Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1031379	1031423	45	37 [0]	[0] 57	yccA	inner membrane protein

CATCAGCATACCGCCGAGGAACGACATATCTTTGCGGGTGGTCAGCACATATGCAGAGCAGC  >  W3110S.gb/1031424‑1031485 |                                                              cATCAGCATACCGCCGAGGAACGACATATCTTTGCGGGTGTTCAGCACATATGCAGagcagc  <  1:990624/62‑1 (MQ=255) cATCAGCATACCGCCGAGGAACGACATATCTTTGCGGGTGGTCAGCACATATGCAGagtagc  <  1:526525/62‑1 (MQ=255) cATCAGCATACCGCCGAGGAACGACATATCTTTGCGGGTGGTCAGCACATATGCAGagcagc  <  1:1629146/62‑1 (MQ=255) cATCAGCATACCGCCGAGGAACGACATATCTTTGCGGGTGGTCAGCACATATGCAGagcagc  <  1:1576541/62‑1 (MQ=255) cATCAGCATACCGCCGAGGAACGACATATCTTTGCGGGTGGTCAGCACATATGCAGagcagc  <  1:171315/62‑1 (MQ=255) cATCAGCATACCGCCGAGGAACGACATATCTTTGCGGGTGGTCAGCACATATGCAGagcagc  <  1:310300/62‑1 (MQ=255) cATCAGCATACCGCCGAGGAACGACATATCTTTGCGGGTGGTCAGCACATATGCAGagcagc  <  1:317794/62‑1 (MQ=255) cATCAGCATACCGCCGAGGAACGACATATCTTTGCGGGTGGTCAGCACATATGCAGagcagc  <  1:340867/62‑1 (MQ=255) cATCAGCATACCGCCGAGGAACGACATATCTTTGCGGGTGGTCAGCACATATGCAGagcagc  <  1:375850/62‑1 (MQ=255) cATCAGCATACCGCCGAGGAACGACATATCTTTGCGGGTGGTCAGCACATATGCAGagcagc  <  1:408652/62‑1 (MQ=255) cATCAGCATACCGCCGAGGAACGACATATCTTTGCGGGTGGTCAGCACATATGCAGagcagc  <  1:446358/62‑1 (MQ=255) cATCAGCATACCGCCGAGGAACGACATATCTTTGCGGGTGGTCAGCACATATGCAGagcagc  <  1:482066/62‑1 (MQ=255) cATCAGCATACCGCCGAGGAACGACATATCTTTGCGGGTGGTCAGCACATATGCAGagcagc  <  1:519123/62‑1 (MQ=255) cATCAGCATACCGCCGAGGAACGACATATCTTTGCGGGTGGTCAGCACATATGCAGagcagc  <  1:525739/62‑1 (MQ=255) cATCAGCATACCGCCGAGGAACGACATATCTTTGCGGGTGGTCAGCACATATGCAGagcagc  <  1:578759/62‑1 (MQ=255) cATCAGCATACCGCCGAGGAACGACATATCTTTGCGGGTGGTCAGCACATATGCAGagcagc  <  1:585245/62‑1 (MQ=255) cATCAGCATACCGCCGAGGAACGACATATCTTTGCGGGTGGTCAGCACATATGCAGagcagc  <  1:667222/62‑1 (MQ=255) cATCAGCATACCGCCGAGGAACGACATATCTTTGCGGGTGGTCAGCACATATGCAGagcagc  <  1:693829/62‑1 (MQ=255) cATCAGCATACCGCCGAGGAACGACATATCTTTGCGGGTGGTCAGCACATATGCAGagcagc  <  1:732468/62‑1 (MQ=255) cATCAGCATACCGCCGAGGAACGACATATCTTTGCGGGTGGTCAGCACATATGCAGagcagc  <  1:735876/62‑1 (MQ=255) cATCAGCATACCGCCGAGGAACGACATATCTTTGCGGGTGGTCAGCACATATGCAGagcagc  <  1:75032/62‑1 (MQ=255) cATCAGCATACCGCCGAGGAACGACATATCTTTGCGGGTGGTCAGCACATATGCAGagcagc  <  1:763289/62‑1 (MQ=255) cATCAGCATACCGCCGAGGAACGACATATCTTTGCGGGTGGTCAGCACATATGCAGagcagc  <  1:776130/62‑1 (MQ=255) cATCAGCATACCGCCGAGGAACGACATATCTTTGCGGGTGGTCAGCACATATGCAGagcagc  <  1:809132/62‑1 (MQ=255) cATCAGCATACCGCCGAGGAACGACATATCTTTGCGGGTGGTCAGCACATATGCAGagcagc  <  1:818241/62‑1 (MQ=255) cATCAGCATACCGCCGAGGAACGACATATCTTTGCGGGTGGTCAGCACATATGCAGagcagc  <  1:822723/62‑1 (MQ=255) cATCAGCATACCGCCGAGGAACGACATATCTTTGCGGGTGGTCAGCACATATGCAGagcagc  <  1:903687/62‑1 (MQ=255) cATCAGCATACCGCCGAGGAACGACATATCTTTGCGGGTGGTCAGCACATATGCAGagcagc  <  1:938974/62‑1 (MQ=255) cATCAGCATACCGCCGAGGAACGACATATCTTTGCGGGTGGTCAGCACATATGCAGagcagc  <  1:1363347/62‑1 (MQ=255) cATCAGCATACCGCCGAGGAACGACATATCTTTGCGGGTGGTCAGCACATATGCAGagcagc  <  1:1051618/62‑1 (MQ=255) cATCAGCATACCGCCGAGGAACGACATATCTTTGCGGGTGGTCAGCACATATGCAGagcagc  <  1:1051922/62‑1 (MQ=255) cATCAGCATACCGCCGAGGAACGACATATCTTTGCGGGTGGTCAGCACATATGCAGagcagc  <  1:1073338/62‑1 (MQ=255) cATCAGCATACCGCCGAGGAACGACATATCTTTGCGGGTGGTCAGCACATATGCAGagcagc  <  1:1076744/62‑1 (MQ=255) cATCAGCATACCGCCGAGGAACGACATATCTTTGCGGGTGGTCAGCACATATGCAGagcagc  <  1:1098815/62‑1 (MQ=255) cATCAGCATACCGCCGAGGAACGACATATCTTTGCGGGTGGTCAGCACATATGCAGagcagc  <  1:1117614/62‑1 (MQ=255) cATCAGCATACCGCCGAGGAACGACATATCTTTGCGGGTGGTCAGCACATATGCAGagcagc  <  1:1140775/62‑1 (MQ=255) cATCAGCATACCGCCGAGGAACGACATATCTTTGCGGGTGGTCAGCACATATGCAGagcagc  <  1:1167861/62‑1 (MQ=255) cATCAGCATACCGCCGAGGAACGACATATCTTTGCGGGTGGTCAGCACATATGCAGagcagc  <  1:1168648/62‑1 (MQ=255) cATCAGCATACCGCCGAGGAACGACATATCTTTGCGGGTGGTCAGCACATATGCAGagcagc  <  1:1192552/62‑1 (MQ=255) cATCAGCATACCGCCGAGGAACGACATATCTTTGCGGGTGGTCAGCACATATGCAGagcagc  <  1:1196074/62‑1 (MQ=255) cATCAGCATACCGCCGAGGAACGACATATCTTTGCGGGTGGTCAGCACATATGCAGagcagc  <  1:1199122/62‑1 (MQ=255) cATCAGCATACCGCCGAGGAACGACATATCTTTGCGGGTGGTCAGCACATATGCAGagcagc  <  1:1333068/62‑1 (MQ=255) cATCAGCATACCGCCGAGGAACGACATATCTTTGCGGGTGGTCAGCACATATGCAGagcagc  <  1:1336965/62‑1 (MQ=255) cATCAGCATACCGCCGAGGAACGACATATCTTTGCGGGTGGTCAGCACATATGCAGagcagc  <  1:1050447/62‑1 (MQ=255) cATCAGCATACCGCCGAGGAACGACATATCTTTGCGGGTGGTCAGCACATATGCAGagcagc  <  1:1386613/62‑1 (MQ=255) cATCAGCATACCGCCGAGGAACGACATATCTTTGCGGGTGGTCAGCACATATGCAGagcagc  <  1:1396427/62‑1 (MQ=255) cATCAGCATACCGCCGAGGAACGACATATCTTTGCGGGTGGTCAGCACATATGCAGagcagc  <  1:1402651/62‑1 (MQ=255) cATCAGCATACCGCCGAGGAACGACATATCTTTGCGGGTGGTCAGCACATATGCAGagcagc  <  1:1457414/62‑1 (MQ=255) cATCAGCATACCGCCGAGGAACGACATATCTTTGCGGGTGGTCAGCACATATGCAGagcagc  <  1:1480170/62‑1 (MQ=255) cATCAGCATACCGCCGAGGAACGACATATCTTTGCGGGTGGTCAGCACATATGCAGagcagc  <  1:1503071/62‑1 (MQ=255) cATCAGCATACCGCCGAGGAACGACATATCTTTGCGGGTGGTCAGCACATATGCAGagcagc  <  1:1514069/62‑1 (MQ=255) cATCAGCATACCGCCGAGGAACGACATATCTTTGCGGGTGGTCAGCACATATGCAGagcagc  <  1:1529870/62‑1 (MQ=255) cATCAGCATACCGCCGAGGAACGACATATCTTTGCGGGTGGTCAGCACATATGCAGagcagc  <  1:1538476/62‑1 (MQ=255) cATCAGCATACCGCCGAGGAACGACATATCTTTGCGGGTGGTCAGCACATATGCAGagcagc  <  1:1547118/62‑1 (MQ=255) cATCAGCATACCGCCGAGGAACGACATATCTTTGCGGGTGGTCAGCACATATGCAGagcagc  <  1:1559978/62‑1 (MQ=255) cATCAGCATACCGCCGAGGAACGACATATCTTCGCGGGTGGTCAGCACATATGCAGagcagc  <  1:1497786/62‑1 (MQ=255) cATCAGCATACCGCCGAGGAACGACATATCTTAGCGGGTGGTCAGCACATATGCAGagcagc  <  1:53886/62‑1 (MQ=255) |                                                              CATCAGCATACCGCCGAGGAACGACATATCTTTGCGGGTGGTCAGCACATATGCAGAGCAGC  >  W3110S.gb/1031424‑1031485

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑