Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	964041	965068	1028	102 [0]	[0] 63	[rpsA]–[ycaI]	[rpsA],ihfB,[ycaI]

TCAGGTCTCGTGATGTATGGCGAATATCTTCCGCAAGCGGTTTGTGCTGGACAACAATGGTC  >  W3110S.gb/965069‑965130 |                                                              tCAGGTCTCGTGATGTATGGCGGATATCTTCCGCAAGCGGTTTGTGCTGGACAACAATGGTc  >  1:1221060/1‑62 (MQ=255) tCAGGTCTCGTGATGTATGGCGAATATCTTCCGCAAGCGGTTtgt                   >  1:1169389/1‑45 (MQ=255) tCAGGTCTCGTGATGTATGGCGAATATCTTCCGCAAGCGGTTTGTGCTGGGCAACAATGGTc  >  1:101377/1‑62 (MQ=255) tCAGGTCTCGTGATGTATGGCGAATATCTTCCGCAAGCGGTTTGTGCTGGACAACAAtt     >  1:342156/1‑58 (MQ=255) tCAGGTCTCGTGATGTATGGCGAATATCTTCCGCAAGCGGTTTGTGCTGGACAACAATGGt   >  1:1299535/1‑61 (MQ=255) tCAGGTCTCGTGATGTATGGCGAATATCTTCCGCAAGCGGTTTGTGCTGGACAACAATGGTc  >  1:555650/1‑62 (MQ=255) tCAGGTCTCGTGATGTATGGCGAATATCTTCCGCAAGCGGTTTGTGCTGGACAACAATGGTc  >  1:578083/1‑62 (MQ=255) tCAGGTCTCGTGATGTATGGCGAATATCTTCCGCAAGCGGTTTGTGCTGGACAACAATGGTc  >  1:550079/1‑62 (MQ=255) tCAGGTCTCGTGATGTATGGCGAATATCTTCCGCAAGCGGTTTGTGCTGGACAACAATGGTc  >  1:547264/1‑62 (MQ=255) tCAGGTCTCGTGATGTATGGCGAATATCTTCCGCAAGCGGTTTGTGCTGGACAACAATGGTc  >  1:542454/1‑62 (MQ=255) tCAGGTCTCGTGATGTATGGCGAATATCTTCCGCAAGCGGTTTGTGCTGGACAACAATGGTc  >  1:533313/1‑62 (MQ=255) tCAGGTCTCGTGATGTATGGCGAATATCTTCCGCAAGCGGTTTGTGCTGGACAACAATGGTc  >  1:528969/1‑62 (MQ=255) tCAGGTCTCGTGATGTATGGCGAATATCTTCCGCAAGCGGTTTGTGCTGGACAACAATGGTc  >  1:521539/1‑62 (MQ=255) tCAGGTCTCGTGATGTATGGCGAATATCTTCCGCAAGCGGTTTGTGCTGGACAACAATGGTc  >  1:441055/1‑62 (MQ=255) tCAGGTCTCGTGATGTATGGCGAATATCTTCCGCAAGCGGTTTGTGCTGGACAACAATGGTc  >  1:439159/1‑62 (MQ=255) tCAGGTCTCGTGATGTATGGCGAATATCTTCCGCAAGCGGTTTGTGCTGGACAACAATGGTc  >  1:434745/1‑62 (MQ=255) tCAGGTCTCGTGATGTATGGCGAATATCTTCCGCAAGCGGTTTGTGCTGGACAACAATGGTc  >  1:42638/1‑62 (MQ=255) tCAGGTCTCGTGATGTATGGCGAATATCTTCCGCAAGCGGTTTGTGCTGGACAACAATGGTc  >  1:4259/1‑62 (MQ=255) tCAGGTCTCGTGATGTATGGCGAATATCTTCCGCAAGCGGTTTGTGCTGGACAACAATGGTc  >  1:421185/1‑62 (MQ=255) tCAGGTCTCGTGATGTATGGCGAATATCTTCCGCAAGCGGTTTGTGCTGGACAACAATGGTc  >  1:566265/1‑62 (MQ=255) tCAGGTCTCGTGATGTATGGCGAATATCTTCCGCAAGCGGTTTGTGCTGGACAACAATGGTc  >  1:266307/1‑62 (MQ=255) tCAGGTCTCGTGATGTATGGCGAATATCTTCCGCAAGCGGTTTGTGCTGGACAACAATGGTc  >  1:578886/1‑62 (MQ=255) tCAGGTCTCGTGATGTATGGCGAATATCTTCCGCAAGCGGTTTGTGCTGGACAACAATGGTc  >  1:627367/1‑62 (MQ=255) tCAGGTCTCGTGATGTATGGCGAATATCTTCCGCAAGCGGTTTGTGCTGGACAACAATGGTc  >  1:63020/1‑62 (MQ=255) tCAGGTCTCGTGATGTATGGCGAATATCTTCCGCAAGCGGTTTGTGCTGGACAACAATGGTc  >  1:65307/1‑62 (MQ=255) tCAGGTCTCGTGATGTATGGCGAATATCTTCCGCAAGCGGTTTGTGCTGGACAACAATGGTc  >  1:706864/1‑62 (MQ=255) tCAGGTCTCGTGATGTATGGCGAATATCTTCCGCAAGCGGTTTGTGCTGGACAACAATGGTc  >  1:718638/1‑62 (MQ=255) tCAGGTCTCGTGATGTATGGCGAATATCTTCCGCAAGCGGTTTGTGCTGGACAACAATGGTc  >  1:799912/1‑62 (MQ=255) tCAGGTCTCGTGATGTATGGCGAATATCTTCCGCAAGCGGTTTGTGCTGGACAACAATGGTc  >  1:803423/1‑62 (MQ=255) tCAGGTCTCGTGATGTATGGCGAATATCTTCCGCAAGCGGTTTGTGCTGGACAACAATGGTc  >  1:814240/1‑62 (MQ=255) tCAGGTCTCGTGATGTATGGCGAATATCTTCCGCAAGCGGTTTGTGCTGGACAACAATGGTc  >  1:86849/1‑62 (MQ=255) tCAGGTCTCGTGATGTATGGCGAATATCTTCCGCAAGCGGTTTGTGCTGGACAACAATGGTc  >  1:887301/1‑62 (MQ=255) tCAGGTCTCGTGATGTATGGCGAATATCTTCCGCAAGCGGTTTGTGCTGGACAACAATGGTc  >  1:916335/1‑62 (MQ=255) tCAGGTCTCGTGATGTATGGCGAATATCTTCCGCAAGCGGTTTGTGCTGGACAACAATGGTc  >  1:976667/1‑62 (MQ=255) tCAGGTCTCGTGATGTATGGCGAATATCTTCCGCAAGCGGTTTGTGCTGGACAACAATGGTc  >  1:1422301/1‑62 (MQ=255) tCAGGTCTCGTGATGTATGGCGAATATCTTCCGCAAGCGGTTTGTGCTGGACAACAATGGTc  >  1:1023315/1‑62 (MQ=255) tCAGGTCTCGTGATGTATGGCGAATATCTTCCGCAAGCGGTTTGTGCTGGACAACAATGGTc  >  1:1049806/1‑62 (MQ=255) tCAGGTCTCGTGATGTATGGCGAATATCTTCCGCAAGCGGTTTGTGCTGGACAACAATGGTc  >  1:1056871/1‑62 (MQ=255) tCAGGTCTCGTGATGTATGGCGAATATCTTCCGCAAGCGGTTTGTGCTGGACAACAATGGTc  >  1:1056934/1‑62 (MQ=255) tCAGGTCTCGTGATGTATGGCGAATATCTTCCGCAAGCGGTTTGTGCTGGACAACAATGGTc  >  1:1057560/1‑62 (MQ=255) tCAGGTCTCGTGATGTATGGCGAATATCTTCCGCAAGCGGTTTGTGCTGGACAACAATGGTc  >  1:1075020/1‑62 (MQ=255) tCAGGTCTCGTGATGTATGGCGAATATCTTCCGCAAGCGGTTTGTGCTGGACAACAATGGTc  >  1:1082838/1‑62 (MQ=255) tCAGGTCTCGTGATGTATGGCGAATATCTTCCGCAAGCGGTTTGTGCTGGACAACAATGGTc  >  1:1172326/1‑62 (MQ=255) tCAGGTCTCGTGATGTATGGCGAATATCTTCCGCAAGCGGTTTGTGCTGGACAACAATGGTc  >  1:1229741/1‑62 (MQ=255) tCAGGTCTCGTGATGTATGGCGAATATCTTCCGCAAGCGGTTTGTGCTGGACAACAATGGTc  >  1:127099/1‑62 (MQ=255) tCAGGTCTCGTGATGTATGGCGAATATCTTCCGCAAGCGGTTTGTGCTGGACAACAATGGTc  >  1:1300807/1‑62 (MQ=255) tCAGGTCTCGTGATGTATGGCGAATATCTTCCGCAAGCGGTTTGTGCTGGACAACAATGGTc  >  1:1354576/1‑62 (MQ=255) tCAGGTCTCGTGATGTATGGCGAATATCTTCCGCAAGCGGTTTGTGCTGGACAACAATGGTc  >  1:1371933/1‑62 (MQ=255) tCAGGTCTCGTGATGTATGGCGAATATCTTCCGCAAGCGGTTTGTGCTGGACAACAATGGTc  >  1:1404374/1‑62 (MQ=255) tCAGGTCTCGTGATGTATGGCGAATATCTTCCGCAAGCGGTTTGTGCTGGACAACAATGGTc  >  1:375714/1‑62 (MQ=255) tCAGGTCTCGTGATGTATGGCGAATATCTTCCGCAAGCGGTTTGTGCTGGACAACAATGGTc  >  1:1437774/1‑62 (MQ=255) tCAGGTCTCGTGATGTATGGCGAATATCTTCCGCAAGCGGTTTGTGCTGGACAACAATGGTc  >  1:1444189/1‑62 (MQ=255) tCAGGTCTCGTGATGTATGGCGAATATCTTCCGCAAGCGGTTTGTGCTGGACAACAATGGTc  >  1:1459086/1‑62 (MQ=255) tCAGGTCTCGTGATGTATGGCGAATATCTTCCGCAAGCGGTTTGTGCTGGACAACAATGGTc  >  1:1528280/1‑62 (MQ=255) tCAGGTCTCGTGATGTATGGCGAATATCTTCCGCAAGCGGTTTGTGCTGGACAACAATGGTc  >  1:1571246/1‑62 (MQ=255) tCAGGTCTCGTGATGTATGGCGAATATCTTCCGCAAGCGGTTTGTGCTGGACAACAATGGTc  >  1:158990/1‑62 (MQ=255) tCAGGTCTCGTGATGTATGGCGAATATCTTCCGCAAGCGGTTTGTGCTGGACAACAATGGTc  >  1:1613805/1‑62 (MQ=255) tCAGGTCTCGTGATGTATGGCGAATATCTTCCGCAAGCGGTTTGTGCTGGACAACAATGGTc  >  1:1642971/1‑62 (MQ=255) tCAGGTCTCGTGATGTATGGCGAATATCTTCCGCAAGCGGTTTGTGCTGGACAACAATGGTc  >  1:224095/1‑62 (MQ=255) tCAGGTCTCGTGATGTATGGCGAATATCTTCCGCAAGCGGTTTGTGCTGGACAACAATGGTc  >  1:226257/1‑62 (MQ=255) tCAGGTCTCGTGATGTATGGCGAATATCTTCCGCAAGCGGTTTGTGCTGGACAACAATGGTc  >  1:230098/1‑62 (MQ=255) tCAGGTCTCGTGATGTATGGCGAATATCTTCCGCAAGCGGTTTGTGCTGGACAACAATGGTc  >  1:230977/1‑62 (MQ=255) tCAGGTCTCGTGATGTATGGCGAATATCTTCCGCAAGCGGTTTGTGCTGGACAACAATGGTc  >  1:32151/1‑62 (MQ=255) |                                                              TCAGGTCTCGTGATGTATGGCGAATATCTTCCGCAAGCGGTTTGTGCTGGACAACAATGGTC  >  W3110S.gb/965069‑965130

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑