGCAcc  <  1:558001/59‑1 (MQ=255) cTAATTATGGATGGTGTTAAATATTCACCGAACTTATTTGGAATTAATTGCGCGGCAcc  <  1:670795/59‑1 (MQ=255) cTAATTATGGATGGTGTTAAATATTCACCGAACTTATTTGGAATTAATTGCGCGGCAcc  <  1:635852/59‑1 (MQ=255) cTAATTATGGATGGTGTTAAATATTCACCGAACTTATTTGGAATTAATTGCGCGGCAcc  <  1:612675/59‑1 (MQ=255) cTAATTATGGATGGTGTTAAATATTCACCGAACTTATTTGGAATTAATTGCGCGGCAcc  <  1:592210/59‑1 (MQ=255) cTAATTATGGATGGTGTTAAATATTCACCGAACTTATTTGGAATTAATTGCGCGGCAcc  <  1:585806/59‑1 (MQ=255) cTAATTATGGATGGTGTTAAATATTCACCGAACTTATTTGGAATTAATTGCGCGGCAcc  <  1:58439/59‑1 (MQ=255) cTAATTATGGATGGTGTTAAATATTCACCGAACTTATTTGGAATTAATTGCGCGGCAcc  <  1:567017/59‑1 (MQ=255) cTAATTATGGATGGTGTTAAATATTCACCGAACTTATTTGGAATTAATTGCGCGGCAcc  <  1:732022/59‑1 (MQ=255) cTAATTATGGATGGTGTTAAATATTCACCGAACTTATTTGGAATTAATTGCGCGGCAcc  <  1:557471/59‑1 (MQ=255) cTAATTATGGATGGTGTTAAATATTCACCGAACTTATTTGGAATTAATTGCGCGGCAcc  <  1:556510/59‑1 (MQ=255) cTAATTATGGATGGTGTTAAATATTCACCGAACTTATTTGGAATTAATTGCGCGGCAcc  <  1:553724/59‑1 (MQ=255) cTAATTATGGATGGTGTTAAATATTCACCGAACTTATTTGGAATTAATTGCGCGGCAcc  <  1:536201/59‑1 (MQ=255) cTAATTATGGATGGTGTTAAATATTCACCGAACTTATTTGGAATTAATTGCGCGGCAcc  <  1:529077/59‑1 (MQ=255) cTAATTATGGATGGTGTTAAATATTCACCGAACTTATTTGGAATTAATTGCGCGGCAcc  <  1:513624/59‑1 (MQ=255) cTAATTATGGATGGTGTTAAATATTCACCGAACTTATTTGGAATTAATTGCGCGGCAcc  <  1:502391/59‑1 (MQ=255) cTAATTATGGATGGTGTTAAATATTCACCGAACTTATTTGGAATTAATTGCGCGGCAcc  <  1:474388/59‑1 (MQ=255) cTAATTATGGATGGTGTTAAATATTCACCGAACTTATTTGGAATTAATTGCGCGGCAcc  <  1:738217/59‑1 (MQ=255) cTAATTATGGATGGTGTTAAATATTCACCGAACTTATTTGGAATTAATTGCGCGGCAcc  <  1:746097/59‑1 (MQ=255) cTAATTATGGATGGTGTTAAATATTCACCGAACTTATTTGGAATTAATTGCGCGGCAcc  <  1:750243/59‑1 (MQ=255) cTAATTATGGATGGTGTTAAATATTCACCGAACTTATTTGGAATTAATTGCGCGGCAcc  <  1:759499/59‑1 (MQ=255) cTAATTATGGATGGTGTTAAATATTCACCGAACTTATTTGGAATTAATTGCGCGGCAcc  <  1:772367/59‑1 (MQ=255) cTAATTATGGATGGTGTTAAATATTCACCGAACTTATTTGGAATTAATTGCGCGGCAcc  <  1:801602/59‑1 (MQ=255) cTAATTATGGATGGTGTTAAATATTCACCGAACTTATTTGGAATTAATTGCGCGGCAcc  <  1:816288/59‑1 (MQ=255) cTAATTATGGATGGTGTTAAATATTCACCGAACTTATTTGGAATTAATTGCGCGGCAcc  <  1:830430/59‑1 (MQ=255) cTAATTATGGATGGTGTTAAATATTCACCGAACTTATTTGGAATTAATTGCGCGGCAcc  <  1:839961/59‑1 (MQ=255) cTAATTATGGATGGTGTTAAATATTCACCGAACTTATTTGGAATTAATTGCGCGGCAcc  <  1:859507/59‑1 (MQ=255) cTAATTATGGATGGTGTTAAATATTCACCGAACTTATTTGGAATTAATTGCGCGGCAcc  <  1:869481/59‑1 (MQ=255) cTAATTATGGATGGTGTTAAATATTCACCGAACTTATTTGGAATTAATTGCGCGGCAcc  <  1:896022/59‑1 (MQ=255) cTAATTATGGATGGTGTTAAATATTCACCGAACTTATTTGGAATTAATTGCGCGGCAcc  <  1:937923/59‑1 (MQ=255) cTAATTATGGATGGTGTTAAATATTCACCGAACTTATTTGGAATTAATTGCGCGGCAcc  <  1:958094/59‑1 (MQ=255) cTAATTATGGATGGTGTTAAATATTCACCGAACTTATTTGGAATTAATTGCGCGGCAcc  <  1:972557/59‑1 (MQ=255) cTAATTATGGATGGTGTTAAATATTCACCGAACTTATTTGGAATTAATTGCGCGGCAcc  <  1:1361358/59‑1 (MQ=255) cTAATTATGGATGGTGTTAAATATTCACCGAACTTATTTGGAATTAATTGCGCGGCAcc  <  1:1024639/59‑1 (MQ=255) cTAATTATGGATGGTGTTAAATATTCACCGAACTTATTTGGAATTAATTGCGCGGCAcc  <  1:1030590/59‑1 (MQ=255) cTAATTATGGATGGTGTTAAATATTCACCGAACTTATTTGGAATTAATTGCGCGGCAcc  <  1:1091666/59‑1 (MQ=255) cTAATTATGGATGGTGTTAAATATTCACCGAACTTATTTGGAATTAATTGCGCGGCAcc  <  1:1103444/59‑1 (MQ=255) cTAATTATGGATGGTGTTAAATATTCACCGAACTTATTTGGAATTAATTGCGCGGCAcc  <  1:11148/59‑1 (MQ=255) cTAATTATGGATGGTGTTAAATATTCACCGAACTTATTTGGAATTAATTGCGCGGCAcc  <  1:1145333/59‑1 (MQ=255) cTAATTATGGATGGTGTTAAATATTCACCGAACTTATTTGGAATTAATTGCGCGGCAcc  <  1:1155350/59‑1 (MQ=255) cTAATTATGGATGGTGTTAAATATTCACCGAACTTATTTGGAATTAATTGCGCGGCAcc  <  1:1168353/59‑1 (MQ=255) cTAATTATGGATGGTGTTAAATATTCACCGAACTTATTTGGAATTAATTGCGCGGCAcc  <  1:1185593/59‑1 (MQ=255) cTAATTATGGATGGTGTTAAATATTCACCGAACTTATTTGGAATTAATTGCGCGGCAcc  <  1:1208749/59‑1 (MQ=255) cTAATTATGGATGGTGTTAAATATTCACCGAACTTATTTGGAATTAATTGCGCGGCAcc  <  1:125552/59‑1 (MQ=255) cTAATTATGGATGGTGTTAAATATTCACCGAACTTATTTGGAATTAATTGCGCGGCAcc  <  1:1310182/59‑1 (MQ=255) cTAATTATGGATGGTGTTAAATATTCACCGAACTTATTTGGAATTAATTGCGCGGCAcc  <  1:1346368/59‑1 (MQ=255) cTAATTATGGATGGTGTTAAATATTCACCGAACTTATTTGGAATTAATTGCGCGGCAcc  <  1:1356611/59‑1 (MQ=255) cTAATTATGGATGGTGTTAAATATTCACCGAACTTATTTGGAATTAATTGCGCGGCAcc  <  1:1360369/59‑1 (MQ=255) cTAATTATGGATGGTGTTAAATATTCACCGAACTTATTTGGAATTAATTGCGCGGCAcc  <  1:1021377/59‑1 (MQ=255) cTAATTATGGATGGTGTTAAATATTCACCGAACTTATTTGGAATTAATTGCGCGGCAcc  <  1:1484857/59‑1 (MQ=255) cTAATTATGGATGGTGTTAAATATTCACCGAACTTATTTGGAATTAATTGCGCGGCAcc  <  1:1597207/59‑1 (MQ=255) cTAATTATGGATGGTGTTAAATATTCACCGAACTTATTTGGAATTAATTGCGCGGCAcc  <  1:1599469/59‑1 (MQ=255) cTAATTATGGATGGTGTTAAATATTCACCGAACTTATTTGGAATTAATTGCGCGGCAcc  <  1:1638858/59‑1 (MQ=255) cTAATTATGGATGGTGTTAAATATTCACCGAACTTATTTGGAATTAATTGCGCGGCAcc  <  1:276440/59‑1 (MQ=255) cTAATTATGGATGGTGTTAAATATTCACCGAACTTATTTGGAATTAATTGCGCGGCAcc  <  1:298087/59‑1 (MQ=255) cTAATTATGGATGGTGTTAAATATTCACCGAACTTATTTGGAATTAATTGCGCGGCAcc  <  1:302667/59‑1 (MQ=255) cTAATTATGGATGGTGTTAAATATTCACCGAACTTATTTGGAATTAATTGCGCGGCAcc  <  1:355224/59‑1 (MQ=255) cTAATTATGGATGGTGTTAAATATTCACCGAACTTATTTGGAATTAATTGCGCGGCAcc  <  1:415541/59‑1 (MQ=255) cTAATTATGGATGGTGTTAAATATTCACCGAACTTATTTGGAATTAATTGCGCGGCAcc  <  1:418416/59‑1 (MQ=255) cTAATTATGGATGGTGTTAAATATTCACCGAACTTATTTGGAATTAATTGCGCGGCAcc  <  1:421875/59‑1 (MQ=255) cTAATTATGGATGGTGTTAAATATTCACCGAACTTATTTGGAATTAATTGCGCGGCAcc  <  1:436668/59‑1 (MQ=255) cTAATTATGGATGGTGTTAAATATTCACCGAACTTATTTGGAATTAATTGCGCGGCAcc  <  1:46685/59‑1 (MQ=255) cTAATTATGGATGGTGTTAAATATTCACCGAACTTATTTGGAATTAATTGCGCGGCAcc  <  1:470546/59‑1 (MQ=255) |                                                           CTAATTATGGATGGTGTTAAATATTCACCGAACTTATTTGGAATTAATTGCGCGGCACC  >  W3110S.gb/683685‑683743

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑