Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1020106	1020671	566	21 [0]	[0] 90	[ompA]	[ompA]

AAAGTCTTGTATAAGGTATGTTTAATCTTTTTTGTCAGCGACAATTTACAGAAGAGA  >  W3110S.gb/1020672‑1020728 |                                                         aaaGTCTTGTATATGGTATGTTTAATCTTTTTTGTCAGCGACAATTTACagaagac   >  1:1594345/1‑55 (MQ=255) aaaGTCTTGTATAAGGTATGTTTAATCTTTTTTGt                        >  1:642252/1‑35 (MQ=255) aaaGTCTTGTATAAGGTATGTTTAATCTTTTTTGt                        >  1:536770/1‑35 (MQ=255) aaaGTCTTGTATAAGGTATGTTTAATCTTTTTTGTCAGCGACAAtt             >  1:1246532/1‑46 (MQ=255) aaaGTCTTGTATAAGGTATGTTTAATCTTTTTTGTCAGCGACAATTTACagaag     >  1:1634630/1‑54 (MQ=255) aaaGTCTTGTATAAGGTATGTTTAATCTTTTTTGTCAGCGACAATTTACAGAagag   >  1:645379/1‑56 (MQ=255) aaaGTCTTGTATAAGGTATGTTTAATCTTTTTTGTCAGCGACAATTTACAGAagag   >  1:416955/1‑56 (MQ=255) aaaGTCTTGTATAAGGTATGTTTAATCTTTTTTGTCAGCGACAATTTACAGAagag   >  1:1596117/1‑56 (MQ=255) aaaGTCTTGTATAAGGTATGTTTAATCTTTTTTGTCAGCGACAATTTACAGAAgaga  >  1:262305/1‑57 (MQ=255) aaaGTCTTGTATAAGGTATGTTTAATCTTTTTTGTCAGCGACAATTTACAGAAgaga  >  1:363018/1‑57 (MQ=255) aaaGTCTTGTATAAGGTATGTTTAATCTTTTTTGTCAGCGACAATTTACAGAAgaga  >  1:567096/1‑57 (MQ=255) aaaGTCTTGTATAAGGTATGTTTAATCTTTTTTGTCAGCGACAATTTACAGAAgaga  >  1:564414/1‑57 (MQ=255) aaaGTCTTGTATAAGGTATGTTTAATCTTTTTTGTCAGCGACAATTTACAGAAgaga  >  1:550247/1‑57 (MQ=255) aaaGTCTTGTATAAGGTATGTTTAATCTTTTTTGTCAGCGACAATTTACAGAAgaga  >  1:307890/1‑57 (MQ=255) aaaGTCTTGTATAAGGTATGTTTAATCTTTTTTGTCAGCGACAATTTACAGAAgaga  >  1:518514/1‑57 (MQ=255) aaaGTCTTGTATAAGGTATGTTTAATCTTTTTTGTCAGCGACAATTTACAGAAgaga  >  1:461357/1‑57 (MQ=255) aaaGTCTTGTATAAGGTATGTTTAATCTTTTTTGTCAGCGACAATTTACAGAAgaga  >  1:445122/1‑57 (MQ=255) aaaGTCTTGTATAAGGTATGTTTAATCTTTTTTGTCAGCGACAATTTACAGAAgaga  >  1:360019/1‑57 (MQ=255) aaaGTCTTGTATAAGGTATGTTTAATCTTTTTTGTCAGCGACAATTTACAGAAgaga  >  1:44135/1‑57 (MQ=255) aaaGTCTTGTATAAGGTATGTTTAATCTTTTTTGTCAGCGACAATTTACAGAAgaga  >  1:300367/1‑57 (MQ=255) aaaGTCTTGTATAAGGTATGTTTAATCTTTTTTGTCAGCGACAATTTACAGAAgaga  >  1:435865/1‑57 (MQ=255) aaaGTCTTGTATAAGGTATGTTTAATCTTTTTTGTCAGCGACAATTTACAGAAgaga  >  1:431814/1‑57 (MQ=255) aaaGTCTTGTATAAGGTATGTTTAATCTTTTTTGTCAGCGACAATTTACAGAAgaga  >  1:371709/1‑57 (MQ=255) aaaGTCTTGTATAAGGTATGTTTAATCTTTTTTGTCAGCGACAATTTACAGAAgaga  >  1:370570/1‑57 (MQ=255) aaaGTCTTGTATAAGGTATGTTTAATCTTTTTTGTCAGCGACAATTTACAGAAgaga  >  1:365382/1‑57 (MQ=255) aaaGTCTTGTATAAGGTATGTTTAATCTTTTTTGTCAGCGACAATTTACAGAAgaga  >  1:830193/1‑57 (MQ=255) aaaGTCTTGTATAAGGTATGTTTAATCTTTTTTGTCAGCGACAATTTACAGAAgaga  >  1:990258/1‑57 (MQ=255) aaaGTCTTGTATAAGGTATGTTTAATCTTTTTTGTCAGCGACAATTTACAGAAgaga  >  1:980524/1‑57 (MQ=255) aaaGTCTTGTATAAGGTATGTTTAATCTTTTTTGTCAGCGACAATTTACAGAAgaga  >  1:961399/1‑57 (MQ=255) aaaGTCTTGTATAAGGTATGTTTAATCTTTTTTGTCAGCGACAATTTACAGAAgaga  >  1:942652/1‑57 (MQ=255) aaaGTCTTGTATAAGGTATGTTTAATCTTTTTTGTCAGCGACAATTTACAGAAgaga  >  1:92673/1‑57 (MQ=255) aaaGTCTTGTATAAGGTATGTTTAATCTTTTTTGTCAGCGACAATTTACAGAAgaga  >  1:924798/1‑57 (MQ=255) aaaGTCTTGTATAAGGTATGTTTAATCTTTTTTGTCAGCGACAATTTACAGAAgaga  >  1:908829/1‑57 (MQ=255) aaaGTCTTGTATAAGGTATGTTTAATCTTTTTTGTCAGCGACAATTTACAGAAgaga  >  1:894856/1‑57 (MQ=255) aaaGTCTTGTATAAGGTATGTTTAATCTTTTTTGTCAGCGACAATTTACAGAAgaga  >  1:879244/1‑57 (MQ=255) aaaGTCTTGTATAAGGTATGTTTAATCTTTTTTGTCAGCGACAATTTACAGAAgaga  >  1:868226/1‑57 (MQ=255) aaaGTCTTGTATAAGGTATGTTTAATCTTTTTTGTCAGCGACAATTTACAGAAgaga  >  1:586466/1‑57 (MQ=255) aaaGTCTTGTATAAGGTATGTTTAATCTTTTTTGTCAGCGACAATTTACAGAAgaga  >  1:809260/1‑57 (MQ=255) aaaGTCTTGTATAAGGTATGTTTAATCTTTTTTGTCAGCGACAATTTACAGAAgaga  >  1:771015/1‑57 (MQ=255) aaaGTCTTGTATAAGGTATGTTTAATCTTTTTTGTCAGCGACAATTTACAGAAgaga  >  1:764347/1‑57 (MQ=255) aaaGTCTTGTATAAGGTATGTTTAATCTTTTTTGTCAGCGACAATTTACAGAAgaga  >  1:755682/1‑57 (MQ=255) aaaGTCTTGTATAAGGTATGTTTAATCTTTTTTGTCAGCGACAATTTACAGAAgaga  >  1:750236/1‑57 (MQ=255) aaaGTCTTGTATAAGGTATGTTTAATCTTTTTTGTCAGCGACAATTTACAGAAgaga  >  1:739594/1‑57 (MQ=255) aaaGTCTTGTATAAGGTATGTTTAATCTTTTTTGTCAGCGACAATTTACAGAAgaga  >  1:733490/1‑57 (MQ=255) aaaGTCTTGTATAAGGTATGTTTAATCTTTTTTGTCAGCGACAATTTACAGAAgaga  >  1:723731/1‑57 (MQ=255) aaaGTCTTGTATAAGGTATGTTTAATCTTTTTTGTCAGCGACAATTTACAGAAgaga  >  1:717334/1‑57 (MQ=255) aaaGTCTTGTATAAGGTATGTTTAATCTTTTTTGTCAGCGACAATTTACAGAAgaga  >  1:646620/1‑57 (MQ=255) aaaGTCTTGTATAAGGTATGTTTAATCTTTTTTGTCAGCGACAATTTACAGAAgaga  >  1:1215263/1‑57 (MQ=255) aaaGTCTTGTATAAGGTATGTTTAATCTTTTTTGTCAGCGACAATTTACAGAAgaga  >  1:1393666/1‑57 (MQ=255) aaaGTCTTGTATAAGGTATGTTTAATCTTTTTTGTCAGCGACAATTTACAGAAgaga  >  1:1392136/1‑57 (MQ=255) aaaGTCTTGTATAAGGTATGTTTAATCTTTTTTGTCAGCGACAATTTACAGAAgaga  >  1:1321889/1‑57 (MQ=255) aaaGTCTTGTATAAGGTATGTTTAATCTTTTTTGTCAGCGACAATTTACAGAAgaga  >  1:1304358/1‑57 (MQ=255) aaaGTCTTGTATAAGGTATGTTTAATCTTTTTTGTCAGCGACAATTTACAGAAgaga  >  1:1300724/1‑57 (MQ=255) aaaGTCTTGTATAAGGTATGTTTAATCTTTTTTGTCAGCGACAATTTACAGAAgaga  >  1:1300067/1‑57 (MQ=255) aaaGTCTTGTATAAGGTATGTTTAATCTTTTTTGTCAGCGACAATTTACAGAAgaga  >  1:1285682/1‑57 (MQ=255) aaaGTCTTGTATAAGGTATGTTTAATCTTTTTTGTCAGCGACAATTTACAGAAgaga  >  1:1285526/1‑57 (MQ=255) aaaGTCTTGTATAAGGTATGTTTAATCTTTTTTGTCAGCGACAATTTACAGAAgaga  >  1:1269198/1‑57 (MQ=255) aaaGTCTTGTATAAGGTATGTTTAATCTTTTTTGTCAGCGACAATTTACAGAAgaga  >  1:126440/1‑57 (MQ=255) aaaGTCTTGTATAAGGTATGTTTAATCTTTTTTGTCAGCGACAATTTACAGAAgaga  >  1:1401583/1‑57 (MQ=255) aaaGTCTTGTATAAGGTATGTTTAATCTTTTTTGTCAGCGACAATTTACAGAAgaga  >  1:1193239/1‑57 (MQ=255) aaaGTCTTGTATAAGGTATGTTTAATCTTTTTTGTCAGCGACAATTTACAGAAgaga  >  1:1192241/1‑57 (MQ=255) aaaGTCTTGTATAAGGTATGTTTAATCTTTTTTGTCAGCGACAATTTACAGAAgaga  >  1:1188288/1‑57 (MQ=255) aaaGTCTTGTATAAGGTATGTTTAATCTTTTTTGTCAGCGACAATTTACAGAAgaga  >  1:1174924/1‑57 (MQ=255) aaaGTCTTGTATAAGGTATGTTTAATCTTTTTTGTCAGCGACAATTTACAGAAgaga  >  1:1159117/1‑57 (MQ=255) aaaGTCTTGTATAAGGTATGTTTAATCTTTTTTGTCAGCGACAATTTACAGAAgaga  >  1:1127629/1‑57 (MQ=255) aaaGTCTTGTATAAGGTATGTTTAATCTTTTTTGTCAGCGACAATTTACAGAAgaga  >  1:1081820/1‑57 (MQ=255) aaaGTCTTGTATAAGGTATGTTTAATCTTTTTTGTCAGCGACAATTTACAGAAgaga  >  1:106669/1‑57 (MQ=255) aaaGTCTTGTATAAGGTATGTTTAATCTTTTTTGTCAGCGACAATTTACAGAAgaga  >  1:1060228/1‑57 (MQ=255) aaaGTCTTGTATAAGGTATGTTTAATCTTTTTTGTCAGCGACAATTTACAGAAgaga  >  1:1043728/1‑57 (MQ=255) aaaGTCTTGTATAAGGTATGTTTAATCTTTTTTGTCAGCGACAATTTACAGAAgaga  >  1:1601190/1‑57 (MQ=255) aaaGTCTTGTATAAGGTATGTTTAATCTTTTTTGTCAGCGACAATTTACAGAAgaga  >  1:268416/1‑57 (MQ=255) aaaGTCTTGTATAAGGTATGTTTAATCTTTTTTGTCAGCGACAATTTACAGAAgaga  >  1:1016253/1‑57 (MQ=255) aaaGTCTTGTATAAGGTATGTTTAATCTTTTTTGTCAGCGACAATTTACAGAAgaga  >  1:257396/1‑57 (MQ=255) aaaGTCTTGTATAAGGTATGTTTAATCTTTTTTGTCAGCGACAATTTACAGAAgaga  >  1:235543/1‑57 (MQ=255) aaaGTCTTGTATAAGGTATGTTTAATCTTTTTTGTCAGCGACAATTTACAGAAgaga  >  1:22873/1‑57 (MQ=255) aaaGTCTTGTATAAGGTATGTTTAATCTTTTTTGTCAGCGACAATTTACAGAAgaga  >  1:223885/1‑57 (MQ=255) aaaGTCTTGTATAAGGTATGTTTAATCTTTTTTGTCAGCGACAATTTACAGAAgaga  >  1:218594/1‑57 (MQ=255) aaaGTCTTGTATAAGGTATGTTTAATCTTTTTTGTCAGCGACAATTTACAGAAgaga  >  1:199623/1‑57 (MQ=255) aaaGTCTTGTATAAGGTATGTTTAATCTTTTTTGTCAGCGACAATTTACAGAAgaga  >  1:175804/1‑57 (MQ=255) aaaGTCTTGTATAAGGTATGTTTAATCTTTTTTGTCAGCGACAATTTACAGAAgaga  >  1:1618829/1‑57 (MQ=255) aaaGTCTTGTATAAGGTATGTTTAATCTTTTTTGTCAGCGACAATTTACAGAAgaga  >  1:274997/1‑57 (MQ=255) aaaGTCTTGTATAAGGTATGTTTAATCTTTTTTGTCAGCGACAATTTACAGAAgaga  >  1:1557917/1‑57 (MQ=255) aaaGTCTTGTATAAGGTATGTTTAATCTTTTTTGTCAGCGACAATTTACAGAAgaga  >  1:155302/1‑57 (MQ=255) aaaGTCTTGTATAAGGTATGTTTAATCTTTTTTGTCAGCGACAATTTACAGAAgaga  >  1:1522850/1‑57 (MQ=255) aaaGTCTTGTATAAGGTATGTTTAATCTTTTTTGTCAGCGACAATTTACAGAAgaga  >  1:1515874/1‑57 (MQ=255) aaaGTCTTGTATAAGGTATGTTTAATCTTTTTTGTCAGCGACAATTTACAGAAgaga  >  1:1503939/1‑57 (MQ=255) aaaGTCTTGTATAAGGTATGTTTAATCTTTTTTGTCAGCGACAATTTACAGAAgaga  >  1:1484488/1‑57 (MQ=255) aaaGTCTTGTATAAGGTATGTTTAATCTTTTTTGTCAGCGACAATTTACAGAAgaga  >  1:1450749/1‑57 (MQ=255) aaaGTCTTGTATAAGGTATGTTTAATCTTTTTTGTCAGCGACAATTTACAGAAgaga  >  1:1445927/1‑57 (MQ=255) aaaGTCTTGTATAAGGTATGTTTAATCTTTTTTGTCAGCGACAATTTACAGAAgaga  >  1:1422159/1‑57 (MQ=255) |                                                         AAAGTCTTGTATAAGGTATGTTTAATCTTTTTTGTCAGCGACAATTTACAGAAGAGA  >  W3110S.gb/1020672‑1020728

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑